โดยทั่วไปแล้วธงชาติของประเทศที่นำธงนั้นมาแสดงจะได้รับเกียรติสูงสุด รองลงมาคือธงของหน่วยงานระดับรองลงมา (เช่น รัฐหรือจังหวัด) และจากนั้นจึงเป็นธงอื่นๆ เช่น ธงของกองทัพ หรือธงส่วนบุคคล

ในกรณีของประเทศต่างชาติ ประเทศเจ้าบ้านจะได้รับความสำคัญสูงสุด และธงชาติของประเทศอื่น ๆ จะถูกแสดงตามลำดับตัวอักษร^{[ 1 ]}ตำแหน่งที่มีความสำคัญสูงสุดนี้อยู่ที่ความสูงเท่ากับธงชาติของประเทศอื่น ๆ ไม่ควรแสดงธงชาติของประเทศใดสูงกว่าธงชาติของประเทศอื่นในยามสงบ^{[ 2 ]}

ธงที่ได้รับเกียรติสูงสุดจะอยู่ตรงกลางหรือค่อนไปทางขวาของธง (ด้านซ้ายของผู้ดู) เมื่อถือเรียงแถวเดียว (เช่น ในพิธีถือธง ) ธงที่ได้รับเกียรติสูงสุดจะอยู่ด้านหน้า

เมื่อเสาสองต้นไขว้กัน ตำแหน่งที่ได้รับเกียรติคือธงที่สิ้นสุดทางด้านซ้ายเมื่อมองจากมุมมองของผู้สังเกต (ดังนั้นเสาจะสิ้นสุดทางด้านขวา) ในรูปครึ่งวงกลม ตำแหน่งที่ได้รับเกียรติคือจุดศูนย์กลาง หากใช้เป็นวงกลมเต็มวงด้านนอกทางเข้า ตำแหน่งที่ได้รับเกียรติจะอยู่เหนือทางเข้าโดยตรง หากใช้ประดับผนังห้อง ควรวางธงไว้ตรงข้ามกับทางเข้าโดยตรง เมื่อวางไว้กับแท่นหรือสถานที่สักการะ ควรแขวนธงไว้ด้านหลังหรือบนเสาทางด้านขวาของผู้พูด เมื่อมองจากมุมมองของธง^{[ 3 ] [ 4 ]}

บนยานพาหนะ ควรติดธงไว้ที่กระจกหรือติดให้แน่นที่ด้านหน้าของตัวรถ ด้านที่อยู่ใกล้คนขับ (กล่าวคือ ในประเทศที่ขับรถทางด้านขวา ธงจะอยู่ทางด้านขวาของรถ) ในกรณีที่ประมุขหรือหัวหน้ารัฐบาลของประเทศเจ้าภาพนั่งรถคันเดียวกันกับประมุขหรือหัวหน้ารัฐบาลของประเทศเจ้าภาพ ธงของประเทศเจ้าภาพจะอยู่ด้านที่อยู่ใกล้คนขับ ส่วนธงของประเทศผู้มาเยือนจะอยู่ด้านที่ไกลจากคนขับ

เมื่อชักธงในแนวนอน เช่น บนเสาธง ควรวางธงให้ส่วนที่เป็นรูปสี่เหลี่ยมมุมฉากอยู่ใกล้กับส่วนบนสุดของเสามากที่สุด หากแขวนไว้กับผนัง ควรวางส่วนที่เป็นรูปสี่เหลี่ยมมุมฉากไว้ที่มุมบนซ้ายเมื่อมองจากมุมมองของผู้สังเกต

เมื่อแขวนธงในแนวตั้ง ควรหมุนธงเพื่อให้ส่วนที่เป็นรูปสี่เหลี่ยมมุมฉากอยู่ใกล้กับส่วนบนสุดของเสามากที่สุด หากแสดงธงชิดผนัง ส่วนที่เป็นรูปสี่เหลี่ยมมุมฉากควรปรากฏอยู่ที่มุมบนซ้ายอีกครั้ง ซึ่งจำเป็นต้องหมุนและ "พลิก" ธงจากแนวนอนด้วย

