• สโมสรฟุตบอลมานากอร์ (1923-1934)
• สโมสรเดปอร์ติโบ นาซิอองนาล เด มานากอร์ (1934-1935)
• ราซิ่ง คลับ เด มานากอร์ (1935-1937)
• คลับ เดปอร์ติโบ มานากอร์ (1937-ปัจจุบัน) ^{[ note 1 ] [ 4 ]}

ในปี พ.ศ. 2451 ฟุตบอลได้เข้ามาสู่เมืองมานาคอร์เป็นครั้งแรกด้วยการก่อตั้งสโมสรฟุตบอลมานาคอร์ซึ่งเกี่ยวข้องกับสหกรณ์การเกษตรในท้องถิ่น^{[ 5 ]}ต่อมา สโมสรใหม่ได้ก่อตั้งขึ้นหลังจากแยกตัวออกมาจากสโมสรแรก คือสโมสรฟุตบอลอัลฟอนโซที่ 12แต่ทั้งสองสโมสรก็หายไปในอีกหนึ่งปีต่อมา สมาชิกและผู้เล่นของทั้งสองทีมได้ก่อตั้งสโมสรฟุตบอลมานาคอร์ขึ้นในปี พ.ศ. 2452 ซึ่งเป็นสโมสรที่ดำเนินกิจกรรมอยู่เป็นเวลาหนึ่งทศวรรษ แต่สุดท้ายก็หายไปเช่นกัน^{[ 6 ]}

เมื่อวันที่ 23 มิถุนายน 2023 ณ โรงละคร Teatre Principal ในเมือง Manacorได้มีการก่อตั้งสโมสรใหม่ขึ้น นั่นคือFutbol Club Manacorซึ่งต่อมาได้กลายเป็นสโมสรตัวแทนแห่งใหม่ของเมืองที่มีชื่อเดียวกัน และจดทะเบียนกับสหพันธ์ฟุตบอลคาตาลัน [ ^{7 ] ใน}เวลาไม่นาน Manacor ก็กลายเป็นหนึ่งในสโมสรฟุตบอลชั้นนำในPart Forana (ส่วนต่างๆ ของมายอร์กาที่อยู่นอกเมืองปาลมา ) ร่วมกับCE Constànciaจากเมืองอินคา^{[ 8 ]}

ในฤดูกาล 1924-25 มานาคอร์ได้ลงเล่นในพรีเมรา คาเทโกเรียของแคมปิโอนาต เด มายอร์กา เด ฟุตบอลเป็นครั้งแรกหลังจากหายไปหนึ่งฤดูกาลเนื่องจากไม่มีสนามที่ตรงตามกฎการแข่งขัน^{[ 9 ]}หนึ่งฤดูกาลต่อมา สโมสรได้อันดับสองหลังจากหลายทีมถูกคัดออกจากการแข่งขัน รอบชิงชนะเลิศฤดูกาล 1925-26 เล่นกับอาร์เอส อัลฟอนส์ที่ 13 เอฟซี (ปัจจุบันคือ อาร์ซีดี มายอร์กา) ที่เฟลานิตซ์และทีมจากปัลมา เป็น ฝ่ายชนะ นี่จะเป็นอันดับสองเพียงครั้งเดียวที่มานาคอร์จะได้รับในการแข่งขันนี้

ในระหว่างการเฉลิมฉลองเทศกาลอีสเตอร์ครั้งที่สองในปี พ.ศ. 2468 สนามEstadi de Na Capelleraได้เปิดอย่างเป็นทางการด้วยการแข่งขันกระชับมิตรกับ RS Alfonso XIII FC ^{[ 10 ]}ที่น่าสนใจคือ ในช่วงปีแรกๆ Manacor สวมเสื้อสีน้ำเงินแดง เลียนแบบFC Barcelonaซึ่งเป็นทีมที่มีผู้ติดตามจำนวนมากบนเกาะ^{[ 7 ] [ 11 ] [ 12 ]}

