กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 2 นาที

เอ็กซ์พาสซี่

Expasy เป็น แหล่ง ข้อมูลชีวสารสนเทศ ออนไลน์ ที่ดำเนินการโดย สถาบันชีวสารสนเทศแห่งสวิตเซอร์แลนด์ (SIB ) เป็น พอร์ทัล ที่ขยายได้ และ บูร ณาการ...

เอ็กซ์พาสซี่

โลโก้ Expasy 2020

Expasyเป็น แหล่ง ข้อมูลชีวสารสนเทศ ออนไลน์ ที่ดำเนินการโดยสถาบันชีวสารสนเทศแห่งสวิตเซอร์แลนด์ (SIB ) เป็น พอร์ทัล ที่ขยายได้และ บูร ณาการซึ่งให้การเข้าถึงฐานข้อมูลและเครื่องมือซอฟต์แวร์มากกว่า 160 รายการ และสนับสนุนสาขาวิทยาศาสตร์ชีวภาพและการวิจัยทางคลินิกหลากหลายสาขา ตั้งแต่จีโนมิกส์โปรตีโอมิกส์และชีววิทยาโครงสร้างไปจนถึงวิวัฒนาการและฟิโลเจเนติกส์ ชีววิทยาระบบและเคมีทางการแพทย์ทรัพยากรแต่ละรายการ (ฐานข้อมูล เครื่องมือซอฟต์แวร์บนเว็บและที่ดาวน์โหลดได้) ถูกจัดเก็บแบบกระจายศูนย์โดยกลุ่มต่างๆ ของสถาบันชีวสารสนเทศแห่งสวิตเซอร์แลนด์ (SIB) และสถาบันพันธมิตร

เครื่องมือค้นหา

การสอบถามข้อมูลจาก Expassy อนุญาตให้:

  1. การค้นหาแบบขนานจะทำการค้นหาในฐานข้อมูล SIB ผ่านการค้นหาเพียงครั้งเดียว
  2. ผลการค้นหาที่รวบรวมจากชุดทรัพยากรทั้งหมดกว่า 160 รายการที่สามารถเข้าถึงได้จากพอร์ทัล[ 1 ]

Expassy ให้ข้อมูลที่ทันสมัยที่สุดจากเวอร์ชันล่าสุดของแต่ละแหล่งข้อมูล

คำศัพท์ที่ใช้ใน Expasy อ้างอิงจากออนโทโลยี ที่ครอบคลุม ของ EDAM [ 2 ]

ประวัติศาสตร์

Expasy ถูกสร้างขึ้นในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2536 เดิมทีเรียกว่าExPASy ( Expert Protein Analysis System) และทำหน้าที่เป็น เซิร์ฟเวอร์ โปรตีโอมิส์เพื่อวิเคราะห์ลำดับและโครงสร้างของโปรตีน และการแยกโปรตีนด้วยเจลอิเล็กโทรโฟ เรซิสแบบสองมิติ (2-D Page electrophoresis) [ 3 ]ในบรรดาสิ่งอื่นๆ ExPASy เป็นที่ตั้งของฐานข้อมูลความรู้ลำดับโปรตีนUniProtKB/Swiss-Protและส่วนเสริมที่คอมพิวเตอร์ระบุ UniProtKB/TrEMBL [ 4 ]

ExPASy เป็นเว็บไซต์แรกของวิทยาศาสตร์ชีวภาพและอยู่ในกลุ่ม 150 เว็บไซต์แรกของโลก ณ วันที่ 5 เมษายน 2550 ExPASy ได้รับการเข้าชม 1 พันล้านครั้งนับตั้งแต่เปิดตัวเมื่อวันที่ 1 สิงหาคม 2536 [ 5 ]

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2554 ได้กลายเป็นพอร์ทัลทรัพยากรชีวสารสนเทศ SIB ExPASy: แคตตาล็อกทรัพยากรชีวสารสนเทศที่หลากหลายซึ่งพัฒนาโดยกลุ่ม SIB [ 6 ] Expasy เวอร์ชันปัจจุบันได้รับการเผยแพร่ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2563 [ 7 ] [ 8 ]

