อ่าน 11 นาที
ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม
ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม (หรือ GEVI ) เป็น โปรตีน ที่สามารถรับรู้ ศักย์เยื่อ หุ้มเซลล์และเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงของ แรงดันไฟฟ้า กับรูปแบบของเอาต์พุต ซึ่งมักจะ...
ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม
ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม (หรือGEVI ) เป็นโปรตีนที่สามารถรับรู้ศักย์เยื่อหุ้มเซลล์และเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงของแรงดันไฟฟ้ากับรูปแบบของเอาต์พุต ซึ่งมักจะเป็นระดับการเรืองแสง[ 1 ]เป็น เครื่องมือบันทึก ออปโตเจเนติกส์ที่มีศักยภาพซึ่งช่วยให้สามารถบันทึก สัญญาณ ทางสรีรวิทยาไฟฟ้าจากเซลล์เพาะเลี้ยงและสัตว์มีชีวิตได้ ตัวอย่างของตระกูล GEVI ได้แก่ Quasar/Archon [ 2 ] [ 3 ] Ace-mNeon [ 4 ]และ ASAP [ 5 ] [ 6 ]
ประวัติศาสตร์
แม้ว่าแนวคิดเรื่องการวัดกิจกรรมของเซลล์ประสาทด้วยแสงจะถูกเสนอขึ้นในช่วงปลายทศวรรษ 1960 [ 7 ]แต่ GEVI ตัวแรกที่ประสบความสำเร็จและสะดวกพอที่จะนำไปใช้งานจริงนั้นยังไม่ได้รับการพัฒนาจนกระทั่งเทคโนโลยีวิศวกรรมพันธุกรรมมีความสมบูรณ์ในช่วงปลายทศวรรษ 1990 GEVI ตัวแรกที่เรียกว่า FlaSh [ 8 ]ถูกสร้างขึ้นโดยการหลอมรวมโปรตีนเรืองแสงสีเขียว ที่ดัดแปลง เข้ากับช่อง K + ที่ไวต่อแรงดันไฟฟ้า ( Shaker ) แตกต่างจากโปรตีนเรืองแสง การค้นพบ GEVI ใหม่ๆ มักไม่ได้รับแรงบันดาลใจจากธรรมชาติ เนื่องจากเป็นการยากที่จะหาสิ่งมีชีวิตที่มีความสามารถในการเปลี่ยนการเรืองแสงตามแรงดันไฟฟ้าได้ตามธรรมชาติ ดังนั้น GEVI ใหม่ๆ ส่วนใหญ่จึงเป็นผลผลิตจากวิศวกรรมพันธุกรรมและ โปรตีน
สามารถใช้สองวิธีในการค้นหา GEVI ใหม่ ได้แก่การออกแบบอย่างมีเหตุผลและการวิวัฒนาการแบบกำหนดทิศทางวิธีแรกมีส่วนช่วยในการสร้าง GEVI รูปแบบใหม่ส่วนใหญ่ แต่การวิจัยล่าสุดที่ใช้การวิวัฒนาการแบบกำหนดทิศทางได้แสดงให้เห็นผลลัพธ์ที่น่าสนใจในการเพิ่มประสิทธิภาพ GEVI [ 9 ] [ 10 ]
โครงสร้าง
ตามหลักการแล้ว GEVI ควรตรวจจับความแตกต่างของแรงดันไฟฟ้าข้ามเยื่อหุ้มเซลล์และรายงานโดยการเปลี่ยนแปลงของฟลูออเรสเซนซ์ โครงสร้างที่แตกต่างกันหลายแบบสามารถใช้สำหรับฟังก์ชันการตรวจจับแรงดันไฟฟ้าได้[ 11 ]แต่คุณสมบัติที่สำคัญอย่างหนึ่งคือต้องฝังอยู่ในเยื่อหุ้มเซลล์ โดยปกติแล้ว โดเมนตรวจจับแรงดันไฟฟ้า (VSD) ของ GEVI จะทอดข้ามเยื่อหุ้มเซลล์และเชื่อมต่อกับโปรตีนเรืองแสง (FP) อย่างไรก็ตาม ไม่จำเป็นว่าการตรวจจับและการรายงานจะต้องเกิดขึ้นในโครงสร้างที่แตกต่างกัน - ดูตัวอย่างเช่น Archons
โดยโครงสร้าง GEVI สามารถจำแนกได้เป็นสี่ประเภทตามการค้นพบในปัจจุบัน: (1) GEVI ที่มีโปรตีนเรืองแสงคู่ FRET เช่น VSFP1 (2) GEVI ออปซินเดี่ยว เช่น Arch (3) GEVI คู่ FRET ของออปซิน-FP เช่น MacQ-mCitrine (4) FP เดี่ยวที่มีโดเมนตรวจจับแรงดันไฟฟ้าชนิดพิเศษ เช่น ASAP1 GEVI ส่วนใหญ่มีพื้นฐานมาจากฟอสฟาเตสที่ไวต่อแรงดันไฟฟ้าของ Ciona intestinalis (Ci-VSP หรือ Ci-VSD (โดเมน)) ซึ่งถูกค้นพบในปี 2548 จาก การสำรวจ จีโนมของสิ่งมีชีวิต[ 12 ] GEVI บางตัวอาจมีส่วนประกอบที่คล้ายกัน แต่ในตำแหน่งที่แตกต่างกัน ตัวอย่างเช่น ทั้ง ASAP1 และ ArcLight ต่างก็ใช้ VSD และ FP หนึ่งตัว แต่ FP ของ ASAP1 อยู่ด้านนอกของเซลล์ ในขณะที่ FP ของ ArcLight อยู่ด้านใน และ FP สองตัวของ VSFP-Butterfly ถูกคั่นด้วย VSD ในขณะที่ FP สองตัวของ Mermaid อยู่ใกล้กันมากกว่า
| เกวี[เอ] | ปี | การรับรู้ | การรายงาน | สารตั้งต้น |
|---|---|---|---|---|
| FlaSh [ 8 ] | พ.ศ. 2540 | เชคเกอร์ (ช่อง K + ) | จีเอฟพี | - |
| VSFP1 [ 13 ] | 2001 | หนู Kv2.1 (ช่อง K + ) | คู่ FRET : CFP และ YFP | - |
| SPARC [ 14 ] | 2002 | ช่องทาง Rat Na + | จีเอฟพี | - |
| VSFP2 [ 15 ] | 2007 | ซี-วีเอสดี | คู่ FRET : CFP (สีฟ้าคราม) และ YFP (สีเหลืองมะนาว) | วีเอสเอฟพี1 |
| แฟลร์[ 16 ] | 2007 | Kv1.4 (ช่อง K + ) | วายเอฟพี | แฟลช |
| VSFP3.1 [ 17 ] | 2008 | ซี-วีเอสดี | ซีเอฟพี | VSFP2 |
| นางเงือก[ 18 ] | 2008 | ซี-วีเอสดี | คู่ FRET : Marine GFP (mUKG) และ OFP (mKOκ) | VSFP2 |
| hVOS [ 19 ] | 2008 | ไดพิคริลามีน | จีเอฟพี | - |
| VSFP ที่มีการเลื่อนสีแดง[ 20 ] | 2009 | ซี-วีเอสดี | RFP/YFP (Citrine, mOrange2, TagRFP หรือ mKate2) | VSFP3.1 |
| อุปกรณ์ประกอบฉาก[ 21 ] | 2011 | โปรตีโอโรดอปซิน (GPR) ที่ดูดซับสีเขียวที่ได้รับการดัดแปลง | เหมือนกับด้านซ้าย | - |
| ซาห์รา, ซาห์รา 2 [ 22 ] | 2012 | Nv-VSD, Dr-VSD | คู่ FRET : CFP (สีฟ้าคราม) และ YFP (สีเหลืองมะนาว) | VSFP2 |
| ArcLight [ 23 ] | 2012 | ซี-วีเอสดี | ซูเปอร์อีคลิปติก pHluorin ที่ได้รับการดัดแปลง | - |
| อาร์ช[ 24 ] | 2012 | อาร์เคอร์โรดอปซิน 3 | เหมือนกับด้านซ้าย | - |
| ElectricPk [ 25 ] | 2012 | ซี-วีเอสดี | EGFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | VSFP3.1 |
| VSFP-ผีเสื้อ[ 26 ] | 2012 | ซี-วีเอสดี | คู่ FRET : YFP (mCitrine) และ RFP (mKate2) | VSFP2 |
| VSFP-CR [ 27 ] | 2013 | ซี-วีเอสดี | คู่ FRET : GFP (Clover) และ RFP (mRuby2) | VSFP2.3 |
| นางเงือก2 [ 28 ] | 2013 | ซี-วีเอสดี | คู่ FRET : CFP (seCFP2) และ YFP | เงือก |
