อ่าน 9 นาที
ดีเอ็นเอ ไมโอติก รีคอมบิเนส 1
โปรตีน DMC1/LIM15 homolog ของการรวมตัวใหม่ของไมโอซิสเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนDMC1 โฮโมล็อกของ DMC1 มีการอนุรักษ์ไว้อย่างดีและพบได้ในสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกันหลายชนิด...
ดีเอ็นเอ ไมโอติก รีคอมบิเนส 1
| ดีเอ็มซี1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | DMC1 , DMC1H, LIM15, dJ199H16.1, ดีเอ็นเอ ไมโอติก รีคอมบิเนส 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 602721 ; เอ็มจีไอ : 105393 ; โฮโมโลยีน : 5135 ; GeneCards : DMC1 ; OMA : DMC1 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
โปรตีน DMC1/LIM15 homolog ของการรวมตัวใหม่ของไมโอซิสเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนDMC1 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]โฮโมล็อกของ DMC1 มีการอนุรักษ์ไว้อย่างดีและพบได้ในสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกันหลายชนิด รวมถึงเชื้อรา พืช และสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม รวมถึงมนุษย์[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
โปรตีน Dmc1 ซึ่งเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการรวมตัวกันใหม่ของโครโมโซมในระยะไมโอซิส เป็นโปรตีนที่มีโครงสร้างคล้ายคลึงกับโปรตีนRecA ซึ่งเป็นโปรตีนที่ทำหน้าที่แลกเปลี่ยนสาย ดีเอ็นเอในแบคทีเรีย Dmc1 มีบทบาทสำคัญใน การรวมตัวกันใหม่ของโครโมโซมแบบโฮ โมล็อกในระยะไมโอซิส โดยจะไปรวมตัวกันที่ตำแหน่งของการแตกของสายดีเอ็นเอคู่ตามโปรแกรมและทำการค้นหาลำดับดีเอ็นเออัลลีลที่อยู่บนโครมาทิด แบบโฮ โมล็อก ชื่อ "Dmc" ย่อมาจาก "disrupted meiotic cDNA" ซึ่งหมายถึงวิธีการที่ใช้ในการค้นพบ โดยใช้โคลนจากคลัง cDNA เฉพาะสำหรับไมโอซิสเพื่อสร้างการกลายพันธุ์แบบน็อกเอาต์ของยีนไมโอซิสที่มีการแสดงออกอย่างมากมาย
โปรตีน Dmc1 เป็นหนึ่งในสองโฮโมล็อกของ RecA ที่พบในเซลล์ยูคาริโอต อีกตัวหนึ่งคือRad51 DMC1 และ RAD51 มีความคล้ายคลึงกันของกรดอะมิโนมากกว่า 50% [ 9 ] ในยีสต์ที่กำลังแตกหน่อ Rad51 ทำหน้าที่เป็นโปรตีนแลกเปลี่ยนสายในไมโทซิส ซึ่งมีความสำคัญต่อการซ่อมแซม DNA ที่แตกหัก Rad51 จะถูกเปลี่ยนเป็นปัจจัยเสริมสำหรับ Dmc1 ในระหว่างไมโอซิสโดยการยับยั้งกิจกรรมการแลกเปลี่ยนสาย[ 10 ]
การค้นพบ
ยีนและโปรตีน DMC1 ถูกค้นพบในยีสต์ S. cerevisiae โดยDouglas Bishopในปี 1992 ขณะที่เขาเป็นนักวิจัยหลังปริญญาเอกในห้องปฏิบัติการของNancy Klecknerที่มหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ด[ 11 ]
โครงสร้าง
