สโมสรแห่งนี้ดำเนินงานมาตั้งแต่ปี 1997 โดยเริ่มแรกเป็นทีมสมัครเล่นที่ใช้ชื่อเดียวกับมหาวิทยาลัย Khazarซึ่งเป็นมหาวิทยาลัยเอกชนแห่งแรกในอาเซอร์ไบจาน และเป็นผู้ก่อตั้งสโมสร ในปี 1999 มหาวิทยาลัย Khazar เริ่มเล่นในลีกสูงสุดของอาเซอร์ไบจานโดยจบอันดับที่ 11 ^{[ 2 ]}ในปีต่อๆ มา อินเตอร์จบอันดับที่ 7 (ฤดูกาล 2000/01) และอันดับที่ 3 (ฤดูกาล 2003–04)

ในฤดูกาล 2003–04 ทีมจบอันดับที่สี่ ทำให้ได้สิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขันUEFA Intertoto Cupเป็นครั้งแรก ในรอบแรกของการแข่งขันUEFA Intertoto Cup ปี 2004พวกเขาเอาชนะBregenzจากออสเตรีย 3–0 จากการที่ฝ่ายตรงข้ามไม่มาแข่งขันในเลกแรก และชนะ 2–1 ในเลกที่สอง^{[ 3 ]}ในรอบที่สอง พวกเขาเล่นกับTampere Unitedจากฟินแลนด์แพ้ในเลกแรก 0–3 ชนะในเลกที่สองซึ่งเล่นที่บากู 1–0 แต่ตกรอบด้วยผลรวม 1–3 ^{[ 4 ]}

ในช่วงฤดูร้อนปี 2004 สิทธิ์ทั้งหมดของสโมสรมหาวิทยาลัยคาซาร์ถูกโอนไปยัง สโมสรฟุตบอลอาชีพ อินเตอร์บากู ที่เพิ่งก่อตั้งขึ้นใหม่ และทีมได้เข้าร่วมการแข่งขันชิงแชมป์ลีกสูงสุดของอาเซอร์ไบจานครั้งที่ 13 ภายใต้ชื่ออินเตอร์บากู ต่อมาในปี 2004 ได้มีการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างการบริหารจัดการของสโมสร และอินเตอร์บากูได้เปลี่ยนชื่อเป็นอินเตอร์อาชีพคลับ โดยจบฤดูกาล 2004–2005 ในอันดับที่เจ็ด การไต่ระดับขึ้นของอินเตอร์ยังคงดำเนินต่อไปในฤดูกาลที่ 14 ของลีกสูงสุดของอาเซอร์ไบจาน โดยอินเตอร์จบในอันดับที่สี่

สโมสรจบอันดับสี่อีกครั้งในฤดูกาล 2006–07 และอันดับหนึ่งในฤดูกาล 2007–08 หลังจากฤดูกาลแห่งการคว้าแชมป์ อินเตอร์ได้ผ่านเข้ารอบยูฟ่าแชมเปียนส์ลีก เป็นครั้งแรก ในปี 2008และผ่านเข้ารอบคัดเลือกที่สองโดยเอาชนะราบอตนิชกีจากสาธารณรัฐมาซิโดเนียด้วยกฎประตูทีมเยือน^{[ 5 ]}

ใน ปี 2009 อินเตอร์ บากูสามารถรักษา ตำแหน่งแชมป์ พรีเมียร์ลีกอาเซอร์ไบจานไว้ได้ ซึ่งเป็นการคว้าแชมป์ครั้งที่สองในประวัติศาสตร์ของสโมสร ส่วน การแข่งขัน แชมเปี้ยนส์ลีก นั้น ไม่ประสบความสำเร็จเท่าที่ควร โดยแพ้ให้กับเลช พอซนานในการดวลจุดโทษนอกบ้าน^{[ 6 ]} ในปี 2011 อินเตอร์ บากูยังสามารถคว้าแชมป์ CIS Cupได้สำเร็จหลังจากเอาชนะชัคเตียร์ โซลิกอร์สค์ในรอบชิงชนะเลิศ^{[ 7 ] [ 8 ]}

