เอทีพี-แกรสป์
ในชีววิทยาโมเลกุล โครงสร้าง ATP-grasp เป็น โครงสร้างเฉพาะของโปรตีนที่จับกับ ATP ซึ่งประกอบด้วย ซับโดเมน α + β สองอัน ที่ "จับ" โมเลกุลของATPระหว่างกัน โปรตีน ATP-grasp มีกิจกรรมของเอนไซม์คาร์บอกซิเลต-อะมีน/ไทออลไลเกสที่ขึ้นอยู่กับ ATP [ 2 ] [ 3 ]
โครงสร้าง
โปรตีนในกลุ่ม ATP-grasp มีโครงสร้าง โดยรวม ที่จัดเรียงเป็น 3 โดเมนได้แก่ โดเมนปลาย N (หรือโดเมน A) โดเมนกลาง (หรือโดเมน B) และโดเมนปลาย C (หรือโดเมน C) [ 3 ]
การทำงาน
เอนไซม์ ATP-grasp เร่งปฏิกิริยาการเชื่อมต่อโมเลกุลที่มีคาร์บอกซิเลตกับโมเลกุลที่มีหมู่เอมีโนหรือไทออลโดยอาศัย ATP ปฏิกิริยาเหล่านี้มักเกี่ยวข้องกับการสร้างสารตัวกลางอะซิลฟอสเฟต เอนไซม์เหล่านี้มีส่วนเกี่ยวข้องในวิถีเมตาบอลิซึมต่างๆ รวมถึงการสังเคราะห์พิวรีนการสังเคราะห์กรดไขมันและกลูโคเนโอเจเนซิส[ 4 ]
ตัวอย่างของโปรตีนที่มีโดเมนนี้
- ดี-อะลานีน-ดี-อะลานีน ไลเกส
- กลูตาไธโอนซินเทส
- ไบโอตินคาร์บอกซิเลส
- คาร์บาโมอิลฟอสเฟตซินเทส
- เอนไซม์ดัดแปลงโปรตีนไรโบโซม S6 (RimK)
- ยูเรียอะมิโดไลเอส
- ทูบูลิน-ไทโรซีนไลเกส
- เอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์พิวรีน
วิวัฒนาการและการกระจายตัว
โครงสร้าง ATP-grasp ได้รับการอนุรักษ์ทางวิวัฒนาการในตระกูลเอนไซม์ ต่างๆ และพบได้ทั่วไปในโปรคาริโอตและยูคาริโอต[ 3 ]
ใช้ในการวิจัย
นักวิจัยได้พัฒนา สารยับยั้งหลายประเภทสำหรับเอนไซม์ เหล่านี้ รวมถึงสารยับยั้งตามกลไกสารยับยั้งแบบแข่งขันกับ ATP และสารยับยั้งแบบไม่แข่งขันเอนไซม์ ATP-grasp บางชนิดกำลังได้รับการศึกษาในฐานะเป้าหมายที่มีศักยภาพสำหรับ ยา ปฏิชีวนะและยาต้านโรคอ้วน[ 3 ]
ลิงก์ภายนอก
- InterPro: โครงสร้างพับ ATP-grasp โดเมนย่อย 1 (IPR013815)
- InterPro: โครงสร้างพับ ATP-grasp โดเมนย่อย 2 (IPR013816)