คลอสทริดิเอซี
| คลอสทริดิเอซี | |
|---|---|
 | |
| ภาพถ่ายจุลทรรศน์ของ แบคทีเรีย Clostridium botulinumที่ย้อมด้วยคริสตัลไวโอเลต | |
การจำแนกทางวิทยาศาสตร์ | |
| โดเมน: | แบคทีเรีย |
| อาณาจักร: | แบคซิลลาติ |
| ไฟลัม: | บาซิลโลต้า |
| ระดับ: | คลอสทริเดีย |
| คำสั่ง: | ยูแบคทีเรียลส์ |
| ตระกูล: | Clostridiaceae Pribram 1933 [ 1 ] |
| ยีน | |
ดูข้อความ | |
| คำพ้องความหมาย | |
| |
วงศ์Clostridiaceaeเป็นวงศ์หนึ่งของแบคทีเรีย ใน ชั้นClostridiaและประกอบด้วยสกุลClostridium
วงศ์ Clostridiaceae (ชื่อวิทยาศาสตร์) ที่กำหนดโดยโครงร่างอนุกรมวิธานของคู่มือ Bergey's Manual of Systematic Bacteriology นั้น ประกอบด้วยสกุลหลักคือClostridium ( sensu stricto ) รวมถึงสกุล Acetivibrio , Acidaminobacter , Alkaliphilus , Anaerobacter , Caloramator , Caloranaerobacter , Coprobacillus , Dorea , Natronincola , Oxobacter , Sarcina , Sporobacter , Thermobrachium , ThermohalobacterและTindalliaการรวมสกุลเพิ่มเติมเหล่านี้ (ดังที่เห็นทางด้านขวา) เข้าไว้ในวงศ์ Clostridiaceae นั้น ส่วนใหญ่เป็นเพราะชนิดต้นแบบ ของสกุลเหล่านี้ในหลายกรณีมีความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการกับชนิดที่ถูก จัดจำแนกผิดพลาดของสกุลClostridiumอย่างไรก็ตาม ยกเว้นAnaerobacter , Caloramator , Oxobacter , SarcinaและThermobrachiumแล้ว สกุลเหล่านี้อยู่นอกเหนือการวิวัฒนาการของวงศ์ Clostridiaceae ที่แท้จริง และปัจจุบันถูกจัดอยู่ในวงศ์อื่น ๆ ภายในไฟลัมแกรมบวกที่มีปริมาณ G + C ต่ำ
การจำแนกประเภทผิดพลาดนี้เป็นผลมาจากปัญหาที่ทราบกันดีของโครงสร้างอนุกรมวิธานปัจจุบันของสกุลClostridium แบบดั้งเดิม การวิเคราะห์ทางวิวัฒนาการของ Collins (1994) เป็นการเปรียบเทียบขนาดใหญ่ครั้งแรกของลำดับยีน 16S rRNA ของสปีชีส์ในสกุลClostridiumและกลุ่มอนุกรมวิธานที่เกี่ยวข้อง ข้อเท็จจริงที่ว่าสปีชีส์ในสกุลClostridiumไม่ได้ก่อตัวเป็นกลุ่มโมโนฟิเลติกได้รับการแสดงให้เห็นในการศึกษาหลายครั้งที่เปรียบเทียบกลุ่มเล็กๆ ของ สปีชีส์ Clostridiumมาตั้งแต่ปี 1981 การศึกษาเปรียบเทียบของ Collins (1994) และการศึกษาที่ตามมาสามารถสรุปได้ว่ามากกว่าครึ่งหนึ่งของสปีชีส์ที่ปัจจุบันถูกกำหนดให้กับสกุลนี้ แท้จริงแล้วไม่ได้มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับสปีชีส์ต้นแบบC. butyricumและจากมุมมองทางวิวัฒนาการไม่ควรถูกรวมอยู่ในสกุลClostridium ที่กำหนดขึ้นใหม่ [ 2 ]
ความหลากหลายทางพันธุกรรมที่กว้างขวางของสกุลClostridium นี้ ได้รับการแสดงให้เห็นแล้วโดยใช้ การศึกษาการผสมพันธุ์ 23S rRNA :DNA ในปี 1975 โดย Johnson และ Francis แต่แนวทางการวิเคราะห์ลำดับยีน 16S rRNA ได้เปิดเผยความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการที่แท้จริงระหว่างสปีชีส์ในสกุลนี้กับสกุลอื่นๆ
ปัจจุบันสกุลClostridium ประกอบด้วยสปีชีส์ที่ได้รับการอธิบายอย่างถูกต้องในระบบการตั้งชื่อจำนวน 152 สปีชีส์ [ 3 ] อย่างไรก็ตาม จากการวิเคราะห์ลำดับยีน 16S rRNA พบว่ามีเพียง 73 สปีชีส์เท่านั้นที่อยู่ในกลุ่มส ปีชีส์ต้นแบบของสกุลClostridium
การแบ่งย่อย
วงศ์Clostridiaceae ซึ่งเป็นวงศ์ที่มีบรรพบุรุษร่วมกันหลายสายประกอบด้วยพืชดังต่อไปนี้:
| LPSN [ 4 ]และNCBI [ 5 ] | LTP _10_2024 ที่ใช้ 16S rRNA [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]และGTDB 09-RS220 ที่ใช้โปรตีนมาร์กเกอร์ 120 ตัว [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] |
|---|---|
|
|
วิวัฒนาการ
อนุกรมวิธานที่ยอมรับในปัจจุบันนั้นอิงตามรายชื่อชื่อโปรคาริโอตที่มีสถานะในระบบการตั้งชื่อ (LPSN) [ 4 ]และศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI) [ 5 ]
| LTPที่ใช้ 16S rRNA _10_2024 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | โปรตีนเครื่องหมาย 120 ตัวตามGTDB 09-RS220 [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|