แบคทีริโอเฟจ AP205
การจำแนกประเภทไวรัส
(ไม่จัดอันดับ):	ไวรัส
อาณาจักร:	ไรโบวิเรีย
อาณาจักร:	ออร์ธอร์นาไวเร
ไฟลัม:	เลนาร์วิริโคตา
ระดับ:	เลวิวิริเซทส์
คำสั่ง:	นอร์ซิไวรัล
ตระกูล:	Duinviridae
ประเภท:	ไวรัสเอปี
สายพันธุ์:	ไวรัสอะพีควิเบก
ไวรัส:	แบคทีริโอแบคเตอร์ AP205

แบคทีริโอเฟจ AP205เป็นแบคทีริโอเฟจที่สร้างคราบจุลินทรีย์ซึ่งติดเชื้อแบคทีเรียAcinetobacter ^{[ 1 ] [ 2 ]}แบคทีริโอเฟจ AP205 เป็นไวรัสที่มีโปรตีนหุ้มและมีจีโนม RNA สายเดี่ยวบวก เป็นสมาชิกของวงศ์ Duinviridaeจากชั้น Leviviricetesซึ่งประกอบด้วยอนุภาคที่ติดเชื้อแบคทีเรียแกรมลบ เช่น E. coli ^{[ 3 ]}

AP205 ถูกแยก ได้จากแบคทีเรียแกรมลบAcinetobacter ^{[ 4 ]}น้ำเสียจากควิเบก ประเทศแคนาดา ถูกตรวจสอบหาแบคทีริโอเฟจที่จำลองตัวเองใน แบคทีเรีย Acinetobacter AP205 ถูกแยกได้โดยวิธีการเพิ่มปริมาณจากปัสสาวะโดย PJM Bouvet ^{[ 4 ]}ไวรัสนี้เกาะติดกับพิไลของAcinetobacterนักวิจัยสามารถอธิบายลักษณะทางกายภาพของ AP205 ได้โดยใช้กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน^{[ 4 ]}

ส่วนประกอบโครงสร้างหลักของแบคทีริโอเฟจ AP205ใน กลุ่ม Leviviricetesคือเปลือกโปรตีน ไวรัสในวงศ์นี้ไม่มีเปลือกหุ้มและมีลักษณะเป็นทรงยี่สิบหน้าและทรงกลม รูปทรงยี่สิบหน้าของแคปซิดเกิดจากการจัดเรียงของโปรตีนเปลือก 178 ชุด ซึ่งเป็นโครงสร้างที่ทำให้ไวรัสมีรูปร่าง แม้ว่าไวรัสจะมีรูปร่างยี่สิบหน้า แต่ส่วนที่ยื่นออกมาบนพื้นผิวจะเรียบกว่าและเด่นชัดน้อยกว่าไวรัสชนิดอื่น ทำให้แคปซิดมีลักษณะเป็นทรงกลม โปรตีนเปลือกสร้างปฏิสัมพันธ์แบบไดเมอร์เนื่องจาก ปฏิสัมพันธ์ แบบไฮโดรโฟบิกและแบบมีขั้ว ทำให้แคปซิดมีความแข็งแกร่งทางโครงสร้างสูง^{[ 3 ]}ก่อนที่จะสร้างไดเมอร์เหล่านี้ โปรตีนเปลือกมีอยู่ในสามรูปแบบโมโนเมอร์ ได้แก่ A, B และ C หน่วยย่อย A และ C ของแคปซิดจะพับตัวในลักษณะที่ก่อให้เกิดแกนสมมาตรสามเท่า ในขณะที่หน่วยย่อย B จะจัดเรียงตัวในลักษณะที่ก่อให้เกิดแกนสมมาตรห้าเท่า เปลือกโปรตีนยังรวมถึงโปรตีนการเจริญเติบโต (โปรตีน A) หนึ่งสำเนา ซึ่งทำหน้าที่ในการเจริญเติบโตของไวรัสและ การยึดเกาะของ พิไลในโปรคาริโอต [ ^{3 ] การ} ก่อตัวของ อนุภาคคล้ายไวรัส (VLP) ที่ไม่มีโปรตีนการเจริญเติบโตประกอบด้วยไดเมอร์ 60 ตัว โดย 30 ตัวประกอบด้วยซับยูนิต A และ B ไดเมอร์ที่เหลือเป็น "ไดเมอร์ CC" ซึ่งก่อตัวเป็นโฮโมไดเมอร์โปรตีนการเจริญเติบโตจะแทนที่ไดเมอร์ CC ส่งผลให้มีโปรตีนเปลือก 178 สำเนา แทนที่จะเป็น 180 สำเนาตามที่คาดไว้^{[ 3 ]}ลักษณะเฉพาะของ โปรตีนเปลือก Leviviridaeได้แก่β-hairpinที่ปลายN-terminus , β-sheet ที่มีห้าสาย และα-helices สองอัน ที่ปลายC -terminus ^{[ 3 ]}แบคทีริโอเฟจ AP205 มีโครงสร้างโปรตีนทุติยภูมิหลายโครงสร้างซึ่งมีส่วนช่วยให้โครงสร้างมีความแข็งแกร่ง แคปซิดประกอบตัวเองในหลอดทดลอง^{[ 5 ]}

