กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 7 นาที

เอ็กโซนิวคลีเอส 1

เอ็กโซนิวคลีเอส 1 เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน EXO1 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

เอ็กโซนิวคลีเอส 1

เอ็กโซ1
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบีการค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่นEXO1 , HEX1, hExoI, เอ็กโซนิวคลีเอส 1
รหัสภายนอกโอมิม : 606063 ; เอ็มจีไอ : 1349427 ; โฮโมโลยีน : 31352 ; การ์ดยีน : EXO1 ; OMA : EXO1 - ออโธโลจี
ออร์โธล็อก
สายพันธุ์มนุษย์หนู
เอนเทรซ
วงดนตรี
ยูนิโปรท
RefSeq (mRNA)

NM_003686 NM_006027 NM_130398 NM_001319224

NM_012012

RefSeq (โปรตีน)

NP_001306153 NP_003677 NP_006018 NP_569082

NP_036142

สถานที่ตั้ง (UCSC)Chr 1: 241.85 – 241.9 MbChr 1: 175.71 – 175.74 Mb
การค้นหาใน PubMed[ 3 ][ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ดู/แก้ไขเมาส์

เอ็กโซนิวคลีเอส 1เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนEXO1 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีน ที่มี กิจกรรมเอ็กโซนิวคลีเอส 5' ถึง 3' เช่นเดียวกับกิจกรรม อาร์เอ็นเอส (กิจกรรมเอนโดนิวคลีเอสที่ตัดอาร์เอ็นเอในไฮบริดดีเอ็นเอ/อาร์เอ็นเอ) [ 8 ]มีลักษณะคล้ายกับโปรตีน Exo1 ของ Saccharomyces cerevisiae ซึ่งมีปฏิสัมพันธ์กับ Msh2 และเกี่ยวข้องกับการซ่อมแซมดีเอ็นเอที่ไม่ตรงกันและการรวมตัวแบบโฮโมโลจัสการตัดต่อทางเลือกของยีนนี้ส่งผลให้เกิดรูปแบบการถอดรหัสสามแบบที่เข้ารหัสไอโซฟอร์มที่แตกต่างกันสองแบบ[ 7 ]

ไมโอซิส

แบบจำลองปัจจุบันของการเกิดการรวมตัวใหม่ในระยะไมโอซิส เริ่มต้นด้วยการแตกของสายดีเอ็นเอสองสายหรือช่องว่าง ตามด้วยการจับคู่กับโครโมโซมที่เป็นโฮโมล็อก และการบุกรุกของสายดีเอ็นเอเพื่อเริ่มต้นกระบวนการซ่อมแซมการรวมตัวใหม่ การซ่อมแซมช่องว่างสามารถนำไปสู่การไขว้กัน (CO) หรือไม่ไขว้กัน (NCO) ของบริเวณข้างเคียง การรวมตัวใหม่แบบ CO เชื่อว่าเกิดขึ้นโดยแบบจำลอง Double Holliday Junction (DHJ) ดังแสดงในภาพด้านขวาด้านบน ส่วนการรวมตัวใหม่แบบ NCO เชื่อว่าเกิดขึ้นโดยแบบจำลอง Synthesis Dependent Strand Annealing (SDSA) เป็นหลัก ดังแสดงในภาพด้านซ้ายด้านบน เหตุการณ์การรวมตัวใหม่ส่วนใหญ่ดูเหมือนจะเป็นแบบ SDSA

ExoI เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการดำเนินไปของไมโอซิสผ่านระยะเมตาเฟส I ในยีสต์Saccharomyces cerevisiaeและในหนู[ 9 ] [ 10 ]

การเกิดการรวมตัวใหม่ระหว่างการแบ่งเซลล์แบบไมโอซิส มักเริ่มต้นด้วยการแตกของสายดีเอ็นเอสองสาย (DSB) ดังแสดงในแผนภาพประกอบ ในระหว่างการรวมตัวใหม่ ส่วนของดีเอ็นเอที่ปลาย 5' ของจุดที่แตกจะถูกตัดออกไปในกระบวนการที่เรียกว่าการตัดออก (resection ) ใน ขั้นตอน การบุกรุกของสายดีเอ็นเอที่ตามมา ปลาย 3' ที่ยื่นออกมาของโมเลกุลดีเอ็นเอที่แตกจะ "บุกรุก" เข้าไปในดีเอ็นเอของโครโมโซมคู่เหมือนที่ไม่แตก ทำให้เกิดห่วงการแทนที่ ( D-loop ) หลังจากการบุกรุกของสายดีเอ็นเอ ลำดับเหตุการณ์ต่อไปอาจเป็นไปตามเส้นทางหลักสองเส้นทางที่นำไปสู่การไขว้กัน (CO) หรือการรวมตัวใหม่แบบไม่ไขว้กัน (NCO) (ดูการรวมตัวทางพันธุกรรมและการรวมตัวแบบคู่เหมือน ) เส้นทางที่นำไปสู่ ​​CO เกี่ยวข้องกับจุดเชื่อมต่อฮอลลิเดย์ คู่ (DHJ) จุดเชื่อมต่อฮอลลิเดย์จำเป็นต้องได้รับการแก้ไขเพื่อให้การรวมตัวใหม่แบบ CO เสร็จสมบูรณ์

