พูดิลเริ่มต้นอาชีพนักฟุตบอลเยาวชนในสาธารณรัฐเช็กกับสโมสรสปาร์ตาปรากเขาออกจากสโมสรเมื่ออายุ 18 ปีและเข้าร่วมทีมเอฟเค ชเมล บล์ซานีที่ชเมล บล์ซานี พูดิลเล่นในตำแหน่งแบ็กซ้ายและทำได้ 2 ประตูจากการลงเล่น 11 นัด หลังจากนั้น 6 เดือน พูดิลย้ายไปร่วมทีมเอฟซี สโลวาน ลิเบเรคแม้จะลงเล่นเพียง 12 นัดในฤดูกาลแรก แต่ไม่นานเขาก็กลายเป็นสมาชิกของทีมชุดใหญ่ ซึ่งคว้าแชมป์ลีกสมัยที่สองได้ โดยพูดิลลงเล่น 29 นัดและทำได้ 3 ประตู ในฤดูกาลนั้น พูดิลทำประตูแรกในอาชีพของเขาได้ในเกมที่เสมอกับเปร็บรัม 2-2 เมื่อวันที่ 7 พฤศจิกายน 2005 ตลอดทั้งฤดูกาล พูดิลได้สร้างชื่อเสียงให้กับตัวเองในฐานะผู้เล่นตัวจริงของสโมสร

ในปี 2550 เขาได้ไปทดสอบฝีเท้ากับทีมวัตฟอร์ด ของอังกฤษ แต่ผู้จัดการทีมAidy Boothroydตัดสินใจไม่เซ็นสัญญากับ Pudil อย่างถาวร^{[ 3 ] [ 4 ]}

ในฤดูกาล 2007–08 ซึ่งเขาลงเล่นให้สโลวาน ลิเบเรคไป 3 นัด ปูดีลย้ายจากลิเบเรคไปร่วมทีมเอสเค สลาเวีย ปรากด้วยสัญญายืมตัวหนึ่งฤดูกาล และประเดิมสนามเมื่อวันที่ 15 กันยายน 2007 ในเกมที่เสมอกับบานิค ออสตราวา 0–0 สี่วันต่อมา เขาประเดิมสนามในแชมเปี้ยนส์ลีกในเกมที่ชนะสเตอัว บูคาเรสต์ ทีมจากโรมาเนีย 2–1 เมื่อวันที่ 29 กันยายน 2007 ปูดีลทำประตูแรกได้ในเกมที่ชนะฟาสตาฟ ซลิน 7–1 สี่วันต่อมาเขาทำประตูแรกได้อีกครั้งในเกมที่แพ้เซบียา 2–1 และประตูที่สองในลีกของเขามาในเกมที่ชนะสปาร์ตา ปราก 2–0 หกวันต่อมา ในการแข่งขันยูฟ่าแชมเปี้ยนส์ลีกนัดที่สามของรอบแบ่งกลุ่ม ปูดีลอยู่ในทีมที่อาร์เซนอลถล่มสลาเวีย 7–0 ^{[ 5 ]}หกวันหลังจากความพ่ายแพ้ 7–0 ปูดิลได้เล่นกับสโมสรเก่าของเขาอีกครั้งในเกมที่เสมอกัน 1–1 แต่การพบกันครั้งต่อไปก็เกิดขึ้นอีกครั้งในอีกหกเดือนต่อมา เมื่อปูดิลเป็นผู้จ่ายบอลให้เซเดเน็ก เชนเกอริกทำประตูเดียวในเกมนั้น หลังจากที่สลาเวีย ปรากตกรอบแชมเปี้ยนส์ลีกไปเล่นยูฟ่าคัพ ปูดิลเป็นผู้จ่ายบอลให้มาเตจ คราจชิกทำประตูตีเสมอ 1-1 กับท็อตแนม ฮอตสเปอร์ในเลกที่สอง อย่างไรก็ตาม สลาเวีย ปรากแพ้ด้วยผลรวม 3–1 หลังจากแพ้ในเลกแรก ในเกมสุดท้ายของฤดูกาล ปูดิลทำประตูได้ในเกมที่เสมอกับเบามิต ยาโบลเนค 2–2 ในตอนท้ายฤดูกาล สลาเวีย ปรากคว้าแชมป์ลีก เนื่องจากความฟุ่มเฟือยและไลฟ์สไตล์ที่ขัดแย้ง สลาเวีย ปรากจึงตัดสินใจไม่เซ็นสัญญากับปูดิล

Pudil เซ็นสัญญากับสโมสรKRC Genk ของเบลเยียม จากFC Slovan Liberecในเดือนกรกฎาคม 2008 หลังจากได้รับความสนใจจากสโมสรRegginaและLecce ของ อิตาลี^{[ 6 ]}ในเกมเปิดฤดูกาลเมื่อวันที่ 17 สิงหาคม 2008 Pudil ได้ลงเล่นนัดแรกให้กับสโมสรในเกมที่เสมอกับBeerschot 1-1 จากนั้นอีกสองนัดต่อมา Pudil ก็ทำประตูแรกได้ในเกมที่ชนะ Zulte Waregem 3-1 เมื่อวันที่ 14 กันยายน 2008 อย่างไรก็ตาม ในเกมถัดไป Pudil ได้รับใบแดงหลังจากได้รับใบเหลืองสองใบในเกมที่แพ้Club Brugge 1-0 ในฤดูกาลแรกของเขา Pudil ทำได้สี่ประตูจากการลงเล่นยี่สิบเก้านัด ที่ Genk Pudil ได้สร้างชื่อเสียงให้กับตัวเองในทีมชุดแรกตลอดสามฤดูกาลที่ Genk ในฤดูกาลถัดมา Pudil ลงเล่น 27 นัด อย่างไรก็ตาม ในการแข่งขันยูโรปา ลีก รอบ 4 นัดที่สองกับลีลล์หลังจากแพ้ไป 2-1 ในนัดแรก ปูดีลเป็นผู้จ่ายบอลให้เอลยานิฟ บาร์ดา ทำประตูได้ แต่ก็ได้รับใบแดงหลังจากได้รับใบเหลืองสองใบ ในฤดูกาลถัดมา ปูดีลเป็นส่วนหนึ่งของทีมเกงค์ที่คว้าแชมป์ลีกเป็นสมัยที่สอง

เขาใช้เวลาสามฤดูกาลกับทีมเบลเยียมก่อนจะย้ายไปร่วมทีมกรานาดาด้วยสัญญาห้าปีครึ่งในเดือนมกราคม 2012 ^{[ 7 ]}

หลังจากเข้าร่วมทีมกรานาดา ปูดิลถูกปล่อยยืมตัวไปเล่นให้เซเซนาจนจบฤดูกาล 2011–12 ทันที ^{[ 8 ]}เมื่อวันที่ 1 กุมภาพันธ์ 2012 ปูดิลได้ลงเล่นนัดแรกในตำแหน่งกองกลางตัวรับ ในเกมที่เสมอกับนาโปลี 0–0 สิบแปดวันหลังจากลงเล่นนัดแรก ปูดิลทำประตูแรกได้ในเกมที่แพ้เอซีมิลาน 3–1 เมื่อวันที่ 7 มีนาคม 2012 เกมไม่เป็นไปในทางที่ดีสำหรับเขา เมื่อเขาได้รับใบแดงหลังจากได้รับใบเหลืองที่สอง เพียงหนึ่งนาทีหลังจากได้รับใบเหลืองในเกมที่เสมอกับคาตาเนีย 0–0 ในตอนท้ายฤดูกาล ปูดิลไม่สามารถช่วยให้เซเซนารักษาสถานะในเซเรียอาได้ เนื่องจากสโมสรตกชั้นไปเซเรียบี

จากนั้น Pudil ย้ายไปร่วมทีม Watford ด้วยสัญญายืมตัวตลอดฤดูกาล 2012–13โดยไปร่วมทีมกับMatěj Vydra เพื่อนร่วมทีมชาวเช็ ก^{[ 9 ]}ในช่วงปรีซีซั่น Pudil ลงเล่นนัดแรกในเกมกระชับมิตรกับTottenham Hotspurใน แมตช์อำลาของ Lloyd Doyleyแต่หลังจากเล่นไปได้ 5 นาที เขาก็ต้องออกจากสนามเนื่องจากสงสัยว่าจะได้รับบาดเจ็บที่เอ็นร้อยหวาย^{[ 10 ]}ซึ่งต่อมาพบว่าเป็นการบาดเจ็บเล็กน้อย^{[ 11 ]} Pudil ประเดิมสนามให้กับ Watford ในเกมที่สองของฤดูกาล ซึ่งเป็นเกมที่แพ้Ipswich Town ไป 1–0

