สโมสรกีฬานักเรียน CNI ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 30 กรกฎาคม 2539 โดยกลุ่มครูจากสถาบันการศึกษา CNI โดยจัดตั้งขึ้นในฐานะสโมสรไม่แสวงหาผลกำไร มีวัตถุประสงค์เพียงอย่างเดียวคือการส่งเสริมกีฬาในหมู่นักเรียนเยาวชน นับตั้งแต่นั้นมา สโมสรได้เข้าร่วมการแข่งขันในระดับท้องถิ่นต่างๆ เช่น Comisión de Menores, Copa Federativa และการแข่งขันชิงแชมป์ภายใน

ด้วยเหตุนี้ ชมรมจึงยังคงดำเนินกิจกรรมต่อไปได้ด้วยการสนับสนุนจากฝ่ายบริหารโรงเรียนและคณะกรรมการบริหาร ซึ่งประกอบด้วยครูกลุ่มเดิม

เวลาผ่านไปหลายปี จนกระทั่งปี 2014 สโมสรตัดสินใจเข้าร่วมการแข่งขันในดิวิชั่น 3 ของลีกดิวิชั่น 1 แห่งเมืองอิควิตอสและสามารถคว้าแชมป์พร้อมเลื่อนชั้นสู่ดิวิชั่น 2 ได้ในปีเดียวกัน

ในปีต่อมา ปี 2015 สโมสรได้เข้าร่วมแข่งขันในลีกนั้นอีกครั้ง และคว้าแชมป์ได้สำเร็จ พร้อมทั้งได้เลื่อนชั้นสู่ดิวิชั่นหนึ่งของลีก Liga Distrital de Iquitos

ในการแข่งขันCopa Perú ปี 2016สโมสรได้ผ่านเข้ารอบระดับชาติ แต่ถูก Venus เขี่ยตกรอบในรอบ Repechage ^{[ 1 ]}

ในการแข่งขันCopa Perú ปี 2017สโมสรได้ผ่านเข้ารอบระดับชาติ แต่ถูกคัดออกเมื่อจบอันดับที่ 3 ^{[ 2 ]}

ในการแข่งขันCopa Perú ปี 2018สโมสรได้ผ่านเข้ารอบระดับชาติ แต่ถูกคัดออกเมื่อจบอันดับที่ 27 ^{[ 3 ]}

ในการแข่งขัน Copa Perú ปี 2019สโมสรตกรอบในรอบแบ่งกลุ่ม โดยจบอันดับที่ 3 ^{[ 4 ]}

ในการแข่งขันโคปาเปรู ปี 2022สโมสรจบลงด้วยตำแหน่งรองชนะเลิศในรอบระดับจังหวัด และคว้าแชมป์ทั้งในรอบระดับจังหวัดและระดับเขต ทำให้ได้สิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขันระดับชาติ อย่างไรก็ตาม พวกเขาตกรอบ 32 ทีมสุดท้ายในระดับชาติด้วยฝีมือของเดเฟนเซอร์ ลา โบคานาหลังจากแพ้ทั้งนัดเยือนและนัดเหย้าด้วยสกอร์ 1-0

ในการแข่งขันCopa Perú ปี 2024สโมสรได้รับโอกาสอันดีเยี่ยมในการเลื่อนชั้นขึ้นสู่ลีกที่สูงขึ้น หลังจากการก่อตั้งLiga 3ซึ่งเริ่มต้นในปี 2025พวกเขาจบฤดูกาลด้วยตำแหน่งรองชนะเลิศระดับเขต แชมป์ระดับจังหวัด และแชมป์ระดับอำเภอ ซึ่งทำให้พวกเขามีสิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขันระดับชาติอีกครั้ง

พวกเขาผ่านเข้ารอบ 32 ทีมสุดท้าย แต่ถูกคัดออกในรอบนั้นโดยสโมสรยูเวนตุส เอฟซี แห่งเมืองฮัวมาชูโก อย่างไรก็ตาม พวกเขาได้เลื่อนชั้นสู่ลีก 3 ในฐานะตัวแทนของโลเรโต โดยสะสมคะแนนได้มากกว่าอีกสโมสรจากภูมิภาคเดียวกันอย่าง ดอลเช เบรตาญา เอฟซี