บางครั้งในการบินโชว์ เพื่อเป็นพิธีการ จะมีการชักธงขึ้นสู่ยอดเสาโดยใช้เชือกถ่วงน้ำหนักที่ห้อยลงมาจากใต้เฮลิคอปเตอร์

กรมสำนักนายกรัฐมนตรีและคณะรัฐมนตรีออกระเบียบปฏิบัติที่ไม่ผูกมัดสำหรับการชักธงชาติและธงอื่นๆ ของออสเตรเลียบุคคลใดๆ ก็สามารถชักธงได้ แม้ว่ากรมจะแนะนำว่า "ควรปฏิบัติต่อธงด้วยความเคารพและศักดิ์ศรีที่สมควรได้รับในฐานะสัญลักษณ์ประจำชาติที่สำคัญที่สุดของประเทศ" ^{[ 5 ]}อย่างไรก็ตาม ไม่มีกฎหมายใดบังคับใช้ระเบียบปฏิบัติเหล่านี้หรือห้ามการดูหมิ่นธง แต่อย่าง ใด

ระเบียบการใช้ธงในเบลเยียมอยู่ภายใต้ลำดับความสำคัญที่เข้มงวดซึ่งกำหนดโดยพระราชกฤษฎีกาของรัฐบาลกลางและระดับภูมิภาค (เช่นแนวทางปฏิบัติของรัฐบาลเฟลมิช^{[ 6 ]} ):

1. ธงชาติเบลเยียม
2. ธงประจำชุมชนหรือภูมิภาค (เช่นสิงโตเฟลมิช ไก่แห่งวอลลูนหรือดอกไอริส แห่งบรัสเซลส์ )
3. ธงชาติยุโรป
4. ธงประจำจังหวัด
5. ธงประจำเทศบาล

ตำแหน่งของธงจะถูกกำหนดโดยการยืนหันหลังให้กับอาคาร (มุมมองของเจ้าภาพ) ขึ้นอยู่กับจำนวนธง: 1-2 , 2-1-3 , 3-1-2-4และ5-3-1-2-4บางสถาบันนิยมการจัดวางแบบสี่เสา เนื่องจากทำให้ธงชาติเบลเยียมและธงประจำภูมิภาคอยู่ในตำแหน่งตรงกลางสองตำแหน่ง ซึ่งจะช่วยหลีกเลี่ยงการที่ธงประจำภูมิภาคถูกลดบทบาทไปอยู่ "ด้านข้าง" ของธงชาติหลักเพียงธงเดียว

ระเบียบการใช้ธงชาติบราซิลกำหนดไว้ในกฎหมายรัฐบาลกลางของประเทศฉบับที่ 5.700 ตั้งแต่ปี 1971 โดยระบุว่าสามารถแสดงธงชาติได้เฉพาะในกรณีต่อไปนี้: ^{[ 7 ]}

• ยกขึ้นบนเสากระโดงหรือบนเชือกชักใบเรือ;
• ติดตั้งโดยไม่ต้องใช้เสา ไม่ว่าจะโดยการลากด้วยเครื่องบิน ติดตั้งบนผนัง หรือยึดติดกับสายเคเบิลแนวนอนที่เชื่อมต่ออาคาร ต้นไม้ หรือโครงสร้างอื่นๆ
• ทาสีลงบนผนัง หลังคา หน้าต่าง ยานพาหนะ หรือเครื่องบิน;
• การจัดขบวนธงร่วมกับธงอื่นๆ;
• นำไปใช้ในงานรับปริญญา ขบวนพาเหรด หรือพกพาโดยลำพัง;
• ขยายขนาดโลงศพก่อนฝัง

อาจไม่ได้ใช้งาน:

