วง Brain Drill ก่อตั้งขึ้นในปี 2548 โดยเดิมทีตั้งใจให้เป็นโปรเจกต์เสริม^{[ 1 ]}โดยมือกีตาร์ Dylan Ruskin หลังจากแยกทางกับวงหลัก Burn at the Stake ^{[ 2 ]} Ruskin เริ่มมองหามือกลอง และในที่สุดก็พบและจ้าง Marco Pitruzella (อดีตมือกลองของวงเดธเมทัลVile , Vital Remains , The Facelessและ วง เอ็กซ์ตรีมเมทัล อื่นๆ ) มาเป็นมือกลองรับจ้าง ^{[ 2 ]} หลังจาก ซ้อมดนตรี กัน ได้ไม่กี่เดือนSteve Rathjen นักร้องนำก็เข้าร่วมวง^{[ 1 ]} ทั้งสามคนเข้าไปบันทึกเสียงที่ Castle Ultimate Studios กับโปรดิวเซอร์ Zack Ohren และบันทึก EPหกเพลงชื่อ The Parasites ในช่วงเดือนมีนาคมและพฤษภาคม 2549 ^{[ 1 ]}ไม่นานหลังจากบันทึกเสียง Rathjen ก็ออกจากวงและถูกแทนที่โดย Andre Cornejo อดีตนักร้องนำของ Dead Syndicate ^{[ 2 ]} Jeff Hughell อดีตมือเบสของ Vile ก็เข้าร่วมวงในฐานะสมาชิกถาวรคนใหม่ จากนั้น Rathjen ก็กลับมาเป็นนักร้องนำของ Brain Drill อีกครั้ง^{[ 2 ]}

ในการสัมภาษณ์เมื่อปี 2550 อเล็กซ์ เว็บสเตอร์ มือเบสของวง Cannibal Corpseได้แนะนำวง Brain Drill ให้กับMetal Blade Recordsซึ่งได้เซ็นสัญญากับวงในเวลาต่อมาในปีนั้น^{[ 3 ]}วงได้เข้าสตูดิโอ Castle Ultimate Studios อีกครั้งพร้อมกับโปรดิวเซอร์ Zack Ohren คราวนี้เพื่อทำงานอัลบั้มเต็มชุดแรก ซึ่งบันทึกเสียงในช่วงเดือนสิงหาคม 2550 อัลบั้มต่อจาก EP ปี 2549 ของ Brain Drill ที่ชื่อApocalyptic Feastingได้รับการปล่อยออกมาเมื่อวันที่ 5 กุมภาพันธ์ 2551 โดย Metal Blade ^{[ 4 ]}

หลังจากปล่อยอัลบั้มApocalyptic Feasting ไม่นาน สมาชิกทั้งสองคน คือ Marco Pitruzzellaและ Jeff Hughell ก็ออกจากวงเนื่องจากปัญหาในการทัวร์คอนเสิร์ต จากคำแถลงของ Dylan Ruskin ที่โพสต์ไว้ใน โปรไฟล์ Myspace ของวง ทำให้ดูเหมือนว่า Brain Drill ได้ยุบวงไปแล้ว^{[ 5 ]}ไม่นานหลังจากนั้น ข่าวลือก็ถูกปฏิเสธ^{[ 6 ]}และวงก็เริ่มมองหามือกลองและมือเบสคนใหม่^{[ 7 ]}

Brain Drill เข้าสตูดิโอ Castle Ultimate กับ Zack Ohren ในเดือนธันวาคม 2009 เพื่อบันทึกอัลบั้มชุดที่สองของพวกเขาผ่าน Metal Blade Records อัลบั้มนี้มีชื่อว่าQuantum Catastropheและวางจำหน่ายในวันที่ 11 พฤษภาคม 2010 เพลง "Monumental Failure" เปิดตัวในรูปแบบสตรีมมิ่งก่อนการวางจำหน่ายอัลบั้ม^{[ 8 ]}เพลงใหม่ "Beyond Bludgeoned" จากอัลบั้มใหม่นี้ถูกปล่อยออกมาเมื่อใกล้ถึงวันวางจำหน่าย ต่อมาได้มีการสร้างมิวสิกวิดีโอสำหรับเพลงนี้และเผยแพร่ทางComcast on-demand

ในเดือนกรกฎาคม 2016 สตีฟ ราธเจน นักร้องนำ และรอน เคซีย์ มือกลอง ได้ออกจากวง และต่อมาก็ได้ทราวิส มอร์แกน และอเล็กซ์ เบนท์ เข้ามาแทนที่ตามลำดับ จากนั้นวง Brain Drill ก็เข้าบันทึกเสียงที่ Castle Ultimate Studios และออกอัลบั้มที่สามของตนเองในชื่อBoundless Obscenityเมื่อวันที่ 2 กรกฎาคม 2016

เมื่อวันที่ 10 กันยายน พ.ศ. 2562 มีการประกาศว่าวงดนตรีได้ยุบวงแล้ว^{[ 9 ]}

ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2567 ดีแลน รัสกิน ได้ปล่อยซิงเกิลแรกสำหรับโปรเจกต์ใหม่ของเขา Stellae Ignotus ^{[ 10 ]} เพลงนี้เป็นเพลงบรรเลง โดยเน้นที่ทำนองและซินเธไซเซอร์มากกว่า Brain Drill แต่ยังคงแสดงให้เห็นถึงระดับฝีมือทางดนตรีในระดับเดียวกัน