ฟลอ โบจาจ เริ่มต้นเส้นทางอาชีพในระดับเยาวชนกับทีมอ็อกซ์เฮย์ วันเดอเรอร์ส ในลีกเวสต์เฮิร์ตส์เคาน์ตี้ โดยเขาถูกแอนดรูว์ ฮูด ผู้จัดการทีม ค้นพบขณะที่กำลังเล่นให้กับโรงเรียนของเขา

โบจาจย้ายไปเล่นให้กับโบเรแฮม วูดก่อนจะเซ็นสัญญากับฮัดเดอร์สฟิลด์ในปี 2013

โบจาจลงเล่นให้กับทีมฮัดเดอร์สฟิลด์ ทาวน์ รุ่นอายุไม่เกิน 18 ปี และรุ่นอายุไม่เกิน 21 ปี หลายครั้ง ซึ่งทั้งสองทีมคว้าแชมป์ลีกของตนเองได้สองฤดูกาลติดต่อกัน

เมื่อวันที่ 29 ตุลาคม 2015 เขาได้เซ็นสัญญากับทีมฮัดเดอร์สฟิลด์ เทอร์เรียร์ส จนถึงปี 2017 โดยสโมสรมีออปชั่นที่จะต่อสัญญาออกไปอีกหนึ่งปี

หลังจากมีชื่ออยู่ในรายชื่อตัวสำรองในเกมสองสามนัด โบยาจได้ประเดิมสนามในระดับอาชีพในฐานะตัวสำรองในช่วงท้ายเกมที่ฮัดเดอร์สฟิลด์ชนะมิลตัน คีนส์ ดอนส์ 2-0 โดยเขาเป็นคนจ่ายบอลให้ เจมี่ แพเตอร์สันทำประตูที่สองในวันที่ 8 มีนาคม 2016 โบยาจทำประตูแรกให้กับฮัดเดอร์สฟิลด์ โดยมีส่วนร่วมในการทำประตูที่สามในเกมที่ชนะเรดดิ้ง 3-1 ^{​​[ 1 ]}

เขาถูกปล่อยตัวเมื่อสิ้นสุดฤดูกาล2016–17 ^{[ 2 ]}

หลังจากทดสอบฝีเท้ากับเซนต์อัลบันส์ซิตี้ในช่วงปรีซีซั่น โบจาจย้ายไปร่วมทีมเวลลิงยูไนเต็ดในเนชั่นแนลลีกเซา ท์ เมื่อวันที่ 8 กันยายน 2017 ^{[ 4 ] [ 5 ]}

เมื่อวันที่ 11 ตุลาคม มีการประกาศว่าโบยาจได้ออกจากสโมสรด้วยความยินยอมร่วมกัน หลังจากลงเล่นไป 3 นัด

หลังจากออกจากตำแหน่ง เขาได้เข้าร่วม สโมสร Walton & HershamในCombined Counties Premier Division ^{[ 6 ]}

เมื่อวันที่ 14 ตุลาคม โบจาจลงเล่นนัดแรกในเกมลีกที่ชนะฮอร์ลีย์ทาวน์ 2-0 เขาทำประตูแรกและเรียกจุดโทษได้สำหรับประตูที่สอง^{[ 7 ]}

เดือนถัดมา เขาทำแฮตทริกแรกของเขาในเกมที่ชนะBanstead Athletic ด้วย สกอร์ 9–1 ^{[ 8 ]}

เมื่อวันที่ 17 กรกฎาคม 2561 Bojaj ได้เซ็นสัญญากับสโมสรEtar ของบัลแกเรีย เป็นเวลาสองปี^{[ 9 ]}

ในเดือนมกราคม 2023 โบจาจเซ็นสัญญากับทีมฮันเวลล์ทาวน์ในเซาเทิร์นลีก^{[ 10 ]}