การจำแนกกลุ่มคนข้ามเพศ (โดยเฉพาะผู้หญิงข้ามเพศ) ออกเป็นกลุ่มต่างๆ นั้น มีความพยายามมาตั้งแต่กลางทศวรรษ 1960 การจำแนกประเภทที่ใช้กันทั่วไปในปัจจุบันคือDSM-5และICDซึ่งส่วนใหญ่ใช้สำหรับการประกันภัยและการบริหารจัดการด้านการดูแลเพื่อยืนยันเพศสภาพ

ในช่วงศตวรรษที่ 20 วงการแพทย์ตะวันตกได้สนับสนุนแนวคิดเรื่องเพศแบบทวิภาคโดยมองว่าชายและหญิงมีความแตกต่างกันโดยธรรมชาติในแง่ของการแสดงออกทางเพศในช่วงเวลานั้น ผู้ที่ถูกกำหนดให้เป็นเพศชายตั้งแต่แรกเกิด (AMAB) และแสดงออกถึงความไม่สอดคล้องทางเพศมักถูกจัดอยู่ในสองกลุ่มย่อย^{[ 1 ]} กลุ่มหนึ่งประกอบด้วยผู้ชายที่แสดง ลักษณะ ความเป็นหญิงตั้งแต่วัยเด็ก พร้อมกับความดึงดูดใจต่อผู้ชายและความปรารถนาที่จะเป็นผู้หญิง กลุ่มนี้ถูกเรียกว่ากลุ่ม ทรานส์เซ็กชวล แบบคลาสสิกประเภทที่ 1หรือ กลุ่มท รานส์เซ็กชวลรัก ร่วมเพศ ^{[ 2 ]} กลุ่มที่สองประกอบด้วยผู้ชายที่มักไม่มีประสบการณ์ในวัยเด็กที่เกี่ยวข้องกับเพศตรงข้ามอย่างชัดเจน มักมีความดึงดูดทางเพศต่อผู้หญิง และแสวงหาการเปลี่ยนเพศในภายหลัง กลุ่มนี้ถูกเรียกว่ากลุ่ม ทรานส์เซ็กชวล แบบไม่คลาสสิกหรือ กลุ่ม ทรานส์เซ็กชวลรักต่างเพศ [ ^{2 ]}และมักถูกอธิบายว่าเป็น กลุ่มทรานส์เว สไทต์ [ ^{1 ] เมื่อ} ไม่นานมานี้ กลุ่มย่อยทั้งสองนี้ถูกเรียกว่ากลุ่ม^แอนโดรฟิลิกและกลุ่มไจนฟิลิกตามลำดับ การจำแนกประเภทอื่นๆ นั้นใช้เกณฑ์ตามอัตลักษณ์ทางเพศ ของบุคคล มากกว่าเพศที่ถูกกำหนดตั้งแต่กำเนิด

สหรัฐอเมริกาได้เห็นแนวโน้มทางสังคมที่เพิ่มขึ้นตั้งแต่ต้นศตวรรษที่ 21 ซึ่งอนุญาตให้มีการแสดงออกถึงอัตลักษณ์ทางเพศของตนเองอย่างไม่เคร่งครัด และบุคคลที่ไม่สอดคล้องกับเพศอาจแสดงออกถึงลักษณะความเป็นชายและหญิงได้หลากหลาย คำว่าทรานส์เจนเดอร์กลายเป็นที่นิยมมากขึ้นส่วนหนึ่งเพื่อสะท้อนถึงความหลากหลายของการแสดงออกทางเพศดังกล่าว^{[ 2 ]}

แฮร์รี่ เบนจามินสร้างมาตราส่วนการวางแนวทางเพศ (SOS) เพื่อจำแนกและทำความเข้าใจรูปแบบและประเภทย่อยต่างๆ ของการแต่งกายข้ามเพศและการแปลงเพศในกลุ่มผู้หญิงข้ามเพศ^{[ 3 ]}เป็นมาตราส่วนเจ็ดจุด โดยมีการแต่งกายข้ามเพศสามประเภท การแปลงเพศสามประเภท และหนึ่งประเภทสำหรับผู้ชายทั่วไป มาตราส่วนของเบนจามินอ้างอิงและใช้มาตราส่วนของคินซีย์ในการแยกแยะระหว่าง "การแปลงเพศที่แท้จริง" และ "การแต่งกายข้ามเพศ"

