วิกิพีเดียภาษาไทย
กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 7 นาที

กาบารัป

ยีนบนโครโมโซมมนุษย์ 17

โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับกรดแกมมาอะมิโนบิวทิริกเป็นโปรตีน ที่ใน มนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนGABARAP

กาบารัป

กาบารัป
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบีการค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่นGABARAP , ATG8A, GABARAP-a, MM46, โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA ชนิด A
รหัสภายนอกโอมิม : 605125 ; เอ็มจีไอ : 1861742 ; โฮโมโลยีน : 134119 ; GeneCards : กาบาแร็ป ; OMA : กาบาแร็ป - orthologs
ออร์โธล็อก
สายพันธุ์มนุษย์หนู
เอนเทรซ

11337

56486

วงดนตรี

ENSG00000170296

ENSMUSG00000018567

ยูนิโปรท

โอ95166

Q9DCD6

RefSeq (mRNA)

NM_007278

NM_019749

RefSeq (โปรตีน)

NP_009209

NP_062723

สถานที่ตั้ง (UCSC)Chr 17: 7.24 – 7.24 MbChr 11: 69.88 – 69.89 Mb
การค้นหาใน PubMed[ 3 ][ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ดู/แก้ไขเมาส์

โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับกรดแกมมาอะมิโนบิวทิริกเป็นโปรตีน ที่ใน มนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนGABARAP [ 5 ]

การทำงาน

ตัวรับ กรดแกมมาอะมิโนบิวทิริกเอ [ตัวรับ GABA(A)] เป็นช่องคลอไรด์ที่ควบคุมด้วยลิแกนด์ซึ่งทำหน้าที่ส่งสัญญาณประสาทแบบยับยั้ง ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA(A) ซึ่งมีประจุบวกสูงที่ปลาย Nและมีลำดับคล้ายคลึงกับสายโซ่เบา-3 ของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับไมโครทูบูล 1A และ 1B โปรตีนนี้รวมกลุ่มตัวรับสารสื่อประสาทโดยทำหน้าที่เป็นตัวกลางในการโต้ตอบกับโครงร่างเซลล์[ 6 ]

ยิ่งไปกว่านั้น GABARAP ยังมีหน้าที่สำคัญใน ออโตฟาโกโซมที่ควบคุมโดย ออโตฟาโกโซมเนื่องจากมีความสำคัญต่อการสร้างออโตฟาโกโซมและการกักเก็บสารในไซโตพลาสซึมไว้ในถุงเยื่อหุ้มสองชั้น ซึ่งนำไปสู่การย่อยสลายในภายหลังหลังจากการรวมตัวกับไลโซโซม[ 7 ]นอกจากนี้ GABARAP ยังสามารถเป็นตัวกลางในการควบคุมออโตฟาจีแบบเลือกได้ เนื่องจากมันจับกับตัวรับออโตฟาจี (เช่น p62, NBr1) ซึ่งจะจับและดึงดูดสารเฉพาะ

ปฏิสัมพันธ์

GABARAP ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับTFRC [ 8 ] ULK1 [ 9 ] [ 10 ]และGABRG2 [ 5 ] [ 11 ] [ 12 ]โครงสร้างที่ผูกพันของ GABARAP กับ GABRG2 ที่สอดคล้องกับการสังเกตการณ์เชิงทดลองได้รับการอนุมานทางคอมพิวเตอร์[ 13 ]

