กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 3 นาที

เว็บไซต์ Chi

ตำแหน่ง ไค (Chi site) หรือ ลำดับไค (Chi sequence) คือส่วนของ ดีเอ็นเอ สั้นๆ ใน จีโนม ของ แบคทีเรีย ซึ่ง มีโอกาสเกิดการรวมตัวกัน แบบโฮโมโลจัส (homologous recombination)...

เว็บไซต์ Chi

ตำแหน่ง ไค(Chi site)หรือลำดับไค (Chi sequence) คือส่วนของดีเอ็นเอ สั้นๆ ในจีโนมของแบคทีเรียซึ่ง มีโอกาสเกิดการรวมตัวกัน แบบโฮโมโลจัส (homologous recombination)มากกว่าค่าเฉลี่ยทั่วทั้งจีโนม ตำแหน่งไคทำหน้าที่กระตุ้นการซ่อมแซมดีเอ็นเอที่แตกหักสองสายในแบคทีเรีย ซึ่งอาจเกิดขึ้นจากรังสีหรือการบำบัดทางเคมี หรือเป็นผลมาจาก การแตกหักของส่วนปลายของสายดีเอ็นเอ (replication fork breakage) ในระหว่างการจำลองดีเอ็นเอลำดับของตำแหน่งไคมีลักษณะเฉพาะสำหรับแต่ละกลุ่มของสิ่งมีชีวิตที่ใกล้เคียงกัน ในอีโคไลและแบคทีเรียในลำไส้อื่นๆ เช่น ซัลโมเนลลา ลำดับหลักคือ5' -GCTGGTGG- 3'บวกกับนิวคลีโอไทด์ที่สำคัญประมาณ 4 ถึง 7 นิวคลีโอไทด์ไปทางด้าน 3' ของลำดับหลัก การค้นพบตำแหน่งไคครั้งแรกเกิดขึ้นในจีโนมของแบคทีริโอเฟจแลมบ์ดาซึ่ง เป็น ไวรัสที่ติดเชื้ออีโคไลแต่ปัจจุบันเป็นที่ทราบกันว่าพบประมาณ 1000 ครั้งในจีโนมของ อีโคไล

ลำดับ Chi ทำหน้าที่เป็นสัญญาณให้กับเอนไซม์เฮลิเคส- นิวคลีเอสRecBCDซึ่งกระตุ้นให้เกิดการเปลี่ยนแปลงครั้งสำคัญในกิจกรรมของเอนไซม์นี้ เมื่อ RecBCD พบกับลำดับ Chi ขณะที่กำลังคลายเกลียว DNA มันจะตัด DNA ไม่กี่นิวคลีโอไทด์ไปทางด้าน 3' ของ Chi ภายในลำดับสำคัญที่กล่าวไว้ข้างต้น ทั้งนี้ ขึ้นอยู่กับสภาวะของปฏิกิริยา การตัดนี้อาจเป็นการตัดแบบง่ายๆ บนสายที่ปลาย 3' หรือการเปลี่ยนแปลงกิจกรรมของนิวคลีเอสจากการตัดสายที่ปลาย 3' ไปเป็นการตัดสายที่ปลาย 5' ในทั้งสองกรณี DNA สายเดี่ยว (ssDNA) ที่ได้ทางด้าน 3' จะถูกจับโดยโมเลกุลของ โปรตีน RecA หลายโมเลกุล ซึ่งช่วยให้เกิด "การบุกรุกของสาย" (strand invasion) ซึ่งสายหนึ่งของ DNA สองสายที่เป็นโฮโมล็อกจะถูกแทนที่ด้วย ssDNA ที่เกี่ยวข้องกับ RecA การบุกรุกของสายนี้ก่อให้เกิดโมเลกุล DNA ร่วมกันที่เรียกว่าD- loop เชื่อกันว่าการสลาย D-loop เกิดขึ้นโดยการจำลองแบบที่เริ่มต้นด้วยปลาย 3' ที่สร้างขึ้นที่ Chi (ใน D-loop) หรืออีกทางหนึ่ง D-loop อาจถูกเปลี่ยนเป็นHolliday junctionโดยการตัด D-loop และการแลกเปลี่ยนสาย DNA ครั้งที่สอง Holliday junction สามารถเปลี่ยนเป็น DNA แบบคู่เชิงเส้นได้โดยการตัด Holliday junction และการเชื่อมต่อรอยตัดที่เกิดขึ้น การสลายแบบใดแบบหนึ่งสามารถสร้างโมเลกุล DNA ลูกผสมได้หาก DNA สองสายที่ทำปฏิกิริยากันนั้นแตกต่างกันทางพันธุกรรม รวมทั้งซ่อมแซม DNA ที่เสียหายในตอนแรกด้วย

