ก่อนที่ฐานข้อมูลจะสามารถขุดหาข้อมูลโดยใช้อัลกอริธึมเชิงวิวัฒนาการได้ ฐานข้อมูลจะต้องได้รับการทำความสะอาดก่อน^{[ 2 ]}ซึ่งหมายความว่าข้อมูลที่ไม่สมบูรณ์ มีสัญญาณรบกวน หรือไม่สอดคล้องกันจะต้องได้รับการแก้ไข จำเป็นอย่างยิ่งที่จะต้องทำเช่นนี้ก่อนที่จะเริ่มการขุด เนื่องจากจะช่วยให้อัลกอริธึมสร้างผลลัพธ์ที่แม่นยำยิ่งขึ้น^{[ 3 ]}

หากข้อมูลมาจากฐานข้อมูลมากกว่าหนึ่งแห่ง สามารถบูรณาการหรือรวมเข้าด้วยกันได้ ณ จุดนี้^{[ 3 ]}เมื่อต้องจัดการกับชุดข้อมูลขนาดใหญ่ อาจเป็นประโยชน์ที่จะลดปริมาณข้อมูลที่ต้องจัดการลงด้วย^{[ 3 ]}วิธีการลดข้อมูลที่ใช้กันทั่วไปวิธีหนึ่งคือการ สุ่มตัวอย่างข้อมูล ที่เป็นมาตรฐานจากฐานข้อมูล ส่งผลให้ได้ผลลัพธ์ที่เร็วขึ้นมาก แต่ยังคงเทียบเท่าทางสถิติ^{[ 3 ]}

ณ จุดนี้ ข้อมูลจะถูกแบ่งออกเป็นสองส่วนที่เท่ากันแต่แยกจากกันโดยสิ้นเชิง คือ ชุดข้อมูลทดสอบและชุดข้อมูลฝึกฝน^{[ 2 ]}ชุดข้อมูลฝึกฝนจะถูกใช้เพื่อพัฒนากฎให้ตรงกับชุดข้อมูลฝึกฝนอย่างใกล้ชิด^{[ 2 ]}จากนั้นชุดข้อมูลทดสอบจะยืนยันหรือปฏิเสธกฎเหล่านี้^{[ 2 ]}

อัลกอริทึมเชิงวิวัฒนาการทำงานโดยพยายามเลียนแบบวิวัฒนาการ ตาม ธรรมชาติ^{[ 3 ]}ขั้นแรก ชุด "กฎ" แบบสุ่มจะถูกตั้งไว้บนชุดข้อมูลฝึกฝน ซึ่งพยายามสรุปข้อมูลให้เป็นสูตร^{[ 3 ]}กฎเหล่านี้จะถูกตรวจสอบ และกฎที่เหมาะสมกับข้อมูลมากที่สุดจะถูกเก็บไว้ ส่วนกฎที่ไม่เหมาะสมกับข้อมูลจะถูกทิ้งไป^{[ 3 ]}จากนั้นกฎที่ถูกเก็บไว้จะถูกกลายพันธุ์และคูณเพื่อสร้างกฎใหม่^{[ 3 ]}

กระบวนการนี้จะทำซ้ำตามความจำเป็นเพื่อสร้างกฎที่ตรงกับชุดข้อมูลให้ใกล้เคียงที่สุด^{[ 3 ]}เมื่อได้กฎนี้แล้ว จะทำการตรวจสอบกับชุดข้อมูลทดสอบ^{[ 2 ]}หากกฎยังคงตรงกับข้อมูล แสดงว่ากฎนั้นถูกต้องและจะถูกเก็บไว้^{[ 2 ]}หากไม่ตรงกับข้อมูล กฎนั้นจะถูกทิ้งและกระบวนการจะเริ่มต้นใหม่โดยการเลือกกฎแบบสุ่มอีกครั้ง^{[ 2 ]}