หลังจากเล่นในตำแหน่งแบ็กซ้ายมา 6 เกม ปูดิลถูกย้ายไปเล่นในตำแหน่งกองกลางฝั่งซ้ายและทำแอสซิสต์ได้หลายครั้ง เมื่อวันที่ 23 ตุลาคม 2012 ปูดิลได้รับใบแดงโดยตรงในเกมที่แพ้คาร์ดิฟฟ์ซิตี้ 2-1 หลังจากแสดงพฤติกรรมรุนแรงต่อเคร็ก นูนหลังจบเกม วัตฟอร์ดได้ยื่นอุทธรณ์คำตัดสิน โดยได้รับการสนับสนุนจากคาร์ดิฟฟ์ซิตี้และนูนเอง^{[ 12 ]}โทษแบน 3 เกมของเขาจึงถูกลดเหลือ 1 เกมโดยสมาคมฟุตบอลอังกฤษ^{[ 13 ]}ในเกมแรกของปี 2013 ปูดิลทำประตูแรกให้กับวัตฟอร์ดในเกมที่แพ้ชาร์ลตันแอธเลติก 4-3 ^{[ 14 ]}ต่อมาในฤดูกาล 2012-13 ปูดิลลงเล่นไป 40 นัดในทุกรายการ และเมื่อสิ้นสุดฤดูกาล ปูดิลก็กลับไปที่กรานาดา เนื่องจากสัญญายืมตัวกับวัตฟอร์ดสิ้นสุดลง^{[ 15 ]}

เมื่อวันที่ 4 กรกฎาคม 2556 Pudil ประกาศผ่านทางทวิตเตอร์ว่าเขาได้ย้ายจากกรานาดา มาอยู่กับวัตฟอร์ดอย่างถาวร โดยเซ็นสัญญาสี่ปี^{[ 16 ]}เกมแรกของ Pudil หลังจากเซ็นสัญญากับสโมสรอย่างถาวรคือการลงสนามแทนIkechi Anyaในนาทีที่ 75 ในเกมเปิดฤดูกาล ซึ่งวัตฟอร์ดชนะเบอร์มิงแฮมซิตี้ 1-0 ขณะที่ประตูแรกของเขาเกิดขึ้นในเกมที่เสมอกับชาร์ลตันแอธเลติก 1-1 เมื่อวันที่ 14 กันยายน 2556 ^{[ 17 ]}

เมื่อวันที่ 29 สิงหาคม 2015 Pudil เซ็นสัญญายืมตัวกับSheffield Wednesdayเป็นเวลาหนึ่งฤดูกาล เขาทำประตูแรกให้กับ Sheffield Wednesday ในเกมที่ชนะPreston North End 3-1 เมื่อวันที่ 3 ตุลาคม 2015 ^{[ 18 ]} Pudil ย้ายมาอยู่กับ Wednesday อย่างถาวรเมื่อวันที่ 28 กรกฎาคม 2016 ด้วยค่าตัว 1,500,000 ปอนด์^{[ 19 ]}เขาเซ็นสัญญากับสโมสรอีกครั้งเป็นเวลาหนึ่งปีในเดือนพฤษภาคม 2018 ^{[ 20 ]}เขาถูกปล่อยตัวออกจาก Sheffield Wednesday เมื่อสิ้นสุดฤดูกาล 2018–19 ^{[ 21 ]}

หลังจากถูกปล่อยตัวจาก Sheffield Wednesday ในเดือนกรกฎาคม 2019 เขาได้เซ็นสัญญากับMladá Boleslav ทีมจากเช็ก เป็นเวลาสองปี^{[ 22 ]}

ปูดิลเซ็นสัญญากับสโมสรเช็กอย่างวิคตอเรีย ชิชคอฟด้วยสัญญาฟรีหนึ่งปี^{[ 23 ]}

เมื่อวันที่ 24 กรกฎาคม 2022 Pudil กลับไปที่ Sheffield และเซ็นสัญญากับHallamซึ่งเป็นสโมสรฟุตบอลที่เก่าแก่ที่สุดเป็นอันดับสองของโลก ใน Northern Counties East League Premier Division ^{[ 24 ]}

ณ วันที่แข่งขัน 17 กุมภาพันธ์ 2561 ^{[ 30 ] [ 31 ]}

ณ วันที่แข่งขัน 16 พฤศจิกายน 2018 ^{[ 32 ]}