• คว่ำหรือวางตะแคงข้าง;
• หากชำรุดเสียหายหรือผลิตด้วยสัดส่วนที่ไม่ถูกต้อง;
• ใช้เป็นเสื้อผ้า ผ้าเช็ดปาก ผ้าปูโต๊ะ หรือผ้าคลุมสำหรับอนุสาวรีย์และแผ่นจารึกที่จะเปิดออก
• ใช้กับบรรจุภัณฑ์หรือห่อหุ้มผลิตภัณฑ์เชิงพาณิชย์ทุกชนิด

กฎอื่นๆ ได้แก่: ธงที่ชำรุดจะต้องนำไปเผาที่ฐานทัพทหารในวันธงชาติ ซึ่งเป็นพิธีระดับชาติประจำปี; ห้ามชักธงต่างประเทศโดยไม่มีธงชาติของประเทศอยู่เคียงข้าง ยกเว้นที่สถานทูตและสถานกงสุลต่างประเทศ; ธงชาติจะต้องส่องสว่างในเวลากลางคืนเสมอ; และจะต้องอยู่ในตำแหน่งที่ให้เกียรติ คืออยู่ตรงกลางและทางด้านขวาเสมอเมื่อแสดงร่วมกับธงต่างประเทศ^{[ 7 ]}

สมาชิกราชวงศ์และขุนนางแต่ละชนชั้นมีธงประจำ ราชวงศ์ของตนเอง ธงประจำพระองค์ของสุลต่านจะต้องโบกสะบัดอยู่เหนือพระราชวังนูรุลอิมาน เท่านั้น เฉพาะธงประจำพระองค์ของสุลต่าน มกุฎราชกุมาร เสนาบดี และขุนนางชั้นสูง (เชเตเรีย) เท่านั้นที่จะถูกโบกสะบัดทุกวัน ณ ที่ประทับของแต่ละพระองค์ ธงส่วนพระองค์ของเหล่าเพงกีรันและธงส่วนพระองค์ของขุนนางชั้นสูง (เช่น เปฮิน มันเตอรี) จะถูกโบกสะบัดเฉพาะในช่วงพิธีการที่สำนักนายกรัฐมนตรีประกาศ เช่น วันคล้ายวันประสูติของสุลต่าน วันอภิเษกสมรส และวันชาติ โดยทั่วไปประชาชนจะโบกธงชาติในช่วงเวลาดังกล่าว เช่นเดียวกับในหลายประเทศ ชาวบรูไนถือว่าการที่ธงชาติแตะพื้นเป็นสิ่งต้องห้าม

มีกฎที่กำหนดไว้สำหรับการชักธงชาติแคนาดาตัวอย่างเช่น "ธงชาติจะต้องชักบนเสาธงของตัวเองเสมอ...การชักธงชาติร่วมกับธงอื่นใดบนเสาธงเดียวกันนั้นไม่เหมาะสม" ^{[ 8 ]}รวมถึงการปฏิบัติตามแนวทางของตำแหน่งเกียรติยศด้วย^{[ 9 ]}

เนื่องจากมีการใช้ผ้าใยสังเคราะห์เพิ่มมากขึ้น แคนาดาจึงได้แก้ไขแนวทางการกำจัดธงชาติอย่างถูกต้องเมื่อไม่นานมานี้

• ธงที่ทำจากเส้นใยธรรมชาติ (ขนสัตว์ ฝ้าย ลินิน) ควรเผาทำลายอย่างมีเกียรติและเป็นส่วนตัว โดยปราศจากพิธีการหรือการดึงดูดความสนใจจากสาธารณชนต่อการทำลายวัสดุดังกล่าว
• ธงที่ทำจากวัสดุสังเคราะห์ (ไนลอนหรือโพลีเอสเตอร์) ไม่ควรนำไปเผาเนื่องจากก่อให้เกิดความเสียหายต่อสิ่งแวดล้อมและอาจก่อให้เกิดอันตรายจากไฟไหม้ ควรฉีกธงอย่างเคารพเป็นแถบ โดยแต่ละส่วนของธงควรเหลือเพียงสีเดียว เพื่อไม่ให้ชิ้นส่วนที่เหลือมีลักษณะเหมือนธง จากนั้นควรนำชิ้นส่วนแต่ละชิ้นใส่ถุงเพื่อนำไปทิ้ง เศษผ้าเหล่านั้นไม่ควรนำกลับมาใช้ใหม่หรือประดิษฐ์เป็นสิ่งใด^{[ 10 ]}

