เบรตต์ เบอร์ตัน เริ่มต้น อาชีพใน เอเอฟแอล (AFL)ในปี 1999เมื่ออายุ 20 ปี เขาสร้างความแตกต่างให้กับทีมได้ทันที โดยลงเล่นทุกเกมยกเว้นเกมเดียว ทำประตูได้ 25 ประตู และมีค่าเฉลี่ยการครองบอล 19 ครั้งต่อเกม เขาทำได้ถึง 22 ครั้งในเกมกับจีลองในรอบที่ 14 ปีต่อมา เขาได้รับบาดเจ็บเล็กน้อยหลายครั้ง ทำให้ฤดูกาลของเขามีเพียง 9 เกม โดยมีค่าเฉลี่ยการครองบอล 15 ครั้งต่อเกม และทำได้ 8 ประตู

เขาลงเล่น 14 เกมในปี 2001 ยิงประตูได้เฉลี่ยเกมละหนึ่งประตู และได้รับการเสนอชื่อเข้าชิงรางวัลลูกรับยอดเยี่ยมแห่งปีหลายครั้ง ในช่วงเวลานั้น เขาได้รับฉายาว่า "เบิร์ดแมน" จากไมค์ แม็คลีน จากสถานีวิทยุทริปเปิลเอ็มฟุตบอล ซึ่งเป็นฉายาที่ติดตัวเขามาตลอดอาชีพการเล่น

ปี 2002เป็นปีที่ยอดเยี่ยมสำหรับเบอร์ตัน เขาลงเล่นครบทั้ง 25 เกม เขาทำได้ถึง 6 ประตูในเกมกับเวสต์โคสต์ อีเกิลส์รวมถึงทำอีก 4 แฮททริก (4 ประตูต่อเกม) จนกลายเป็นผู้ทำประตูสูงสุดของครอว์สด้วยจำนวน 52 ประตู เขายังสร้างโอกาสให้เพื่อนร่วมทีมมากมาย โดยเฉลี่ยแล้วเขาครองบอล 11 ครั้งต่อเกมในบทบาทที่เน้นเกมรุกเป็นหลัก ในปี 2003อาการบาดเจ็บของเบอร์ตันกลับมาอีกครั้ง ทำให้เขาพลาดการลงเล่น 8 เกมติดต่อกันในช่วงต้นฤดูกาล อย่างไรก็ตาม เมื่อเขากลับมา เขาก็ยังคงทำผลงานได้อย่างยอดเยี่ยม ทำได้ถึง 23 ประตูจาก 16 เกม และขยับขึ้นไปเล่นในตำแหน่งที่สูงขึ้นเพื่อหาค่าเฉลี่ยการครองบอล 21 ครั้งต่อเกม

ปี 2004เป็นปีที่ย่ำแย่สำหรับแอดิเลด แต่ยิ่งแย่กว่านั้นสำหรับเบอร์ตัน เขาลงเล่นเพียง 13 เกมในฤดูกาลที่เต็มไปด้วยอาการบาดเจ็บ และเขาก็เล่นได้ไม่สม่ำเสมอ แม้จะยังคงเล่นในตำแหน่งที่สูงขึ้น เขาสามารถทำได้เฉลี่ย 20 การจ่ายบอลต่อเกม แต่ทำได้เพียง 8 ประตูเท่านั้น อย่างไรก็ตาม ในปี 2005 เมื่อทีมครอว์สทำผลงานได้อย่างยอด เยี่ยม เบอร์ตันก็ทำผลงานได้ดีเช่นกัน เขาลงเล่น 20 เกม ทำได้เฉลี่ย 20 การจ่ายบอลต่อเกม และทำได้ 14 ประตู รวมถึงแอสซิสต์ให้เพื่อนร่วมทีมทำประตูอีกหลายเกม การกลับไปเล่นในตำแหน่งกองหน้าในปี 2006และความเหนือกว่าอย่างต่อเนื่องของทีมครอว์ส ทำให้เบอร์ตันทำได้ 27 ประตูจาก 10 เกมแรก ก่อนที่อาการบาดเจ็บจะทำให้ฤดูกาลที่เหลือของเขาและแอดิเลดต้องจบลง

ในปี 2007เบอร์ตันเริ่มต้นปีด้วยอาการบาดเจ็บที่หัวเข่าในเกมแรก เนื่องจากทีมครอว์สประสบปัญหาผู้เล่นบาดเจ็บจำนวนมาก เขาจึงเล่นต่อไปจนถึงรอบที่ 8 ก่อนที่จะเข้ารับการผ่าตัดเล็กน้อย เมื่อเขากลับมา ครอว์สก็ให้เขาเล่นในตำแหน่งกองหน้า และเขาก็ช่วยให้ครอว์สคว้าอันดับที่ 8 และได้เข้าแข่งขันในรอบชิงชนะเลิศ แต่ถึงแม้จะทำผลงานได้ดี ครอว์สก็ไม่สามารถเอาชนะฮอว์ธอร์น ได้ ในรอบคัดออก