แบคทีริโอเฟจ AP205 มีจีโนม RNA สายเดี่ยวแบบ(+) sense ^{[ 3 ]}ความยาวของจีโนมสำหรับฟาจ RNA สายเดี่ยวนั้นสั้น รวมถึงของแบคทีริโอเฟจ AP205 ด้วย อย่างไรก็ตาม จีโนมของ AP205 นั้นยาวกว่าLeviviricetes อื่นๆ โดยมีนิวคลี โอไทด์ประมาณ 4268 ตัว พร้อมด้วยบริเวณที่เข้ารหัสโปรตีนไลติก โปรตีนการเจริญเติบโต โปรตีนเปลือก และRNA-dependent RNA polymerase [ ^{6 ] [ 4 ] จี}โนมของ AP205 นั้นยาวกว่าฟาจ RNA สายเดี่ยวส่วนใหญ่ เนื่องจากมีบริเวณระหว่างยีนที่ยาว ยีนการเจริญเติบโตที่ยาว และกรอบการอ่านแบบเปิด พิเศษสองกรอบ ก่อนลำดับการเจริญเติบโต^{[ 4 ]}

ตัวดำเนินการของ AP205 ประกอบด้วยลูป 4 นิวคลีโอไทด์ที่มีอะดีโนซีนอยู่ที่ตำแหน่งแรกและตำแหน่งสุดท้าย โดยมีกรดอะมิโนอีกสองตัวคั่นอยู่ตรงกลาง ลูปนี้มักพบในบริเวณตัวดำเนินการของLeviviricetes ^{[ 4 ]} บริเวณตัวดำเนินการของ AP205 มีอะดีโนซีนที่ยื่นออกมาบนโครงสร้างแฮร์พินคล้ายกับไวรัสในสกุล Qubevirus อย่างไรก็ตาม ตำแหน่ง ของอะดีโนซีนจะอยู่ใกล้กับปลาย 3' ของโครงสร้างแฮร์พินมากกว่า^{[ 4 ]}

