อ่าน 3 นาที
คลอโรเบียม
Chlorobiumเป็นสกุลของแบคทีเรียซัลเฟอร์สีเขียวพวกมันเป็นแบคทีเรียที่ออกซิไดซ์ซัลเฟอร์ โดยใช้แสง เป็นแหล่งพลังงาน...
คลอโรเบียม
| คลอโรเบียม | |
|---|---|
| การจำแนกทางวิทยาศาสตร์ | |
| โดเมน: | แบคทีเรีย |
| อาณาจักร: | ซูโดโมนาดาติ |
| ไฟลัม: | คลอโรไบโอตา |
| ระดับ: | คลอโรเบีย |
| คำสั่ง: | คลอโรไบอัลส์ |
| ตระกูล: | คลอโรบิซี |
| ประเภท: | คลอโรเบียมแนดสัน 1906 |
| ชนิดต้นแบบ | |
| คลอโรเบียม ลิมิโคล่า นาดสัน 1906 | |
| สายพันธุ์ | |
| คำพ้องความหมาย | |
| |
Chlorobiumเป็นสกุลของแบคทีเรียซัลเฟอร์สีเขียวพวกมันเป็นแบคทีเรียที่ออกซิไดซ์ซัลเฟอร์ โดยใช้แสง เป็นแหล่งพลังงาน และที่สำคัญที่สุดคือใช้ห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอนแบบไม่เป็นวัฏจักรเพื่อลด NAD+การสังเคราะห์แสงเกิดขึ้นโดยใช้ศูนย์ปฏิกิริยาประเภท 1 โดยใช้ แบค ทีริโอคลอโรฟิลล์ (BChl) aคอมเพล็กซ์เสาอากาศสังเคราะห์แสงสองแห่งช่วยในการดูดซับแสง ได้แก่- Matthews-Olson ("FMO" ซึ่งมี BChl a ด้วย ) และคลอโรโซมซึ่งส่วนใหญ่ใช้ BChl c , dหรือ e ไฮโดรเจนซัลไฟด์ใช้เป็นแหล่งอิเล็กตรอนและคาร์บอนไดออกไซด์ใช้เป็นแหล่งคาร์บอน [ 1 ]
สายพันธุ์Chlorobiumมีสีเขียวเข้ม ในคอลัมน์ Winogradskyชั้นสีเขียวที่มักพบเห็นนั้นประกอบด้วยChlorobiumสกุลนี้อาศัยอยู่ในสภาวะที่ปราศจากออกซิเจนอย่างเคร่งครัดใต้ผิวน้ำ โดยทั่วไปคือ เขต ไร้ออกซิเจนของทะเลสาบยูโทรฟิก[ 1 ]
Chlorobium aggregatumเป็นสปีชีส์ที่มีความสัมพันธ์แบบพึ่งพาอาศัยกันกับแบคทีเรียที่ไม่มีสีและไม่สามารถสังเคราะห์แสงได้ สปีชีส์นี้มีลักษณะเป็นกลุ่มแบคทีเรียสีเขียวที่เกาะติดกับเซลล์รูปแท่งตรงกลางซึ่งสามารถเคลื่อนที่ไปมาได้ด้วยแฟลเจลลัมแบคทีเรียสีเขียวด้านนอกใช้แสงในการออกซิไดซ์ซัลไฟด์ให้เป็นซัลเฟตเซลล์ด้านในซึ่งไม่สามารถสังเคราะห์แสงได้จะรีดิวซ์ซัลเฟตให้เป็นซัลไฟด์ แบคทีเรียเหล่านี้แบ่งตัวพร้อมกัน ทำให้โครงสร้าง มีลักษณะ เป็นหลายเซลล์ซึ่งเป็นลักษณะที่ผิดปกติอย่างมากในแบคทีเรีย [ 2 ]
เชื่อกันว่าสาหร่ายสกุล Chlorobiumมีบทบาทสำคัญใน เหตุการณ์ การสูญพันธุ์ครั้งใหญ่บนโลก หากมหาสมุทรขาดออกซิเจน (เนื่องจากการหยุดไหลเวียนของน้ำในมหาสมุทร) สาหร่ายChlorobiumจะสามารถแข่งขันกับสิ่งมีชีวิตสังเคราะห์แสงชนิดอื่นได้ พวกมันจะผลิตก๊าซมีเทนและไฮโดรเจนซัลไฟด์ ในปริมาณมหาศาล ซึ่งจะทำให้เกิดภาวะโลกร้อนและฝนกรดสิ่งนี้จะส่งผลกระทบอย่างใหญ่หลวงต่อสิ่งมีชีวิตในมหาสมุทรและสิ่งมีชีวิตบนบก หลักฐานที่แสดงถึง ประชากรสาหร่าย Chlorobium จำนวนมากนั้น มาจากซากดึกดำบรรพ์ทางเคมีที่พบในตะกอนที่สะสมตัวในช่วงการสูญพันธุ์ครั้งใหญ่ในยุคครีเทเชียส