บริเวณ Chi บางครั้งเรียกว่า "จุดร้อนของการรวมตัวใหม่" (recombination hot spots) ชื่อ "Chi" เป็นคำย่อของcrossover hotspot instigator ( ตัวกระตุ้น จุดร้อน แบบไขว้) ในการอ้างอิงถึง แบค ทีริโอเฟจแลมบ์ดาของE. coli บางครั้งเขียนว่า "χ site" โดยใช้ตัวอักษรกรีก ไคสำหรับE. coliและแบคทีเรียอื่นๆ คำว่า "Chi" เป็นคำที่ถูกต้อง

การกระจายตัวทางจีโนม

ในE. coli K-12 MG1655 ตำแหน่ง Chi ไม่ได้กระจายแบบสุ่ม โดยประมาณ 98% เกิดขึ้นในบริเวณรหัสพันธุกรรม และประมาณ 75% มุ่งไปในทิศทางการจำลองแบบ[ 1 ]การวิเคราะห์เปรียบเทียบจีโนมแบคทีเรียสี่ชนิดพบว่าลำดับ Chi มีความถี่ กระจายตัวอย่างสม่ำเสมอ และมีจำนวนมากเกินไปในแต่ละจีโนมที่ตรวจสอบ แต่ลักษณะการกระจายตัวอื่นๆ ไม่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ในโฮสต์ต่างๆ[ 2 ]

  • แอนิเมชั่นเชิงโต้ตอบเกี่ยวกับการรวมตัวกันของโครโมโซมที่เหมือนกัน (Homologous Recombination ) ผลงานศิลปะออนไลน์จาก Trun N และ Trempy J, Fundamental Bacterial Genetics
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Chi_site&oldid=1359977755 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เว็บไซต์ Chi

ตำแหน่ง ไค (Chi site) หรือ ลำดับไค (Chi sequence) คือส่วนของ ดีเอ็นเอ สั้นๆ ใน จีโนม ของ แบคทีเรีย ซึ่ง มีโอกาสเกิดการรวมตัวกัน แบบโฮโมโลจัส (homologous recombination)...

การกระจายตัวทางจีโนม

ใน E. coli K-12 MG1655 ตำแหน่ง Chi ไม่ได้กระจายแบบสุ่ม โดยประมาณ 98% เกิดขึ้นในบริเวณรหัสพันธุกรรม และประมาณ 75% มุ่งไปในทิศทางการจำลองแบบ [ 1 ] การวิเคราะห์เปรียบเทียบจีโนมแบคทีเรียสี่ชนิดพบว่าลำดับ Chi มีความถี่ กระจายตัวอย่างสม่ำเสมอ...

ลิงก์ภายนอก

แอนิเมชั่นเชิงโต้ตอบเกี่ยวกับการรวมตัวกันของโครโมโซมที่เหมือนกัน (Homologous Recombination ) ผลงานศิลปะออนไลน์จาก Trun N และ Trempy J, Fundamental Bacterial Genetics ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Chi_site&oldid=1359977755 "