ดีดีเอ็กซ์20 โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 2OXC , 3B7G
ตัวระบุ ชื่อเรียกอื่น DDX20 , DP103, GEMIN3, DEAD-box helicase 20รหัสภายนอก โอมิม : 606168 ; เอ็มจีไอ : 1858415 ; โฮโมโลยีน : 5214 ; การ์ดยีน : DDX20 ; OMA : DDX20 - ออโธล็อกการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก)สูงสุดที่แสดงใน อสุจิ อัณฑะซ้าย อัณฑะข้างขวา กล้ามเนื้อทิบิอาลิสแอนทีเรียร์ โอโอไซต์รอง อัณฑะ ต่อมเพศ เซลล์เยื่อบุผิวตับอ่อน เยื่อบุลำไส้เล็กส่วนปลาย กล้ามเนื้อเดลทอยด์
สูงสุดที่แสดงใน แผ่นเนื้อเยื่อหู ถุงน้ำในหู ถุงน้ำ สเปิร์มมาติด ท่อสร้างอสุจิ เซลล์สเปิร์ม เอพิบลาสต์ ปุ่มอวัยวะเพศ ความนูนของขากรรไกรบน ความนูนของขากรรไกรล่าง
ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ไบโอจีพีเอส ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับ DNA กิจกรรมตัวเชื่อมต่อโปรตีน-โมเลกุลขนาดใหญ่ การจับนิวคลีโอไทด์ กิจกรรมเฮลิเคส การจับจำเพาะของโดเมนโปรตีน การจับกับฮิสโตนดีอะเซทิเลส การจับโปรตีน การจับกรดนิวคลีอิก กิจกรรมไฮโดรเลส การจับกับ ATP ส่วนประกอบของเซลล์ โปรตีนคอมเพล็กซ์ SMN-Sm ไซโตซอล เมมเบรน คอมเพล็กซ์ยับยั้งการถอดรหัส นิวคลีโอพลาสม์ คอมเพล็กซ์ SMN คอมเพล็กซ์ยับยั้งการถอดรหัสของ RNA polymerase II โครงสร้างเซลล์ นิวเคลียส ราศีเมถุนแห่งร่างกายที่ขดตัว ไซโตพลาซึม นิวเคลียร์บอดี้ นิวคลีโอลัส กระบวนการทางชีวภาพ กระบวนการประมวลผล RNA การประกอบคอมเพล็กซ์ไตร-snRNP ของสไปโซโซม กระบวนการประมวลผล mRNA การควบคุมกระบวนการสังเคราะห์สเตียรอยด์ การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดย RNA polymerase II กระบวนการสร้างไข่ การประกอบ snRNP ของสไปโซโซม การคลายโครงสร้างทุติยภูมิของ RNA การตัดต่ออาร์เอ็นเอ การควบคุมเชิงบวกของกระบวนการอะพอพโทซิส การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การควบคุมเชิงลบของการเพิ่มจำนวนประชากรเซลล์ นำเข้าสู่นิวเคลียส แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
วิกิดาต้า
เฮลิเคส RNA ที่ขึ้นอยู่กับ ATP ที่น่าจะเป็นไปได้ DDX20 หรือที่รู้จักกันในชื่อDEAD-box helicase 20 และโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับ gem 3 ( GEMIN3 ) เป็นเอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน DDX20 [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน โปรตีน DEAD box ซึ่งมีลักษณะเฉพาะด้วยโมทิฟอนุรักษ์ Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) เป็นเฮลิเคส RNA ที่สันนิษฐานได้ โปรตีน เหล่านี้มีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการของเซลล์หลายอย่างที่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างทุติยภูมิของ RNA เช่น การเริ่มต้นการแปล การตัดต่อในนิวเคลียสและไมโทคอนเดรีย และ การประกอบไร โบโซม และสไปโซโซม จากรูปแบบการกระจายตัว เชื่อกันว่าสมาชิกบางส่วนของตระกูลนี้มีส่วนเกี่ยวข้องกับการเกิดตัวอ่อน การ สร้าง สเปิร์ม และการเจริญเติบโตและการแบ่งเซลล์ ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีน DEAD box ซึ่งมี กิจกรรม ATPase และเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์การอยู่รอดของเซลล์ประสาท สั่งการ (SMN) [ 6 ] [ 6 ]