DMC1 ของมนุษย์เป็นโฮโมมัลติเมอร์ในรูปของวงแหวนแปดเหลี่ยมที่มีเส้นผ่านศูนย์กลาง 140 Å และมีรูตรงกลางขนาด 45 Å [ 12 ] [ 9 ] DMC1 จับกับ ssDNA ได้ดีกว่า dsDNA [ 12 ]แตกต่างจาก RecA และ Rad51 DMC1 ดูเหมือนจะไม่สร้างเส้นใยเกลียวบน DNA แต่จะสร้างวงแหวนโดยมี DNA ผ่านตรงกลาง[ 12 ] hDMC1 สามารถสร้าง D-loop ใน DNA ที่มีเกลียวมากได้[ 13 ] DMC1 มีกิจกรรม ATPase ที่อ่อนแอและสามารถส่งเสริมการสร้างเฮเทอโรดูเพล็กซ์ในที่ที่มีอะนาล็อกของ ATP ที่ไม่สามารถไฮโดรไลซ์ได้ ซึ่งบ่งชี้ถึงความต้องการการจับ ATP มากกว่า การไฮโดรไล ซ์ATP [ 14 ] DMC1 ยังแสดง การ จับกับนิวคลีโอโซมที่มีหางฮิสโตนที่ถูกกำจัดออกไปได้ดี ขึ้นซึ่งบ่งชี้ว่าสถาปัตยกรรมของโครโมโซมอาจมีบทบาทในการจับของ DMC1 แต่ไม่ใช่ Rad51 [ 15 ]
การทำงาน
โปรตีนที่ถูกเข้ารหัสโดยยีนนี้มีความสำคัญต่อการเกิดการรวมตัวกันใหม่ของโครโมโซมคู่เหมือนในระยะไมโอ ซิส การรวมตัวกันใหม่ของยีนในระยะไมโอซิสมีบทบาทสำคัญในการสร้างความหลากหลายของข้อมูลทางพันธุกรรม และช่วยให้เกิดการแยกตัวของโครโมโซมแบบลดจำนวน ซึ่งจำเป็นต้องเกิดขึ้นเพื่อการสร้างเซลล์สืบพันธุ์ในระหว่างการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศ
ในระหว่างการแบ่งเซลล์แบบไมโอซิส เอนไซม์Spo11 ที่มีลักษณะคล้ายโทโปไอโซเมอเรสจะสร้างการแตกของสายดีเอ็นเอสองสาย (DSBs) ตามโปรแกรม DSBs จะถูกขยายให้ยาวขึ้นโดยการทำงานของเอ็กโซนิวคลีเอสในการตัดปลาย 5' และสร้างสายดีเอ็นเอเดี่ยว (ssDNA) ยาวที่ปลาย 3' ส่วนที่ยื่นออกมาที่ปลาย 3' เหล่านี้จะถูกทำให้เสถียรโดยโปรตีนที่จับกับสายเดี่ยว (SSBs) เพื่อปกป้อง ssDNA และป้องกันการก่อตัวของโครงสร้างทุติยภูมิ DMC1 จะถูกบรรจุลงบน ssDNA ที่ปลาย 3' เพื่อสร้างเส้นใยโปรตีนนิวคลีโอโปรตีนแบบเกลียวขวา จากนั้น เส้นใยโปรตีนนิวคลีโอโปรตีนนี้จะทำการค้นหาความเหมือนกันในบริเวณดีเอ็นเอที่เหมือนกัน การบุกรุกของสายเดี่ยวในบริเวณที่เสริมกันในโครโมโซมที่เหมือนกันโดยสายดีเอ็นเอที่ปลาย 3' จะสร้างเฮเทอโรดูเพล็กซ์ในรูปแบบของลูปการแทนที่ (D-loop) D-Loop นี้จะขยายออกไปเมื่อเกิดการสังเคราะห์ซ่อมแซม DNA ทำให้เกิดHoliday junctionการแก้ไข Holiday junction นี้ส่งผลให้เกิดผลิตภัณฑ์แบบครอสโอเวอร์หรือไม่ครอสโอเวอร์[ 16 ]ผลิตภัณฑ์แบบครอสโอเวอร์จะถูกสร้างขึ้นในปริมาณที่น้อยกว่าผลิตภัณฑ์แบบไม่ครอสโอเวอร์[ 17 ]
เช่นเดียวกับสมาชิกอื่นๆ ในตระกูล Rad51/RecA โปรตีน Dmc1 ทำหน้าที่ทำให้ตัวกลางการแลกเปลี่ยนสาย (Rad1/RecA-stretched DNA หรือ RS-DNA) มีเสถียรภาพในรูปแบบสามนิวคลีโอไทด์ที่ยืดออกคล้ายกับ DNA รูปแบบ B แต่ละโมเลกุลของโปรตีนจะจับกับนิวคลีโอไทด์สามตัว และความแข็งแรงของการจับนั้น ซึ่งประเมินได้จากการเปลี่ยนแปลงของพลังงานอิสระของกิบส์สามารถประเมินได้จากระยะเวลาที่โพรบ dsDNA ที่ติดฉลากซึ่งมีลำดับโฮโมล็อกสั้นๆ ยังคงจับกับ DNA ที่มีบริเวณโฮโมล็อกสั้นๆ การศึกษาประเภทนี้แสดงให้เห็นว่า ความไม่ตรงกันในตำแหน่งใดๆ ในสามตำแหน่งที่ปลายของช่วงโฮโมล็อกจะไม่เพิ่มระยะเวลาที่โพรบยังคงจับอยู่ และในโครงสร้าง Rad51 หรือ RecA ความไม่ตรงกันภายในจะทำให้เวลาในการจับลดลงในลักษณะเดียวกัน เอนไซม์ทั้งหมดสามารถ "ข้ามผ่าน" ความไม่ตรงกันและจับโพรบได้แน่นขึ้นหากมีบริเวณโฮโมล็อกที่ยาวกว่าอยู่ อย่างไรก็ตาม สำหรับ Dmc1 ทริปเล็ตที่มีความไม่ตรงกันภายในเพียงหนึ่งตำแหน่ง (แต่ไม่ใช่ตำแหน่งปลาย) จะช่วยเพิ่มความเสถียรของการจับโพรบได้ในระดับเดียวกับที่ไม่มีความไม่ตรงกัน ด้วยวิธีนี้ Dmc1 จึงเหมาะสมเป็นพิเศษกับบทบาทของมันในฐานะรีคอมบิเนสเฉพาะไมโอซิส เนื่องจากกิจกรรมนี้ช่วยให้สามารถเร่งปฏิกิริยารีคอมบิเนชันระหว่างลำดับที่ไม่ตรงกันอย่างสมบูรณ์ได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น[ 18 ]
ปฏิสัมพันธ์
DMC1 (ยีน) ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับRAD51และคอมเพล็กซ์ Structural Maintenance of Chromosome 5/6 (SMC5/6) [ 19 ] [ 14 ]โปรตีนนี้ยังได้รับการแสดงให้เห็นว่าจับกับ Tid1(Rdh54), Mei5/Sae3 และ Hop2/Mnd1 โปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์เหล่านี้ทั้งหมดทำหน้าที่เพิ่มกิจกรรมของ Dmc1 ในระบบที่บริสุทธิ์ และยังมีส่วนเกี่ยวข้องว่าจำเป็นต่อการทำงานของ Dmc1 ในเซลล์ด้วย
นอกจากนี้ ยังพบว่า DMC1 มีปฏิสัมพันธ์กับ FIGNL1 ด้วย เชื่อกันว่า FIGNL1 ส่งเสริมการแยกส่วนของ DMC1 ในระหว่างการแบ่งเซลล์แบบไมโอซิสของเพศชาย[ 20 ]
ราด51
ในระหว่างไมโอซิสรีคอมบิเนสสองตัวได้แก่Rad51 และ Dmc1 จะทำปฏิกิริยากับ DNAสายเดี่ยวเพื่อสร้างเส้นใยพิเศษที่ปรับให้เหมาะสมเพื่ออำนวยความสะดวกในการเกิดรีคอมบิเนชันระหว่างโครโมโซมคู่เหมือน ทั้ง Dmc1 และ Rad51 มีความสามารถโดยธรรมชาติในการรวมตัวกันเอง[ 21 ] การมีอยู่ของเส้นใย Rad51 จะทำให้เส้นใย Dmc1 ที่อยู่ติดกันมีเสถียรภาพ และในทางกลับกัน Dmc1 ก็จะทำให้เส้นใย Rad51 ที่อยู่ติดกันมีเสถียรภาพ มีการเสนอแบบจำลองที่ Dmc1 และ Rad51 สร้างเส้นใยแยกกันบน DNA สายเดี่ยวเดียวกัน และการสื่อสารระหว่างรีคอมบิเนสทั้งสองส่งผลต่อคุณสมบัติทางชีวเคมีของพวกมัน[ 21 ]
ในระหว่างไมโอซิส แม้จะไม่มีกิจกรรมการแลกเปลี่ยนสาย Rad51 แต่ Dmc1 ก็ดูเหมือนจะสามารถซ่อมแซมการแตกหักของ DNA ในไมโอซิสทั้งหมดได้ และการไม่มีกิจกรรมนี้ไม่ได้ส่งผลกระทบต่ออัตราการไขว้กันของไมโอซิส[ 22 ]
ฮอป2/เอ็มเอ็นดี1
Hop2 และ Mnd1 รวมตัวกันเป็นเฮเทอโรไดเมอร์ซึ่งมีความสัมพันธ์กับ dsDNA และในระดับที่น้อยกว่าคือ ssDNA Hop2/Mnd1 กระตุ้นกิจกรรมการแลกเปลี่ยนสายของ DMC1 ในหลอดทดลองปฏิสัมพันธ์ระหว่าง Hop2/Mnd1 และ DMC1 เชื่อว่าส่งเสริมการจับของ DMC1 กับ ssDNA อย่างเฉพาะเจาะจงและนำโฮโมล็อกเข้ามาใกล้กัน[ 23 ] [ 24 ]