กรอบการอ่านแบบเปิด (ORF) แรกเข้ารหัสยีนไลซิสสั้นๆ ที่มีกรดอะมิโน 35 ตัว^{[ 7 ]}ยีนนี้อยู่ในตำแหน่งที่แตกต่างจากยีนไลติกของไวรัสอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับ AP205 ^{[ 2 ]} ในขณะที่ Leviviricetesอื่นๆเข้ารหัสยีนไลติกไว้ระหว่างโปรตีนเปลือกและโปรตีนรีพลิเคส แต่ AP205 มีกรอบการอ่านแบบเปิดที่เข้ารหัสโปรตีนที่ใช้งานได้ทางด้านปลาย 5' ของจีโนม ซึ่งนักวิจัยสงสัยว่ามีหน้าที่ในการไลติก^{[ 4 ] [ 8 ]}ปลาย N ของยีนประกอบด้วยกรดอะมิโนที่มีประจุบวก ปลาย C ประกอบด้วยกลุ่มของกรดอะมิโนที่ไม่มีขั้ว เพื่อยืนยันหน้าที่ของโปรตีน นักวิจัยได้โคลนยีนลงในพลาสมิด ที่มี โปรโมเตอร์ที่แข็งแรงพลาสมิดถูกเหนี่ยวนำในE. coliซึ่งส่งผลให้มีการเจริญเติบโตของเซลล์ที่จำกัดเมื่อเทียบกับกลุ่มควบคุม เอนไซม์ที่เข้ารหัสโดยโปรตีนไลซิสจะไม่รบกวนแรงขับเคลื่อนโปรตอนของเซลล์เจ้าบ้าน^{[ 4 ]}สิ่งนี้สนับสนุนทฤษฎีที่ว่าแบคทีริโอเฟจ AP205 วิวัฒนาการและสร้างยีนไลซิสโดยใช้พื้นที่ว่างในจีโนม^{[ 4 ]}โปรตีนไลติกของ AP205 ถูกผลิตขึ้นอย่างมีประสิทธิภาพ และใช้ในการสลายแบคทีเรียอื่นที่ไม่ใช่เซลล์เจ้าบ้าน^{[ 8 ]}

นักวิจัยสงสัยว่ากรอบการอ่านแบบเปิดที่สองมีส่วนเกี่ยวข้องกับการแปลยีนการเจริญเติบโต การแปลอิสระจากรหัสเริ่มต้นของกรอบการอ่านที่สองถูกยับยั้งโดยการขาด ลำดับ Shine-Dalgarno ที่แข็งแกร่ง และโครงสร้างแฮร์พินที่เสถียรรหัสเริ่มต้นของ ORF นี้อยู่ภายในโครงสร้างทุติยภูมิแฮร์พินที่แข็งแกร่งนี้^{[ 4 ]}โครงสร้างแฮร์พินส่งผลให้เกิดการแปลใหม่จากกรอบการอ่าน ORF2 ไปยังกรอบโปรตีน A (โปรตีนการเจริญเติบโต) ^{[ 4 ]}ผลิตภัณฑ์โปรตีนของยีนการเจริญเติบโตช่วยอำนวยความสะดวกในการยึดเกาะของแบคทีริโอเฟจกับพิไลของโฮสต์ผ่านทางโมทีฟการยึดเกาะเซลล์^{[ 4 ] [ 9 ]}