เมื่อเรือฝรั่งเศสลำหนึ่งพบกับเรือฝรั่งเศสอีกลำหนึ่ง เรือฝรั่งเศสลำหนึ่งจะลดธงลงและชักธงขึ้นเพื่อเป็นการทักทาย ส่วนเรือสินค้าที่พบกับเรือของกองทัพเรือฝรั่งเศสจะทักทายกันสามครั้ง

ธงชาติอินเดียมีระเบียบปฏิบัติที่โดดเด่นมาก^{[ 11 ]}อยู่ภายใต้การกำกับดูแลของประมวลกฎหมายธงชาติอินเดียพ.ศ. 2545; พระราชบัญญัติตราสัญลักษณ์และชื่อ (การป้องกันการใช้ที่ไม่เหมาะสม) พ.ศ. 2493 ; และพระราชบัญญัติป้องกันการดูหมิ่นเกียรติยศแห่งชาติ พ.ศ. 2514 ^{[ 12 ]}

การดูหมิ่นธงชาติมีโทษจำคุกสูงสุดสามปี หรือปรับ หรือทั้งจำทั้งปรับ^{[ 13 ]}

ระเบียบอย่างเป็นทางการระบุว่าธงจะต้องไม่สัมผัสพื้นดินหรือน้ำ หรือใช้เป็นผ้าม่านในรูปแบบใดๆ^{[ 14 ]}

การกำจัดธงที่เสียหายก็อยู่ภายใต้ประมวลกฎหมายเกี่ยวกับธงเช่นกัน ห้ามทิ้งธงที่เสียหายหรือสกปรก หรือทำลายอย่างไม่เคารพ ต้องทำลายทั้งผืนและในที่ส่วนตัว โดยควรเผาหรือใช้วิธีอื่นใดที่สอดคล้องกับศักดิ์ศรีของธง^{[ 15 ]}

ธงชาติญี่ปุ่นสามารถโบกสะบัดได้หลายทิศทาง

ธงชาติฟิลิปปินส์มีตำแหน่งที่กำหนดไว้อย่างเคร่งครัด ในยามสงบ ด้านสีน้ำเงินควรอยู่ทางขวา (ซ้ายของผู้สังเกต) และในยามสงคราม ด้านสีแดงควรอยู่ทางขวา (ซ้ายของผู้สังเกต) เมื่อชักธงขึ้นกลางถนน เช่น ระหว่างอาคารหรือเสา ธงควรถูกแขวนในแนวตั้งโดยให้แถบสีน้ำเงินชี้ไปทางทิศเหนือหรือทิศตะวันออก

เนื่องจากธงชาติซาอุดีอาระเบียมีคำปฏิญาณชาฮาดา อยู่ จึงไม่มีการลดธงลงครึ่งเสา

ธงชาติเกาหลีใต้สามารถโบกสะบัดได้ทุกที่ ระเบียบเกี่ยวกับธงยังกำหนดสีของเสาธงซึ่งควรจะเป็นสีขาว สีเงิน หรือสีเขียว และจัดทำแผ่นแบบก่อสร้างของฝาปิดปลาย เสา ซึ่งมีรูปร่างเหมือนดอกตูมของมูกุงฮวา^{[ 38 ]}

แตกต่างจากหลายประเทศ การใช้ธงชาติอังกฤษ ( Union Jack ) ในหลายๆ โอกาสที่ไม่เป็นทางการ เช่น การใช้บนเสื้อผ้า เป็นสิ่งที่ยอมรับได้

