แผนที่สมองประกอบด้วยส่วนตัดตามลำดับตามระนาบกายวิภาค ที่แตกต่างกันของสมอง ของสัตว์หรือมนุษย์ ที่กำลังพัฒนาหรือโตเต็มวัยที่มีสุขภาพดีหรือเป็นโรค โดยแต่ละโครงสร้างสมองที่เกี่ยวข้องจะได้รับการกำหนดพิกัดจำนวนหนึ่งเพื่อกำหนดขอบเขตหรือปริมาตร แผนที่สมองเป็นผลลัพธ์ที่ต่อเนื่องและครอบคลุมของการทำแผนที่สมอง ด้วยภาพ และอาจรวมถึงคุณลักษณะทางกายวิภาค พันธุกรรม หรือการทำงาน^{[ 1 ]}แผนที่สมองเชิงฟังก์ชันประกอบด้วย${\displaystyle N}$ภูมิภาคที่น่าสนใจซึ่งโดยทั่วไปภูมิภาคเหล่านี้จะถูกกำหนดให้เป็นบริเวณของเนื้อเยื่อสีเทาที่มีความต่อเนื่องเชิงพื้นที่และสอดคล้องกันในเชิงฟังก์ชัน^{[ 2 ]}

ในหนังสือแผนที่กายวิภาคส่วนใหญ่ มิติทั้งสามคือ: ด้านข้าง-ด้านข้าง (x), ด้านบน-ด้านล่าง (y) และด้านหน้า - ด้านหลัง (z) ส่วนตัดที่เป็นไปได้คือ

• โคโรนัล
• แนวระนาบ
• แนวขวาง

บางครั้งมีการใช้แผนที่พื้นผิวเพิ่มเติมจากแผนที่ส่วนอนุกรม 3 มิติ^{[ 3 ]}

นอกจากสมองของมนุษย์แล้ว^{[ 4 ]ยัง}มีแผนที่สมองสำหรับสมองของหนู [ ^{5 ]}ลิงแรซัส^[ 6 ^{] แมลง}หวี่^{[ 7} ] หมู^{[ 8 ] และ}อื่นๆ

ตัวอย่างที่น่าสนใจ ได้แก่Allen Brain Atlas , BrainMaps , BigBrain , Infant Brain Atlas [ ^{9 ]}และผลงานของ International Consortium for Brain Mapping (ICBM ⁾

• การทำแผนที่สมอง
• คอนเน็กโทม
• กายวิภาคประสาท
• แผนที่สเตอริโอแท็กซิก
• สเตอริโอแท็กซี