ORF ที่สามเข้ารหัสโปรตีนเปลือก โปรตีนเปลือกของ AP205 แตกต่างจากฟาจ RNA สายเดี่ยวอื่นๆ เนื่องจากมี β-strand ที่ปลาย C ซึ่งไม่พบในอนุภาคที่มีความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ^{[ 3 ]}ในแบคทีริโอฟาจ RNA สายเดี่ยวอื่นๆ ที่รู้จักทั้งหมดกรดอะมิโน 20 ตัวแรก ของโปรตีนเปลือกจะสร้าง β-strand สองสาย (สาย A และ B) ที่รวมกันและสร้าง β-hairpin บนพื้นผิวด้านนอกของอนุภาคไวรัส^{[ 3 ]}ใน AP205 β-strand สายแรก (สาย A) ของโปรตีนเปลือกตั้งอยู่ที่ตำแหน่งเดียวกับสายที่สอง (สาย B) ในฟาจอื่นๆ อย่างไรก็ตาม สายที่ปลาย C (สาย B) ใน AP205 ตรงกับสายแรก (สาย A) ปลายทั้งสองเชื่อมต่อกันผ่านตัวเชื่อมกรดอะมิโนและสร้างไดเมอร์ ซึ่งทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยสำหรับการประกอบแคปซิด^{[ 3 ] [ 10 ]}เมื่อเกิดไดเมอร์ ปลาย C ของโมโนเมอร์โปรตีนเปลือกหนึ่งจะอยู่ใกล้กับปลาย N ของอีกโมโนเมอร์หนึ่ง โปรตีนเปลือก AP205 จะถ่ายโอนสายเบต้าสแตรนด์ปลาย N ไปยังปลาย C เพื่อให้ได้การเรียงลำดับแบบวงกลมของแคปซิด ผลลัพธ์ของโครงสร้างนี้คือการขาดลูป AB ที่เกิดจากสาย A และ B ^{[ 3 ]} โทโพโลยีของ ไดเมอร์โปรตีนเปลือก AP205 คล้ายกับแบบจำลองแซนด์วิชคู่ของฟาจ ssRNA อื่นๆ เกลียวของ AP205 ก่อให้เกิดช่องว่างกว้างที่เต็มไปด้วยโซ่ข้างขนาดใหญ่^{[ 3 ]}ช่องว่างที่กว้างขึ้นเกิดจากซับยูนิต αA ที่ยาวและมุมกว้างที่ซับยูนิต αB ทำกับซับยูนิต αA และแผ่นเบต้า^{[ 3 ]}พื้นที่ที่ช่องว่างเหล่านี้จัดหาให้ถูกใช้โดยโซ่ข้างขนาดใหญ่ โปรตีนหุ้มเป็นไปตามรูปแบบการพับที่อนุรักษ์ไว้ของLeviviricetesยกเว้นการก่อตัวของ β-hairpin ที่ปลาย N ^{[ 3 ]}

ORF สุดท้ายเข้ารหัสยีนรีพลิเคส ผลิตภัณฑ์โปรตีนของลำดับนี้ให้RNA-dependent RNA polymeraseยีนรีพลิเคสถูกควบคุมด้วยกลไกเดียวกันในแบคทีริโอเฟจ RNA สายเดี่ยวทั้งหมด โคดอนเริ่มต้นถูกพับเป็นโครงสร้างแฮร์พินที่มีความสัมพันธ์กับโปรตีนเปลือก อย่างไรก็ตาม ใน AP205 ไม่มีการจับกันของโปรตีนเปลือกกับตัวดำเนินการแปลของยีนรีพลิเคสเพื่อยับยั้งการแปล^{[ 11 ]}

ไวรัส RNA สายเดี่ยวมีแนวโน้มที่จะเกิดการกลายพันธุ์ในระดับที่สูงกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับไวรัสชนิดอื่น ส่งผลให้มีลำดับจีโนมที่หลากหลาย^{[ 3 ]}โคลิฟาจ RNA สายเดี่ยวถูกจัดอยู่ในสองสกุล ได้แก่QubevirusและEmesvirus โดย AP205 มีลักษณะร่วมกับไวรัสในทั้งสองสกุลนี้ (เช่นEmesvirus MS2และQuebevirus Qβ ) ^{[ 4 ]}และถูกจัดอยู่ในกลุ่มวิวัฒนาการระหว่าง MS2 และ Qβ บริเวณโอเปอเรเตอร์แสดงลักษณะเฉพาะของทั้งสองสกุล โอเปอเรเตอร์ใน AP205 มีสารตกค้างของอะดีโนซีนอยู่ในตำแหน่งเดียวกับในLeviviricetesแต่ไม่มีอะดีโนซีนที่โป่งออกมาในตำแหน่งเดียวกับห่วงแฮร์พินในโอเปอเรเตอร์^{[ 4 ]}ไวรัสใน สกุล Quebevirusเข้ารหัสโปรตีนส่วนขยายเปลือก ซึ่ง สกุล Leviviricetesไม่มี AP205 ไม่มีโปรตีนส่วนขยายเปลือกนี้^{[ 4 ]} AP205 มีความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมกับLeviviricetes มากกว่า ยกเว้น 3' UTR ซึ่งมีความคล้ายคลึงกับQuebevirusมากกว่า^{[ 4 ]}มีลำดับและโมทีฟที่อนุรักษ์ไว้มากมายใน AP205 ซึ่งช่วยในการจำแนกทางวิวัฒนาการของแบคทีริโอเฟจ ลำดับ UGCUU ในบริเวณที่ไม่ถูกแปล 3' ถูกรักษาไว้ในโคลิเฟจ RNA ทั้งหมด และมีอยู่ใน AP205 ^{[ 4 ]} RNA-dependent RNA polymerase ของ AP205 มีโมทีฟ (Y)GGD ที่อนุรักษ์ไว้ซึ่งมีอยู่ในแบคทีริโอเฟจ RNA สายเดี่ยวบวกอื่นๆ^{[ 4 ]}