ประมาณปี 1930 มานาคอร์เริ่มประสบปัญหาทางการเงินอย่างหนัก ส่งผลให้สโมสรตกชั้น สนามกีฬาถูกขายในเดือนสิงหาคม 1934 และสโมสรก็หายไปในอีกไม่กี่วันต่อมา^{[ 6 ]}ในปีเดียวกันนั้นสโมสรเดปอร์ติโว นาซิอองนัล เด มานาคอร์ได้ก่อตั้งขึ้นโดยอดีตผู้เล่นของสโมสรที่เพิ่งหายไป^{[ 13 ]}สโมสรใหม่ได้เปลี่ยนสีประจำสโมสรเป็นลายทางแนวตั้งสีแดงและขาว และถุงเท้าสีดำ (ซึ่งเปลี่ยนเป็นสีน้ำเงินในช่วงทศวรรษ 1970) ในขณะที่ยังคงใช้สนามกีฬาของสโมสรเดิม ในช่วงต้นปี 1935 นาซิอองนัลได้เปลี่ยนชื่อเป็นเรซซิ่ง คลับ เด มานาคอร์^{[ 13 ]}

ในตอนแรก ดูเหมือนว่า Racing จะสามารถกลับไปสู่จุดสูงสุดที่ FC Manacor เคยไปถึงได้ แต่การปะทุของสงครามกลางเมืองสเปนทำให้กิจกรรมของสโมสรต้องหยุดชะงักลงชั่วคราว ในช่วงต้นปี 1937 ผู้บริหารของฝ่ายฟรังโกเข้าควบคุมสโมสรและก่อตั้งใหม่ในชื่อClub Deportivo Manacorโดยรวมเอาฐานผู้เล่นของ Racing เข้า มาด้วย ^{[ 14 ]}

หลังจากฤดูกาลหนึ่งในเซกุนดา รีจิโอนัล มานาคอร์ก็ได้รับการเลื่อนชั้นสู่พรีเมรา รีจิโอนัลในปี 1940-41 ^{[ 15 ]}สโมสรรักษาระดับนั้นไว้ได้อย่างง่ายดายและจบอันดับหนึ่งถึงสามครั้ง ได้แก่ 1944-45, 1945-46 และ 1948-49 ได้รับการเลื่อนชั้นสู่เทอร์เซรา ดิวิซิออนหลังจากการแข่งขันชิงแชมป์ครั้งที่สาม^{[ 16 ]}

เมื่อได้รับการเลื่อนชั้นสู่Tercera Divisiónมานาคอร์จึงทิ้งการแข่งขันระดับภูมิภาคไว้เบื้องหลังเป็นเวลานาน และเริ่มเล่นกับ ทีม จากแคว้นกาตาลุญญาและวาเลนเซี ย อันดับที่สี่ที่ได้รับในฤดูกาลแรก ทำให้มานาคอร์อยู่เหนือทีมที่มีชื่อเสียงของมายอร์กาเช่นCE Atlètic BalearsหรือCE Constànciaกลายเป็นทีมที่แข็งแกร่งเป็นอันดับสองของเกาะชั่วคราว (รองจากCD Mallorcaซึ่งเล่นอยู่ในSegunda División ) ^{[ 17 ]}

ในช่วงที่เหลือของทศวรรษ 1950 มานาคอร์มักจะจบฤดูกาลด้วยอันดับสูง แม้กระทั่งเกือบจะคว้าแชมป์ได้ในบางฤดูกาล^{[ 18 ]}ฤดูกาลที่ดีที่สุดของทศวรรษคือ1959-60ซึ่งมานาคอร์คว้าแชมป์ลีกได้หลังจากจบฤดูกาลอย่างดุเดือด^{[ 19 ]}มานาคอร์ได้เล่นรอบชิงชนะเลิศเพลย์ออฟเพื่อเลื่อนชั้นสู่เซกุนดา ดิวิซิออ น กับเฮอร์คิวเลส ซีเอฟและแพ้ไป 2-0 ^{[ 20 ]}สโมสรจะไม่เข้าใกล้การเลื่อนชั้นสู่ลีกรองอีกเลย