ลักษณะเฉพาะระดับโมเลกุลของคลอโรไบโอตา
การวิเคราะห์จีโนมเชิงเปรียบเทียบนำไปสู่การระบุอินเดลที่เป็นเอกลักษณ์ที่อนุรักษ์ไว้ 2 ตำแหน่ง ซึ่งพบเฉพาะในสมาชิกของไฟลัมChlorobiota (เดิมชื่อ Chlorobi) และจึงเป็นลักษณะเฉพาะของไฟลัมนี้ อินเดลแรกคือการแทรกกรดอะมิโน 28 ตัวในDNA polymerase IIIและอินเดลที่สองคือการแทรกกรดอะมิโน 12 ถึง 14 ตัวในalanyl-tRNA synthetaseอินเดลเหล่านี้ไม่พบในแบคทีเรียชนิดอื่นใด จึงทำหน้าที่เป็นเครื่องหมายโมเลกุลสำหรับไฟลัมนี้ นอกจากอินเดลที่เป็นเอกลักษณ์ที่อนุรักษ์ไว้แล้ว ยังพบโปรตีนอีก 51 ชนิดที่พบเฉพาะในสมาชิกของไฟลัมChlorobiota นอกจากนี้ ยังพบโปรตีนอีก 65 ชนิดที่พบเฉพาะใน ไฟลัม Chlorobiotaอย่างไรก็ตาม โปรตีนเหล่านี้หายไปในChlorobiota หลาย ชนิด และไม่ได้กระจายตัวไปทั่วไฟลัมอย่างมีรูปแบบที่ชัดเจน ซึ่งหมายความว่าอาจมีการสูญเสียยีนอย่างมีนัยสำคัญ หรือการมีอยู่ของโปรตีนเหล่านี้อาจเป็นผลมาจากการถ่ายโอนยีนในแนวนอน ในบรรดาโปรตีนทั้ง 65 ชนิดนี้ มี 8 ชนิดที่พบเฉพาะในChlorobium luteolumและChlorobium phaeovibrioides เท่านั้น สายพันธุ์ทั้งสองนี้ก่อตัวเป็นกลุ่มที่มีความสัมพันธ์กันอย่างแน่นแฟ้นในแผนภูมิวิวัฒนาการ และความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดระหว่างสายพันธุ์เหล่านี้ยังได้รับการสนับสนุนเพิ่มเติมจากการที่โปรตีนทั้ง 8 ชนิดนี้มีอยู่ร่วมกัน[ 3 ]
ความสัมพันธ์ของChlorobiotaกับไฟลัมBacteroidotaและFibrobacterota
สปีชีส์จาก ไฟลัม Bacteroidota (เดิมชื่อ Bacteroidetes) และChlorobiotaแยกสาขากันอย่างใกล้ชิดในแผนภูมิวิวัฒนาการ ซึ่งบ่งชี้ถึงความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิด จากการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ พบว่ามีโปรตีน 3 ชนิดที่พบร่วมกันในสมาชิกเกือบทั้งหมดของไฟลัมBacteroidotaและChlorobiota [ 3 ]การมีโปรตีน 3 ชนิดนี้ร่วมกันมีความสำคัญ เนื่องจากนอกจากโปรตีน 3 ชนิดนี้แล้ว ไม่มีโปรตีนจาก ไฟลัม BacteroidotaหรือChlorobiotaที่พบร่วมกันในกลุ่มแบคทีเรียอื่น ๆ อีก นอกจากนี้ยังมีการระบุอินเดลลายเซ็นที่อนุรักษ์ไว้หลายรายการ ซึ่งพบร่วมกันเฉพาะในสมาชิกของ ไฟลัม BacteroidotaและChlorobiotaการมีอยู่ของลายเซ็นโมเลกุลเหล่านี้สนับสนุนความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดของไฟลัมBacteroidotaและChlorobiota [ 3 ] [ 4 ]ยิ่งไปกว่านั้น ไฟลัมFibrobacterota (เดิมชื่อ Fibrobacteres) ยังบ่งชี้ว่ามีความสัมพันธ์เฉพาะกับสองไฟลัมนี้ กลุ่มที่ประกอบด้วยไฟลัมทั้งสามนี้ได้รับการสนับสนุนอย่างมากจากการวิเคราะห์ทางวิวัฒนาการโดยอาศัยโปรตีนที่แตกต่างกันหลายชนิด[ 4 ]ไฟลัมเหล่านี้ยังแตกแขนงในตำแหน่งเดียวกันโดยอาศัยอินเดลลายเซ็นที่อนุรักษ์ไว้ในโปรตีนสำคัญหลายชนิด[ 5 ]สุดท้ายและที่สำคัญที่สุด มีการระบุอินเดลลายเซ็นที่อนุรักษ์ไว้สองรายการ (ในโปรตีน RpoC และในซีรีนไฮดรอกซีเมทิลทรานสเฟอเรส ) และโปรตีนลายเซ็น PG00081 หนึ่งรายการ ซึ่งพบร่วมกันในทุกสปีชีส์จากไฟลัมทั้งสามนี้ ผลลัพธ์ทั้งหมดนี้ให้หลักฐานที่น่าเชื่อถือว่าสปีชีส์จากไฟลัมทั้งสามนี้มีบรรพบุรุษร่วมกันที่แยกจากแบคทีเรียอื่นๆ ทั้งหมด และมีการเสนอว่าควรยอมรับพวกมันทั้งหมดเป็นส่วนหนึ่งของซูเปอร์ไฟลัม “FCB” เดียวกัน[ 3 ] [ 4 ]
วิวัฒนาการ
อนุกรมวิธานที่ยอมรับในปัจจุบันนั้นอิงตามรายชื่อชื่อโปรคาริโอตที่มีสถานะในระบบการตั้งชื่อ (LPSN) [ 6 ]และศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI) [ 7 ]
| LTPที่ใช้ 16S rRNA _10_2024 [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] | โปรตีนเครื่องหมาย 120 ตัวตามGTDB 10-RS226 [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Species incertae sedis:
- " C. bathyomarinum " Betty และคณะ 2005
- " Ca. C. canadense" ซึจิ และคณะ 2020
- " C. gokarna " Kumar และคณะ 2548
ลิงก์ภายนอก
- Chlorobiumที่ Bac Dive - ฐานข้อมูลเมตาของความหลากหลายทางแบคทีเรีย
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ คลอโรเบียม
Chlorobiumเป็นสกุลของแบคทีเรียซัลเฟอร์สีเขียวพวกมันเป็นแบคทีเรียที่ออกซิไดซ์ซัลเฟอร์ โดยใช้แสง เป็นแหล่งพลังงาน...
ลักษณะเฉพาะระดับโมเลกุลของ คลอโรไบโอตา
การวิเคราะห์จีโนมเชิงเปรียบเทียบนำไปสู่การระบุ อินเดลที่เป็นเอกลักษณ์ที่อนุรักษ์ไว้ 2 ตำแหน่ง ซึ่งพบเฉพาะในสมาชิกของไฟลัม Chlorobiota (เดิมชื่อ Chlorobi) และจึงเป็นลักษณะเฉพาะของไฟลัมนี้ อินเดลแรกคือการแทรกกรดอะมิโน 28 ตัวใน DNA polymerase III...
ความสัมพันธ์ของ Chlorobiota กับไฟลัม Bacteroidota และ Fibrobacterota
สปีชีส์จาก ไฟลัม Bacteroidota (เดิมชื่อ Bacteroidetes) และ Chlorobiota แยกสาขากันอย่างใกล้ชิดในแผนภูมิวิวัฒนาการ ซึ่งบ่งชี้ถึงความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิด จากการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ พบว่ามีโปรตีน 3 ชนิดที่พบร่วมกันในสมาชิกเกือบทั้งหมดของไฟลัม Bacteroidota และ...
วิวัฒนาการ
อนุกรมวิธานที่ยอมรับในปัจจุบันนั้นอิงตาม รายชื่อชื่อโปรคาริโอตที่มีสถานะในระบบการตั้งชื่อ (LPSN) [ 6 ] และ ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI) [ 7 ]