ในปี 2012 สโมสรทำสถิติชนะมากที่สุดในการแข่งขันระดับยุโรปของอาเซอร์ไบจานด้วยการเอาชนะนาร์วา ทรานส์ 5-0 ในเอสโตเนีย [ ^{9 ] สโมสร}เริ่มต้นฤดูกาล 2013–14ด้วยการแพ้ติดต่อกัน 3 นัด ซึ่งเป็นสถิติการเริ่มต้นฤดูกาลที่แย่ที่สุดในประวัติศาสตร์^{[ 10 ]}อย่างไรก็ตาม ทีมก็สามารถคว้าอันดับสองในลีกได้^{[ 11 ]}

ในช่วงฤดูกาล 2015–16 อินเตอร์เริ่มประสบปัญหาทางการเงินพร้อมๆ กับผู้สนับสนุนหลักอย่างธนาคารระหว่างประเทศแห่งอาเซอร์ไบจาน ในเดือนธันวาคม 2015 ประธานสโมสร จอร์จี นิโคลอฟ ถูกแทนที่โดยราชาด กาซิมอฟ เมื่อวันที่ 31 มีนาคม 2016 อินเตอร์ บากู ถูกแบนจากการเข้าร่วมการแข่งขันสโมสรยูฟ่าครั้งต่อไปที่พวกเขาจะผ่านเข้ารอบในอีกสามฤดูกาลถัดไป ซึ่งครอบคลุมฤดูกาล 2016/17, 2017/18 และ 2018/19 ^{[ 12 ]}

สถานการณ์ยังคงดำเนินต่อไปในช่วงฤดูกาล 2016–17 เมื่ออินเตอร์ประสบปัญหาในการจ่ายเงินเดือนให้กับผู้เล่นและทำการซื้อตัวผู้เล่นใหม่ แม้จะเป็นเช่นนั้น อินเตอร์ก็สามารถคว้าเหรียญทองแดงในการแข่งขันชิงแชมป์แห่งชาติและเข้าถึงรอบรองชนะเลิศในรายการฟุตบอลถ้วยได้ เมื่อสิ้นสุดฤดูกาล IBA ประกาศว่าจะไม่ให้การสนับสนุนสโมสรอีกต่อไป ซึ่งนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงในฝ่ายบริหาร ซาอูร์ อัคฮุนดอฟ อดีตผู้อำนวยการสหพันธ์ฟุตซอลแห่งชาติ ได้รับแต่งตั้งเป็นหัวหน้าคณะกรรมการกำกับดูแล และรามิช มาลิเยฟ กลายเป็นผู้อำนวยการบริหารคนใหม่ของสโมสร แม้จะมีข่าวลือเกี่ยวกับการล้มละลาย อินเตอร์ก็สามารถหาผู้สนับสนุนได้สำหรับฤดูกาล 2017–18 และได้เข้าร่วมการแข่งขันยูโรปา ลีก โดยสามารถเอาชนะมลาดอสต์ ลูชานี จากเซอร์เบีย ในรอบคัดเลือกแรก ก่อนจะตกรอบโดยโฟลา เอชในรอบที่สอง

เมื่อวันที่ 28 ตุลาคม 2017 อินเตอร์ บากู พีไอเค ได้เปลี่ยนชื่ออย่างเป็นทางการเป็นเคชเล เอฟเค [ ^{13 ] สโมสร}ยังได้เปลี่ยนโลโก้และสีเสื้อแข่งด้วย ในการแข่งขันนัดแรก เคชเลแพ้ให้กับคาปาซ 0–2 ในวันถัดมา ผู้จัดการทีมซาอูร์ สวานาด เซ ถูกแทนที่โดยรามิซ มัมมาดอฟ [ ^{14 ] เมื่อ}วันที่ 25 ธันวาคม 2017 เคชเลประกาศว่า มัมมาดอฟ ได้เป็นผู้อำนวยการฝ่ายกีฬาของสโมสร โดยมียูริ มักซิมอฟเข้ามาเป็นผู้จัดการทีมคนใหม่^{[ 15 ]}เมื่อวันที่ 17 กรกฎาคม 2018 Maksymov ถูกปลดออกจากตำแหน่ง^{[ 16 ]}และMladen Milinkovićได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้จัดการคนใหม่เมื่อวันที่ 25 กรกฎาคม 2018 ^{[ 17 ]}เมื่อวันที่ 29 ตุลาคม 2018 Milinković ถูกปลดออกจากตำแหน่งผู้จัดการ^{[ 18 ]}โดยTarlan Ahmadovได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้แทนเมื่อวันที่ 30 ตุลาคม 2018 ^{[ 19 ]}เมื่อวันที่ 8 สิงหาคม 2020 Ahmadov ออกจาก Keşlə ^{[ 20 ]}