เอสซีเอ็ม5/6
DMC1 มีปฏิสัมพันธ์กับคอมเพล็กซ์ Structural Maintenance of Chromosomes 5/6 (SMC5/6) คอมเพล็กซ์ SCM5/6 ยับยั้งการก่อตัวของตัวกลาง DNA และมีส่วนเกี่ยวข้องในการแก้ไข มีหลักฐานว่า SCM5/6 มีปฏิสัมพันธ์และยับยั้งการแปลตำแหน่งของ DMC1 ในระยะไมโอซิส Rad51 สามารถยับยั้งปฏิสัมพันธ์นี้ได้ และนี่อาจเป็นบทบาทของมันในฐานะปัจจัยเสริมในระหว่างการรวมตัวของโครโมโซมคู่เหมือนในระยะไมโอซิส[ 19 ]
ความสำคัญทางคลินิก
การกลายพันธุ์ในยีน DMC1 เกี่ยวข้องกับภาวะมีบุตรยากในเพศชายเนื่องจาก ภาวะไม่มี อสุจิแบบ ไม่อุดตัน ซึ่งอัณฑะผลิตอสุจิได้น้อยหรือไม่ผลิตเลย[ 25 ]ในหนู การเปลี่ยนแปลงกรดอะมิโนเพียงตัวเดียวสามารถป้องกันการไขว้กันและนำไปสู่การหยุดชะงักของไมโอซิสผ่านกลไกเด่นของออโตโซม[ 26 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Golub EI, Gupta RC, Haaf T, Wold MS, Radding CM (ธันวาคม 1998). "ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนการรวมตัวใหม่ rad51 ของมนุษย์กับโปรตีนจับดีเอ็นเอสายเดี่ยว RPA" . Nucleic Acids Research . 26 (23): 5388– 5393. doi : 10.1093/nar/26.23.5388 . PMC 148005 . PMID 9826763 .
- Masson JY, Davies AA, Hajibagheri N, Van Dyck E, Benson FE, Stasiak AZ และคณะ (พฤศจิกายน 2542). "recombinase hDmc1 ที่จำเพาะต่อไมโอซิสสร้างโครงสร้างวงแหวนและโต้ตอบกับ hRad51 " วารสารEMBO 18 (22): 6552– 6560. ดอย : 10.1093/emboj/18.22.6552 . PMC 1171718 . PMID10562567 .
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE และคณะ (ธันวาคม 2542). "ลำดับดีเอ็นเอของโครโมโซม 22 ของมนุษย์ " ธรรมชาติ . 402 (6761): 489– 495. รหัสสินค้า : 1999Natur.402..489D . ดอย : 10.1038/990031 . PMID10591208 .
- Moens PB, Kolas NK, Tarsounas M, Marcon E, Cohen PE, Spyropoulos B (เมษายน 2545). "ลำดับเวลาและตำแหน่งโครโมโซมของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการรวมตัวใหม่ในระยะไมโอซิสในหนูนั้นสอดคล้องกับแบบจำลองที่สามารถแยกแยะปฏิสัมพันธ์ของ DNA-DNA ในระยะเริ่มต้นได้โดยไม่ต้องมีการรวมตัวใหม่แบบผกผัน" วารสารวิทยาศาสตร์เซลล์ 115 (ตอนที่ 8): 1611–1622 . doi : 10.1242/jcs.115.8.1611 . PMID 11950880 .
- Habu T, Wakabayashi N, Yoshida K, Yomogida K, Nishimune Y, Morita T (มิถุนายน 2547). "โปรตีน p53 มีปฏิสัมพันธ์เฉพาะกับโปรตีน DMC1 ที่คล้าย RecA ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมซึ่งจำเพาะต่อการแบ่งเซลล์แบบไมโอซิส" . Carcinogenesis . 25 (6): 889– 893. doi : 10.1093/carcin/bgh099 . PMID 14764457 .