แบคทีริโอเฟจ AP205 ติดเชื้อ แบคทีเรีย แกรมลบโดยการเกาะติดและดูดซับเข้าไปในพิไลของAcinetobacteriumโปรตีนการเจริญเติบโตจะจดจำหน่วยย่อยพิไลของพิไลของโฮสต์^{[ 12 ]} AP205 ใช้พิไลแบบกระตุกชนิด IV ในการเกาะติดกับเซลล์โฮสต์^{[ 7 ] [ 13 ]}เมื่อจับกับพิไลแล้ว ไวรัสจะปล่อยจีโนมของมันเข้าไปในแบคทีเรียโดยการตัดโปรตีนการเจริญเติบโต/A ^{[ 6 ]}ในช่วงระยะหลังของการติดเชื้อใน RNA สายเดี่ยว โปรตีนเปลือกจะจับกับโครงสร้างแฮร์พินของ RNA ที่อยู่ก่อนหน้ายีนรีพลิเคส AP205 เป็นข้อยกเว้น และไม่มีปฏิสัมพันธ์ประเภทนี้^{[ 14 ]}ในฟาจ RNA สายเดี่ยวอื่นๆ ความเข้มข้นสูงของโปรตีนเปลือกส่งผลให้เกิดการจับกันของไดเมอร์กับห่วงแฮร์พิน ซึ่งปิดกั้นการเข้าถึงของไรโบโซม^{[ 4 ]}สิ่งนี้จะหยุดการถอดรหัสของโปรตีนรีพลิเคส และส่งผลให้เกิดการบรรจุจีโนมไวรัสที่จำลองขึ้น^{[ 3 ]}จำเป็นต้องมีการวิจัยเพิ่มเติมเพื่อกำหนดการสิ้นสุดของการแปลรีพลิเคส หลังจากที่โปรตีนเปลือกถูกผลิตขึ้น แคปซิดจะประกอบตัวเอง^{[ 8 ]}การเรียงลำดับแบบวงกลมจะเปิดเผยปลายด้านนอกของโปรตีนเปลือก ซึ่งจะรวมกลุ่มกันผ่านปฏิสัมพันธ์ต่างๆ^{[ 8 ]}เมื่อประกอบเสร็จแล้ว ไวรัสจะทำลายเซลล์ผ่านผลิตภัณฑ์ของยีนทำลายเซลล์ กลไกการทำลายเซลล์ด้วยยีนเดี่ยวของ AP205 ยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด อย่างไรก็ตาม ผลิตภัณฑ์ของยีนทำลายเซลล์ในแบคทีริโอเฟจ RNA สายเดี่ยวจำนวนมากไม่มีความสามารถในการย่อยสลายเพปติโดไกลแคน^{[ 12 ]}

