สงครามรอยแยกคือสงครามที่เกิดขึ้นระหว่างกลุ่มอัตลักษณ์สองกลุ่มขึ้นไป (โดยปกติจะเป็นศาสนาหรือชาติพันธุ์) จากอารยธรรมที่แตกต่างกัน^{[ 1 ]}เป็นความขัดแย้งระหว่างรัฐหรือกลุ่มจากอารยธรรม ที่แตกต่างกัน ซึ่งกลายเป็นความรุนแรง สงครามเหล่านี้อาจเกิดขึ้นระหว่างรัฐ ระหว่างกลุ่มที่ไม่ใช่รัฐบาล หรือระหว่างรัฐกับกลุ่มที่ไม่ใช่รัฐบาล บ่อยครั้งที่ประเด็นในสงครามรอยแยกมักเป็นเรื่องดินแดน แต่ก็อาจเป็นเรื่องการควบคุมผู้คนได้เช่นกัน สงครามดังกล่าวภายในรัฐอาจเกี่ยวข้องกับกลุ่มที่ส่วนใหญ่อยู่ในดินแดนที่แตกต่างกัน หรือกลุ่มที่ผสมผสานกัน ในกรณีหลัง ความรุนแรงมักปะทุขึ้นเป็นระยะ^{[ 2 ]}

ประเด็นสำคัญในสงครามรอยแยกเป็นสัญลักษณ์สำหรับกลุ่มใดกลุ่มหนึ่งที่เกี่ยวข้องอย่างน้อยหนึ่งกลุ่ม เนื่องจากประเด็นดังกล่าวเป็นเรื่องของอัตลักษณ์พื้นฐาน สงครามเหล่านี้จึงยืดเยื้อและยากต่อการแก้ไขมากกว่าสงครามทั่วไปและแม้ว่าจะบรรลุข้อตกลงกันได้ กลุ่มต่างๆ ก็แทบจะไม่พึงพอใจอย่างเต็มที่ และบ่อยครั้งความเกลียดชังจะสลายไปได้ก็ต่อเมื่อมีการฆ่าล้างเผ่าพันธุ์^{[ 3 ]}

แนวคิดเรื่องสงครามรอยแยกถูกนำเสนอครั้งแรกโดยนักทฤษฎีการทหารซามูเอล ฮันติงตันในหนังสือThe Clash of Civilizations ปี 1996 ของเขา ฮันติงตันกล่าวว่า สงครามรอยแยกมักเกิดขึ้นระหว่างรัฐที่ข้ามอารยธรรม เขาเรียกสิ่งเหล่านี้ว่า "รัฐรอยแยก" ฮันติงตันยก ตัวอย่าง สงครามบอสเนียเป็นตัวอย่างของสงครามรอยแยก โดยสังเกตว่าความแตกต่างทางศาสนาเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหลักของความขัดแย้ง^{[ 4 ]}ในการวิจารณ์หนังสือThe Clash of Civilizations ของเขา ฟลอเรียน บีเบอร์ตั้งข้อสังเกตว่าฮันติงตันทำให้สาเหตุของความขัดแย้งในบอลข่านง่ายเกินไป และดูเหมือนจะมองข้ามลัทธิชาตินิยมว่าเป็นปัจจัยหนึ่ง^{[ 5 ]}

• การแบ่งแยกบอลข่าน
• ความขัดแย้งทางสังคมที่ยืดเยื้อ
• การปะทะกันของอารยธรรม