อ่าน 4 นาที
สีย้อม CF
สีย้อม CF ( จดทะเบียนเครื่องหมายการค้าในชื่อCF Dyesโดย Biotium) เป็นกลุ่มของสีย้อมเรืองแสงที่พัฒนาขึ้นสำหรับการประยุกต์ใช้ในการวิจัยทางชีววิทยา รวมถึงกล้องจุลทรรศน์เรืองแสง
สีย้อม CF
สีย้อม CF ( จดทะเบียนเครื่องหมายการค้าในชื่อCF Dyesโดย Biotium) เป็นกลุ่มของสีย้อมเรืองแสงที่พัฒนาขึ้นสำหรับการประยุกต์ใช้ในการวิจัยทางชีววิทยา รวมถึงกล้องจุลทรรศน์เรืองแสง การวิเคราะห์เซลล์ด้วยการไหลและการถ่ายภาพในร่างกาย[ 1 ] [ 2 ]สีย้อมเหล่านี้ได้รับการแนะนำครั้งแรกในช่วงปลายทศวรรษ 2000 โดยมีลักษณะเฉพาะคือกลยุทธ์ทางเคมีที่ผสมผสานการเติมหมู่เพกิลกับหมู่ซัลโฟเนชันเพื่อให้ละลายน้ำได้สูงในขณะที่ลดการจับแบบไม่จำเพาะให้น้อยที่สุด[ 3 ]
สายพันธุ์ต่างๆ ประกอบด้วยฟลูออโรฟอร์ 42 ชนิด ครอบคลุมช่วงความยาวคลื่นกระตุ้นตั้งแต่ 347 นาโนเมตร (อัลตราไวโอเลต) ถึง 876 นาโนเมตร (อินฟราเรดใกล้) สร้างขึ้นบนโครงสร้างทางเคมีหลักสี่แบบ ได้แก่คูมารินไพรีนโรดามีนและไซยานีน [ 3 ] สีย้อมเหล่านี้ถูกนำมาใช้ในกล้องจุลทรรศน์ความละเอียดสูงพิเศษโดยมีการตรวจสอบตัวแปรต่างๆ หลายตัวสำหรับเทคนิคต่างๆ รวมถึงกล้องจุลทรรศน์ STORM, MINFLUX และ STED [ 4 ] [ 5 ]
ประวัติและพัฒนาการ
การพัฒนาเริ่มขึ้นราวปี 2550 [ 2 ] [ 6 ]เพื่อตอบสนองต่อข้อจำกัดที่พบในฟลูออโรฟอร์เชิงพาณิชย์ที่มีอยู่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งแนวโน้มของสีย้อมซัลโฟเนตจำนวนมากที่จะแสดงการจับแบบไม่จำเพาะเจาะจงกับส่วนประกอบของเซลล์ที่มีประจุบวก[ 3 ]เพื่อแก้ไขปัญหาเหล่านี้ นักวิจัยได้พัฒนากลยุทธ์การออกแบบโดยผสมผสานการซัลโฟเนตเข้ากับการดัดแปลงโพลีเอทิลีนไกลคอล (PEG) ซึ่งรายละเอียดต่างๆ ได้รับการอธิบายไว้ในสิทธิบัตรของสหรัฐอเมริกาในปี 2557 [ 3 ]
ในปี 2552 นักวิจัยได้รายงานการพัฒนากลยุทธ์การแทนที่โรดามีน-อิมิดาโซล โดยที่วงแหวนเบนซีนที่ใช้กันทั่วไปสำหรับการเชื่อมต่อถูกแทนที่ด้วยกลุ่มอิมิดาโซเลียม[ 3 ] [ 7 ]การดัดแปลงนี้ทำให้เกิดการเลื่อนไปทางสีแดงในความยาวคลื่นการปล่อยแสง ในขณะที่ยังคงรักษาเสถียรภาพทางแสงของแกนโรดามีนแซนทีนไว้ ซึ่งขยายช่วงสเปกตรัมที่ใช้งานได้ของสีย้อมโรดามีนไปสู่บริเวณใกล้อินฟราเรด[ 7 ]
ในปี 2022 การร่วมมือกับนักวิจัยที่UC Berkeleyทำให้เกิด CF583R และ CF597R ซึ่งเป็นสีย้อมโรดามีนที่ได้รับการปรับให้เหมาะสมสำหรับกล้องจุลทรรศน์ STORM [ 7 ]
เคมี
