กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 2 นาที

เจเนอริฟ

GeneRIF หรือ Gene Reference Into Function คือข้อความสั้นๆ (ไม่เกิน 255 ตัวอักษร) เกี่ยวกับหน้าที่ของยีน GeneRIF เป็น กลไก ง่ายๆ ที่ช่วยให้ นักวิทยาศาสตร์ สามารถเพิ่ม คำอธิบาย...

เจเนอริฟ

GeneRIF หรือGene Reference Into Functionคือข้อความสั้นๆ (ไม่เกิน 255 ตัวอักษร) เกี่ยวกับหน้าที่ของยีน GeneRIF เป็นกลไก ง่ายๆ ที่ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถเพิ่มคำอธิบาย หน้าที่ ของยีนที่อธิบายไว้ในฐานข้อมูล Entrez Gene ได้ ในทางปฏิบัติหน้าที่นั้นถูกสร้างขึ้นอย่างกว้างขวาง ตัวอย่างเช่น มี GeneRIF ที่กล่าวถึงบทบาทของยีนในโรค GeneRIF ที่ชี้ให้ผู้ดูไปยังบทความวิจารณ์เกี่ยวกับยีน และ GeneRIF ที่กล่าวถึงโครงสร้างของยีน อย่างไรก็ตาม เจตนาที่ระบุไว้คือ GeneRIF ควรเกี่ยวกับหน้าที่ของยีน ปัจจุบันมีการสร้าง GeneRIF มากกว่าครึ่งล้านรายการสำหรับยีนจากเกือบ 1,000 สปีชีส์ที่แตกต่างกัน[ 1 ]

GeneRIF จะเชื่อมโยงกับรายการเฉพาะในฐานข้อมูล Entrez Gene เสมอ GeneRIF แต่ละตัวจะมีตัวชี้ไปยัง PubMed ID (ตัวระบุเอกสารประเภทหนึ่ง) ของสิ่งพิมพ์ทางวิทยาศาสตร์ที่ให้หลักฐานสนับสนุนข้อความที่ระบุโดย GeneRIF นั้น GeneRIF มักถูกดึงมาจากเอกสารที่ระบุโดย PubMed ID โดยตรง ซึ่งส่วนใหญ่มักดึงมาจากชื่อเรื่องหรือประโยคสุดท้ายของเอกสารนั้น

โดยปกติแล้ว GeneRIF จะถูกสร้างขึ้นโดย ผู้จัดทำดัชนี ของ NCBIแต่ใครก็ได้สามารถส่ง GeneRIF ได้ ในการประมวลผล ต้องมี Gene ID ที่ถูกต้องสำหรับยีนนั้นๆ หรือเจ้าหน้าที่ Gene ต้องกำหนด Gene ID โดยรวมให้กับสายพันธุ์นั้นๆ กรณีหลังนี้จะดำเนินการผ่านบันทึกใน Gene ที่มีสัญลักษณ์ NEWENTRY เมื่อระบุ Gene ID ได้แล้ว จะต้องใช้ข้อมูลเพียงสามประเภทเท่านั้นในการส่งข้อมูล ให้เสร็จสมบูรณ์ :

  1. วลีสั้นๆที่อธิบายถึงฟังก์ชันหรือหลายฟังก์ชัน (ความยาวไม่เกิน 255 ตัวอักษรโดยควรยาวกว่าการกล่าวซ้ำชื่อเรื่องของบทความ)
  2. บทความที่ตีพิมพ์ซึ่งอธิบายถึงฟังก์ชันดังกล่าว โดยดำเนินการโดยการระบุ PubMed ID ของบทความอ้างอิงใน PubMed
  3. ที่อยู่อีเมลที่ถูกต้อง(ซึ่งจะถูกเก็บเป็นความลับ)

ตัวอย่าง

ต่อไปนี้เป็นตัวอย่าง GeneRIF จากEntrez Gene สำหรับ GeneID 7157 ซึ่ง เป็นยีนTP53 ของมนุษย์ รหัสเอกสาร PubMed ถูกละเว้นจากตัวอย่าง โปรดสังเกตความหลากหลายอย่างมากเกี่ยวกับการมีหรือไม่มีเครื่องหมายวรรคตอนและการใช้อักษรตัวใหญ่ขึ้นต้นประโยค

  • p53 และ c-erbB-2 อาจมีบทบาทอิสระในการก่อให้เกิดมะเร็งถุงน้ำดี
  • การสลายตัวของ HIPK2 ภายในเซลล์ขึ้นอยู่กับการมีอยู่ของโปรตีน p53 ที่ทำงานได้อย่างสมบูรณ์
  • อัลลีลของโคดอน 72 ของ p53 มีอิทธิพลต่อการตอบสนองต่อยาต้านมะเร็งในเซลล์จากผู้สูงอายุ โดยควบคุมตัวยับยั้งวงจรเซลล์ p21WAF1
  • การวิเคราะห์การถดถอยเชิงลอจิสติกแสดงให้เห็นว่า p53 และ COX-2 เป็นตัวทำนายที่ขึ้นอยู่กันในการเกิดมะเร็งตับอ่อน และมีความสัมพันธ์แบบผกผันระหว่าง p53 และ COX-2 กับการลุกลามของเนื้องอก

GeneRIF เป็นรูปแบบข้อความที่ไม่ธรรมดา และเพิ่งเป็นหัวข้อของบทความจำนวนมากจากชุมชนการประมวลผลภาษาธรรมชาติเมื่อไม่นานมานี้

  • หน้าเว็บของ NCBI ที่อธิบายเกี่ยวกับ GeneRIF
  • Mitchell JA, Aronson AR, Mork JG, Folk LC, Humphrey SM, Ward JM (2003). "การจัดทำดัชนียีน: ลักษณะเฉพาะและการวิเคราะห์ GeneRIF ของ NLM" AMIA Annu Symp Proc : 460– 4. PMC  1480312 . PMID  14728215 .
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=GeneRIF&oldid=1300571445 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เจเนอริฟ

GeneRIF หรือ Gene Reference Into Function คือข้อความสั้นๆ (ไม่เกิน 255 ตัวอักษร) เกี่ยวกับหน้าที่ของยีน GeneRIF เป็น กลไก ง่ายๆ ที่ช่วยให้ นักวิทยาศาสตร์ สามารถเพิ่ม คำอธิบาย...

ตัวอย่าง

ต่อไปนี้เป็นตัวอย่าง GeneRIF จาก Entrez Gene สำหรับ GeneID 7157 ซึ่ง เป็น ยีน TP53 ของมนุษย์ รหัสเอกสาร PubMed ถูกละเว้นจากตัวอย่าง โปรดสังเกตความหลากหลายอย่างมากเกี่ยวกับการมีหรือไม่มีเครื่องหมายวรรคตอนและการใช้อักษรตัวใหญ่ขึ้นต้นประโยค

ลิงก์ภายนอก

หน้าเว็บของ NCBI ที่อธิบายเกี่ยวกับ GeneRIF Mitchell JA, Aronson AR, Mork JG, Folk LC, Humphrey SM, Ward JM (2003). "การจัดทำดัชนียีน: ลักษณะเฉพาะและการวิเคราะห์ GeneRIF ของ NLM" AMIA Annu Symp Proc : 460– 4. PMC 1480312 . PMID 14728215 .