รายชื่อธงประจำเมืองแสดงธงของเมืองต่างๆธงประจำเมืองส่วนใหญ่จะอิงจากตราประจำ เมือง หรือสัญลักษณ์ของเมืองนั้นๆ และบางครั้งก็อาจใช้ตราประจำเมืองหรือสัญลักษณ์ของเมืองนั้นๆ มาทำเป็นธงด้วยธงประจำเมืองส่วนใหญ่จะถูกชักขึ้นหน้าศาลากลางและสภาเมือง

เนื่องจากรายชื่อมีขนาดใหญ่ จึงถูกแบ่งออกเป็นทวีปต่างๆ :

• รายชื่อธงประจำเมืองต่างๆ ในทวีปแอฟริกา
• รายชื่อธงฐานทัพในทวีปแอนตาร์กติกา
• แกลเลอรี่ภาพธงประจำเมืองต่างๆ ในเอเชีย
• แกลเลอรีธงประจำเมืองต่างๆ ในยุโรป
• แกลเลอรี่ภาพธงประจำเมืองต่างๆ ในทวีปอเมริกาเหนือ
• แกลเลอรีธงประจำเมืองต่างๆ ในโอเชียเนีย
• แกลเลอรี่ภาพธงประจำเมืองต่างๆ ในอเมริกาใต้

เมืองที่มีประชากรในเขตมหานครห้าล้านคนขึ้นไป โดยไม่รวมเมืองขนาดใหญ่ที่สุด ที่ไม่มีธงประจำเมืองของตนเอง

• 
  โตเกียวประเทศญี่ปุ่น
• 
  เดลีประเทศอินเดีย
• 
  เซาเปาโลประเทศบราซิล
• 
  เมืองเม็กซิโกซิตี้ประเทศเม็กซิโก
• 
  โอซาก้าประเทศญี่ปุ่น
• 
  นครนิวยอร์กสหรัฐอเมริกา
• 
  บัวโนสไอเรสประเทศอาร์เจนตินา
• 
  มะนิลาประเทศฟิลิปปินส์
• 
  ริโอเดจาเนโรประเทศบราซิล
• 
  คินชาซาสาธารณรัฐประชาธิปไตยคองโก
• 
  ลอสแอนเจลิสสหรัฐอเมริกา
• 
  มอสโกประเทศรัสเซีย
• 
  ปารีสประเทศฝรั่งเศส
• 
  โบโกตาโคลอมเบีย​
• 
  จาการ์ตาอินโดนีเซีย​
• 
  ลิมาประเทศเปรู
• 
  กรุงเทพฯประเทศไทย​
• 
  โซลประเทศเกาหลีใต้
• 
  นาโกย่าประเทศญี่ปุ่น
• 
  เตหะรานอิหร่าน​
• 
  ชิคาโกสหรัฐอเมริกา​
• 
  กัวลาลัมเปอร์ประเทศมาเลเซีย
• 
  ฮ่องกง
• 
  ซานติอาโกประเทศชิลี
• 
  มาดริดประเทศสเปน
• 
  ฮิวสตันสหรัฐอเมริกา
• 
  ดัลลัสสหรัฐอเมริกา
• 
  โทรอนโตประเทศแคนาดา
• 
  ไมอามีสหรัฐอเมริกา
• 
  เบโลโอริซอนเตประเทศบราซิล
• 
  สิงคโปร์
• 
  ฟิลาเดลเฟียสหรัฐอเมริกา
• 
  แอตแลนตาสหรัฐอเมริกา
• 
  ฟุกุโอกะประเทศญี่ปุ่น
• 
  บาร์เซโลนาประเทศสเปน
• 
  โจฮันเนสเบิร์กประเทศแอฟริกาใต้
• 
  เซนต์ปีเตอร์สเบิร์กประเทศรัสเซีย
• 
  วอชิงตันดี.ซี.สหรัฐอเมริกา
• 
  ย่างกุ้งประเทศเมียนมาร์
• 
  อเล็กซานเดรียประเทศอียิปต์
• 
  กัวดาลาฮาราเม็กซิโก
• 
  ซิดนีย์ประเทศออสเตรเลีย
• 
  เมลเบิร์นประเทศออสเตรเลีย

• ธงของเขตการปกครองย่อยของประเทศ
• แกลเลอรีธงของดินแดนในปกครอง
• ธงฮันเซอติก

วิกิมีเดียคอมมอนส์มีสื่อที่เกี่ยวข้องกับธงของเทศบาลต่างๆ

• ธงประจำเมืองที่ดีที่สุด - WorldAtlas