ระบบรากฝอยเป็นระบบที่ตรงข้ามกับ ระบบ รากแก้วโดยปกติแล้วจะประกอบด้วยรากฝอย บางๆ ที่แตกแขนงปานกลาง งอก ออกมาจากลำต้นระบบรากฝอยพบได้ทั่วไปใน พืชใบเลี้ยง เดี่ยวและเฟิร์นเมื่อพืชเจริญเติบโตเต็มที่ ระบบรากฝอยจะมีลักษณะคล้ายพรมที่ทำจากราก

ต้นไม้ส่วนใหญ่เริ่มต้นชีวิตด้วยรากแก้วแต่หลังจากนั้นหนึ่งถึงสองปีจะเปลี่ยนเป็นระบบรากฝอยที่แผ่กว้าง โดยส่วนใหญ่เป็นรากผิวดินในแนวนอน และมีเพียงไม่กี่รากที่ยึดเกาะในแนวตั้งและลึก ต้นไม้ที่โตเต็มที่โดยทั่วไปสูง 30-50 เมตรจะมีระบบรากที่แผ่ขยายออกไปในแนวนอนทุกทิศทางไกลเท่ากับความสูงของต้นไม้หรือมากกว่านั้น แต่รากมากกว่า 95% จะอยู่ในระดับความลึก 50 เซนติเมตรแรกของดิน

พืชบางชนิดที่มีระบบรากแบบเส้นใย:

• ต้นมะพร้าว^{[ 1 ]}
• หญ้า
• โรสแมรี่

รากฝอยเจริญเติบโตค่อนข้างใกล้กับผิวดิน ใบที่มีเส้นใบขนานกันจะมีรากฝอย

พืชอาหารสัตว์มีระบบรากฝอย ซึ่งช่วยต่อต้านการกัดเซาะโดยการยึดพืชไว้กับชั้นบนสุดของดิน และปกคลุมพื้นที่ทั้งหมด เนื่องจากเป็นพืชที่ไม่ขึ้นเป็นแถว^{[ 2 ]}ในระบบรากฝอย รากจะเจริญเติบโตลงไปในดิน และแตกแขนงออกไปด้านข้างทั่วทั้งดิน ทำให้เกิดกลุ่มรากฝอยจำนวนมาก โดยไม่มีรากแก้วที่ชัดเจน เนื่องจากรากอ่อนจะตายไปในขณะที่พืชยังเล็กและกำลังเจริญเติบโต^{[ 3 ]}