ใน ปี 2008เป็นครั้งแรกที่เบอร์ตันได้ฝึกซ้อมช่วงปรีซีซั่นอย่างต่อเนื่องโดยไม่ถูกขัดจังหวะซึ่งส่งผลดีอย่างมาก โดยเบอร์ตันกลับมาอยู่ในฟอร์มที่ดีที่สุดในอาชีพการงาน เล่นในตำแหน่งกองหน้าตัวหลัก และลงเล่นทุกเกมจนกระทั่งถูกแบนสองเกมในรอบที่ 10 หลังจากกลับมา เบอร์ตันฟอร์มตก แต่ก็ทำผลงานได้อย่างยอดเยี่ยมในครึ่งแรกของเกมกับคอลลิงวูดในรอบที่ 15 โดยยิงได้สี่ประตูทำให้แอดิเลดนำห่างในครึ่งแรก อย่างไรก็ตาม เหตุการณ์ร้ายก็เกิดขึ้น ในช่วงที่คอลลิงวูดกำลังบุกหนักในต้นควอเตอร์ที่สาม ขาซ้ายของเบอร์ตันกระแทกพื้นขณะที่เขาพยายามเปลี่ยนทิศทางอย่างรวดเร็ว และต้องถูกนำตัวออกจากสนามด้วยเปลหาม เหตุการณ์นี้ทำให้ขวัญกำลังใจของทีมครอว์สตกต่ำและพ่ายแพ้ไปอย่างราบคาบ ต่อมาในวันนั้น สโมสรเปิดเผยว่าเบอร์ตันเอ็นไขว้หน้าฉีก ขาด และต้องเข้ารับการผ่าตัดซ่อมแซมเข่า ซึ่งจะทำให้เขาต้องพักการเล่นฟุตบอลเป็นเวลา 12 เดือน แม้จะลงเล่นเต็มเกมเพียง 12 เกม แต่เบอร์ตันก็เป็นผู้ทำประตูสูงสุดของทีมครอว์สในปีนั้นด้วยจำนวน 34 ประตู สัญญาของเขาหมดลงเมื่อสิ้นปี 2008 และมีการคาดเดากันมากมายว่าอาชีพของเขาอาจจบลงแล้ว อย่างไรก็ตาม แอดิเลดได้เสนอสัญญาฉบับใหม่ที่ลดลงให้กับเขาสำหรับปี 2009 ซึ่งเขาก็ยอมรับ

เบอร์ตันกลับมาลงเล่นให้กับทีมWoodville-West Torrens Eaglesในลีก SANFL ได้อย่างประสบความสำเร็จ ในรอบที่ 14 ของฤดูกาล AFL ปี 2009โดยทำได้ถึง 4 ประตู ทำให้เกิดการคาดเดาว่าเขาจะได้รับเลือกให้ลงเล่นในเกมต่อไปของทีม Crows กับ Fremantle หรือไม่ อย่างไรก็ตาม เขาไม่ได้รับเลือก และเขาก็ได้ลงเล่นให้กับ Eagles อีกครั้ง โดยเป็นผู้เล่นที่ทำผลงานได้ดีแม้ว่าทีมจะพ่ายแพ้ให้กับSturtอย่างยับเยินก็ตาม เขาได้รับเลือกกลับมาเล่นในทีมชุดใหญ่ในสัปดาห์ต่อมาในเกมกับSt Kildaและถึงแม้ว่าเขาจะมีบทบาทไม่มากนักในเกมนั้น แต่เขาก็ทำผลงานได้อย่างยอดเยี่ยมในเกมถัดไป โดยทำได้ถึง 4 ประตูในเกมกับPort Adelaideและยึดตำแหน่งในแนวรุกที่แข็งแกร่งขึ้นอย่างเห็นได้ชัด

เบอร์ตันยังคงแสดงฟอร์มที่ยอดเยี่ยมให้เห็นเป็นระยะๆ รวมถึงการรับลูกที่ยอดเยี่ยมในเกมกับคาร์ลตันในรอบสุดท้ายของฤดูกาล ซึ่งทำให้เขาได้รับรางวัลการรับลูกยอดเยี่ยมแห่งปีในที่สุด อย่างไรก็ตาม เขาก็เล่นได้ไม่ดีในบางช่วงและประสบปัญหาบาดเจ็บ ทำให้เกิดคำถามว่าเวลาของเขาในวงการรักบี้ลีกอาจจบลงแล้วหรือไม่ แต่เขาก็ได้แสดงเจตจำนงว่าต้องการเล่นต่อไป

ในปี 2010 เบอร์ตันได้ดำรงตำแหน่งประธานสมาคมผู้เล่น AFLแทนที่โจเอล โบว์เดน [ ^{1 ] แม้}จะได้รับการแต่งตั้งนี้ ผลงานในสนามของเขาในปี 2010 ก็ลดลงอย่างมาก จนกระทั่งเขาไม่ได้รับเลือกให้ลงเล่นใน เกมรอบที่ 8 ของ ครอว์สกับนอร์ทเมลเบิร์นหลังจากผลงานที่ย่ำแย่ ใน เกมโชว์ดาวน์และเกมที่เงียบเหงาเมื่อเจอกับริชมอนด์ ทีมอันดับสุดท้าย เขาจึงประกาศเลิกเล่นเมื่อสิ้นสุดฤดูกาล 2010