ฟุงเคลดำรงตำแหน่งผู้จัดการทีม MSV Duisburg ระหว่างวันที่ 13 พฤษภาคม 1996 ถึง 24 มีนาคม 2000 ^{[ 1 ]}ในช่วงที่เขาดำรงตำแหน่ง ฟุงเคลได้นำพาสโมสรผ่านช่วงเวลาที่มั่นคงที่สุดช่วงหนึ่งในยุคบุนเดสลีกา ในฤดูกาลแรกเต็มๆ ที่เขาคุมทีม เขาพาทีมเลื่อนชั้นสู่บุนเดสลีกาได้สำเร็จ โดยจบอันดับสองในฤดูกาล 1995–96 2. Bundesliga

หนึ่งในไฮไลท์สำคัญระหว่างที่เขาคุมทีมดุยส์บวร์ก คือฤดูกาลบุนเดสลีกา 1997–98 ซึ่งทีมจบอันดับ 9 เป็นอันดับที่ดีที่สุดในรอบหลายทศวรรษ ในฤดูกาลเดียวกันนั้น ฟุงเคลยังนำดุยส์บวร์กเข้าสู่รอบชิงชนะเลิศของถ้วย DFB-Pokal แต่พ่ายแพ้ให้กับบาเยิร์น มิวนิคไปอย่างเฉียดฉิว 2-1 วินัยทางแท็กติกและการเน้นความสามัคคีในทีมของเขาได้รับการยกย่องอย่างกว้างขวางว่าเป็นปัจจัยสำคัญที่ทำให้สโมสรประสบความสำเร็จในช่วงเวลานั้น

วาระ การดำรงตำแหน่งของฟุงเคลสิ้นสุดลงในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2543 หลังจากผลการแข่งขันที่น่าผิดหวังหลายครั้งติดต่อกัน เขาจบด้วยสถิติโดยรวมชนะ 56 ครั้ง เสมอ 47 ครั้ง และแพ้ 59 ครั้ง^{[ 1 ]}แม้จะมีผลการแข่งขันที่ผันผวนในช่วงท้าย แต่ช่วงเวลาของฟุงเคลที่ดุยส์บวร์กมักถูกจดจำว่าเป็นหนึ่งในยุคที่มีการแข่งขันสูงและสม่ำเสมอที่สุดในประวัติศาสตร์สมัยใหม่ของสโมสร

เขาเป็นผู้จัดการของHansa Rostockตั้งแต่วันที่ 19 กันยายน พ.ศ. 2543 ถึง 1 ธันวาคม พ.ศ. 2544 ^{[ 2 ]}เขาจบด้วยสถิติชนะ 13 ครั้ง เสมอ 10 ครั้ง และแพ้ 22 ครั้ง^{[ 2 ]}

เขาเป็นผู้จัดการทีม1. FC Kölnตั้งแต่วันที่ 14 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2545 ถึง 30 ตุลาคม พ.ศ. 2546 ^{[ 3 ]}เขาจบด้วยสถิติชนะ 29 นัด เสมอ 15 นัด และแพ้ 19 นัด^{[ 3 ]}

ฟุงเคลเป็นโค้ชของไอน์ทรัค แฟรงก์เฟิร์ตตั้งแต่ปี 2004 ถึง 2009 ^{[ 4 ]}ต่อมาเขาถูกปล่อยตัวจากสัญญาเมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม 2009 เขาพาทีมขึ้นสู่บุนเดสลีกาในฤดูกาลแรกที่เขาคุมทีม หนึ่งปีต่อมา เขาและทีมรอดพ้นจากการตกชั้นและเข้าถึงรอบชิงชนะเลิศ DFB-Pokal อย่างน่าประหลาดใจ ซึ่งในที่สุดก็ส่งพวกเขาไปเล่นในยูฟ่าคัพ

Funkel ครองสถิติ ร่วมกับErich Ribbeckในฐานะนักเตะที่อยู่กับ Eintracht นานที่สุด โดยคุมทีมครบ 5 ฤดูกาล เขาจบฤดูกาลด้วยสถิติชนะ 70 ครั้ง เสมอ 50 ครั้ง และแพ้ 74 ครั้ง^{[ 4 ]}

เมื่อวันที่ 3 ตุลาคม พ.ศ. 2552 แฮร์ธา เบอร์ลินได้แต่งตั้งฟุงเคลเป็นหัวหน้าโค้ชคนใหม่หลังจากปลดลูเซียน ฟาฟร์ออก จากตำแหน่ง ^{[ 5 ]}หลังจากที่แฮร์ธาตกชั้น ฟุงเคลและสโมสรตกลงร่วมกันที่จะไม่ต่อสัญญา^{[ 6 ]}เขาจบอาชีพด้วยสถิติชนะ 7 ครั้ง เสมอ 10 ครั้ง และแพ้ 16 ครั้ง^{[ 7 ]}