ในช่วงทศวรรษ 1960 มานาคอร์เล่นอยู่ในTercera División เท่านั้น แต่ไม่ได้เข้าร่วมการแข่งขันเพลย์ออฟเพื่อเลื่อนชั้น ในปี 1970 สโมสรตกชั้นไปเล่นในPrimera Regionalซึ่งเป็นลีกที่จะเปลี่ยนเป็นRegional Preferenteในอีกสองปีต่อมา ทศวรรษ 1970 มีลักษณะเด่นคือการเลื่อนชั้นและตกชั้นของมานาคอร์หลายครั้ง สโมสรตกชั้น (1970) เลื่อนชั้น (1973) ตกชั้น (1974) เลื่อนชั้น (1978) ตกชั้น (1979) และในที่สุดก็เลื่อนชั้น (1980) ฤดูกาล 1979-80 จะเป็นฤดูกาลสุดท้ายของมานาคอร์ในลีกระดับภูมิภาคในช่วงศตวรรษที่ 20 ^{[ 22 ]}

ในช่วงทศวรรษ 1980 มานาคอร์ตั้งเป้าที่จะเลื่อนชั้นสู่เซกุนดา ดิวิซิออน บี ที่เพิ่งก่อตั้งขึ้นใหม่ เป็นครั้งแรก^{[ 23 ]}ในฤดูกาล 1983-84มานาคอร์ประสบความสำเร็จในการเลื่อนชั้นสู่เซกุนดา บี แม้ว่าจะไม่ได้ครองตำแหน่งแชมป์ก็ตาม^{[ 24 ]}ฤดูกาลถัดมาถือเป็นฤดูกาลที่ประสบความสำเร็จมากที่สุดในประวัติศาสตร์ของสโมสร เนื่องจากมานาคอร์สามารถอยู่รอดในดิวิชั่นสามที่เพิ่งก่อตั้งขึ้นใหม่ได้ ซึ่งเป็นครั้งเดียวที่สโมสรบรรลุเป้าหมายนั้น อย่างไรก็ตาม ในฤดูกาล 1985-86สโมสรก็ตกชั้นสู่เทอร์เซรา ดิวิซิออน

ในช่วงทศวรรษ 1990 มานาคอร์คว้าแชมป์ Tercera División ได้ 2 สมัย คือในฤดูกาล 1989-90และ1992-93ทั้งสองสมัยมีผลลัพธ์ที่คล้ายคลึงกัน คือสโมสรได้เลื่อนชั้นขึ้นสู่ Segunda División B โดยตรง แต่ก็กลับมาสู่ Tercera División อีกครั้งในอีกหนึ่งปีต่อมา ในช่วงหลายปีที่ผ่านมา มานาคอร์ได้ใช้ชีวิตอยู่ในยุครุ่งเรือง เคยทำให้สนามEstadi de Na Capellera เต็มไปด้วยผู้ ชมและถือเป็นหนึ่งในทีมที่แข็งแกร่งที่สุดของPart Forana ^{[ 25 ]}

ในศตวรรษที่ 21 มานาคอร์ได้ยืนยันสถานะของตนในฐานะทีม 'คลาสสิก' ในTercera Divisiónโดยสะสมฤดูกาลเพิ่มอีก 16 ฤดูกาลในช่วงสองทศวรรษแรก ในช่วงปีแรก ๆ ของศตวรรษ ดูเหมือนว่าสโมสรจะสามารถกลับไปสู่​​Segunda División B ได้ แต่ถูกคัดออกจากการแข่งขันเพลย์ออฟเพื่อเลื่อนชั้นทุกครั้งที่เข้าร่วม และตกชั้นไปอยู่Regional Preferenteในปี 2009 ^{[ 26 ]}