เมื่อวันที่ 16 สิงหาคม 2020 Keşlə ประกาศแต่งตั้งYunis Huseynov เป็นผู้จัดการทีมคนใหม่ ^{[ 21 ]}เมื่อวันที่ 24 มกราคม 2021 Huseynov ลาออก^{[ 22 ]} Sanan Gurbanovได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้จัดการทีมคนใหม่ของสโมสรเมื่อวันที่ 25 มกราคม 2021 ^{[ 23 ]}

เมื่อวันที่ 6 เมษายน 2565 ลีกสูงสุดของอาเซอร์ไบจานได้อนุมัติการเปลี่ยนชื่อของ Keşlə FK เป็น Şamaxı FK ^{[ 24 ]}

ข้อมูล ณ วันที่แข่งขัน 29 กรกฎาคม 2564

เกมของชามัคคีในการแข่งขันของยูฟ่า
ฤดูกาล	การแข่งขัน	กลม	คลับ	บ้าน	ห่างออกไป	มวลรวม
2004	อินเตอร์โตโต้ คัพ	อาร์1	เบรเกนซ์	2–1	3–0	5–1
		อาร์2	แทมเปเร่ ยูไนเต็ด	1–0	0–3	1–3
2551–2552	แชมเปี้ยนส์ลีก	1Q	ราบอตนิชกิ	0–0	1–1	1–1 ( ก )
		ไตรมาสที่ 2	ปาร์ติซาน	1–1	0–2	1–3
2552–2553	ยูโรปา ลีก	ไตรมาสที่ 2	สปาร์ตัก ตรนาวา	1–2	1–3	2–5
2553–2554	แชมเปี้ยนส์ลีก	ไตรมาสที่ 2	เลช โปซนาน	0–1	1–0	1–1 (8–9 หน้า )
2012–13	ยูโรปา ลีก	1Q	นาร์วา ทรานส์	5–0	2–0	7–0
		ไตรมาสที่ 2	แอสเตราส ทริโปลิส	1–1	1–1	2–2 (2–4 หน้า )
2013–14	ยูโรปา ลีก	1Q	IFK มารีฮัมน์	1–1	2–0	3–1
		ไตรมาสที่ 2	ทรอมโซ	1–0	0–2	1–2
2014–15	ยูโรปา ลีก	1Q	ติรัสปอล	3–1	3–2	6–3
		ไตรมาสที่ 2	IF Elfsborg	0–1	1–0	1–1 (3–4 หน้า )
2015–16	ยูโรปา ลีก	1Q	ลาซี	0–0	1–1	1–1 ( ก )
		ไตรมาสที่ 2	เอฟเอช	2–2	2–1	4–3
		3Q	แอธเลติก บิลเบา	0–0	0–2	0–2
2017–18	ยูโรปา ลีก	1Q	มลาดอสต์ ลูชานี	2–0	3–0	5–0
		ไตรมาสที่ 2	โฟล่า เอช	1–0	1–4	2–4
2018–19	ยูโรปา ลีก	1Q	บัลซาน	2–1	1–4	3–5
2020–21	ยูโรปา ลีก	1Q	ลาซี	0–0 (4–5 หน้า )	— ไม่มีข้อมูล	— ไม่มีข้อมูล
2021–22	ยูโรปา คอนเฟอเรนซ์ ลีก	ไตรมาสที่ 2	โซชี	2–4	0–3	2–7

ณ วันที่ 28 พฤษภาคม พ.ศ. 2569 ^{[ 26 ]}

หมายเหตุ: ธงแสดงถึงทีมชาติ ตามที่กำหนดไว้ในกฎเกณฑ์คุณสมบัติของฟีฟ่าโดยมีข้อยกเว้นบางประการ ผู้เล่นอาจถือสัญชาติที่ไม่ใช่สัญชาติของฟีฟ่าได้มากกว่าหนึ่งสัญชาติ