แคปซิดของ AP205 มีโปรตีนย่อย 180 หน่วย แต่ละหน่วยย่อยสามารถเชื่อมต่อกับเปปไทด์ได้หลายตัว นักวิจัยได้สร้าง AP205 VLP ที่มีเปปไทด์ติดอยู่กับเปลือกมากถึง 370 ตัว^{[ 15 ]}การที่ AP205 ไม่มีลูป AB ทำให้มีข้อได้เปรียบในการใช้ VLP ในการพัฒนาวัคซีน การแทรกเปปไทด์ในบริเวณนี้อาจทำให้เปลือกโปรตีนของ VLP ไม่เสถียรและทำให้เกิดไดเมอร์ที่ไม่ทำงาน^{[ 3 ]}แบคทีริโอเฟจ AP205 ถูกใช้เป็นพาหะในการส่งแอนติเจนในวัคซีน^{[ 3 ]}การผลิตอนุภาคคล้ายไวรัส ( VLP ) ที่ได้จากแบคทีริโอเฟจ AP205 สามารถใช้ในการแสดงแอนติเจนที่กระตุ้นการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันในเป้าหมาย การใช้ VLP เป็นพาหะสำหรับการสร้างภูมิคุ้มกันไม่ก่อให้เกิดความเสี่ยงต่อการแพร่กระจายโรคเนื่องจากไม่มีจีโนมของไวรัส^{[ 16 ]} AP205 เป็นไวรัสที่น่าสนใจสำหรับกระบวนการนี้เนื่องจากมีความทนทานต่อการหลอมรวมแอนติเจนสูง โปรตีนเปลือกของ AP205 VLP สามารถทนต่อการเชื่อมต่อกับแอนติเจนหลายชนิดได้เนื่องจากมีปลาย N และ C พร้อมใช้งาน ความพร้อมของปลายทั้งสองนี้เป็นปัจจัยจำกัดในการใช้ VLP อื่นๆ ในการศึกษาทางภูมิคุ้มกันวิทยา^{[ 17 ]}

แบคทีริโอเฟจ AP205 ถูกนำมาใช้ในการผลิตวัคซีนป้องกันไข้หวัดใหญ่ โดยการรวมโดเมนภายนอกเซลล์ M2e ของไวรัสไข้หวัดใหญ่เข้ากับแคปซิดของ AP205 VLP นักวิจัยสามารถผลิตวัคซีนที่อธิบายว่าสามารถป้องกันหนูที่ติดเชื้อจากปริมาณไข้หวัดใหญ่ที่ร้ายแรงได้^{[ 18 ]}นักวิจัยได้รวมลำดับคอนเซนซัสของโปรตีนแอนติเจน M2e ของไวรัสไข้หวัดใหญ่เข้ากับปลาย N ของโปรตีนแคปซิดของ AP205 โดยใช้ลำดับลิงเกอร์ VLP ถูกขยายพันธุ์ในE. coliเนื้อหาจีโนมภายใน M2e-AP205 VLP อาจปนเปื้อนด้วย RNA จากE. coliที่ใช้ในการขยายพันธุ์ VLP ซึ่งนำไปสู่การเหนี่ยวนำแอนติบอดีต่างๆ ที่ไม่ได้ถูกเหนี่ยวนำต่อต้าน M2e ^{[ 18 ]}หนูที่ได้รับการฉีดวัคซีนด้วย M2e-AP205 ที่มี RNA จากE. coliแสดงการป้องกันที่มากกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับหนูที่ได้รับการฉีดวัคซีนด้วย M2e-AP205 ที่ไม่มี RNA ผลลัพธ์เหล่านี้บ่งชี้ว่า RNA ภายใน VLP มีบทบาทในภูมิคุ้มกันที่ต่อต้านไข้หวัดใหญ่^{[ 18 ]}

Researchers have used AP205 VLP to decrease blood pressure in hypertensive animal subjects. They produced a vaccine through conjugating the B cell epitope ATR001 to the AP205 capsid protein structure.^[19] The repetitive pattern of the ATR001 epitopes permitted the formation of immune complexes with IgM antibodies following exposure. In addition to activating humoral immunity in vivo, the  ATR-AP205-001 vaccine resulted in enhanced differentiation of Tfh cells, leading to expression of proinflammatory cytokines such as IL-21.^[19] IL-21 is required for the activation of memory B cells that are specific to the ATR001 epitope.^[19][20] The ATR-AP205-001 vaccine resulted in a rapid humoral response initiated through the recruitment of dendritic cells, Tfh cells, and B cells with limited activation from regulatory T cells.^[19][21]