กระทรวงชุมชนและรัฐบาลท้องถิ่น ได้เผยแพร่ คู่มือภาษาอังกฤษแบบง่ายเกี่ยวกับการชักธงสำหรับประเทศอังกฤษในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2555 ซึ่งเป็น "บทสรุปของการควบคุมการชักธงแบบใหม่ที่ผ่อนปรนมากขึ้นซึ่งเริ่มใช้เมื่อวันที่ 12 ตุลาคม พ.ศ. 2555" ^{[ 39 ]}ในประเทศอังกฤษ กฎหมายที่ควบคุมการชักธงคือ ข้อบังคับการวางแผนเมืองและชนบท (การควบคุมโฆษณา) (อังกฤษ) (แก้ไขเพิ่มเติม) พ.ศ. 2550 ^{[ 40 ]}และ พ.ศ. 2555 ^{[ 41 ]}

ในวันที่มีการไว้ทุกข์ระดับชาติ เช่น หลังจากการสวรรคตของพระมหากษัตริย์ ธงทางการทั้งหมดรวมถึงธงยูเนี่ยนแจ็กจะถูกลดลงครึ่งเสา^{[ 42 ]}ธงเดียวในสหราชอาณาจักรที่ไม่เคยลดลงครึ่งเสาคือ ธง รอยัลสแตนดาร์ดซึ่งเป็นธงส่วนพระองค์ของพระมหากษัตริย์ เนื่องจากไม่มีพระมหากษัตริย์องค์ใดที่ขาดหายไป เพราะเมื่อพระมหากษัตริย์สวรรคต ผู้สืบราชบัลลังก์จะขึ้นครองราชย์ทันที^{[ 43 ]}ดังนั้น ธงจะต้องถูกชักขึ้นเต็มเสาตลอดเวลาเหนือที่ประทับ อาคาร เรือ หรือรถยนต์ที่พระมหากษัตริย์ประทับอยู่

เมื่อแสดงธงไม่ว่าจะในแนวนอนหรือแนวตั้งติดกับผนัง ด้านที่มีรูปดาวควรอยู่ด้านบนสุดและอยู่ทางด้านขวาของธง นั่นคืออยู่ทางด้านซ้ายของผู้สังเกต เมื่อแสดงธงในหน้าต่าง ก็ควรแสดงในลักษณะเดียวกัน โดยให้ด้านที่มีรูปดาวหรือด้านสีน้ำเงินอยู่ทางด้านซ้ายของผู้สังเกตที่อยู่บนถนน

ควรวางธงไว้ทางด้านขวาของผู้พูด (หรือเรียกว่าด้านขวาของธงเองหรือด้านซ้ายของผู้ชม) นั่นคือทางด้านซ้ายของแท่นพูดหรือแท่นเทศน์เมื่อผู้พูดหันหน้าเข้าหาผู้ชม แนวทางเดิมมีการแยกแยะว่าธงควรอยู่ระดับเดียวกับผู้พูดบนเวทีหรือระดับเดียวกับผู้ชม การแยกแยะนั้นได้ถูกยกเลิกไปแล้วและกฎก็ถูกทำให้ง่ายขึ้น^{[ 44 ]}

เมื่อลดธงลงครึ่งเสา ตามธรรมเนียมแล้วจะชักธงขึ้นสู่ยอดเสาอย่างรวดเร็ว แล้วค่อยๆ ลดลงมาอยู่ครึ่งเสา การทำเช่นนี้ก็ทำเช่นเดียวกันเมื่อลดธงลง การลดธงลงครึ่งเสาจะทำได้ก็ต่อเมื่อมีพระราชกฤษฎีกาของประธานาธิบดีหรือกฎหมายของรัฐสภาเท่านั้น ยกเว้นในสองวัน ได้แก่วันรำลึกเหตุการณ์เพิร์ลฮาร์เบอร์ซึ่งสามารถลดธงลงครึ่งเสาได้จนถึงพระอาทิตย์ตกดิน และ วันรำลึกถึงผู้เสียสละ (Memorial Day) ซึ่ง สามารถ ลดธงลงครึ่งเสาได้จนถึงเที่ยงวัน แล้วจึงชักขึ้นเต็มเสาในช่วงเวลาที่เหลือของวัน

