เอซี ชาลคิส ก่อตั้งขึ้นในปี 1967 หลังจากการควบรวมกิจการระหว่างสโมสรที่ใหญ่ที่สุดในเมือง ได้แก่โอลิมปิอาโกส ชาลกิดาและเอฟรีปอสซึ่งทั้งสองสโมสรต่างแข่งขันกันในดิวิชั่นสองของกรีกในขณะนั้น โดยโอลิมปิอาโกสจบอันดับที่ 4 และเอฟรีปอสจบอันดับที่ 9 ^{[ 1 ]}

เนื่องจากกฎหมายของระบอบการปกครองของนายทหารที่ปกครองกรีซตั้งแต่เดือนเมษายน พ.ศ. 2510 สโมสรกีฬาที่ตั้งอยู่ในเมืองเดียวกันจึงถูกบังคับให้รวมเข้าด้วยกัน^{[ 2 ] [ 3 ]}ส่งผลให้ Olympiakos Chalkida และ Evrypos รวมเข้าด้วยกันในฤดูร้อน พ.ศ. 2510 และสโมสรที่เกิดขึ้นใหม่นี้มีชื่อว่าAC Chalkis ^{[ 4 ]}เพื่อเป็นตัวแทนของเมือง Chalkis โดยรวม

ในฤดูกาล 1967–68 ซึ่งเป็นฤดูกาลแรกหลังจากการควบรวมกิจการ ชาลคิดาจบอันดับ 1 ในกลุ่มเหนือของเบตา เอธนิกิ และได้รับการเลื่อนชั้นสู่ อัลฟา เอธนิกิเป็นครั้งแรก^{[ 5 ]}อย่างไรก็ตาม พวกเขาตกชั้นทันทีหลังจากฤดูกาลเดียว โดยจบอันดับ 17 ในอัลฟา เอธนิกิ ฤดูกาล 1968–69ซึ่งเป็นอันดับรองสุดท้ายรองจากเออีแอล ลิมาสโซล^{[ 6 ]}

จนถึงปี 1989 ทีมได้เข้าร่วมการแข่งขันชิงแชมป์ Beta และGamma Ethnikiโดยไม่ประสบความสำเร็จซ้ำรอยฤดูกาลแรก แม้ว่าพวกเขาจะคว้าแชมป์ Gamma Ethniki ได้ 2 ครั้งในปี 1977 และ 1987 ^{[ 7 ] [ 8 ]}ตั้งแต่ปี 1989 ถึง 1996 ทีมได้เข้าร่วมการแข่งขันชิงแชมป์ Gamma และDelta Ethniki ระดับล่าง และตั้งแต่ปี 1996 ถึง 2003 เข้าร่วมเฉพาะการแข่งขัน Delta Ethniki เท่านั้น

ในปี 2003 AC Chalkis กลับมาแข่งขันในลีกระดับชาติอีกครั้งหลังจากห่างหายไป 7 ปี โดยเข้าร่วมการแข่งขัน Gamma Ethniki ฤดูกาล 2003–04 และจบอันดับที่ 11 ^{[ 9 ]}แม้ว่าจะจบในอันดับกลางตารางที่ปลอดภัย แต่ทีมก็ประสบปัญหาทางการเงินอย่างหนัก นักเตะทั้งทีมถูกปล่อยตัว^{[ 10 ]}และการเจรจากับนักลงทุนที่มีศักยภาพก็ไม่ประสบความสำเร็จ^{[ 11 ]}หลังจากที่การควบรวมกิจการกับสโมสรท้องถิ่นDoxa Prokopiouไม่ได้เกิดขึ้น Chalkida จึงตัดสินใจถอนตัวจากการแข่งขันทุกรายการ หยุดกิจกรรมเป็นเวลา 1 ปี และกลับมาเข้าร่วม ลีก Evia Football Club Association ในฤดูกาล 2005–06 ^{[ 12 ]}

AC Chalkis จบอันดับ 1 ในดิวิชั่น A1 ของ Evia และได้รับการเลื่อนชั้นสู่ Delta Ethniki ในปี 2010 ^{[ 13 ]}สโมสรยังชนะถ้วย Evia Amateur Cup ถึง 6 ครั้ง และได้รองชนะเลิศอีก 1 ครั้ง โดยชัยชนะครั้งสุดท้ายคือในปี 2012 ^{[ 14 ]}