เบนจามินตั้งข้อสังเกตว่า “ต้องเน้นย้ำอีกครั้งว่าประเภทที่เหลืออีกหกประเภทนั้นไม่สามารถแยกออกจากกันได้อย่างชัดเจน” ^{[ 3 ]}เบนจามินเสริมข้อควรระวังว่า “จุดประสงค์ในที่นี้คือเพื่อชี้ให้เห็นถึงความเป็นไปได้ของแนวคิดและการจำแนกประเภทต่างๆ ของปรากฏการณ์การแต่งกายข้ามเพศและการเปลี่ยนเพศ การศึกษาและการสังเกตในอนาคตอาจตัดสินได้ว่าแนวคิดใดน่าจะใกล้เคียงกับความจริงมากที่สุด และด้วยวิธีนี้อาจได้รับความเข้าใจเกี่ยวกับสาเหตุได้” ^{[ 3 ]}

การจำแนกโรคระหว่างประเทศ (โดยทั่วไปรู้จักกันในชื่อย่อICD ) ตามที่ผู้จัดพิมพ์คือองค์การอนามัยโลกซึ่งได้รับการสนับสนุนจากสหประชาชาติระบุว่าเป็น "เครื่องมือวินิจฉัยมาตรฐานสำหรับระบาดวิทยา การจัดการสุขภาพ และวัตถุประสงค์ทางคลินิก" ^{[ 10 ]}เป็นที่รู้จักกันในชื่อระบบการจำแนกการดูแลสุขภาพที่ให้รหัสเพื่อจำแนกโรคและอาการ สัญญาณ ความผิดปกติ ข้อร้องเรียน สถานการณ์ทางสังคม และสาเหตุภายนอกของการบาดเจ็บหรือโรคต่างๆ มากมาย ภายใต้ระบบนี้ สภาวะสุขภาพแต่ละอย่างสามารถกำหนดให้กับหมวดหมู่เฉพาะและได้รับรหัสที่มีความยาวไม่เกินหกตัวอักษร หมวดหมู่ดังกล่าวสามารถรวมชุดของโรคที่คล้ายคลึงกันได้

การจำแนกโรคระหว่างประเทศ (International Classification of Diseases) จัดพิมพ์โดยองค์การอนามัยโลก (WHO) และใช้ทั่วโลกสำหรับสถิติการเจ็บป่วยและการเสียชีวิต ระบบ การชำระเงินคืนและการสนับสนุนการตัดสินใจอัตโนมัติในด้านการดูแลสุขภาพระบบนี้ได้รับการออกแบบมาเพื่อส่งเสริมความสามารถในการเปรียบเทียบระหว่างประเทศในการรวบรวม การประมวลผล การจำแนก และการนำเสนอสถิติเหล่านี้ ICD เป็นการจำแนกหลักของตระกูลการจำแนกโรคระหว่างประเทศขององค์การอนามัยโลก (WHO-FIC) ^{[ 11 ]}

ICD ได้รับการแก้ไขเป็นระยะ และปัจจุบันอยู่ในการแก้ไขครั้งที่ 11 องค์การอนามัยโลกจะเผยแพร่การอัปเดตย่อยประจำปีและ การอัปเดตหลัก ทุกสามปีของ ICD ^{[ 12 ]}

ทฤษฎีการจำแนกประเภทคนข้ามเพศของแบลนชาร์ด (หรือทฤษฎีออโตไจนฟิเลียของแบลนชาร์ด (BAT) และอนุกรมวิธานของแบลนชาร์ด) เป็นทฤษฎีทางจิตวิทยา เกี่ยวกับ การข้ามเพศจากชายเป็นหญิง ซึ่ง คิดค้นและพัฒนาต่อยอดโดยเรย์ แบลนชาร์ดในช่วงทศวรรษ 1980 และ 1990 โดยต่อยอดจากงานของเพื่อนร่วมงานของเขาเคิร์ ต ฟรอย ด์ แบลนชาร์ดแบ่งคนข้ามเพศจากชายเป็นหญิง (MtF หรือ M2F) ออกเป็นสองกลุ่ม ได้แก่ " คนข้ามเพศรักร่วมเพศ " ซึ่งมีความดึงดูดใจต่อผู้ชาย และ "คนข้ามเพศไม่รักร่วมเพศ" ซึ่ง "มีออโตไจนฟิเลีย" (มีอารมณ์ทางเพศเมื่อนึกถึงหรือเห็นภาพตัวเองเป็นผู้หญิง)

