อ่าน 2 นาที
APBS (ซอฟต์แวร์)
APBS (เดิมชื่อ Advanced Poisson-Boltzmann Solver ) เป็น ซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สฟรี สำหรับแก้สม การไฟฟ้าสถิต แบบต่อเนื่อง ซึ่งมีจุดประสงค์หลักสำหรับระบบชีวโมเลกุลขนาดใหญ่ [ 1 ] [ 2 ]...
APBS (ซอฟต์แวร์)
| APBS และ PDB2PQR | |
|---|---|
| ผู้เขียนต้นฉบับ | เบเกอร์ NA, ก.ย. D, โจเซฟเอส, โฮลสต์เอ็มเจ, แมคแคมมอน JA (APBS); Dolinsky TJ, Czodrowski P, Li H, Nielsen JE, Jensen JH, Klebe G, Baker NA (PDB2PQR) |
| เขียนเป็น | Python , C++ , C |
| ระบบปฏิบัติการ | ลินุกซ์ |
| พิมพ์ | ไฟฟ้าสถิตระดับโมเลกุล |
| ใบอนุญาต | ใบอนุญาต BSD |
| เว็บไซต์ | www.poissonboltzmann.org |
| ที่เก็บข้อมูล | github.com/Electrostatics/apbs |
APBS (เดิมชื่อAdvanced Poisson-Boltzmann Solver ) เป็นซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สฟรีสำหรับแก้สมการไฟฟ้าสถิต แบบต่อเนื่อง ซึ่งมีจุดประสงค์หลักสำหรับระบบชีวโมเลกุลขนาดใหญ่[ 1 ] [ 2 ]สามารถใช้งานได้ภายใต้ใบ อนุญาต BSD
PDB2PQR เตรียม ไฟล์ โครงสร้างโปรตีนจากProtein Data Bankเพื่อใช้กับ APBS ขั้นตอนการเตรียมการรวมถึงแต่ไม่จำกัดเพียง การเพิ่มอะตอมหนักที่ขาดหายไปในโครงสร้างและการกำหนดประจุจากฟิลด์แรงจำนวน หนึ่ง [ 3 ] [ 4 ]รูปแบบไฟล์เอาต์พุตคือ PQR [ 5 ]และนั่นคือที่มาของชื่อซอฟต์แวร์
ลิงก์ภายนอก
- เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ
- เอกสารทางการ
- APBS, PDB2PQR และซอฟต์แวร์ที่เกี่ยวข้อง - GitHub
 | บทความเกี่ยวกับซอฟต์แวร์สร้างแบบจำลองโมเลกุล นี้ยัง ไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป |
 | บทความเกี่ยวกับซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สและใช้งานได้ฟรีนี้ ยังเป็น เพียงบทความย่อคุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป |
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ APBS (ซอฟต์แวร์)
APBS (เดิมชื่อ Advanced Poisson-Boltzmann Solver ) เป็น ซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สฟรี สำหรับแก้สม การไฟฟ้าสถิต แบบต่อเนื่อง ซึ่งมีจุดประสงค์หลักสำหรับระบบชีวโมเลกุลขนาดใหญ่ [ 1 ] [ 2 ]...
ลิงก์ภายนอก
บทความเกี่ยวกับซอฟต์แวร์ สร้างแบบจำลองโมเลกุล นี้ยัง ไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป