อ่าน 7 นาที
ซีเอชดี8
โปรตีน Chromodomain-helicase-DNA-binding 8เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนCHD8
ซีเอชดี8
| ซีเอชดี8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | CHD8 , AUTS18, HELSNF1, โปรตีนจับดีเอ็นเอเฮลิเคสโครโมโดเมน 8, IDDAM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 610528 ; เอ็มจีไอ : 1915022 ; โฮโมโลยีน : 72405 ; การ์ดยีน : CHD8 ; OMA : CHD8 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
โปรตีน Chromodomain-helicase-DNA-binding 8เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนCHD8 [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
ยีน CHD8 เข้ารหัสโปรตีนโครโมโดเมนเฮลิเคส DNA ไบน์ดิงโปรตีน 8 [ 7 ]ซึ่งเป็น เอนไซม์ควบคุม โครมาตินที่จำเป็นในระหว่างการพัฒนาของทารกในครรภ์[ 8 ] CHD8 เป็นเอนไซม์ที่ต้องพึ่งพา ATP [ 9 ]
โปรตีนประกอบด้วยโดเมนเฮลิเคส Snf2 ซึ่งรับผิดชอบในการไฮโดรไลซิส ATP เป็น ADP [ 9 ] CHD8 เข้ารหัสสำหรับดีเอ็นเอเฮลิเคสที่ทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งการถอดรหัสโดยการปรับโครงสร้างโครมาตินโดยการเปลี่ยนแปลงตำแหน่งของนิวคลีโอโซม[ 8 ] CHD8 ควบคุมสัญญาณ Wnt ในเชิงลบ[ 10 ]สัญญาณ Wnt มีความสำคัญในการพัฒนาและการสร้างรูปร่างในระยะเริ่มต้นของสัตว์มีกระดูกสันหลัง เชื่อกันว่า CHD8 ยังดึงดูดฮิสโตนเชื่อมโยง H1 และทำให้เกิดการยับยั้งยีนเป้าหมายของ β-catenin และ p53 [ 7 ]ความสำคัญของ CHD8 สามารถสังเกตได้จากการศึกษาที่พบว่าหนูที่ขาด CHD8 ตายหลังจาก 5.5 วันของการพัฒนาตัวอ่อนเนื่องจากการเกิดอะพอพโทซิสที่เกิดจาก p53 อย่างแพร่หลาย[ 7 ]
เมื่อเร็วๆ นี้ CD8 ได้รับการเชื่อมโยงกับการควบคุม RNA ที่ไม่เข้ารหัสแบบยาว (lncRNAs) [ 11 ]และการควบคุมการเริ่มต้นการปิดใช้งานโครโมโซม X (XCI) ผ่านการควบคุม RNA ที่ไม่เข้ารหัสแบบยาว Xist ซึ่งเป็นตัวควบคุมหลักของ XCI โดยการจับกับบริเวณควบคุมของ Xist แบบแข่งขัน[ 12 ]
ความสำคัญทางคลินิก
การกลายพันธุ์ในยีนนี้เชื่อมโยงกับกลุ่มย่อยของออทิสติก[ 13 ]ในแบบจำลองของมนุษย์และหนู[ 14 ]
การกลายพันธุ์ใน CHD8 อาจนำไปสู่การควบคุมยีนที่ถูกควบคุมโดย β-catenin ในระดับสูงขึ้น ในบางส่วนของสมอง การควบคุมในระดับสูงขึ้นนี้อาจทำให้สมองมีขนาดใหญ่ขึ้น หรือที่รู้จักกันในชื่อ macrocephaly [ 8 ]
การศึกษาบางชิ้นได้ระบุบทบาทของ CHD8 ในความผิดปกติของสเปกตรัมออทิสติก (ASD) [ 8 ]การแสดงออกของ CHD8 เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในช่วงพัฒนาการของทารกในครรภ์ของมนุษย์[ 7 ]กิจกรรมการปรับโครงสร้างโครมาตินและการโต้ตอบกับตัวควบคุมการถอดรหัสแสดงให้เห็นว่ามีบทบาทสำคัญในสาเหตุของ ASD [ 15 ]สมองของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่กำลังพัฒนามีบริเวณเป้าหมายของ CHD8 ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ซึ่งเกี่ยวข้องกับยีนเสี่ยงต่อ ASD [ 8 ]การลดระดับ CHD8 ในเซลล์ต้นกำเนิดประสาทของมนุษย์ส่งผลให้เกิดการควบคุมที่ผิดปกติของยีนเสี่ยงต่อ ASD ที่เป็นเป้าหมายของ CHD8 [ 16 ]
ลิงก์ภายนอก
- ตำแหน่งจีโนมของยีน CHD8ในมนุษย์และรายละเอียดของยีนCHD8 ใน UCSC Genome Browser
- ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : Q9HCK8 (โปรตีนจับดีเอ็นเอแบบเฮลิเคสโครโมโดเมน 8) ที่PDBe- KB
อ่านเพิ่มเติม
- นากาจิมะ ดี, โอคาซากิ เอ็น, ยามาคาวะ เอช, คิคุโนะ อาร์, โอฮารา โอ, นากาเสะ ที (มิถุนายน 2545) "การสร้างโคลน cDNA ที่พร้อมแสดงออกสำหรับยีน KIAA: การดูแลโคลน KIAA cDNA 330 โคลนด้วยตนเอง " การวิจัยดีเอ็นเอ9 (3): 99– 106. ดอย : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .
- Epplen C, Epplen JT (มกราคม 1994). "การแสดงออกของลำดับซ้ำแบบง่าย (cac)n/(gtg)n ใน mRNA ของลิมโฟไซต์มนุษย์" Human Genetics . 93 (1): 35– 41. doi : 10.1007/BF00218910 . PMID 7505766 . S2CID 22998633 .
- Sakamoto I, Kishida S, Fukui A, Kishida M, Yamamoto H, Hino S และคณะ (ตุลาคม 2000). "โปรตีนที่จับกับเบต้า-แคเทนินชนิดใหม่ยับยั้งการกระตุ้น Tcf ที่ขึ้นอยู่กับเบต้า-แคเทนินและการ สร้างแกน"วารสารชีวเคมี275 (42): 32871– 8. doi : 10.1074/jbc.M004089200 . PMID 10921920 .
- Kobayashi M, Hanai R (กันยายน 2544). "การเชื่อมโยงเฉพาะเฟส M ของ topoisomerase IIIbeta ของมนุษย์กับโครโมโซม" Biochemical and Biophysical Research Communications . 287 (1): 282– 7. doi : 10.1006/bbrc.2001.5580 . PMID 11549288 .
- Kobayashi M, Kishida S, Fukui A, Michiue T, Miyamoto Y, Okamoto T และคณะ (กุมภาพันธ์ 2545) "การแปลตำแหน่งนิวเคลียสของ Duplin ซึ่งเป็นโปรตีนที่จับกับเบต้า-แคทเทนิน เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับกิจกรรมการยับยั้งของมันในเส้นทางการส่งสัญญาณ Wnt"วารสารเคมีชีวภาพ 277 ( 8): 5816– 22. doi : 10.1074/jbc.M108433200 . PMID 11744694 .
- Nishiyama M, Nakayama K, Tsunematsu R, Tsukiyama T, Kikuchi A, Nakayama KI (ตุลาคม 2547). "การตายของตัวอ่อนในระยะเริ่มต้นในหนูที่ขาดโปรตีน Duplin ที่จับกับเบต้า-แคทเทนิน" . Molecular and Cellular Biology . 24 (19): 8386– 94. doi : 10.1128/MCB.24.19.8386-8394.2004 . PMC 516734 . PMID 15367660 .
- Lin KT, Lu RM, Tarn WY (ตุลาคม 2547). "โปรตีนที่มีโดเมน WW โต้ตอบกับสไปโซโซมระยะเริ่มต้นและมีส่วนร่วมในการตัดต่อ pre-mRNA ในร่างกาย" . Molecular and Cellular Biology . 24 (20): 9176– 85. doi : 10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004 . PMC 517884 . PMID 15456888 .
- Ishihara K, Oshimura M, Nakao M (กันยายน 2549). "ตัวกั้นโครมาตินที่ขึ้นอยู่กับ CTCF เชื่อมโยงกับการปรับโครงสร้างเอพิเจเนติก" . Molecular Cell . 23 (5): 733– 42. doi : 10.1016/j.molcel.2006.08.008 . PMID 16949368 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (ตุลาคม 2549). "วิธีการตามหลักความน่าจะเป็นสำหรับการวิเคราะห์ฟอสโฟรีเลชันของโปรตีนแบบความเร็วสูงและการระบุตำแหน่งไซต์" Nature Biotechnology . 24 (10): 1285– 92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P และคณะ (พฤศจิกายน 2549) "พลวัตการฟอสโฟรีเลชันทั่วโลก ในร่างกาย และเฉพาะตำแหน่งในเครือข่ายการส่งสัญญาณ"เซลล์127 ( 3 ): 635–48 . doi : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983
- Yuan CC, Zhao X, Florens L, Swanson SK, Washburn MP, Hernandez N (ธันวาคม 2007). "CHD8 เชื่อมโยงกับ Staf ของมนุษย์และมีส่วนช่วยในการถอดรหัส U6 RNA polymerase III อย่างมีประสิทธิภาพ" . Molecular and Cellular Biology . 27 (24): 8729– 38. doi : 10.1128/MCB.00846-07 . PMC 2169411 . PMID 17938208 .
- Thompson BA, Tremblay V, Lin G, Bochar DA (มิถุนายน 2551). "CHD8 เป็นปัจจัยการปรับโครงสร้างโครมาตินที่ขึ้นอยู่กับ ATP ซึ่งควบคุมยีนเป้าหมายของเบตา-แคทเทนิน" . Molecular and Cellular Biology . 28 (12): 3894– 904. doi : 10.1128/MCB.00322-08 . PMC 2423111 . PMID 18378692 .
- Caldon CE, Sergio CM, Schütte J, Boersma MN, Sutherland RL, Carroll JS และคณะ (กันยายน 2552) "การควบคุมไซคลิน E2 โดยเอสโตรเจนต้องอาศัยไซคลิน D1 แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ c-Myc"ชีววิทยาโมเลกุลและเซลล์29 (17): 4623– 39. doi : 10.1128/MCB.00269-09 . PMC 2725719 . PMID 19564413 .
- Nishiyama M, Oshikawa K, Tsukada Y, Nakagawa T, Iemura S, Natsume T และคณะ (กุมภาพันธ์ 2552). "CHD8 ยับยั้งการเกิดอะพอพโทซิสที่เกิดจาก p53 ผ่านการดึงดูดฮิสโตน H1 ในช่วงต้นของการเกิดตัวอ่อน" Nature Cell Biology . 11 (2): 172– 82. doi : 10.1038/ncb1831 . PMC 3132516 . PMID 19151705 .
- Rodríguez-Paredes M, Ceballos-Chávez M, Esteller M, García-Domínguez M, Reyes JC (พฤษภาคม 2552). "ปัจจัยการปรับโครงสร้างโครมาติน CHD8 มีปฏิสัมพันธ์กับ RNA polymerase II ที่กำลังยืดตัวและควบคุมการแสดงออกของยีน cyclin E2" . Nucleic Acids Research . 37 (8): 2449– 60. doi : 10.1093/nar/gkp101 . PMC 2677868 . PMID 19255092 .
- Yates JA, Menon T, Thompson BA, Bochar DA (กุมภาพันธ์ 2010). "การควบคุมการแสดงออกของยีน HOXA2 โดยเอนไซม์ CHD8 ที่ปรับโครงสร้างโครมาตินซึ่งขึ้นอยู่กับ ATP" (PDF) FEBS Letters 584 ( 4): 689– 93. doi : 10.1016/j.febslet.2010.01.022 . hdl : 2027.42/116349 . PMID 20085832 . S2CID 9956275 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ซีเอชดี8
โปรตีน Chromodomain-helicase-DNA-binding 8เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนCHD8
การทำงาน
ยีน CHD8 เข้ารหัสโปรตีนโครโมโดเมนเฮลิเคส DNA ไบน์ดิงโปรตีน 8 [ 7 ] ซึ่งเป็น เอนไซม์ควบคุม โครมาติน ที่จำเป็นในระหว่างการพัฒนาของทารกในครรภ์ [ 8 ] CHD8 เป็นเอนไซม์ที่ต้องพึ่งพา ATP [ 9 ]
ความสำคัญทางคลินิก
การกลายพันธุ์ในยีนนี้เชื่อมโยงกับกลุ่มย่อยของ ออทิสติก [ 13 ] ในแบบจำลองของมนุษย์และหนู [ 14 ]
ลิงก์ภายนอก
ตำแหน่งจีโนมของยีน CHD8 ในมนุษย์และรายละเอียดของยีน CHD8 ใน UCSC Genome Browser ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ใน PDB สำหรับ UniProt : Q9HCK8 (โปรตีนจับดีเอ็นเอแบบเฮลิเคสโครโมโดเมน 8) ที่ PDBe- KB