กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 5 นาที

อาราป1

Arf-GAP ที่มีโดเมน Rho-GAP, ANK repeat และ PH domain-containing protein 1 เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน ARAP1 [ 5 ] มัน...

อาราป1

อาราป1
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบีการค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่นARAP1 , CENTD2, ArfGAP ที่มีโดเมน RhoGAP, แอนคิรินรีพีท และโดเมน PH 1, cnt-d2
รหัสภายนอกโอมิม : 606646 ; เอ็มจีไอ : 1916960 ; โฮโมโลยีน : 12326 ; GeneCards : ARAP1 ; OMA : ARAP1 - ออโธโลจี
ออร์โธล็อก
สายพันธุ์มนุษย์หนู
เอนเทรซ
วงดนตรี
ยูนิโปรท
RefSeq (mRNA)

NM_015242 NM_001040118 NM_001135190 NM_001369489

NM_001040111 NM_001040112 NM_027180 NM_198096

RefSeq (โปรตีน)

NP_001035207 NP_001128662 NP_056057 NP_001356418

สถานที่ตั้ง (UCSC)Chr 11: 72.69 – 72.79 MbChr 7: 101 – 101.06 Mb
การค้นหาใน PubMed[ 3 ][ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ดู/แก้ไขเมาส์

Arf-GAP ที่มีโดเมน Rho-GAP, ANK repeat และ PH domain-containing protein 1เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนARAP1 [ 5 ] มันควบคุมเส้นทางเอนโดโซมและพลวัตของโครงสร้างเซลล์โดยใช้กิจกรรมโปรตีนกระตุ้น GTPase [ 6 ] [ 7 ]

โครงสร้าง

ARAP1 ประกอบด้วยArf GAP, Rho GAP, Ankyrin repeat , RA และโดเมนPH ห้าโดเมน [ 6 ]ในHomo sapiens ARAP1 มีความยาว 1450 กรดอะมิโนและน้ำหนักโมเลกุล 162 kDa มีรายงานไอโซฟอร์มของมนุษย์ที่มีการตัดต่อทางเลือกเจ็ดแบบ[ 8 ]

Northern blotถูกนำมาใช้เพื่ออนุมานการมีอยู่ของ ARAP1 ในเนื้อเยื่อต่อไปนี้: สมอง หัวใจ กล้ามเนื้อโครงร่าง ลำไส้ใหญ่ ต่อมไทมัส ม้าม ไต ตับ ลำไส้เล็ก รก ปอดPBLC ต่อม หมวกไต กระเพาะปัสสาวะ ไขกระดูก ต่อมน้ำเหลือง ต่อมน้ำนม ต่อมลูกหมาก ไขสันหลัง กระเพาะอาหาร ต่อมไทรอยด์ หลอดลม มดลูก[ 6 ]

การทำงาน

ARAP1 แสดงให้เห็นว่ามี กิจกรรม โปรตีนกระตุ้น GTPase (GAP) สำหรับGTPase ของ ArfและRho ในหลอดทดลอง [ 6 ] กิจกรรมของ ARAP1 บนโปรตีน Arf ได้รับการกระตุ้นโดยฟอสโฟอิโนซิไทด์โดย PI(3,4)P2และPI(3,4,5)P3 แสดงผลที่แรงที่สุด โดเมน PH-1 เป็นโดเมนเดียวที่จับกับ PI(3,4,5)P3 ในหลอดทดลอง [ 9 ] ARAP1ชอบ Arf1 และ Arf5 มากกว่า Arf6 ในฐานะสารตั้งต้น กิจกรรม GAP ​​ที่เกิดขึ้นกับโปรตีน Rho ไม่ขึ้นอยู่กับฟอสโฟอิโนซิไทด์[ 6 ]

มีการสังเกตการเชื่อมโยงของ ARAP1 กับคอมเพล็กซ์กอลจิและเอนโดโซม[ 9 ]การเชื่อมโยงนี้ขึ้นอยู่กับการมีอยู่ของฟอสฟาติดิลอิโนซิทอล 3-ฟอสเฟต (เอนโดโซม) และฟอสฟาติดิลอิโนซิทอล 4-ฟอสเฟต (กอลจิ) มีงานวิจัยที่ขัดแย้งกันเกี่ยวกับผลกระทบของระดับ ARAP1 ต่อเครื่องมือของกอลจิ เนื่องจากบางรายงานระบุว่าไม่มีผลต่อกอลจิ[ 9 ]ในขณะที่บางรายงานระบุถึงการเปลี่ยนแปลงทางสรีรวิทยา[ 6 ]เส้นทางเอนโดโซมประสบกับความแตกต่างที่ขึ้นอยู่กับความอุดมสมบูรณ์ของ ARAP1 ระดับ ARAP1 ที่ลดลงจะเร่งการดูดซึมตัวรับปัจจัยการเจริญเติบโตของผิวหนังโดยการลดปริมาณ Arf-GDP ที่มีอยู่[ 9 ] [ 10 ]

กิจกรรม Rho GAP ของ ARAP1 ทำให้เซลล์กลมขึ้นและสูญเสียเส้นใยความเครียด[ 6 ] [ 9 ]ในขณะที่กิจกรรม Arf GAP ทำให้เกิดการสร้างฟิโลโพเดีย [ 6 ] นอกจากนี้ ARAP1 ยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับการจัดระเบียบโครงสร้างเซลล์เนื่องจากมันควบคุมขนาดวงแหวนของรอยย่นด้านหลังที่เป็นวงกลม[ 7 ]และควบคุม พลวัต ของแอคตินและการขนส่งเมมเบรนในออสทีโอคลาสต์[ 11 ]