- Kinebuchi T, Kagawa W, Enomoto R, Tanaka K, Miyagawa K, Shibata T และคณะ (พฤษภาคม 2547). "โครงสร้างพื้นฐานสำหรับการก่อตัวของวงแหวนแปดเหลี่ยมและการโต้ตอบกับ DNA ของโปรตีนจับคู่โฮโมล็อกัสของมนุษย์ Dmc1" Molecular Cell . 14 (3): 363– 374. doi : 10.1016/S1097-2765(04)00218-7 . PMID 15125839 .
- Sehorn MG, Sigurdsson S, Bussen W, Unger VM, Sung P (พฤษภาคม 2547). "รีคอมบิเนสไมโอติกของมนุษย์ Dmc1 ส่งเสริมการแลกเปลี่ยนสาย DNA ที่เป็นโฮโมล็อกโดยอาศัย ATP" Nature . 429 (6990): 433– 437. Bibcode : 2004Natur.429..433S . doi : 10.1038/nature02563 . PMID 15164066 . S2CID 4316803 .
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG และคณะ (2004). "แนวทางที่ขับเคลื่อนด้วยการระบุคำอธิบายจีโนมเพื่อการโคลน ORFeome ของมนุษย์" . Genome Biology . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
- Kinebuchi T, Kagawa W, Kurumizaka H, Yokoyama S (สิงหาคม 2548). "บทบาทของโดเมน N-terminal ของโปรตีน DMC1 ในมนุษย์ในการสร้างอ็อกตาเมอร์และการจับกับ DNA"วารสารชีวเคมี280 (31): 28382– 28387. doi : 10.1074 /jbc.M503372200 . PMID 15917243 .
- บูครีเยฟ ดีวี, โกลูบ อีไอ, สตาเซียค อาริโซน่า, สตาเซียค เอ, มาซิน เอวี (กรกฎาคม 2548) "การกระตุ้น Dmc1 ชนิดรีคอมบิเนสที่จำเพาะต่อไมโอซิสของมนุษย์โดย Ca2+ " วารสารเคมีชีวภาพ . 280 (29): 26886– 26895. ดอย : 10.1074/jbc.M502248200 . PMID15917244 .
- Pezza RJ, Voloshin ON, Vanevski F, Camerini-Otero RD (กรกฎาคม 2550). "Hop2/Mnd1 ทำงานในสองขั้นตอนสำคัญในการจับคู่โฮโมล็อกัสที่ส่งเสริมโดย Dmc1" Genes & Development . 21 (14): 1758– 1766. doi : 10.1101/gad.1562907 . PMC 1920170 . PMID 17639081 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ดีเอ็นเอ ไมโอติก รีคอมบิเนส 1
โปรตีน DMC1/LIM15 homolog ของการรวมตัวใหม่ของไมโอซิสเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนDMC1 โฮโมล็อกของ DMC1 มีการอนุรักษ์ไว้อย่างดีและพบได้ในสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกันหลายชนิด...
การค้นพบ
ยีนและโปรตีน DMC1 ถูกค้นพบในยีสต์ S. cerevisiae โดย Douglas Bishop ในปี 1992 ขณะที่เขาเป็นนักวิจัยหลังปริญญาเอกในห้องปฏิบัติการของ Nancy Kleckner ที่มหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ด [ 11 ]
โครงสร้าง
DMC1 ของมนุษย์เป็นโฮโมมัลติเมอร์ในรูปของวงแหวนแปดเหลี่ยมที่มีเส้นผ่านศูนย์กลาง 140 Å และมีรูตรงกลางขนาด 45 Å [ 12 ] [ 9 ] DMC1 จับกับ ssDNA ได้ดีกว่า dsDNA [ 12 ] แตกต่างจาก RecA และ Rad51 DMC1 ดูเหมือนจะไม่สร้างเส้นใยเกลียวบน DNA แต่จะสร้างวงแหวนโดยมี DNA...
การทำงาน
โปรตีนที่ถูกเข้ารหัสโดยยีนนี้มีความสำคัญต่อการเกิดการรวมตัวกันใหม่ของโครโมโซมคู่เหมือนในระยะไมโอ ซิส การรวมตัวกันใหม่ของยีน ในระยะไมโอซิสมีบทบาทสำคัญในการสร้างความหลากหลายของข้อมูลทางพันธุกรรม และช่วยให้เกิดการแยกตัวของโครโมโซมแบบลดจำนวน...