ไวรัสครินิ
Crinivirusซึ่งเดิมเรียกว่ากลุ่มไวรัสโรคใบเหลืองติดเชื้อในผักกาดหอมเป็นสกุลของไวรัสในวงศ์ Closteroviridae [ 1 ] พวกมันเป็น ไวรัส RNAสายเดี่ยวเชิงเส้นที่มีทิศทางบวก(และจึงจัดอยู่ในกลุ่ม IV ) [ 2 ]มี 19 สปีชีส์ในสกุลนี้ [ 1 ] [ 3 ]โรคที่เกี่ยวข้องกับสกุลนี้ ได้แก่ โรคใบเหลืองและเนื้อตาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ส่งผลกระทบต่อท่อลำเลียงอาหาร [ 1 ] [ 4 ]
ตัวอย่างของสายพันธุ์ที่มีการจัดลำดับจีโนม ทั้งหมด และปัจจุบันถูกจัดอยู่ในสกุลนี้ ได้แก่ ไวรัสโรคใบเหลืองในมันเทศ (SPCSV) และไวรัสโรคใบเหลืองติดเชื้อในผักกาดหอม (LIYV) [ 5 ] [ 6 ]
พันธุศาสตร์
ไวรัสในสกุลนี้มีจีโนมแบบแบ่งส่วนสองส่วนซึ่งมีความยาว รวมกัน 7,500–19,500 นิว คลีโอไทด์ จีโนมของพวกมันยังเข้ารหัส โปรตีนที่ไม่เป็นส่วนหนึ่งของอนุภาคไวริออน รวมถึงโปรตีนโครงสร้างด้วย ฐานข้อมูลไวรัสสากลอธิบายว่าลำดับจีโนมของพวกมันใกล้กับปลาย 3' สามารถสร้างโครงสร้างแฮร์พินลูปได้ และเชื่อว่าปลาย 5' อาจมีหมวกเมทิลเลต[ 6 ]โมเลกุล RNA ของไวรัสแต่ละโมเลกุลประกอบด้วยโครงสร้างแฮร์พินสี่โครงสร้างและซูโดน็อตใน3'UTRซูโดน็อตนั้นผิดปกติตรงที่มันมี โครงสร้าง ก้านลูปขนาด เล็ก อยู่ภายในลูป L1 [ 7 ]ในสกุลClosterovirus ที่เกี่ยวข้อง พบว่าโครงสร้างทุติยภูมิเหล่านี้มีความสำคัญในการจำลองแบบ RNA ของไวรัส[ 8 ]
โครงสร้าง
ไวรัสในสกุลCrinivirusไม่มีเปลือกหุ้ม มีโครงสร้างเป็นเส้นใยแบบสองส่วน เส้นผ่านศูนย์กลางประมาณ 10-13 นาโนเมตร ความยาว 700-900 นาโนเมตร จีโนมเป็นแบบเส้นตรงและสองส่วน ความยาวประมาณ 17.6 กิโลเบส[ 1 ] [ 4 ]
| ประเภท | โครงสร้าง | สมมาตร | แคปซิด | การจัดเรียงจีโนม | การแบ่งส่วนจีโนม |
|---|---|---|---|---|---|
| ไวรัสครินิ | เส้นใย | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | โมโนพาร์ไทต์ ไบพาร์ไทต์ หรือ ไตรพาร์ไทต์ |
วงจรชีวิต
การจำลองแบบของไวรัสเกิดขึ้นในไซโตพลาสซึม การเข้าสู่เซลล์เจ้าบ้านเกิดขึ้นโดยการเจาะเข้าไปในเซลล์เจ้าบ้าน การจำลองแบบเป็นไปตามแบบจำลองการจำลองแบบของไวรัส RNA สายบวก การถอดรหัสของไวรัส RNA สายบวกเป็นวิธีการถอดรหัส ไวรัสออกจากเซลล์เจ้าบ้านโดยการเคลื่อนที่ของไวรัสที่นำทางด้วยท่อ พืชทำหน้าที่เป็นเจ้าบ้านตามธรรมชาติ ไวรัสถูกส่งผ่านโดยพาหะ (แมลงหวี่ขาว) เส้นทางการส่งผ่านเป็นแบบกลไก[ 1 ] [ 4 ]
| ประเภท | รายละเอียดโฮสต์ | การมุ่งเป้าไปยังเนื้อเยื่อ | รายละเอียดการลงทะเบียน | รายละเอียดการเผยแพร่ | ไซต์จำลอง | สถานที่ประกอบการ | การแพร่เชื้อ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ไวรัสครินิ | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | การฉีดวัคซีนทางกล: แมลง (เพลี้ยขาว) |
อนุกรมวิธาน
สายพันธุ์ต่อไปนี้ได้รับการกำหนดให้เป็นสกุล โดยระบุตามชื่อวิทยาศาสตร์และตามด้วยไวรัสตัวอย่างของสายพันธุ์: [ 3 ]
- Crinivirus abutilonis , ไวรัส Abutilon สีเหลือง
- Crinivirus arracaciae , Arracacha ไวรัสแฝง C
- Crinivirus chelidonii , ไวรัสที่ทำให้เกิดอาการใบเหลืองในพืชตระกูล Tetterwort
- Crinivirus contagichlorosis , ไวรัสโรคใบเหลืองติดเชื้อในมะเขือเทศ
- Crinivirus cucurbitae , ไวรัสโรคต้นเหลืองแคระแกร็นในพืชตระกูลแตง
- Crinivirus diodiae , ไวรัสโรคใบเหลืองในลำต้นของต้น Diodia
- Crinivirus dioscoreae , ไวรัสเผือก 1
- Crinivirus flavibetae , ไวรัสโรคใบเหลืองในถั่ว
- Crinivirus flavisolani , ไวรัสหลอดเลือดดำมันฝรั่งสีเหลือง
- Crinivirus ipomeae , ไวรัสโรคใบเหลืองในมันเทศ
- Crinivirus kurdistanfragariae , ไวรัสสตรอว์เบอร์รีแห่งเคอร์ดิสถาน
- Crinivirus lactucachlorosi , ไวรัสโรคใบเหลืองในผักกาดหอม
- Crinivirus lactucaflaviหรือไวรัสโรคใบเหลืองติดเชื้อในผักกาดหอม
- Crinivirus mori , ไวรัสครินิไวรัสในหม่อน
- Crinivirus palidofragariae , ไวรัสที่เกี่ยวข้องกับโรคสตรอว์เบอร์รีพัลลิโดซิส
- Crinivirus papyriferae , ไวรัสครินิไวรัสของต้นหม่อนกระดาษ 1
- Crinivirus pseudobetae , ไวรัสโรคใบเหลืองในบีทรูท
- Crinivirus rubi , ไวรัสที่เกี่ยวข้องกับเส้นใบสีเหลืองของแบล็กเบอร์รี่
- Crinivirus tomatichlorosis , ไวรัสที่ทำให้เกิดโรคใบเหลืองในมะเขือเทศ
ลิงก์ภายนอก
- รายงาน ICTV : Closteroviridae
- ไวรัลโซน : ครินิไวรัส
- รายการ Rfam สำหรับ pseudoknot ปลาย 3' ใน SPCSV
- ข้อมูล Rfam สำหรับ pseudoknot ปลาย 3' ของ CuYV/BPYV
- รายการ Rfam สำหรับ pseudoknot ปลาย 3' ใน PYVV