สีย้อม CF ถูกสังเคราะห์ขึ้นโดยการปรับเปลี่ยนทางเคมีของโครงสร้างสีย้อมคูมาริน โรดามีน และไซยานีนที่มีอยู่แล้ว[ 7 ]สีย้อมเหล่านี้ใช้กลยุทธ์คู่ของการซัลโฟเนชันและการเพกิเลชัน[ 3 ]การซัลโฟเนชันเป็นการนำกลุ่มซัลโฟเนต (–SO₃⁻) เข้ามาเพื่อเพิ่มความสามารถในการละลายในน้ำ ในขณะที่การเพกิเลชันเป็นการเพิ่มโซ่โพลีเอทิลีนไกลคอล (PEG) ที่ป้องกันกลุ่มที่มีประจุและลดการรวมตัวของสีย้อม[ 3 ]
หมู่ PEG ยับยั้งการเรียงซ้อนแบบ π ระหว่างโมเลกุลสีย้อมที่อยู่ติดกัน ลดการก่อตัวของ H-aggregate H-aggregation เป็นสาเหตุของการลดความสว่างของฟลูออเรสเซนซ์เมื่อโมเลกุลสีย้อมหลายโมเลกุลติดอยู่กับแอนติบอดี ตัวเดียว ซึ่งจำกัดระดับการติดฉลากที่มีประโยชน์ (DOL) ในแอนติบอดีคอนจูเกต[ 3 ]
สีย้อม CF อินฟราเรดใกล้ที่มีโรดามีนเป็นองค์ประกอบ (ระบุด้วยคำต่อท้าย "R") ใช้เคมีทดแทนโรดามีน-อิมิดาโซล ดังที่อธิบายไว้ใน Wang et al. (2022) เพื่อขยายความยาวคลื่นการปล่อยแสงให้เกินขีดจำกัด ~600 นาโนเมตรแบบดั้งเดิม ในขณะที่ยังคงรักษาคุณสมบัติความเสถียรต่อแสงของโครงสร้างโรดามีนไว้[ 3 ] [ 7 ]แกนแซนทีนที่แข็งของโรดามีนทำให้มีความต้านทานต่อการฟอกสีด้วยแสงเมื่อเทียบกับสะพานโพลีเมทินที่ยืดหยุ่นซึ่งพบในสีย้อมไซยานีน[ 7 ]
แอปพลิเคชัน
การใช้งานรวมถึงกล้องจุลทรรศน์อิมมูโนฟลูออเรสเซนซ์ , โฟลว์ไซโตเมทรี, เวสเทิร์นบลอตติ้ง, การถ่ายภาพในร่างกาย, การผสมแบบฟลูออเรสเซนซ์ในแหล่งกำเนิด , กล้องจุลทรรศน์ขยายและการตรวจจับอะพอพโทซิส[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]
กล้องจุลทรรศน์ความละเอียดสูงพิเศษ
สีย้อมเหล่านี้ได้รับการประเมินในการศึกษาวิจัยที่ผ่านการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิเพื่อใช้ในเทคนิคกล้องจุลทรรศน์ความละเอียดสูง[ 4 ] [ 7 ] [ 11 ]การประเมินอย่างเป็นระบบของสีย้อมเชิงพาณิชย์ 28 ชนิดโดย Lehmann และคณะ (2016) ระบุว่า CF647 และ CF680 เป็นคู่สีย้อมที่เหมาะสมที่สุดสำหรับ dSTORM หลายสีแบบไม่ต้องลงทะเบียนโดยอาศัยการแยกสเปกตรัมเมื่อใช้ร่วมกับ CF568 เนื่องจากมีการรบกวนสเปกตรัมต่ำ[ 4 ] CF583R และ CF597R ช่วยให้มีความแม่นยำในการระบุตำแหน่งประมาณ 10 นาโนเมตรในแนวราบและ 20 นาโนเมตรในแนวแกน[ 7 ]
งานวิจัยจาก Diekmann และเพื่อนร่วมงานที่ EMBL แสดงให้เห็นว่า CF660C มีความเสถียรต่อแสงในระหว่างการถ่ายภาพเป็นเวลานาน ทำให้สามารถบันทึกภาพได้ประมาณหนึ่งล้านเฟรมครอบคลุมเซลล์ที่กำลังแบ่งตัวทั้งหมด (ปริมาตร 40 × 40 × 6 μm) [ 5 ] CF640R และ CF680R ได้รับการตรวจสอบแล้วสำหรับกล้องจุลทรรศน์แบบ STED (stimulated emission depletion) [ 12 ] มีการใช้สีย้อมหลายชนิดในกล้องจุลทรรศน์แบบ SIM (structured illumination microscopy) [ 13 ] CF660Cและ CF680 ได้รับการตรวจสอบแล้วสำหรับ กล้องจุลทรรศน์นาโน MINFLUXโดยใช้บัฟเฟอร์สลับแสง GLOX+MEA มาตรฐาน[ 14 ]