ความสัมพันธ์ของโรค

การศึกษาการเชื่อมโยงจีโนมทั่วทั้งประชากรที่มีเชื้อสายยุโรปได้ระบุ SNP (โพลีมอร์ฟิซึมนิวเคลียร์เดี่ยว) จำนวน 9 ตำแหน่งบนโครโมโซม 11 ซึ่งมีส่วนทำให้เกิดผลกระทบทั้งแบบอิสระและแบบสะสมต่อความเสี่ยงในการเกิดโรคเบาหวานประเภทที่ 2 [ 12 ] CENTD2 มีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญกับการลดลงของการหลั่งอินซูลินที่กระตุ้นด้วยกลูโคสและการเพิ่มขึ้นของค่ากลูโคสในพลาสมา ซึ่งบ่งชี้ว่าการทำงานของเซลล์เบต้าในตับอ่อนที่บกพร่องเป็นตัวกลางที่ทำให้เกิดผลกระทบต่อโรคเบาหวานของตำแหน่งนี้[ 13 ]

  • ตำแหน่งจีโนมของยีน ARAP1ในมนุษย์และรายละเอียดของยีนARAP1 ใน UCSC Genome Browser

อ่านเพิ่มเติม

  • นากาจิมะ ดี, โอคาซากิ เอ็น, ยามาคาวะ เอช, คิคุโนะ อาร์, โอฮารา โอ, นากาเสะ ที (มิถุนายน 2545) "การสร้างโคลน cDNA ที่พร้อมสำหรับการแสดงออกสำหรับยีน KIAA: การสร้างโคลน KIAA cDNA 330 โคลนด้วยตนเอง" การวิจัยดีเอ็นเอ9 (3) : 99– 106. CiteSeerX 10.1.1.500.923ดอย : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .  
  • Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A และ คณะ (ตุลาคม 1998). "การทำนายลำดับรหัสของยีนมนุษย์ที่ไม่ระบุชื่อ XI. ลำดับสมบูรณ์ของโคลน cDNA ใหม่ 100 ตัวจากสมองซึ่งเข้ารหัสโปรตีนขนาดใหญ่ในหลอดทดลอง" DNA Research . 5 (5): 277– 286. doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452 . 
  • Krugmann S, Anderson KE, Ridley SH, Risso N, McGregor A, Coadwell J และ คณะ (มกราคม 2545) "การระบุ ARAP3 ซึ่งเป็นตัวกระตุ้น PI3K ใหม่ที่ควบคุมทั้ง Arf และ Rho GTPases โดยการจับแบบเลือกบนเมทริกซ์ความสัมพันธ์ฟอสโฟอิโนซิไทด์" Molecular Cell 9 ( 1): 95– 108. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00434-3 . PMID 11804589 . 
  • Miura K, Jacques KM, Stauffer S, Kubosaki A, Zhu K, Hirsch DS และ คณะ (มกราคม 2545). "ARAP1: จุดบรรจบของการส่งสัญญาณ Arf และ Rho" . Molecular Cell . 9 (1): 109– 119. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00428-8 . PMID 11804590 . 
  • Ahn J, Chung KS, Kim DU, Won M, Kim L, Kim KS และ คณะ (พฤศจิกายน 2547) "การระบุโปรตีนในเซลล์ตับที่ทำปฏิกิริยากับ NS5A ของไวรัสตับอักเสบซีอย่างเป็นระบบ"วารสารชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล 37 ( 6): 741– 748. doi : 10.5483/bmbrep.2004.37.6.741 . PMID 15607035 . 
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H และคณะ (กันยายน 2548). "เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์: แหล่งข้อมูลสำหรับการระบุโปรตีโอม" Cell . 122 (6): 957– 968. Bibcode : 2005Cell..122..957S . doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .  
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P และ คณะ (พฤศจิกายน 2549) "พลวัตการฟอสโฟรีเลชันทั่วโลก ในร่างกาย และเฉพาะตำแหน่งในเครือข่ายการส่งสัญญาณ"เซลล์127 ( 3 ): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .  
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ARAP1&oldid=1348360085 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ อาราป1

Arf-GAP ที่มีโดเมน Rho-GAP, ANK repeat และ PH domain-containing protein 1 เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน ARAP1 [ 5 ] มัน...

โครงสร้าง

ARAP1 ประกอบด้วย Arf GAP, Rho GAP, Ankyrin repeat , RA และโดเมน PH ห้าโดเมน [ 6 ] ใน Homo sapiens ARAP1 มีความยาว 1450 กรดอะมิโนและ น้ำหนักโมเลกุล 162 kDa มีรายงานไอโซฟอร์มของมนุษย์ที่มีการตัดต่อทางเลือกเจ็ดแบบ [ 8 ]

การทำงาน

ARAP1 แสดงให้เห็นว่ามี กิจกรรม โปรตีนกระตุ้น GTPase (GAP) สำหรับ GTPase ของ Arf และ Rho ในหลอดทดลอง [ 6 ] กิจกรรม ของ ARAP1 บนโปรตีน Arf ได้รับการกระตุ้นโดย ฟอสโฟอิโนซิไทด์ โดย PI(3,4)P2 และ PI(3,4,5)P3 แสดงผลที่แรงที่สุด โดเมน PH-1 เป็นโดเมนเดียวที่จับกับ...

ความสัมพันธ์ของโรค

การศึกษาการเชื่อมโยงจีโนมทั่วทั้งประชากรที่มีเชื้อสายยุโรปได้ระบุ SNP (โพลีมอร์ฟิซึมนิวเคลียร์เดี่ยว) จำนวน 9 ตำแหน่งบนโครโมโซม 11 ซึ่งมีส่วนทำให้เกิดผลกระทบทั้งแบบอิสระและแบบสะสมต่อความเสี่ยงในการเกิดโรคเบาหวานประเภทที่ 2 [ 12 ] CENTD2...