เมื่อวันที่ 22 พฤษภาคม 2010 เขาได้รับการแต่งตั้งให้เป็นโค้ชคนใหม่ของVfL Bochum [ ^{8 ] การ} แข่งขันนัดแรกของเขาคือการแพ้ให้กับ Kickers Offenbach 3-0 ในรอบแรกของฟุตบอลถ้วยเยอรมัน^{[ 9 ]}เขาถูกปลดออกจากตำแหน่งเมื่อวันที่ 14 กันยายน 2011 ^{[ 10 ]}การแข่งขันนัดสุดท้ายของเขาคือการแพ้ให้กับDynamo Dresden 2-1 ^{[ 11 ]}เขาจบอาชีพด้วยสถิติชนะ 21 นัด เสมอ 8 นัด และแพ้ 16 นัด^{[ 12 ]}

เมื่อวันที่ 20 กันยายน 2011 ฟุงเคลเข้ารับตำแหน่งผู้จัดการทีมอาเลมันเนีย อาเคิน [ ^{13 ] ฟุ}งเคลถูกปลดออกจากตำแหน่งเมื่อวันที่ 1 เมษายน 2012 ^{[ 13 ]}หลังจากแพ้ติดต่อกัน 5 นัด^{[ 14 ]}เขาจบอาชีพด้วยสถิติชนะ 3 เสมอ 8 และแพ้ 9 จาก 20 นัด^{[ 13 ]}

เมื่อวันที่ 7 กันยายน 2013 เขาได้รับการแต่งตั้งให้เป็นโค้ชคนใหม่ของ1860 มิวนิค [ ^{15 ] การ} แข่งขันนัดแรกที่เขาคุมทีมคือการเสมอกับ VfR Aalen 0-0 เมื่อวันที่ 13 กันยายน 2013 ^{[ 16 ]}เมื่อวันที่ 2 เมษายน 2014 1860 มิวนิคประกาศว่า Funkel จะออกจากสโมสรหลังจบฤดูกาลเนื่องจาก "มุมมองเชิงแนวคิดที่แตกต่างกันเกี่ยวกับทิศทางในวงการกีฬา" ^{[ 17 ]}อย่างไรก็ตาม 1860 มิวนิคได้ปลด Funkel ออกจากตำแหน่งเมื่อวันที่ 6 เมษายน 2014 ^{[ 18 ]}หลังจากแพ้Karlsruher SC 3-0 ^{[ 19 ]}ในบ้านก่อนหน้านั้นในวันเดียวกัน^{[ 20 ]}เขาจบอาชีพด้วยสถิติชนะ 7 นัด เสมอ 8 นัด และแพ้ 9 นัด จากทั้งหมด 24 นัด^{[ 21 ]}

ฟุงเคลได้รับการแต่งตั้งเป็นหัวหน้าโค้ชคนใหม่ของฟอร์ทูน่า ดุสเซลดอร์ฟเมื่อวันที่ 14 มีนาคม 2016 ^{[ 22 ]}เขาถูกปลดออกจากตำแหน่งเมื่อวันที่ 29 มกราคม 2020 หลังจากแพ้ 6 นัดจาก 8 นัดสุดท้าย^{[ 23 ]}

Funkel ได้รับการแต่งตั้งใหม่ให้เป็นหัวหน้าโค้ชคนใหม่ของ1. FC Kölnเมื่อวันที่ 11 เมษายน 2021 สำหรับช่วงที่เหลือของฤดูกาล 2020–21 ^{[ 24 ]}

เมื่อวันที่ 14 กุมภาพันธ์ 2024 เขาได้เซ็นสัญญากับ1. FC Kaiserslautern [ ^{25 ] การ}แข่งขันนัดแรกของเขาเกิดขึ้นเมื่อวันที่ 18 กุมภาพันธ์ 2024 กับ1. FC Nürnbergซึ่งจบลงด้วยผลเสมอ 1-1 ^{[ 26 ]}หนึ่งนัดก่อนจบฤดูกาล สโมสรได้ประกาศว่าสัญญาของเขาจะสิ้นสุดในวันที่ 30 มิถุนายน 2024 ^{[ 27 ]}

ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2568 เขากลับมาที่โคโลญจน์เป็นครั้งที่สอง^{[ 28 ]}ในที่สุดเขาก็นำสโมสรคว้า แชมป์ 2. Bundesliga ฤดูกาล 2024–25และเลื่อนชั้นกลับสู่บุนเดสลีกา อย่างไรก็ตาม เขาตัดสินใจออกจากสโมสรเมื่อสิ้นสุดฤดูกาล^{[ 29 ]}

ณ วันที่ 18 พฤษภาคม 2568

ไบเออร์ เออร์ดินเงน

• ดีเอฟบี-โปกัล : 1984–85

1. เอฟซี โคโลญจน์

• 2. บุนเดสลีกา : 2024–25