แม้ว่าการตกชั้นจะมีผลกระทบอย่างมากต่อสโมสร แต่มันก็นำไปสู่จุดเริ่มต้นของพลวัตใหม่ ด้วยทีมที่แข็งแกร่ง มานาคอร์จึงคว้าแชมป์ได้สองครั้ง และต่อมาก็ได้รับการเลื่อนชั้นสองครั้ง ครั้งหนึ่งสู่ Tercera División (2010) และอีกครั้งสู่ Segunda División B (2011) อย่างไรก็ตาม สโมสรไม่สามารถอยู่รอดในลีกสูงสุดได้และกลับไปเล่นใน Tercera División อีกครั้งหลังจากฤดูกาลเดียว ระหว่างปี 2015 ถึง 2017 มานาคอร์ได้แข่งขันใน Regional Preferente โดยเล่นใน Tercera ในฤดูกาลอื่นๆ ของทศวรรษ 2010 ^{[ 27 ]}

ในฤดูกาล 2020-21ซึ่งได้รับผลกระทบอย่างรุนแรงจากการระบาดของ COVID-19มานาคอร์ตั้งเป้าที่จะเลื่อนชั้นเป็นครั้งแรกนับตั้งแต่กลับมาสู่ Tercera División ในปี 2017 สโมสรจบอันดับที่สี่ในรอบแรกและอันดับที่สามในรอบที่สอง พลาดโอกาสในการเล่นเพลย์ออฟเพื่อเลื่อนชั้นไปเพียงหนึ่งแต้ม^{[ 28 ]}

ก่อนเริ่มฤดูกาล2021-22ลีกTercera Divisiónถูกแทนที่ด้วยTercera Federaciónและกลายเป็นลีกระดับที่ห้าของฟุตบอลสเปนด้วยเหตุนี้ Manacor จึงได้ลงเล่นในรายการแข่งขันใหม่ แม้ว่าในทางปฏิบัติแล้วจะเป็นการต่อเนื่องจากรายการเดิมก็ตาม ในส่วนของผลการแข่งขัน Manacor มีฤดูกาลที่ดีกว่าฤดูกาลก่อนหน้า โดยจบอันดับที่สอง^{[ 29 ]}ในการแข่งขันเพลย์ออฟเพื่อเลื่อนชั้นสู่ Segunda Federación Manacor ผ่านเข้ารอบระดับภูมิภาค โดยเอาชนะCE Llosetí (4-1) และUE Poblera (2-1) อย่างไรก็ตาม ในรอบระดับประเทศ สโมสรแพ้ให้กับAD Alcorcón Bจากมาดริด (0-2) ^{[ 30 ]}

ฤดูกาล2022-23จะเป็นอีกฤดูกาลที่ดี แต่ผลลัพธ์ก็เหมือนเดิม ในการแข่งขันชิงแชมป์ที่สูสีกับCE Andratx , SE Penya IndependentและUE Pobleraมานาคอร์จบอันดับสอง โดยมีคะแนนเท่ากับอันดราตซ์^{[ 31 ]}ในรอบเพลย์ออฟระดับภูมิภาคสโมสรแพ้ให้กับCE Santanyíในรอบแรก (1-0 ที่ซานตานีและ 1-1 ที่มานาคอร์ ) และต้องไปแข่งขันต่อใน Tercera Federación ^{[ 32 ]}

ในฤดูกาล 2023-24มานาคอร์ได้ผ่านเข้ารอบเพลย์ออฟเพื่อเลื่อนชั้นสู่เซกุนดาเฟเดอราซิออนเป็นครั้งที่สามติดต่อกัน แต่ครั้งนี้หลังจากจบอันดับที่ห้าในลีกปกติ^{[ 33 ]}เป็นครั้งที่สองติดต่อกันที่สโมสรตกรอบเพลย์ออฟในรอบแรก โดยครั้งนี้แพ้ให้กับอาร์ซีดี มายอร์กา บี (1-0 ที่มานาคอร์และ 5-1 ที่ปัลมา ) ^{[ 34 ]}