ความสำคัญทางคลินิก งานวิจัยก่อนหน้านี้ได้เปิดเผยว่า DDX20 อาจทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งเนื้องอกในมะเร็งตับ และเป็น ตัวส่งเสริม เนื้องอก ในมะเร็งเต้านม การขาด DDX20 จะเพิ่ม กิจกรรม ของ NF-κB โดยทำให้การยับยั้ง NF-κB ของไมโครอาร์เอ็น เอบกพร่อง และชี้ให้เห็นว่าการควบคุมที่ผิดปกติของส่วนประกอบของกลไกไมโครอาร์เอ็นเออาจเกี่ยวข้องกับการเกิดโรคในโรคต่างๆ ของมนุษย์[ 7 ] [ 8 ] มะเร็งต่อมลูกหมาก (PCa) ผ่านทางเส้นทาง NF-κB [ 9 ] เคมีบำบัด ทำให้ DP103 มีศักยภาพเป็นเป้าหมายในการรักษาโรคมะเร็งเต้านม[ 10 ]
ปฏิสัมพันธ์ จากการศึกษาพบว่า DDX20 มีปฏิกิริยา กับสารดังต่อไปนี้:
EIF2C2 , [ 11 ] [ 12 ] GEMIN4 , [ 11 ] [ 13 ] GEMIN5 , [ 11 ] [ 14 ] LSM2 , [ 15 ] SMN1 , [ 11 ] [ 15 ] [ 16 ] SNRPB , [ 15 ] SNRPD3 [ 15 ] SNRPG , [ 15 ] SNRPD1 , [ 15 ] SNRPD2 , [ 15 ] SNRPE , [ 15 ] SNRPF , [ 15 ] SIP1 . [ 11 ] [ 15 ]
อ่านเพิ่มเติม Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (เมษายน 1996). "วิธีการ "อะแดปเตอร์คู่" สำหรับการสร้างไลบรารีช็อตกันที่ดีขึ้น" Analytical Biochemistry . 236 (1): 107– 113. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 . Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W และ คณะ (เมษายน 1997). "การจัดลำดับ cDNA แบบต่อกันขนาดใหญ่" . Genome Research . 7 (4): 353– 358. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 . Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (ธันวาคม 1999). "Gemin3: โปรตีน DEAD box ชนิดใหม่ที่โต้ตอบกับ SMN ซึ่งเป็นผลิตภัณฑ์ยีนของโรคกล้ามเนื้อฝ่อไขสันหลัง และเป็นส่วนประกอบของ gems"วารสารชีววิทยาของเซลล์ 147 ( 6): 1181– 1194. doi : 10.1083/jcb.147.6.1181 . PMC 2168095 . PMID 10601333 . Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Yong J, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (มีนาคม 2000). "Gemin4. ส่วนประกอบใหม่ของคอมเพล็กซ์ SMN ที่พบได้ทั้งใน gems และนิวคลีโอไล"วารสารชีววิทยาของเซลล์ 148 ( 6): 1177– 1186. doi : 10.1083/jcb.148.6.1177 . PMC 2174312 . PMID 10725331 . Meister G, Bühler D, Laggerbauer B, Zobawa M, Lottspeich F, Fischer U (สิงหาคม 2000). "การจำแนกลักษณะของคอมเพล็กซ์นิวเคลียร์ 20S ที่มีโปรตีนการอยู่รอดของเซลล์ประสาทสั่งการ (SMN) และโปรตีน Sm ของสไปโซโซมกลุ่มย่อยเฉพาะ" Human Molecular Genetics . 9 (13): 1977– 1986. doi : 10.1093/hmg/9.13.1977 . PMID 10942426 . Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (มกราคม 2544). "ปฏิสัมพันธ์เชิงหน้าที่ระหว่างคอมเพล็กซ์มอเตอร์นิวรอนเพื่อการอยู่รอดและ RNA polymerase II"วารสารชีววิทยาของเซลล์ 152 ( 1): 75– 85. doi : 10.1083/jcb.152.1.75 . PMC 2193649 . PMID 11149922 . Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A, Massenet S, Pesiridis GS, Van Duyne G และ คณะ (ธันวาคม 2001) "เมทิลโลโซม ซึ่งเป็นคอมเพล็กซ์ 20S ที่ประกอบด้วย JBP1 และ pICln ผลิตโปรตีน Sm ที่ถูกดัดแปลงด้วยไดเมทิลอาร์จินีน"ชีววิทยาโมเลกุลและเซลล์ 21 (24): 8289– 8300. doi : 10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001 . PMC 99994 . PMID 11713266 . Gubitz AK, Mourelatos Z, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (กุมภาพันธ์ 2545). " Gemin5 โปรตีนองค์ประกอบ WD repeat ใหม่ของคอมเพล็กซ์ SMN ที่จับกับโปรตีน Sm"วารสารชีวเคมี 277 (7): 5631– 5636. doi : 10.1074/jbc.M109448200 . PMID 11714716 . Pellizzoni L, Baccon J, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (มีนาคม 2545). "การทำให้บริสุทธิ์ของคอมเพล็กซ์การอยู่รอดของเซลล์ประสาทสั่งการตามธรรมชาติและการระบุ Gemin6 เป็นส่วนประกอบใหม่"วารสารเคมีชีวภาพ 277 ( 9): 7540– 7545. doi : 10.1074/jbc.M110141200 . PMID 11748230 . Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L และ คณะ (มีนาคม 2545) "miRNPs: ไรโบนิวคลีโอโปรตีนชนิดใหม่ที่มีไมโครอาร์เอ็นเอจำนวนมาก" Genes & Development 16 ( 6): 720– 728. doi : 10.1101/gad.974702 . PMC 155365 . PMID 11914277 . Klappacher GW, Lunyak VV, Sykes DB, Sawka-Verhelle D, Sage J, Brard G และ คณะ (เมษายน 2545) "คอมเพล็กซ์ยับยั้ง Ets ที่ถูกเหนี่ยวนำควบคุมการหยุดการเจริญเติบโตในระหว่างการแยกตัวของแมโครฟาจขั้นสุดท้าย" เซลล์ 109 ( 2 ) : 169– 180. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00714-6 . PMID 12007404 . S2CID 16359491 . Baccon J, Pellizzoni L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (สิงหาคม 2545). "การระบุและลักษณะเฉพาะของ Gemin7 ซึ่งเป็นส่วนประกอบใหม่ของกลุ่มเซลล์ประสาทสั่งการที่อยู่รอด"วารสารเคมีชีวภาพ 277 ( 35): 31957– 31962. doi : 10.1074/jbc.M203478200 . PMID 12065586 . Narayanan U, Ospina JK, Frey MR, Hebert MD, Matera AG (กรกฎาคม 2545). "SMN โปรตีนโรคกล้ามเนื้อฝ่อไขสันหลัง สร้างคอมเพล็กซ์ snRNP ก่อนนำเข้ากับ snurportin1 และ importin beta" Human Molecular Genetics . 11 (15): 1785– 1795. doi : 10.1093/hmg/11.15.1785 . PMC 1630493 . PMID 12095920 . Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (มกราคม 2547). "การวิเคราะห์ระบบยีสต์ทูไฮบริดแบบความเร็วสูงและการใช้เพื่อทำนายหน้าที่ของโปรตีนภายในเซลล์ที่เข้ารหัสภายในบริเวณ MHC คลาส III ของมนุษย์" Genomics . 83 (1): 153– 167. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 . Nelson PT, Hatzigeorgiou AG, Mourelatos Z (มีนาคม 2547) "การเชื่อมโยง miRNP:mRNA ในโพลีไรโบโซมในเส้นเซลล์ประสาทของมนุษย์ " อาร์เอ็น เอ10 (3): 387– 394. ดอย : 10.1261 / rna.5181104 PMC 1370934 . PMID14970384 . Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J และ คณะ (สิงหาคม 2547). "การศึกษาลักษณะเฉพาะของโปรตีนฟอสโฟในนิวเคลียสของเซลล์ HeLa ในวงกว้าง" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130– 12135. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/ pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 . 
