ปลาซิสโกน้ำลึก ( Coregonus johannae ) เป็นหนึ่งในปลาซิสโก ที่ใหญ่ที่สุด ในทะเลสาบใหญ่ทั้ง ห้าแห่ง มีความยาวเฉลี่ย 30  เซนติเมตร (12 นิ้ว) และหนักประมาณ 1 กิโลกรัม (2.2 ปอนด์) พบได้เฉพาะในทะเลสาบฮูรอนและมิชิแกนอาศัยอยู่ในน้ำลึกระหว่าง 50 ถึง 150 เมตร ทำให้ยากที่จะแยกแยะออกจากปลาซิสโกชนิดอื่น และอาจเป็นชนิดเดียวกันกับปลาซิสโกปากสั้น ( Coregonus zenithicus ) ปลาซิสโกน้ำลึกมีลักษณะเด่นคือมักมีซี่เหงือกน้อยกว่า 33 ซี่ ครีบหน้าอกค่อนข้างยาว และขากรรไกรไม่มีสี มีสีเงินอมชมพูหรือม่วงเป็นประกาย และหลังสีเขียวหรือน้ำเงิน วางไข่ในเดือนสิงหาคมและกันยายน ซึ่งเร็วกว่าปลาซิสโกชนิดอื่นส่วนใหญ่ ไม่ค่อยมีข้อมูลเกี่ยวกับพฤติกรรมเฉพาะของมัน อาหารของมันประกอบด้วย กุ้ง Mysis relictaหอยกาบและแมลงน้ำชนิดต่างๆ เนื่องจากมีขนาดใหญ่ ปลาซิสโก้ที่อาศัยอยู่ในน้ำลึกจึงถูกจับเพื่อการค้าเป็นจำนวนมาก

สาเหตุหลักที่ทำให้มันสูญพันธุ์คือการแข่งขันจากปลาอะเลไว ฟ์ ที่ รุกราน การถูกล่าโดยปลาแลมเพรย์ทะเล ที่ถูกนำเข้ามา และการประมงเชิงพาณิชย์ในทะเลสาบใหญ่ทั้งห้า

สาเหตุส่วนหนึ่งที่ทำให้มีข้อมูลเกี่ยวกับปลาชนิดนี้น้อย อาจมาจากกิจกรรมการประมงเชิงพาณิชย์ในช่วงต้นทศวรรษ 1930 ก่อนที่จะมีการวิเคราะห์ปลาในน้ำลึกอย่างถูกต้อง ปลาซิสโก้ในน้ำลึกมีจำนวนมากก่อนปี 1900 เนื่องจากก่อนที่การประมงเชิงพาณิชย์ขนาดใหญ่จะเริ่มต้นขึ้นในทะเลสาบมิชิแกน ปลาซิสโก้ขนาดใหญ่ไม่มีผู้ล่าตามธรรมชาติ

จนกระทั่งช่วงทศวรรษ 1930 ปลาชนิดนี้จึงเริ่มถูกจับมาเพื่อการประมงเชิงพาณิชย์ ปลาซิสโก้ที่อาศัยอยู่ในน้ำลึก หรือที่รู้จักกันในวงการประมงว่าปลาชับ เป็นที่นิยมเนื่องจากมีขนาดใหญ่กว่าปกติ ในช่วงที่มีการจับปลาชนิดนี้อย่างแพร่หลาย จำนวนของปลาชนิดนี้จึงลดลงอย่างมาก

ตัวอย่างปลาซิสโกน้ำลึกตัวสุดท้ายถูกบันทึกไว้ในทะเลสาบมิชิแกนในปี 1951 และทะเลสาบฮูรอนในปี 1952 หลังจากนั้นไม่นานก็ประกาศว่าสายพันธุ์นี้สูญพันธุ์ เมื่อมีการประเมินใหม่ในหลายรัฐที่อยู่ติดกับทะเลสาบมิชิแกนในช่วงทศวรรษ 1960 พบว่าไม่มีตัวอย่างปลาซิสโกน้ำลึกที่สามารถระบุได้ในตัวอย่างใดๆ เลย สิ่งนี้ยืนยันการสูญพันธุ์ของสายพันธุ์นี้ซึ่งเกิดจากปัจจัยหลายอย่างรวมกัน ได้แก่ การประมงเชิงพาณิชย์และสัตว์นักล่าที่รุกราน เช่น ปลา แลมเพร ย์ทะเล^{[ 1 ]}