กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 2 นาที

เจนแมปป์

GenMAPP (Gene Map Annotator and Pathway Profiler) เป็น เครื่องมือซอฟต์แวร์ ชีวสารสนเทศ แบบโอเพนซอร์ส ฟรี ที่ออกแบบมาเพื่อแสดงภาพและวิเคราะห์ ข้อมูล จีโนม ในบริบทของวิถี (...

เจนแมปป์

เจนแมปป์
นักพัฒนาอเล็กซานเดอร์ ปิโก้

คริสตินา แฮนสเปอร์ส, นาธาน ซาโลโมนิส, คัม ดาห์ลควิสต์, สก็อตต์ โดนิเกอร์, เจฟฟ์ ลอว์เลอร์, อเล็กซ์ แซมบอน, ลินน์ เฟอร์รานเต, คาเรน วรานิซาน, สตีเวน ซี. ลอว์เลอร์,

บรูซ คอนคลิน
ระบบปฏิบัติการวินโดวส์
พิมพ์ชีวสารสนเทศ
ใบอนุญาตใบอนุญาต Apache
เว็บไซต์www.genmapp.org

GenMAPP (Gene Map Annotator and Pathway Profiler) เป็น เครื่องมือซอฟต์แวร์ ชีวสารสนเทศแบบโอเพนซอร์ส ฟรี ที่ออกแบบมาเพื่อแสดงภาพและวิเคราะห์ ข้อมูล จีโนมในบริบทของวิถี ( เมตาบอลิซึมการส่งสัญญาณ ) โดยเชื่อมโยงชุดข้อมูลระดับยีนกับกระบวนการทางชีววิทยาและโรค[ 1 ] GenMAPP ถูกสร้างขึ้นครั้งแรกในปี 2000 โดยทีมโอเพนซอร์สที่ตั้งอยู่ในห้องปฏิบัติการวิจัยทางวิชาการ GenMAPP มีฐานข้อมูลของตัวระบุยีนและชุดแผนที่วิถี นอกเหนือจากเครื่องมือแสดงภาพและวิเคราะห์ ร่วมกับทรัพยากรสาธารณะอื่นๆ GenMAPP มีเป้าหมายที่จะมอบเครื่องมือให้กับชุมชนวิจัยเพื่อให้ได้รับข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับชีววิทยาผ่านการบูรณาการข้อมูลประเภทต่างๆ ตั้งแต่ยีน โปรตีน วิถี ไปจนถึงโรค

ประวัติศาสตร์

GenMAPP ถูกสร้างขึ้นครั้งแรกในปี 2000 ในฐานะเครื่องมือซอฟต์แวร์ต้นแบบในห้องปฏิบัติการของ Bruce Conklin ที่สถาบัน J. David Gladstone ในซานฟรานซิสโกและยังคงได้รับการพัฒนาอย่างต่อเนื่องในสภาพแวดล้อมการวิจัยทางวิชาการที่ไม่แสวงหาผลกำไรเช่นเดิม เวอร์ชันแรกของ GenMAPP 1.0 เปิดตัวในปี 2002 โดยรองรับการวิเคราะห์ ข้อมูล ไมโครอาร์เรย์ดีเอ็นเอจากมนุษย์หนูเมาส์หนูแรตและยีสต์ในปี 2004 GenMAPP 2.0 ได้รับการเผยแพร่ โดยรวมโปรแกรมเสริมก่อนหน้านี้อย่าง MAPPFinder และ MAPPBuilder เข้าด้วยกัน และขยายการรองรับไปยังสายพันธุ์เพิ่มเติม GenMAPP 2.1 เปิดตัวในปี 2006 พร้อมคุณสมบัติการแสดงภาพใหม่และรองรับสายพันธุ์ทั้งหมด 11 สายพันธุ์

การใช้งาน

GenMAPP ถูกพัฒนาโดยนักชีววิทยาและมุ่งเน้นไปที่การแสดงภาพเส้นทางชีวเคมีสำหรับนักชีววิทยาในห้องปฏิบัติการ แตกต่างจาก เครื่องมือ ชีววิทยาเชิงระบบ คำนวณอื่นๆ หลายๆ ตัว GenMAPP ไม่ได้ออกแบบมาเพื่อการสร้างแบบจำลองเซลล์/ระบบ แต่เน้นที่ความต้องการเร่งด่วนของนักชีววิทยาในห้องปฏิบัติการโดยช่วยให้พวกเขาสามารถตีความ ข้อมูล ทางพันธุกรรม ได้อย่างรวดเร็ว ด้วยอินเทอร์เฟซที่ใช้งานง่าย GenMAPP ถูกพัฒนาขึ้นด้วยVisual Basic 6.0 และมีให้ใช้งานเป็นแอปพลิเคชันแบบสแตนด์อะโลนสำหรับระบบปฏิบัติการMicrosoft Windows รวมถึง Boot CampหรือParallels Workstationบน Mac

เนื้อหาและคุณสมบัติ

GenMAPP สร้างและดูแลฐานข้อมูลยีนสำหรับ สิ่งมีชีวิตต้นแบบที่สำคัญหลากหลายชนิด:

GenMAPP มีเครื่องมือสำหรับสร้าง แก้ไข และใส่คำอธิบายประกอบในแผนที่เส้นทางชีวภาพ

GenMAPP ช่วยให้ผู้ใช้สามารถแสดงภาพและวิเคราะห์ข้อมูลของตนในบริบทของกลุ่มเส้นทางชีวเคมีและออนโทโลยีของยีนได้

ดูเพิ่มเติม

  • เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ
  • GenMAPP – ลิงก์ข้อมูลที่เก็บถาวรเมื่อวันที่ 10 ตุลาคม 2549 ที่Wayback Machine
  • ไซโตสเคป
  • PathVisio ถูกเก็บถาวรเมื่อวันที่ 6 มีนาคม 2016 ที่Wayback Machine
  • วิกิพาธเวย์
  • GenMAPPบนSourceForge
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=GenMAPP&oldid=1225417515 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เจนแมปป์

GenMAPP (Gene Map Annotator and Pathway Profiler) เป็น เครื่องมือซอฟต์แวร์ ชีวสารสนเทศ แบบโอเพนซอร์ส ฟรี ที่ออกแบบมาเพื่อแสดงภาพและวิเคราะห์ ข้อมูล จีโนม ในบริบทของวิถี (...

ประวัติศาสตร์

GenMAPP ถูกสร้างขึ้นครั้งแรกในปี 2000 ในฐานะเครื่องมือซอฟต์แวร์ต้นแบบในห้องปฏิบัติการของ Bruce Conklin ที่สถาบัน J.

การใช้งาน

GenMAPP ถูกพัฒนาโดยนักชีววิทยาและมุ่งเน้นไปที่การแสดงภาพเส้นทางชีวเคมีสำหรับนักชีววิทยาในห้องปฏิบัติการ แตกต่างจาก เครื่องมือ ชีววิทยาเชิงระบบ คำนวณอื่นๆ หลายๆ ตัว GenMAPP ไม่ได้ออกแบบมาเพื่อการสร้างแบบจำลองเซลล์/ระบบ...

เนื้อหาและคุณสมบัติ

GenMAPP สร้างและดูแลฐานข้อมูลยีนสำหรับ สิ่งมีชีวิตต้นแบบ ที่สำคัญหลากหลายชนิด: