อาเพทาลา 2
| โดเมน AP2 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
โครงสร้างของโดเมนการจับ GCC-box ที่ซับซ้อนกับ DNA [ 1 ] | |||||||
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | เอพี2 | ||||||
| พีแฟม | PF00847 | ||||||
| ตระกูลพีแฟม | ซีแอล0081 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR001471 | ||||||
| ปราดเปรื่อง | SM00380 | ||||||
| โปรไซต์ | พีเอส51032 | ||||||
| สโคป2 | 3gcc / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| |||||||
| อาเพทาลา 2 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | เอพี2 | ||||||
| ยีน NCBI | 829845 | ||||||
| ยูนิโปรท | พี47927 | ||||||
| |||||||
Apetala 2 (AP2)เป็นยีนและเป็นสมาชิกของกลุ่มปัจจัยการถอดรหัสขนาดใหญ่ คือ กลุ่ม AP2/ EREBPในArabidopsis thaliana AP2 มีบทบาทในแบบจำลอง ABC ของการพัฒนาของดอกไม้ [ 2 ] เดิมทีคิดว่าโปรตีนกลุ่มนี้มีเฉพาะในพืชเท่านั้น อย่างไรก็ตาม การศึกษาล่าสุดแสดงให้เห็นว่าapicomplexansรวมถึงเชื้อก่อโรคมาลาเรีย Plasmodium falciparumเข้ารหัสปัจจัยการถอดรหัสที่เกี่ยวข้องชุดหนึ่ง เรียกว่า กลุ่ม ApiAP2 [ 3 ]
ในปัจจัยการถอดรหัสRAV 1 ของ A. thaliana โดเมน AP2 ที่ปลาย Nจะจับกับ ลำดับ 5'- CAACA -3'ในขณะที่โดเมน B3 ที่ปลาย C ซึ่งมีการอนุรักษ์สูงจะจับกับลำดับ5'- CACCTG -3' [ 4 ]
โครงสร้างและเนื้อหาทางชีวภาพของ AP2
จากการศึกษาล่าสุด พบว่า Apetala 2 มีบทบาทสำคัญในการควบคุมฮอร์โมน โดยเฉพาะในดอกไม้และพืช เช่น AGAMOUS [ 5 ]การศึกษาที่ Ogawa เป็นผู้กำหนดเรื่องนี้ มีจุดประสงค์เพื่อชี้แจงความสัมพันธ์ระหว่าง Apetala 2 และ AtEBP ในการแสดงออกของยีน ผลการศึกษาแสดงให้เห็นว่าการแสดงออกของ AtEBP ที่มากเกินไปทำให้การแสดงออกของ AP2 ในใบเพิ่มขึ้น ซึ่งแสดงให้เห็นว่าบริเวณปลาย N ไม่จำเป็นต่อการสร้างฟีโนไทป์ที่คล้าย AP2 [ 6 ] AP2 ยังประกอบเป็นสารประกอบอีกชนิดหนึ่งที่เรียกว่า ANT ซึ่งประกอบด้วยโดเมน AP2 สองโดเมนที่มีความคล้ายคลึงกับโดเมนการจับ DNA ของโปรตีนที่จับกับองค์ประกอบการตอบสนองต่อเอทิลีน[ 7 ]การศึกษาอีกชิ้นหนึ่งโดย Maes, T. ในหัวข้อยีนที่คล้าย Ap2 ของเพทูเนียและบทบาทของพวกมันในการพัฒนาของดอกไม้และเมล็ดได้ค้นพบโปรตีนที่คล้าย AP2 สามชนิดจากเพทูเนีย และจากการศึกษาแบบแผนการแสดงออกของพวกมันโดยวิธีไฮบริดไดเซชันในแหล่งกำเนิด ได้แก่ PhAP2A, PhAP2B และ PhAP2C พบว่า PhAP2A มีฟังก์ชันที่คล้ายคลึงกับ AP2 อย่างมากในA. thalianaและมีลำดับยีนที่เกือบจะเหมือนกันทุกประการ PhAP2B และ PhAP2C เข้ารหัสโปรตีนที่คล้ายกับ AP2 ซึ่งอยู่ในกลุ่มย่อยที่แตกต่างกันของตระกูลปัจจัยการถอดรหัส AP2 และแสดงรูปแบบการแสดงออกที่แตกต่างกันมากในระหว่างการพัฒนาของดอกไม้เมื่อเทียบกับ PhAP2A [ 8 ]
ความสัมพันธ์ของ AP2 กับสารประกอบทางเคมี
การกลายพันธุ์ของ Apetala 2 ทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงในอัตราส่วนของเฮกโซสต่อซูโครสในระหว่างการพัฒนาเมล็ด ซึ่งเปิดโอกาสที่ AP2 อาจควบคุมมวลเมล็ดผ่านผลกระทบต่อการเผาผลาญน้ำตาล[ 9 ]ในฐานะโปรตีน มันควบคุมปริมาณน้ำตาลในระบบและเกี่ยวข้องกับการขนส่ง การขึ้นรูป และการส่งสัญญาณ การศึกษาอีกชิ้นหนึ่งแสดงให้เห็นว่าได้วิเคราะห์การทำงานของ DBF1 ในการตอบสนองต่อความเครียดจากสิ่งแวดล้อม และพบว่าพืช Arabidopsis ที่แสดงออก DBF1 มากเกินไปมีความทนทานต่อความเครียดจากออสโมซิสมากกว่าพืชควบคุม[ 10 ] DBF1 เป็นปัจจัยการจับที่พบในการช่วยให้ Apetala 2 ดำเนินการปัจจัยการถอดรหัส
โรคต่างๆ
ดีเอ็นเอมีการกลายพันธุ์อยู่ตลอดเวลา ซึ่งอาจทำให้การทำงานของโปรตีนเปลี่ยนแปลงไปอย่างสิ้นเชิงเนื่องจากโปรตีนผิดรูป ทำให้เกิดโรคในบางกรณี ตัวอย่างเช่น ในการศึกษา AP2 พบว่าปัจจัยการถอดรหัสแบบ ERF/AP2 ถูกแยกได้โดยใช้การถอดรหัสย้อนกลับแบบดิฟเฟอเรนเชียลดิสเพลย์-PCR ซึ่งทำให้เกิดการตอบสนองที่ไวเกินในใบ[ 11 ]ตระกูลยีน CBF ของ Arabidopsis ประกอบด้วยยีนสามยีนที่เข้ารหัสโปรตีนที่มีโดเมน AP2 ซึ่งทั้งหมดถูกควบคุมโดยอุณหภูมิต่ำเพื่อให้สามารถแสดงออกของยีนได้ แต่ไม่ใช่โดยกรดแอ็บซิสิกหรือการขาดน้ำ[ 12 ]
ลิงก์ภายนอก
- APETALA2+โปรตีน,+อาราบิโดปซิส ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- ตระกูล AP2 , ตระกูล ERF , ตระกูล RAVที่PlantTFDB: ฐานข้อมูลปัจจัยการถอดรหัสทางพันธุกรรมของพืช