การวิพากษ์วิจารณ์ทางวิทยาศาสตร์เกี่ยวกับงานวิจัยและทฤษฎีนี้มาจากJohn Bancroft , Jaimie Veale , Larry Nuttbrock, Charles Allen Moserและคนอื่นๆ ที่โต้แย้งว่าทฤษฎีนี้เป็นตัวแทนของกลุ่มคนข้ามเพศจากชายเป็นหญิงได้ไม่ดี ลดทอนอัตลักษณ์ทางเพศให้เหลือเพียงเรื่องของความดึงดูดใจ ไม่ให้คำแนะนำที่เป็นประโยชน์ และงานวิจัยที่อ้างถึงเพื่อสนับสนุนทฤษฎีนี้มีกลุ่มควบคุมที่ไม่เพียงพอหรือขัดแย้งกับข้อมูลอื่นๆ ส่วนผู้สนับสนุนทฤษฎีนี้ ได้แก่Anne Lawrence , J. Michael Bailey , James Cantorและคนอื่นๆ ที่โต้แย้งว่ามีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญระหว่างสองกลุ่มนี้ รวมถึงเรื่องเพศวิถี อายุของการเปลี่ยนผ่าน เชื้อชาติ ไอคิว ความชอบทางเพศ และคุณภาพของการปรับตัว

ทฤษฎีนี้เป็นประเด็นของการประท้วงในชุมชนคนข้ามเพศ แม้ว่าจะมีผู้สนับสนุนอยู่บ้างก็ตาม ปัญหาเกี่ยวกับงานของแบลนชาร์ดกลับมาเป็นประเด็นของการวิพากษ์วิจารณ์อีกครั้งเมื่อเบลีย์ตีพิมพ์หนังสือThe Man Who Would Be Queenในปี 2546 ในปี 2548 แบลนชาร์ดได้แสดงท่าทีห่างเหินจากการยืนยันของเบลีย์เกี่ยวกับความแน่นอนทางวิทยาศาสตร์ของสาเหตุ โดยระบุว่าจำเป็นต้องมีการวิจัยเพิ่มเติมก่อนที่จะสามารถพิสูจน์ความแน่นอนดังกล่าวได้อย่างเพียงพอ^{[ 19 ]}

การทบทวนในปี 2016 พบว่ามีหลักฐานสนับสนุนการคาดการณ์ของ Blanchard ที่ว่าผู้หญิงข้ามเพศที่ชอบผู้ชายและผู้หญิงข้ามเพศที่ชอบผู้ชายมีลักษณะ ทางสมองที่แตกต่างกัน โดยระบุว่าถึงแม้James Cantorดูเหมือนจะถูกต้องที่ว่าการคาดการณ์ของ Blanchard ได้รับการตรวจสอบโดย การศึกษา ทางประสาทวิทยาเชิง โครงสร้างอิสระสอง การศึกษา แต่ “ยังคงมีการศึกษาเพียงการศึกษาเดียวเกี่ยวกับผู้หญิงข้ามเพศที่ไม่รักร่วมเพศ เพื่อยืนยันสมมติฐานอย่างสมบูรณ์ จำเป็นต้องมีการศึกษาอิสระเพิ่มเติมเกี่ยวกับผู้หญิงข้ามเพศที่ไม่รักร่วมเพศ การตรวจสอบสมมติฐานที่ดีกว่ามากสามารถทำได้โดยการศึกษาที่ออกแบบมาโดยเฉพาะซึ่งรวมถึงผู้หญิงข้ามเพศที่เป็นรักร่วมเพศและไม่รักร่วมเพศ” การทบทวนระบุว่า “การยืนยันการคาดการณ์ของ Blanchard ยังคงต้องการการเปรียบเทียบที่ออกแบบมาโดยเฉพาะระหว่างผู้หญิงข้ามเพศที่เป็นรักร่วมเพศ ชายรักร่วมเพศ และชายและหญิงรักต่างเพศ” ^{[ 20 ]}