อ่านเพิ่มเติม

  • Kanematsu T, Hirata M (เม.ย. 2002). " [การวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง PRIP-1 ] " . Nihon Yakurigaku Zasshi. Folia Pharmacologica Japonica . 119 (4): 241– 6. doi : 10.1254/fpj.119.241 . PMID 11979730 . 
  • Paz Y, Elazar Z, Fass D (สิงหาคม 2000). "โครงสร้างของ GATE-16 ตัวปรับการขนส่งผ่านเยื่อหุ้มเซลล์และออร์โธล็อกของปัจจัยออโตฟาโกไซโตซิส Aut7p ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม"วารสารชีวเคมี 275 ( 33): 25445– 25450. doi : 10.1074/jbc.C000307200 . PMID 10856287 . 
  • Wang H, Olsen RW (สิงหาคม 2543). "การจับกันของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA(A) (GABARAP) กับไมโครทูบูลและไมโครฟิลาเมนต์บ่งชี้ถึงการมีส่วนร่วมของโครงสร้างเซลล์ในการโต้ตอบระหว่าง GABARAP และตัวรับ GABA(A)"วารสารเคมีประสาท 75 ( 2): 644– 655. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750644.x . PMID 10899939 . S2CID 86634862 .  
  • Kneussel M, Haverkamp S, Fuhrmann JC, Wang H, Wässle H, Olsen RW, Betz H (กรกฎาคม 2000). "โปรตีน GABARAP ที่เกี่ยวข้องกับตัวรับกรดแกมมาอะมิโนบิวทิริกชนิด A (GABAAR) มีปฏิสัมพันธ์กับเกฟิริน แต่ไม่ได้เกี่ยวข้องกับการยึดเกาะของตัวรับที่ไซแนปส์" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (15): 8594– 8599. Bibcode : 2000PNAS...97.8594K . doi : 10.1073/pnas.97.15.8594 . PMC 26993 . PMID 10900017 .  
  • Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R, Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (สิงหาคม 2000). "การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในแกนไฮโปทาลามัส-ต่อมใต้สมอง-ต่อมหมวกไตของมนุษย์และการโคลน cDNA แบบเต็มความยาว" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (17): 9543– 9548. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .  
  • Chen L, Wang H, Vicini S, Olsen RW (ตุลาคม 2000). "โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับกรดแกมมาอะมิโนบิวทิริกชนิด A (GABAA) (GABARAP) ส่งเสริมการรวมกลุ่มของตัวรับ GABAA และปรับเปลี่ยนจลนศาสตร์ของช่องสัญญาณ" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (21): 11557– 11562. Bibcode : 2000PNAS...9711557C . doi : 10.1073/pnas.190133497 . PMC 17239 . PMID 10984509 .  
  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ตุลาคม 2000). "การโคลนและการวิเคราะห์การทำงานของ cDNA ที่มีกรอบการอ่านแบบเปิดสำหรับยีน 300 ยีนที่ไม่เคยมีการระบุมาก่อนซึ่งแสดงออกในเซลล์ต้นกำเนิด/เซลล์บรรพบุรุษเม็ดเลือด CD34+" . Genome Research . 10 (10): 1546– 1560. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .  
  • Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (ธันวาคม 2000). "ปฏิสัมพันธ์ของไคเนสที่คล้าย Unc-51 และโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับสายโซ่เบาของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับไมโครทิวบูล 3 ในสมอง: บทบาทที่เป็นไปได้ของการขนส่งเวสิเคิลในการยืดตัวของแอกซอน" Brain Research. Molecular Brain Research . 85 ( 1– 2): 1– 12. doi : 10.1016/S0169-328X(00)00218-7 . PMID 11146101 . 
  • Xin Y, Yu L, Chen Z, Zheng L, Fu Q, Jiang J, Zhang P, Gong R, Zhao S (มิถุนายน 2544). "การโคลน รูปแบบการแสดงออก และตำแหน่งโครโมโซมของโฮโมล็อกของมนุษย์ 3 ตัวและหนู 2 ตัวของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA(A)" Genomics . 74 (3): 408– 413. doi : 10.1006/geno.2001.6555 . PMID 11414770 . 
  • Kittler JT, Rostaing P, Schiavo G, Fritschy JM, Olsen R, Triller A, Moss SJ (กรกฎาคม 2544). "การกระจายตัวของ GABARAP ในระดับเซลล์ย่อยและความสามารถในการโต้ตอบกับ NSF ชี้ให้เห็นถึงบทบาทของโปรตีนนี้ในการขนส่งตัวรับ GABA(A) ภายในเซลล์" Molecular and Cellular Neurosciences . 18 (1): 13– 25. doi : 10.1006/mcne.2001.1005 . PMID 11461150 . S2CID 43244403 .  
  • Stangler T, Mayr LM, Dingley AJ, Luge C, Willbold D (ต.ค. 2001). "การกำหนดตำแหน่งเรโซแนนซ์ 1H, 13C และ 15N เฉพาะลำดับของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA ของมนุษย์" Journal of Biomolecular NMR . 21 (2): 183– 4. doi : 10.1023/A:1012416810974 . PMID 11727985 . S2CID 31757286 .  
  • Harris R, McAlister MS, Sankar A, Phelan JP, Moss SJ, Keep NH, Driscoll PC (ตุลาคม 2544). "การกำหนดตำแหน่งเรโซแนนซ์ 1H, 13C และ 15N ของโครงสร้างหลักสำหรับโปรตีน 14 kD โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA(A) (GABARAP)" Journal of Biomolecular NMR . 21 (2): 185– 6. doi : 10.1023/A:1012473609468 . PMID 11727986 . S2CID 82224217 .  
  • Knight D, Harris R, McAlister MS, Phelan JP, Geddes S, Moss SJ, Driscoll PC, Keep NH (กุมภาพันธ์ 2545). "โครงสร้างผลึกเอกซ์เรย์และคุณสมบัติการจับเปปไทด์ที่ได้จากลิแกนด์ที่คาดการณ์ของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับกรดแกมมาอะมิโนบิวทิริกชนิด A"วารสารเคมีชีวภาพ 277 ( 7): 5556– 5561. doi : 10.1074/jbc.M109753200 . PMID 11729197 . 
  • Coyle JE, Qamar S, Rajashankar KR, Nikolov DB (ม.ค. 2545). "โครงสร้างของ GABARAP ในสองคอนฟอร์เมชัน: นัยสำคัญสำหรับการกำหนดตำแหน่งของตัวรับ GABA(A) และการจับกับทูบูลิน" . Neuron . 33 (1): 63– 74. doi : 10.1016/S0896-6273(01)00558-X . PMID 11779480 . S2CID 14487823 .  
  • Tanida I, Tanida-Miyake E, Komatsu M, Ueno T, Kominami E (เมษายน 2545). "Human Apg3p/Aut1p homologue เป็นเอนไซม์ E2 ที่แท้จริงสำหรับสารตั้งต้นหลายชนิด ได้แก่ GATE-16, GABARAP และ MAP-LC3 และอำนวยความสะดวกในการเชื่อมต่อของ hApg12p กับ hApg5p"วารสารชีวเคมี 277 ( 16 ): 13739– 13744. doi : 10.1074/jbc.M200385200 . PMID 11825910 . 
  • Stangler T, Mayr LM, Willbold D (เมษายน 2545). "โครงสร้างสารละลายของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA(A) ของมนุษย์ GABARAP: นัยสำคัญต่อการทำงานทางชีวภาพและการควบคุม"วารสารเคมีชีวภาพ277 (16): 13363– 13366. doi : 10.1074 /jbc.C200050200 . PMID 11875056 . 
  • โคอูโนะ ที, มิอุระ เค, คาเนมัตสึ ที, ชิรากาวะ เอ็ม, ฮิราตะ เอ็ม, คาวาโนะ เค (ม.ค. 2545) "การกำหนดเรโซแนนซ์ 1H, 13C และ '5N ของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABAAP, GABAA" วารสารชีวโมเลกุล NMR . 22 (1): 97– 98. ดอย : 10.1023/A:1013884402033 . PMID 11885988 . S2CID 82980835 .  
  • Tanida I, Tanida-Miyake E, Nishitani T, Komatsu M, Yamazaki H, Ueno T, Kominami E (มีนาคม 2545). "Murine Apg12p มีความชอบสารตั้งต้นสำหรับ murine Apg7p มากกว่า Apg8p homologs สามตัว" Biochemical and Biophysical Research Communications . 292 (1): 256– 262. doi : 10.1006/bbrc.2002.6645 . PMID 11890701 . 
  • Nymann-Andersen J, Wang H, Chen L, Kittler JT, Moss SJ, Olsen RW (มีนาคม 2545). "ความจำเพาะของหน่วยย่อยและโดเมนการโต้ตอบระหว่างโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA(A) (GABARAP) และตัวรับ GABA(A)". Journal of Neurochemistry . 80 (5): 815– 823. doi : 10.1046/j.0022-3042.2002.00762.x . PMID 11948245 . S2CID 38049055 .  
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=GABARAP&oldid=1358448495 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ กาบารัป

โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับกรดแกมมาอะมิโนบิวทิริกเป็นโปรตีน ที่ใน มนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนGABARAP

การทำงาน

ตัวรับ กรดแกมมาอะมิโนบิวทิริก เอ [ตัวรับ GABA(A)] เป็นช่องคลอไรด์ที่ควบคุมด้วยลิแกนด์ซึ่งทำหน้าที่ส่งสัญญาณประสาทแบบยับยั้ง ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตัวรับ GABA(A) ซึ่งมีประจุบวกสูงที่ ปลาย N และมีลำดับคล้ายคลึงกับสายโซ่เบา-3...

ปฏิสัมพันธ์

GABARAP ได้รับการแสดงให้เห็นว่า มี ปฏิสัมพันธ์ กับ TFRC [ 8 ] ULK1 [ 9 ] [ 10 ] และ GABRG2 [ 5 ] [ 11 ] [ 12 ] โครงสร้างที่ผูกพันของ GABARAP กับ GABRG2 ที่สอดคล้องกับการสังเกตการณ์เชิงทดลองได้รับการอนุมานทางคอมพิวเตอร์ [ 13 ]

อ่านเพิ่มเติม

Kanematsu T, Hirata M (เม.ย. 2002). " [ การวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง PRIP-1 ] " . Nihon Yakurigaku Zasshi. Folia Pharmacologica Japonica . 119 (4): 241– 6. doi : 10.1254/fpj.119.241 . PMID 11979730 .