ผลึกชีสมีลักษณะเป็นผลึกสีขาว กึ่งแข็งถึงแข็ง มีลักษณะกรุบกรอบเล็กน้อยถึงหยาบ เป็นเม็ด เล็ก ๆ และกลุ่มผลึกที่สามารถก่อตัวขึ้นบนพื้นผิวและภายในชีสได้^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]} ผลึกชีสเป็นลักษณะเฉพาะของ ชีสแข็งที่บ่มนาน หลายชนิด

ชีสแข็งที่มักพบผลึกชีสและมีคุณค่า ได้แก่ชีสกงเต้เชดดาร์บ่มชีสกรานาเช่นพาร์เมซานกรานาปาดาโนและเปโกริโนโรมาโนรวมถึงกูดา เก่า อย่างไรก็ตาม ในชีสบางชนิด เช่น เชดดาร์ที่ผลิตในโรงงาน ผลึกชีสถือเป็นข้อบกพร่องในการผลิต

ผลึกชีสสามารถประกอบด้วยสารต่างๆ ได้ ผลึกที่พบได้บ่อยที่สุดคือ ผลึก แคลเซียมแลคเตทโดยเฉพาะในชีสที่อายุน้อย บนผิวหน้า และในเชดดาร์ ขึ้นอยู่กับชนิดของชีสและอายุของมัน ผลึกเหล่านี้อาจประกอบด้วยเอนันติโอเมอร์ อย่างใดอย่างหนึ่งหรือทั้งสอง อย่าง^{[ 1 ]}สำหรับกรานาปาดาโนมีรายงานว่าพบ ผลึก กรดอะมิโน ที่เป็นเม็ดๆ อยู่ภายในชีส ซึ่งส่วนใหญ่ประกอบด้วยไทโรซีนลิวซีนและไอโซลิวซีน^{[ 1 ] [ 3 ]}โดยทั่วไป สารใดๆ ที่มีความละลายในน้ำต่ำและมีแนวโน้มที่จะตกผลึกก็สามารถก่อตัวเป็นผลึกได้เมื่อชีสแห้งลงในระหว่างการบ่ม