เลขที่ ตำแหน่ง ประเทศชาติ ผู้เล่น 1 ผู้รักษาประตู  ปอร์ ริคาร์โด เฟอร์นันเดส 7 เอ็มเอฟ  อาเซ่ เอ็ดการ์ อดิลคาโนฟ 13 เอ็มเอฟ  ปอร์ ริคาร์โด อโปลินาริโอ

เลขที่ ตำแหน่ง ประเทศชาติ ผู้เล่น 19 เอฟดับบลิว  เอ็นจีเอ อับดุลลาฮี ชูไอบู 44 ดีเอฟ  บรา เดวิด 62 ผู้รักษาประตู  อาเซ่ อับดุลลา เซยิดาห์มาดอฟ 80 เอฟดับบลิว  อาเซ่ ฮาบิบ อิสมายิลอฟ 97 เอ็มเอฟ  อาเซ่ โอรุค มัมมาดอฟ — เอฟดับบลิว  อาเซ่ อูเกอร์ ชาฮันจิรอฟ

ข้อมูล ณ วันที่แข่งขัน 22 พฤษภาคม 2565

	ชื่อ	ปี	ลีก	ถ้วยอาเซอร์ไบจาน	ยุโรป	ทั้งหมด
1	บาชานา ทสคาดัดเซ	2011–2015	36 (116)	10 (20)	6 (11)	47 (147)
2	นิซามิ ฮาจิเยฟ	2007–2008 2010–2013 2014–2017	28 (139)	4 (22)	4 (16)	36 (177)
3	วอลเตอร์ กูกลิเอลโมเน	พ.ศ. 2550–2552	28 (44)	4 (?)	1 (3)	33 (47+)
4	คากานี มัมมาดอฟ	พ.ศ. 2550–2552	22 (35)	3 (?)	0 (5)	25 (40+)
5	โรเบอร์ตัส โปสคุส	พ.ศ. 2552–2554	17 (49)	3 (5+)	0 (2)	20 (46+)
5	เซซาร์ เมซา	ปี 2013–2015, 2016 , 2018, 2019–2021	10 (86)	8 (18)	2 (2)	20 (106)
5	วากิฟ จาวาดอฟ	2013–2014 2018–2020	17 (52)	2 (7)	1 (5)	20 (64)
8	เราฟ อาลีเยฟ	2016–2017	12 (36)	3 (5)	2 (10)	17 (51)
9	เกิร์ตส์ คาร์ลสันส์	พ.ศ. 2552–2558	10 (63)	5 (7+)	1 (2)	16 (72+)
10	เปตาร์ ซลาตินอฟ	พ.ศ. 2551–2556	14 (107)	0 (9+)	1 (10)	15 (126+)

สิบอันดับแรกของผู้เล่นที่มีจำนวนการลงสนามมากที่สุด

ผู้เล่น		ระยะเวลา	หมวก	เป้าหมาย
1	โวโลดิมีร์ เลวิน	2547–2556	204	11
2	อาซิฟ มัมมาดอฟ	2008–10; 2011–2015	118	7
3	บาชานา ทสคาดัดเซ	พ.ศ. 2553–2558	117	47
4	จอร์จิ โลไมอา	พ.ศ. 2552–2559	108	0
5	อาริฟ ดาชเดมิรอฟ	พ.ศ. 2553–2558	98	5
6	เปตาร์ ซลาตินอฟ	2008–13	97	10
7	อิเลีย คันเดลากิ	2010–13	75	3
8	เอลมาร์ บาคชีเยฟ	2547–2550	74	1
9	เกิร์ตส์ คาร์ลสันส์	2552–2555	73	36
10	บรอนิสลาฟ เชอร์เวนกา	2550–2555	72	5

• สันนิบาตอาเซอร์ไบจาน
  • ผู้ชนะ (2) : 2007–08 , 2009–10
• ถ้วยอาเซอร์ไบจาน
  • ผู้ชนะ (2) : 2017–18 , 2020–21

• ถ้วยซีไอเอส
  • ผู้ชนะ (1) : 2011