ข้อมูลสเปกตรัมและข้อมูลการตรวจสอบที่เป็นตัวแทน
| ย้อม | ตัวอย่าง (นาโนเมตร) | เอ็ม (นาโนเมตร) | ε (M⁻¹cm⁻¹) | หมายเหตุ |
|---|---|---|---|---|
| ซีเอฟ350 | 347 | 448 | 18,000 | ไวต่อรังสียูวี |
| ซีเอฟ405เอส | 404 | 431 | 33,000 | กระตุ้นด้วยแสง 405 นาโนเมตร |
| ซีเอฟ405เอ็ม | 408 | 452 | 41,000 | กระตุ้นด้วยแสง 405 นาโนเมตร |
| ซีเอฟ405แอล | 395 | 545 | 24,000 | กระตุ้นด้วยแสงที่ความยาวคลื่น 405 นาโนเมตร ทำให้เกิดการเลื่อนของสโตกส์ขนาดใหญ่ |
| ซีเอฟ430 | 426 | 498 | 40,000 | เปล่งแสงสีเขียวเมื่อกระตุ้นด้วยแสงที่ความยาวคลื่น 405 นาโนเมตร |
| ซีเอฟ440 | 440 | 515 | 40,000 | เปล่งแสงสีเขียวเมื่อกระตุ้นด้วยแสงที่ความยาวคลื่น 405 นาโนเมตร |
| ซีเอฟ450 | 450 | 538 | 40,000 | |
| ซีเอฟ488เอ | 490 | 515 | 70,000 | ได้รับการตรวจสอบสำหรับ STORM, TIRF [ 15 ] |
| ซีเอฟ503อาร์ | 503 | 542 | 90,000 | |
| ซีเอฟ514 | 514 | ~530 | 105,000 | |
| ซีเอฟ532 | 532 | ~550 | 96,000 | |
| ซีเอฟ535เอสที | 535 | 568 | 95,000 | ผลิตจากโรดามีน ออกแบบมาสำหรับ STORM |
| ซีเอฟ543 | 543 | ~560 | 100,000 | |
| ซีเอฟ550อาร์ | 550 | ~570 | 100,000 | |
| CF555 | 555 | 565 | 150,000 | |
| ซีเอฟ568 | 562 | 583 | 100,000 | ได้รับการตรวจสอบสำหรับ STORM [ 16 ] |
| ซีเอฟ570 | 570 | ~590 | 150,000 | |
| ซีเอฟ583 | 583 | 606 | 150,000 | |
| ซีเอฟ583อาร์ | 586 | 609 | 100,000 | ใช้โรดามีนเป็นพื้นฐาน; ผ่านการตรวจสอบสำหรับ STORM [ 7 ] |
| ซีเอฟ594 | 593 | 614 | 115,000 | |
| ซีเอฟ597อาร์ | 597 | 619 | 115,000 | ได้รับการตรวจสอบสำหรับ STORM [ 7 ] |
| ซีเอฟ620อาร์ | 620 | ~642 | 115,000 | |
| ซีเอฟ633 | 630 | ~650 | 100,000 | |
| ซีเอฟ640อาร์ | 642 | 662 | 105,000 | ใช้โรดามีนเป็นพื้นฐาน; ผ่านการตรวจสอบสำหรับ STED [ 12 ] |
| ซีเอฟ647 | 650 | 665 | 240,000 | ได้รับการตรวจสอบสำหรับ STORM [ 4 ] |
| ซีเอฟ647พลัส | 652 | 668 | 240,000 | |
| ซีเอฟ660ซี | 667 | 685 | 200,000 | ตรวจสอบความถูกต้องสำหรับ STORM, MINFLUX [ 4 ] [ 14 ] |
| ซีเอฟ660อาร์ | 660 | 682 | 100,000 | โรดามีน |
| ซีเอฟ680 | 681 | 698 | 210,000 | ได้รับการตรวจสอบสำหรับ STORM [ 4 ] |