งานวิจัยสรุปว่าแบคทีริโอเฟจ AP205-VLP สามารถนำมาใช้สร้างวัคซีนป้องกันSARS-CoV-2 ได้ [ ^{22 ] โดย}ใช้โปรตีนเปลือกของ AP205 นักวิจัยสามารถนำเสนอโดเมนการจับกับตัวรับของ โปรตีนหนามของ SARS-CoV-2เพื่อกระตุ้นการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันในหนู^{[ 23 ]}ได้มีการออกแบบ AP205 VLP ที่เสถียรโดยใช้ตัวเชื่อมเพื่อรวมโปรตีนแคปซิด 2 ตัว จากนั้นเพิ่มโดเมนโมทีฟการจับกับตัวรับ (RBM) ของโปรตีนหนาม SARS-CoV-2 เข้ากับปลาย C ของไดเมอร์ AP205 ^{[ 22 ]}การก่อตัวของคอมเพล็กซ์นี้ได้รับการยืนยันผ่านการวิเคราะห์ SDS-PAGE และกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน ไดเมอร์แต่ละตัวใน AP205 VLP ประกอบด้วยโดเมน RBM ส่งผลให้มีโดเมน RBM 90 โดเมนต่อ VLP หนูที่ได้รับภูมิคุ้มกันด้วย AP205-RBM มีการตอบสนองของIgA เพิ่มขึ้น การผลิตแอนติบอดีเฉพาะ RBD และโปรตีนหนาม และการเปลี่ยนคลาสเป็น แอนติบอดี IgG2aและIgG1ซึ่งไม่พบในกลุ่มควบคุม^{[ 22 ]}นักวิจัยยังใช้SpyCatcherเพื่อเชื่อมโปรตีน RBD เข้ากับแคปซิดของ AP205VLP ^{[ 23 ]}เพื่อสร้างอนุภาค RBD-CLP นักวิจัยได้เชื่อม Tag ที่จับกับเปปไทด์และตัวเชื่อมยีนเข้ากับโปรตีนเปลือก AP205 ที่ปลาย N จากนั้นจึงโคลนลงในเวกเตอร์ pET28a(+) พลาสมิดถูกถ่ายโอนไปยัง เซลล์ E. coli ที่มีความสามารถ และผลิตภัณฑ์ Tag-CLP ที่ได้ถูกทำให้บริสุทธิ์^{[ 23 ]}นักวิจัยได้เชื่อมแอนติเจนโดเมนที่จับกับตัวรับกับตัวเชื่อม GSGS และ Catcher โปรตีนแบบแยกส่วน และรวมผลิตภัณฑ์นี้กับ Tag-CLP เพื่อสร้างคอมเพล็กซ์ RBD-CLP หนูที่ได้รับการฉีดวัคซีนด้วยสารประกอบนี้แสดงให้เห็นการเหนี่ยวนำของ  แอนติบอดีIgG2aและIgG2b ^{[ 23 ]}

