โปรแกรม UCSF DOCKถูกสร้างขึ้นในช่วงทศวรรษ 1980 โดย กลุ่มของ Irwin "Tack" Kuntzและเป็นโปรแกรมด็อกกิ้ง ตัวแรก ^{[ 1 ]} DOCK ใช้ขั้นตอนวิธีทางเรขาคณิตเพื่อทำนายรูปแบบการจับของโมเลกุลขนาดเล็ก^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]} Brian K. Shoichet, David A. Case และ Robert C. Rizzo เป็นผู้ร่วมพัฒนา DOCK

ปัจจุบันมีการพัฒนาโปรแกรมเชื่อมต่อยานอวกาศอยู่ 2 เวอร์ชัน ได้แก่ DOCK 6 และ DOCK 3

วิธีการสุ่มตัวอย่างลิแกนด์ที่ใช้โดยโปรแกรม DOCK ได้แก่:

• การเชื่อมต่อแบบแข็ง: การจับคู่รูปร่าง โดยใช้ทรงกลมที่วางอยู่ในช่อง และทำการจับคู่แบบทวิภาคระหว่างทรงกลมเหล่านั้นกับโมเลกุล (ทุกเวอร์ชัน)
• ลิแกนด์ที่ยืดหยุ่นจะถูกพิจารณาโดยใช้วิธีการต่อไปนี้: อัลกอริทึมที่เรียกว่าanchor and grow (v4-v6) ^{[ 2 ]}และการเชื่อมต่อแบบลำดับชั้นของฐานข้อมูล (v3.5-3.7) ^{[ 5 ] [ 6 ]}

กลุ่มของ David A. Case ได้นำ เอน จิน พลศาสตร์โมเลกุลมาใช้ใน DOCK v6 ในฟังก์ชันการให้ คะแนน AMBER score ความสามารถนี้คำนึงถึงความยืดหยุ่นของตัวรับและอนุญาตให้จัดลำดับตามกลุ่มพลังงานในการคำนวณการด็อกกิ้ง^{[ 4 ]}

• ออโต้ด็อก
• การสร้างแบบจำลองโมเลกุล
• การเปรียบเทียบซอฟต์แวร์สำหรับการสร้างแบบจำลองกลศาสตร์โมเลกุล

เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