| ซีเอฟ680อาร์ | 680 | 701 | 140,000 | ใช้โรดามีนเป็นพื้นฐาน; ผ่านการตรวจสอบสำหรับ STED [ 12 ] |
| ซีเอฟ700 | 696 | ~719 | 240,000 | |
| ซีเอฟ710 | 712 | 736 | 115,000 | |
| ซีเอฟ725 | 729 | 750 | 120,000 | |
| ซีเอฟ740 | ~740 | ~760 | 105,000 | โรดามีน |
| ซีเอฟ750 | 755 | 777 | 250,000 | ได้รับการตรวจสอบสำหรับ STORM [ 17 ] |
| ซีเอฟ770 | 770 | 797 | 220,000 | |
| ซีเอฟ790 | 784 | 806 | 210,000 | |
| ซีเอฟ800 | 797 | 816 | 210,000 | |
| ซีเอฟ820 | 822 | 835 | 253,000 | |
| ซีเอฟ850 | 852 | 870 | — | |
| ซีเอฟ870 | 876 | 896 | — | |
| RPE-Astral™616 | 496, 546, 566 | 617 | — | สีย้อมคู่ FRET สำหรับการวิเคราะห์เซลล์ด้วยการไหล[ 14 ] |
| RPE-Astral™775 | 496, 546, 565 | 774 | — | สีย้อมคู่ FRET สำหรับการวิเคราะห์เซลล์ด้วยการไหล[ 14 ] |
| เอพีซี-แอสทรัล™813 | 633, 638 | 813 | — | สีย้อมคู่ FRET สำหรับการวิเคราะห์เซลล์ด้วยการไหล[ 14 ] |
สิทธิบัตร
สิทธิบัตรสำคัญที่ครอบคลุมเทคโนโลยี CF Dye ได้แก่ US8709830B2 (“สีย้อมเรืองแสง ชุดสีย้อมเรืองแสง และวิธีการเตรียมโมเลกุลที่มีฉลาก”) EP2223086B1 (วันที่ยื่นขอสิทธิบัตรปี 2007) และคำขอระหว่างประเทศ WO2012129128A1 [ 3 ] [ 18 ]
ดูเพิ่มเติม
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ สีย้อม CF
สีย้อม CF ( จดทะเบียนเครื่องหมายการค้าในชื่อCF Dyesโดย Biotium) เป็นกลุ่มของสีย้อมเรืองแสงที่พัฒนาขึ้นสำหรับการประยุกต์ใช้ในการวิจัยทางชีววิทยา รวมถึงกล้องจุลทรรศน์เรืองแสง
ประวัติและพัฒนาการ
การพัฒนาเริ่มขึ้นราวปี 2550 [ 2 ] [ 6 ] เพื่อตอบสนองต่อข้อจำกัดที่พบในฟลูออโรฟอร์เชิงพาณิชย์ที่มีอยู่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งแนวโน้มของสีย้อมซัลโฟเนตจำนวนมากที่จะแสดงการจับแบบไม่จำเพาะเจาะจงกับส่วนประกอบของเซลล์ที่มีประจุบวก [ 3 ] เพื่อแก้ไขปัญหาเหล่านี้...
เคมี
สีย้อม CF ถูกสังเคราะห์ขึ้นโดยการปรับเปลี่ยนทางเคมีของโครงสร้างสีย้อมคูมาริน โรดามีน และไซยานีนที่มีอยู่แล้ว [ 7 ] สีย้อมเหล่านี้ใช้กลยุทธ์คู่ของการซัลโฟเนชันและการเพกิเลชัน [ 3 ] การซัลโฟเนชันเป็นการนำกลุ่มซัลโฟเนต (–SO₃⁻)...
แอปพลิเคชัน
การใช้งานรวมถึง กล้องจุลทรรศน์อิมมูโนฟลูออเรสเซนซ์ , โฟลว์ไซโตเมทรี, เวสเทิร์น บลอตติ้ง, การถ่ายภาพในร่างกาย, การผสมแบบฟลูออเรสเซนซ์ในแหล่งกำเนิด , กล้องจุลทรรศน์ขยาย และการตรวจจับอะพอพโทซิส [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]