การเชื่อมโยงแอนติเจนเข้ากับพื้นผิวของ AP205 VLP สามารถเพิ่มภูมิคุ้มกันของโปรตีนได้^{[ 24 ]}วัคซีนที่สร้างขึ้นโดยการเชื่อมต่อ DIII กับ AP205 VLP กระตุ้นให้เกิด แอนติบอดีที่ มีไทเตอร์ สูง ต่อ DIII หลังจากการฉีดเพียงครั้งเดียว เมื่อเปรียบเทียบกับกลุ่มหนูที่ได้รับภูมิคุ้มกันด้วยโปรตีน DIII-C อิสระและอนุภาค AP205 ที่ไม่ได้เชื่อมต่อ^{[ 25 ]}รูปแบบซ้ำๆ ของ DIII บนแคปซิดส่งผลให้เกิด  การเชื่อมโยงตัว รับ B-Cell อย่างมีประสิทธิภาพ และนำไปสู่การตอบสนองของสารน้ำ ที่จำเพาะ ในโฮสต์ เซลล์นำเสนอแอนติเจนจะดูดซับ VLP และนำเสนออีพิโทปของแอนติเจน DIII บน ตัวรับ MHC IIเพื่อกระตุ้นเซลล์ T helper ^{[ 25 ]} RNA ของแบคทีเรียที่บรรจุอยู่ภายใน BLP ช่วยเพิ่มกิจกรรมของเซลล์นำเสนอแอนติเจนเมื่อถูกส่งไปยังช่องเอนโดโซมและกระตุ้น TLR 3 และ TLR7/8 ^{[ 25 ]}หน่วยย่อย AP205 ที่เชื่อมโยงกับโมเลกุล DIII-C แสดงให้เห็นโมเลกุล DIII เฉลี่ย 50 โมเลกุลต่ออนุภาค เนื่องจากการมีอยู่ของปลาย N และ C บนโปรตีนเปลือก ภูมิคุ้มกันของวัคซีน AP205 พิสูจน์แล้วว่าสูงกว่าวัคซีนก่อนหน้านี้^{[ 25 ]} VLP ที่สร้างขึ้นในการทดลองนี้มี RNA ของเซลล์โฮสต์ E. Coli ประมาณ 25-30 ไมโครกรัมต่อโปรตีนเปลือก 100 ไมโครกรัม แอนติบอดีที่ผลิตขึ้นทำหน้าที่ในการทำให้เป็นกลางอนุภาคไวรัสเวสต์ไนล์ ที่ก่อให้เกิดการติดเชื้อ ^{[ 25 ]}

แบคทีริโอเฟจ AP2-5 สามารถใช้เพื่อกำหนดเป้าหมายแบคทีเรียก่อโรคในสัตว์และมนุษย์ได้ แบคทีริโอเฟจ AP205 สามารถใช้เพื่อสร้างวัคซีนป้องกันA. salmonicidaซึ่งเป็นแบคทีเรียแกรมลบที่พบในปลาแซลมอนที่เป็นโรคฝี^{[ 26 ]}งานวิจัยได้ใช้ AP205 VLP-VapA ที่เชื่อมต่อกันเพื่อกระตุ้นปฏิกิริยาแอนติบอดีที่แข็งแกร่งในปลาเทราต์สายรุ้ง ส่งผลให้อัตราการรอดชีวิตสูงกว่ากลุ่มควบคุมถึง 44% ^{[ 16 ]}

AP205 สามารถใช้เป็นตัวบ่งชี้การปนเปื้อนของจุลินทรีย์ในน้ำเพื่อลดความเสี่ยงต่อสุขภาพของประชาชน ในขณะที่แบคทีเรียโคลิฟอร์มมักใช้ในการกำหนดระดับการปนเปื้อนของน้ำ แต่ไวรัสมีข้อดีหลายประการ^{[ 27 ]}โดยทั่วไปไวรัสจะทนต่อรังสี UV และความเครียดจากสิ่งแวดล้อมอื่นๆ ได้ดีกว่า AP205 มีองค์ประกอบทางเคมีและลักษณะทางกายภาพหลายอย่างที่คล้ายกับโนโรไวรัสและโรตาไวรัสทำให้สามารถใช้เป็นตัวบ่งชี้แทนการปนเปื้อนของพืชผลโดยไวรัสในลำไส้ได้^{[ 27 ]} AP205 แพร่กระจายในAcinetobacter baumanniiซึ่งสามารถทำให้เกิดโรคกระเพาะและลำไส้อักเสบในบุคคลที่บริโภคผลผลิตที่ปนเปื้อน^{[ 28 ]}