ในระหว่างไมโอซิสในS. cerevisiaeการถอดรหัสของยีน Exo1 จะถูกเหนี่ยวนำอย่างมาก[ 9 ] ในเซลล์ไมโอซิสการกลายพันธุ์ ของ Exo1 จะลดการประมวลผลของ DSB และความถี่ของ CO [ 9 ] Exo1 มีหน้าที่สองอย่างที่แตกต่างกันทั้งในด้านเวลาและชีวเคมีในการเกิดการรวมตัวใหม่ของไมโอซิส[ 11 ] ประการแรก Exo1 ทำหน้าที่เป็นนิวคลีเอส 5'–3' เพื่อตัดปลาย DSB ต่อมาในกระบวนการรวมตัวใหม่ Exo1 ทำหน้าที่อำนวยความสะดวกในการแก้ไข DHJ ให้กลายเป็น CO โดยไม่ขึ้นอยู่กับกิจกรรมนิวคลีเอส ในการแก้ไข DHJ นั้น Exo 1 ทำงานร่วมกับ เฮเทอโรไดเมอร์ MLH1 - MLH3 (MutL gamma) และSgs1 (ออร์โธล็อกของเฮลิเคส Bloom syndrome ) เพื่อกำหนดเส้นทางการแก้ไขโมเลกุลร่วมกันที่สร้างครอสโอเวอร์ส่วนใหญ่[ 12 ]

หนูตัวผู้ที่ขาด Exo1 สามารถดำเนินกระบวนการไมโอซิสในระยะพาคีนีมาได้ตามปกติ แต่เซลล์สืบพันธุ์ส่วนใหญ่ไม่สามารถดำเนินไปถึงระยะเมตาเฟส I ได้ตามปกติเนื่องจากการสูญเสียไคแอสมาแบบไดนามิก[ 10 ]อย่างไรก็ตาม ที่น่าประหลาดใจคือ บทบาทของ Exo1 ในไมโอซิสนี้ไม่ได้เกิดจากการทำงานของนิวคลีเอสโดยตรง เนื่องจากหนู Exo1-DA ที่มีการกลายพันธุ์แบบจุดในโดเมนนิวคลีเอสของ Exo1 ไม่มีข้อบกพร่องในไมโอซิสที่ตรวจพบได้[ 13 ]

ปฏิสัมพันธ์

เอ็กโซนิวคลีเอ ส1 ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับMSH2 [ 6 ] [ 14 ] [ 15 ]และMLH1 [ 15 ]

