แม่น้ำเกบามีต้นกำเนิดในพื้นที่ทางเหนือสุดของประเทศกินีใน ที่ราบสูง ฟูตาจัลลอนไหลผ่านทางตอนใต้ของเซเนกัลและไหลลงสู่มหาสมุทรแอตแลนติกในประเทศกินีบิสเซามีความยาวรวมประมาณ550 กิโลเมตร (340 ไมล์) ^{[ 2 ]} 

แม่น้ำสายนี้ส่วนใหญ่เป็นแม่น้ำในที่ราบลุ่ม มีปริมาณน้ำไหลสูงขึ้นในช่วงฤดูฝน (ตั้งแต่เดือนมิถุนายนถึงตุลาคม) บริเวณรอบๆ ปลายน้ำเป็นที่ราบน้ำท่วมถึงซึ่งล้อมรอบด้วยทุ่งหญ้าสะวันนาและป่าไม้ มีประชากรหนาแน่นโดยอาศัยการทำเกษตรกรรมเพื่อยังชีพเป็นหลัก^{[ 3 ] : 162}

ปากแม่น้ำเกบาเป็นปากแม่น้ำที่มีกระแสน้ำขึ้น ลงกว้าง ซึ่งใช้ร่วมกับแม่น้ำโครูบัล [ ^{4 ] ระดับ}น้ำขึ้นลงอาจสูงถึง7 เมตร (23 ฟุต)ภายในปากแม่น้ำ (เรียกอีกอย่างว่าช่องเกบา ) ^{[ 5 ]} 

แม่น้ำสาขาของแม่น้ำสายนี้ ได้แก่ แม่น้ำอนัมเบ แม่น้ำกัมเบียล และแม่น้ำคัมโปสซา (หรือแม่น้ำโคลูเฟ) แม่น้ำ โคลูเฟ ไหลมาบรรจบ กับ แม่น้ำเกบา ที่เมืองบาฟาตา แม่น้ำเกบาแบ่งปากแม่น้ำ ที่กว้างกับ แม่น้ำโครูบัล (ซึ่งไหลมาบรรจบกันใกล้กับเมืองซีเม ) เมือง บิสเซาเมืองหลวงของกินีบิสเซา ตั้งอยู่ริมฝั่งทางเหนือของปากแม่น้ำแห่งนี้ ปากแม่น้ำจะกว้างขึ้นอีกเมื่อแม่น้ำไหลลงสู่มหาสมุทรแอตแลนติกบริเวณหมู่เกาะบิจาโกส^{[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]}

ลุ่มน้ำเกบาครอบคลุมพื้นที่ประมาณ12,000 ตารางกิโลเมตร (4,600 ตารางไมล์)โดย 65% ของลุ่มน้ำอยู่ในประเทศกินีบิสเซา 34% อยู่ในประเทศเซเนกัล และส่วนที่เหลือเล็กน้อยอยู่ในมุมทางเหนือของประเทศกินี  

แม่น้ำเกบา พร้อมกับแม่น้ำโครูบัลเป็นแหล่งระบายน้ำของที่ราบสูงบาฟาตา นอกจากนี้ยังเป็นแหล่งระบายน้ำของที่ราบกาบู พร้อมกับแม่น้ำฟาริม (หรือที่รู้จักกันในชื่อแม่น้ำกาเชอู) และลำน้ำสาขา^{[ 9 ]}