เมื่อแสดงธงชาติสหรัฐอเมริกา เป็นธรรมเนียมที่จะต้องอยู่เหนือธงของรัฐเมื่อชักขึ้นบนเสาเดียวกัน เมื่อชักแยกกัน ธงของรัฐอาจอยู่ที่ความสูงเดียวกันกับธงชาติสหรัฐอเมริกา โดยธงชาติสหรัฐอเมริกาอยู่ทางซ้ายของธงของรัฐ เมื่อมองจากมุมมองของผู้ดู^{[ 45 ] [ 44 ]}เมื่อชักร่วมกับธงของรัฐหลายรัฐ ธงชาติสหรัฐอเมริกาควรอยู่ที่ความสูงเดียวกันและอยู่ทางขวาของธงนั้นเอง (ทางซ้ายของผู้ดู) หรืออยู่ตรงกลางและสูงกว่ากลุ่มธงของรัฐ^{[ 44 ]}ความคิดที่ว่าเฉพาะธงของรัฐเท็กซัสและฮาวายเท่านั้น—ซึ่งเคยเป็นธงชาติของสาธารณรัฐเท็กซัสและราชอาณาจักรฮาวาย—ที่สามารถชักขึ้นที่ความสูงเท่ากับธงชาติสหรัฐอเมริกาได้นั้นเป็นเพียงตำนานในความเป็นจริง ธงอื่นๆ ใดๆ ก็สามารถชักขึ้นที่ความสูงเท่ากับธงชาติสหรัฐอเมริกาได้ ตราบใดที่ธงชาติสหรัฐอเมริกาอยู่บนเสาซ้ายสุดเมื่อมองจากมุมมองของผู้ดู

ธงชาติสหรัฐอเมริกาใช้คลุมโลงศพของทหารผ่านศึกที่เสียชีวิตเมื่อใช้ในลักษณะนี้ ส่วนที่เป็นดาวสีขาวบนพื้นสีน้ำเงิน (ส่วนที่เรียกว่า "ยูเนียน") จะถูกวางไว้เหนือไหล่ซ้ายของผู้เสียชีวิต

ตามประมวลกฎหมายของสหรัฐอเมริกาหมวด 4 บทที่ 1 ว่าด้วยขนบธรรมเนียมและประเพณีรักชาติ:

§8(k) เมื่อธงอยู่ในสภาพที่ไม่สามารถใช้เป็นสัญลักษณ์แสดงได้อีกต่อไป ควรทำลายทิ้ง โดยควรเผาทำลายจะดีที่สุด

กฎหมายเหล่านี้ได้รับการเสริมด้วยคำสั่งบริหารและประกาศของประธานาธิบดี^{[ 46 ]}

ธงชาติไม่สามารถดัดแปลงแก้ไขได้ไม่ว่าในทางใด และห้ามนำไปใช้ในวัตถุประสงค์อื่นใดนอกเหนือจากการเป็นสัญลักษณ์ประจำชาติ ตามที่กฎหมายกำหนด นอกจากนี้ยังห้ามมิให้อาคารใดชักธงอื่นใดนอกจากธงชาติ ประชาชนทุกคนต้องกล่าวคำปฏิญาณตนต่อธงชาติอย่างน้อยหนึ่งครั้ง ซึ่งจะมีการเฉลิมฉลองในวันที่ 19 มิถุนายน ณ สถาบันการศึกษา กองทัพอุรุกวัยจะเป็นผู้ดำเนินการกำจัดธงที่ชำรุดเสียหาย โดยทุกปีในวันที่ 23 กันยายน จะมีการเผาธงที่ชำรุดเสียหายอย่างเป็นทางการ