Further reading

  • Liberti SE, Rasmussen LJ (2005). "Is hEXO1 a cancer predisposing gene?". Mol. Cancer Res. 2 (8): 427–32. doi:10.1158/1541-7786.427.2.8. PMID 15328369. S2CID 9070659.
  • Holle GE (1985). "[Pathophysiology of ulcer disease]". Langenbecks Archiv für Chirurgie. 366: 81–7. doi:10.1007/bf01836609. PMID 2414623. S2CID 19231591.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
  • Tishkoff DX, Amin NS, Viars CS, et al. (1998). "Identification of a human gene encoding a homologue of Saccharomyces cerevisiae EXO1, an exonuclease implicated in mismatch repair and recombination". Cancer Res. 58 (22): 5027–31. PMID 9823303.
  • Qiu J, Qian Y, Chen V, et al. (1999). "Human exonuclease 1 functionally complements its yeast homologues in DNA recombination, RNA primer removal, and mutation avoidance". J. Biol. Chem. 274 (25): 17893–900. doi:10.1074/jbc.274.25.17893. PMID 10364235.
  • Lee BI, Wilson DM (2000). "The RAD2 domain of human exonuclease 1 exhibits 5' to 3' exonuclease and flap structure-specific endonuclease activities". J. Biol. Chem. 274 (53): 37763–9. doi:10.1074/jbc.274.53.37763. PMID 10608837.
  • Rasmussen LJ, Rasmussen M, Lee B และคณะ (2000). "การระบุปัจจัยที่โต้ตอบกับ hMSH2 ในตับของทารกในครรภ์โดยใช้ระบบยีสต์ทูไฮบริด การโต้ตอบในร่างกายผ่านโดเมนปลาย C ของ hEXO1 และ hMSH2 และการวิเคราะห์การแสดงออกเชิงเปรียบเทียบ" Mutat. Res . 460 (1): 41– 52. CiteSeerX  10.1.1.614.1507 . doi : 10.1016/S0921-8777(00)00012-4 . PMID  10856833 .
  • Wu Y, Berends MJ, Post JG และคณะ (2001). "การกลายพันธุ์ของยีน EXO1 ในเซลล์สืบพันธุ์ในผู้ป่วยมะเร็งลำไส้ใหญ่ที่ไม่ใช่ชนิดติ่งเนื้อทางพันธุกรรม (HNPCC) และ HNPCC รูปแบบผิดปกติ" Gastroenterology . 120 (7): 1580– 7. doi : 10.1053/gast.2001.25117 . PMID  11375940 .
  • Schmutte C, Sadoff MM, Shim KS และคณะ (2001). "ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนซ่อมแซม DNA ที่ไม่ตรงกันกับ exonuclease I ของมนุษย์" J. Biol. Chem . 276 (35): 33011– 8. doi : 10.1074/jbc.M102670200 . PMID  11427529 .
  • Jäger AC, Rasmussen M, Bisgaard HC และคณะ (2001). "การกลายพันธุ์ HNPCC ในยีนซ่อมแซมความผิดพลาดของ DNA ของมนุษย์ hMLH1 มีอิทธิพลต่อการประกอบ hMutLalpha และคอมเพล็กซ์ hMLH1-hEXO1" Oncogene . 20 (27): 3590– 5. doi : 10.1038/sj.onc.1204467 . PMID  11429708 . S2CID  29870057 .
  • Genschel J, Bazemore LR, Modrich P (2002). "Human exonuclease I is required for 5' and 3' mismatch repair" . J. Biol. Chem . 277 (15): 13302– 11. doi : 10.1074/jbc.M111854200 . PMID  11809771 .
  • ลี บี บี, เหงียน LH, บาร์สกี้ ดี และคณะ (2545). "ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลของมนุษย์ Exo1 กับ DNA " กรดนิวคลีอิก Res 30 (4): 942– 9. ดอย : 10.1093/nar/30.4.942 . PMC  100345 . PMID11842105  .​
  • Sun X, Zheng L, Shen B (2002). "การเปลี่ยนแปลงการทำงานของกลายพันธุ์เอ็กโซนิวคลีเอส 1 ของมนุษย์ที่ระบุในกลุ่มอาการมะเร็งลำไส้ใหญ่ที่ไม่ใช่โพลีโพซิสทางพันธุกรรมที่ผิดปกติ" Cancer Res . 62 (21): 6026– 30. PMID  12414623 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และคณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Jagmohan-Changur S, Poikonen T, Vilkki S และคณะ (2003). "ตัวแปร EXO1 เกิดขึ้นทั่วไปในประชากรปกติ: หลักฐานที่ขัดแย้งกับบทบาทในมะเร็งลำไส้ใหญ่ที่ไม่ใช่โพลีโพซิสทางพันธุกรรม" Cancer Res . 63 (1): 154– 8. PMID  12517792
  • Sharma S, Sommers JA, Driscoll HC และคณะ (2003). "กิจกรรมการตัดแบบเอ็กโซนิวคลีโอไลติกและเอนโดนิวคลีโอไลติกของเอ็กโซนิวคลีเอส 1 ของมนุษย์ได้รับการกระตุ้นโดยปฏิสัมพันธ์กับบริเวณปลายคาร์บอกซิลของโปรตีนกลุ่มอาการเวอร์เนอร์" J. Biol. Chem . 278 (26): 23487–96 . doi : 10.1074/jbc.M212798200 . PMID  12704184 .
  • Alam NA, Gorman P, Jaeger EE และคณะ (2004). "การลบยีน EXO1 ในเซลล์สืบพันธุ์ไม่ได้ทำให้เกิดเนื้องอกในลำไส้ใหญ่และรอยโรคที่ไม่มี EXO1 และไม่มีความไม่เสถียรของไมโครแซทเทลไลต์" Cancer Genet. Cytogenet . 147 (2): 121– 7. doi : 10.1016/S0165-4608(03)00196-1 . PMID  14623461 .
  • Genschel J, Modrich P (2004). "กลไกการตัดออกที่ 5' ในการซ่อมแซมความผิดพลาดของการจับคู่ในมนุษย์" . Mol. Cell . 12 (5): 1077– 86. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00428-3 . PMID  14636568 .
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Exonuclease_1&oldid=1300691562 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เอ็กโซนิวคลีเอส 1

เอ็กโซนิวคลีเอส 1 เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน EXO1 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

ไมโอซิส

ExoI เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการดำเนินไปของไมโอซิสผ่านระยะเมตาเฟส I ในยีสต์ Saccharomyces cerevisiae และในหนู [ 9 ] [ 10 ]

ปฏิสัมพันธ์

เอ็กโซนิวคลีเอ ส1 ได้รับการแสดงให้เห็นว่า มีปฏิสัมพันธ์ กับ MSH2 [ 6 ] [ 14 ] [ 15 ] และ MLH1 [ 15 ]

Further reading

Liberti SE, Rasmussen LJ (2005). "Is hEXO1 a cancer predisposing gene?". Mol. Cancer Res . 2 (8): 427– 32. doi : 10.1158/1541-7786.427.2.8 . PMID 15328369. S2CID 9070659. Holle GE (1985). "[Pathophysiology of ulcer disease]". Langenbecks Archiv für Chirurgie .