ซาลาซาร์เซ็นสัญญากับอินเดียนส์ในฐานะผู้เล่นอิสระ ระหว่างประเทศ ในปี 2549 เขาใช้เวลาสองปีเล่นเบสบอลระดับรุกกี้ให้กับอินเดียนส์ จากนั้นใช้เวลาตั้งแต่ปี 2552 ถึง 2554 กับเลคเคาน์ตี้แคปตันส์อินเดียนส์ซื้อสัญญาของเขาเมื่อวันที่ 18 พฤศจิกายน 2554 เพื่อป้องกันเขาจากการดราฟต์ตามกฎข้อที่ 5เขาใช้เวลาในปี 2555 กับแคโรไลนามัดแคทส์และแอครอนแอโรส์ในสัปดาห์สิ้นสุดวันที่ 5 พฤษภาคม 2556 ซาลาซาร์ได้รับเลือกให้เป็น ผู้เล่นตำแหน่งพิชเชอร์ยอด เยี่ยมประจำสัปดาห์ของอีสเทิร์นลีก ขณะเล่นให้กับแอโรส์ และได้รับการเลื่อนชั้นไปเล่นให้กับ โคลัมบัสคลิปเปอร์สในระดับทริปเปิลเอในเวลาต่อมาไม่นาน^{[ 1 ]}

ซาลาซาร์ถูกเรียกตัวกลับมาจากทีมโคลัมบัส คลิปเปอร์ส ระดับทริปเปิลเอ เมื่อวันที่ 11 กรกฎาคม 2013 และได้ลงเล่นเมเจอร์ลีกเบสบอลเป็นครั้งแรกในฐานะผู้ขว้างตัวจริงในการแข่งขันกับทีมโตรอนโต บลูเจย์ส^{[ 2 ]} เขาทำโนฮิตเตอร์ได้จนถึงอินนิ่งที่ 6 โดยสามารถเอาชนะผู้ตีได้ 7 คนใน 6 อินนิ่งเต็ม ซึ่งเป็นจำนวนการเอาชนะผู้ตีมากที่สุดของผู้ขว้างตัวจริงของอินเดียนส์ในการลงเล่นเมเจอร์ลีกครั้งแรกนับตั้งแต่หลุยส์ เทียนต์เอาชนะผู้ตีได้ 11 คนในการลงเล่นครั้งแรกของเขาในปี 1964 ^{[ 3 ]}เขาถูกส่งตัวกลับไปที่โคลัมบัสในวันที่ 12 กรกฎาคม แดนนี่ ซาลาซาร์ถูกเรียกตัวขึ้นมาเพื่อลงเล่นเป็นตัวจริงในวันที่ 7 สิงหาคม 2013 ในการแข่งขันกับทีม ดีทรอย ต์ ไทเกอร์ส^{[ 4 ]}ซาลาซาร์ลงเล่นเป็นตัวจริงในรอบเพลย์ออฟครั้งแรกในอาชีพของเขาให้กับอินเดียนส์ในการแข่งขันกับทีมแทมปาเบย์ เรย์สในเกมไวลด์การ์ดของอเมริกันลีกปี 2013

ในปี 2014 ซาลาซาร์แบ่งฤดูกาลระหว่างทีมอินเดียนส์และคลิปเปอร์ส โดยลงเล่น 20 เกมให้กับทีมหลัก และจบฤดูกาลด้วยสถิติชนะ 6 แพ้ 8 และค่าเฉลี่ยการเสียแต้ม 4.25

ซาลาซาร์ได้รับเลือกให้ติดทีมออลสตาร์ของอเมริกันลีกในปี 2016

หลังจากที่ฟอร์มตกใน 10 เกมแรกของฤดูกาล 2017 โดยมีค่าเฉลี่ย ERA สูงถึง 5.50 ซาลาซาร์ถูกย้ายไปอยู่ในทีมสำรองเมื่อวันที่ 28 พฤษภาคม 2017 แต่กลับมาลงสนามเป็นตัวจริงอีกครั้งในวันที่ 22 กรกฎาคม 2017 เขาจบฤดูกาลด้วยสถิติชนะ 5 แพ้ 6 และมีค่าเฉลี่ย ERA 4.28 จากการลงสนามเป็นตัวจริง 19 เกม นอกจากนี้ยังลงสนามในฐานะตัวสำรองอีก 4 เกม เขาทำสถิติ strikeouts 145 ครั้ง ใน 103 อินนิง

เขาเริ่มต้นฤดูกาล 2018 ด้วยการอยู่ในรายชื่อผู้เล่นบาดเจ็บ 60 วัน เมื่อวันที่ 30 มิถุนายน 2018 มีการประกาศว่าซาลาซาร์จะเข้ารับการผ่าตัดสำรวจบริเวณไหล่ขวา^{[ 5 ]}เมื่อวันที่ 2 กรกฎาคม 2018 ซาลาซาร์เข้ารับการผ่าตัดไหล่ขวาอย่างเป็นทางการ ส่งผลให้โอกาสในการเล่นใน MLB ในปี 2018 ลดลง หลังจากการผ่าตัด ซาลาซาร์ต้องงดขว้างลูกเป็นเวลา 12 ถึง 16 สัปดาห์^{[ 6 ]}ซาลาซาร์เปิดตัวในฤดูกาล 2019 เมื่อวันที่ 1 สิงหาคม ในเกมกับฮุสตัน แอสโทรส์โดยเสีย 2 รันจากการขว้าง 66 ลูก ในเกมที่แพ้ 7-1 ^{[ 7 ]}ซาลาซาร์ถูกส่งกลับไปอยู่ในรายชื่อผู้เล่นบาดเจ็บ 10 วันในวันถัดมาเนื่องจากอาการบาดเจ็บที่ขาหนีบ เมื่อวันที่ 6 กันยายน 2019 ซาลาซาร์ถูกย้ายไปอยู่ในรายชื่อผู้เล่นบาดเจ็บ 60 วัน ซึ่งเป็นการสิ้นสุดฤดูกาล 2019 ของเขาโดยปริยาย โดยเขาได้ลงเล่นให้กับอินเดียนส์เพียงครั้งเดียว^{[ 8 ]}หลังจากฤดูกาล 2019 ซาลาซาร์ถูกปล่อยตัวโดยอินเดียนส์และกลายเป็นผู้เล่นอิสระ

เมื่อวันที่ 13 พฤษภาคม 2022 ซาลาซาร์เซ็นสัญญาระดับไมเนอร์ลีกกับ ทีม นิวยอร์ก แยง กี้ส์ เขาลงเล่น 2 เกมให้กับทีม Scranton/Wilkes-Barre RailRidersในระดับ Triple-A และทำผลงาน ERA 3.86 พร้อมกับ 4 สไตรค์เอาท์ใน2 เกม+1/3 อินนิง ส์ซาลาซาร์ถูกปล่อยตัวออกจากทีมแยงกี้เมื่อวันที่ 20กันยายน

เมื่อวันที่ 15 มิถุนายน 2024 ซาลาซาร์เซ็นสัญญากับดิอาโบลส์ โรโฆส เดล เม็กซิโกในลีกเม็กซิกัน^{[ 9 ]}เขาลงเล่นให้เม็กซิโกสองครั้ง โดยมีค่าเฉลี่ยการเสียแต้ม (ERA) สูงถึง 40.50 พร้อมกับตีเอาท์สองครั้งใน2/3 อิน นิง ของการลงมาช่วย ซาลาซาร์ถูกปล่อยตัวจากดิอาโบลส์เมื่อ วันที่ 22 มิถุนายน