หมายเหตุและเอกสารอ้างอิง

  1. ^ "แหล่งข้อมูล SIB" . sib.swiss . สืบค้นเมื่อ 27 ตุลาคม 2020 .
  2. ^ Ison J, Kalas M, Jonassen I, Bolser D, Uludag M, McWilliam H และคณะ (พฤษภาคม 2013). "EDAM: ออนโทโลยีของการดำเนินการทางชีวสารสนเทศ ประเภทของข้อมูลและตัวระบุ หัวข้อ และรูปแบบ" . Bioinformatics . 29 (10): 1325– 32. doi : 10.1093/bioinformatics/btt113 . PMC 3654706 . PMID 23479348 .  
  3. ^ Gasteiger E, Gattiker A, Hoogland C, Ivanyi I, Appel RD, Bairoch A (กรกฎาคม 2546). "ExPASy: เซิร์ฟเวอร์โปรตีโอมิกส์สำหรับความรู้และการวิเคราะห์โปรตีนเชิงลึก" . Nucleic Acids Research . 31 (13): 3784– 8. doi : 10.1093/nar/gkg563 . PMC 168970 . PMID 12824418 .  
  4. ^ "UniProtKB/Swiss-Prot - SIB สถาบันชีวสารสนเทศแห่งสวิตเซอร์แลนด์ | Expasy" . www.expasy.org . สืบค้นเมื่อ15 มีนาคม 2024 .
  5. ^ ExPASy: พอร์ทัลแหล่งข้อมูลชีวสารสนเทศของ SIB
  6. อาร์ติโม พี, จอนนาลาเกดดา เอ็ม, อาร์โนลด์ เค, บาราติน ดี, ซีซาร์ดี จี, เด คาสโตร อี และคณะ (กรกฎาคม 2555). "ExPASy: พอร์ทัลทรัพยากรชีวสารสนเทศศาสตร์ SIB " การวิจัยกรดนิวคลีอิก40 (ปัญหาเว็บเซิร์ฟเวอร์): W597-603 ดอย : 10.1093/nar/ gks400 PMC 3394269 . PMID22661580 .  
  7. ดูโวด์, เซเวอรีน; กาเบลลา, เคียรา; ลิซาเซค, เฟรเดอริก; สต็อคกิ้งเกอร์, ไฮนซ์; อิโออันนิดิส, วาสซิลิออส; ดูรินซ์, คริสติน (13 เมษายน 2564). "Expasy พอร์ทัลทรัพยากรชีวสารสนเทศศาสตร์ของสวิส ออกแบบโดยผู้ใช้ " การวิจัยกรดนิวคลีอิก49 (W1): W216– W227. ดอย : 10.1093/nar/gkab225 . ISSN 0305-1048 . พีเอ็มซี8265094 . PMID 33849055 .   
  8. ^ "ค้นพบ Expasy.org ใหม่ เว็บไซต์แหล่งข้อมูลชีวสารสนเทศของสวิตเซอร์แลนด์" . sib.swiss . สืบค้นเมื่อ26 ตุลาคม 2020 .
  • เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Expasy&oldid=1335451888 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เอ็กซ์พาสซี่

Expasy เป็น แหล่ง ข้อมูลชีวสารสนเทศ ออนไลน์ ที่ดำเนินการโดย สถาบันชีวสารสนเทศแห่งสวิตเซอร์แลนด์ (SIB ) เป็น พอร์ทัล ที่ขยายได้ และ บูร ณาการ...

ประวัติศาสตร์

Expasy ถูกสร้างขึ้นในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2536 เดิมทีเรียกว่า ExPASy ( Expert Protein Analysis System) และทำหน้าที่เป็น เซิร์ฟเวอร์ โปรตี โอ มิ ก ส์ เพื่อวิเคราะห์ลำดับและโครงสร้าง ของโปรตีน และการแยกโปรตีนด้วยเจลอิเล็กโทรโฟ เร ซิสแบบสองมิติ (2-D Page...

หมายเหตุและเอกสารอ้างอิง

^ "แหล่งข้อมูล SIB" . sib.swiss . สืบค้น เมื่อ 27 ตุลาคม 2020 . ^ Ison J, Kalas M, Jonassen I, Bolser D, Uludag M, McWilliam H และคณะ (พฤษภาคม 2013). "EDAM: ออนโทโลยีของการดำเนินการทางชีวสารสนเทศ ประเภทของข้อมูลและตัวระบุ หัวข้อ และรูปแบบ" . Bioinformatics .

ลิงก์ภายนอก

เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Expasy&oldid=1335451888 "