เมื่อวันที่ 1 สิงหาคม พ.ศ. 2545 Chowdhury พร้อมด้วยเจ้าหน้าที่ดูแลนักศึกษา Nazrul Islam ได้ลาออกจากตำแหน่งรองอธิการบดีของมหาวิทยาลัยธากา หลังจากเกิดเหตุการณ์ตำรวจชายบุกเข้าไปในหอพัก Shamsunnahar ซึ่งเป็นหอพักหญิง เมื่อวันที่ 23 กรกฎาคม นักศึกษาหญิงได้ประท้วงการพักอาศัยอย่างผิดกฎหมายของนักกิจกรรมทางการเมืองในหอพักของมหาวิทยาลัย^{[ 3 ] [ 4 ]}ในเวลานั้น Chowdhury ถูกวิพากษ์วิจารณ์ที่ไม่สามารถดำเนินการใดๆ เพื่อตอบโต้การบุกของตำรวจ^{[ 5 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2558 ได้มีการจัดตั้งกองทุนทรัสต์มูลค่า 600,000 ตากา ในชื่อ"กองทุนทรัสต์ศาสตราจารย์ ดร. อันวารุลลาห์ โชว์ดูรี"ที่ภาควิชามานุษยวิทยา มหาวิทยาลัยธากา^{[ 6 ]}กองทุนทรัสต์ดังกล่าวถูกยกเลิกภายในหนึ่งเดือนหลังจากการประท้วงของนักศึกษา^{[ 7 ]}

ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2561 Chowdhury ได้รับการแต่งตั้งเป็นอาจารย์พิเศษประจำภาควิชามานุษยวิทยา แต่เขาถูกปลดจากหน้าที่ภายในหนึ่งสัปดาห์^{[ 8 ]}