| Mac GEVIs [ 29 ] | 2014 | แมคโรดอปซิน (ตัวรับ FRET) | ผู้บริจาค FRET: mCitrine หรือ mOrange2 | - |
| QuasAr1, QuasAr2 [ 30 ] | 2014 | อาร์เคอร์โรดอปซิน 3 ที่ได้รับการดัดแปลง | เหมือนกับด้านซ้าย | โค้ง |
| อาร์เชอร์[ 31 ] | 2014 | อาร์เคอร์โรดอปซิน 3 ที่ได้รับการดัดแปลง | เหมือนกับด้านซ้าย | โค้ง |
| ASAP1 [ 32 ] | 2014 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | - |
| เอซ GEVI [ 33 ] | 2015 | โรดอปซินเอซที่ดัดแปลงแล้ว | ผู้บริจาค FRET: mNeonGreen | แม็ค จีอีวี |
| ArcLightning [ 34 ] | 2015 | ซี-วีเอสดี | ซูเปอร์อีคลิปติก pHluorin ที่ได้รับการดัดแปลง | อาร์คไลท์ |
| ปาโด[ 35 ] | 2016 | ช่องโปรตอนที่ควบคุมด้วยแรงดันไฟฟ้า | ซูเปอร์อีคลิปติก พีเอชลูริน | - |
| ASAP2f [ 36 ] | 2016 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | เร็วที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้1 |
| FlicR1 [ 37 ] | 2016 | ซี-วีเอสดี | RFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม (mApple) | VSFP3.1 |
| บงวูรี[ 38 ] | 2017 | ซี-วีเอสดี | ซูเปอร์อีคลิปติก pHluorin ที่ได้รับการดัดแปลง | อาร์คไลท์ |
| ASAP2s [ 39 ] | 2017 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | เร็วที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้1 |
| ASAP-Y [ 40 ] | 2017 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | เร็วที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้1 |
| (pa)QuasAr3(-s) [ 41 ] | 2019 | อาร์เคอร์โรดอปซิน 3 ที่ได้รับการดัดแปลง | เหมือนกับด้านซ้าย | ควาสอาร์2 |
| โวลตรอน(-ST) [ 42 ] | 2019 | โรดอปซิน Ace ที่ได้รับการดัดแปลง (Ace2) | สารให้ FRET: Janelia Fluor (สารเคมี) | - |
| ASAP3 [ 43 ] | 2019 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | เอเอสเอพี2 |
| JEDI-2P [ 44 ] | 2022 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | เอเอสเอพี2 |
| ASAP4 | 2023 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | เอเอสเอพี2 |
| ASAP5 | 2024 | Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง | GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม | ASAP3 |
- ↑ชื่อที่พิมพ์เป็นตัวเอียง หมายถึง GEVI ที่ยังไม่ได้ตั้งชื่อ
ลักษณะเฉพาะ
GEVI สามารถประเมินได้จากคุณลักษณะหลายประการ คุณลักษณะเหล่านี้สามารถจำแนกได้เป็นสองประเภท ได้แก่ ประสิทธิภาพและความเข้ากันได้ คุณสมบัติด้านประสิทธิภาพ ได้แก่ ความสว่างความเสถียรต่อแสง ความไว จลนศาสตร์ (ความเร็ว) ความเป็นเส้นตรงของการตอบสนอง เป็นต้น ในขณะที่คุณสมบัติด้านความเข้ากันได้ ครอบคลุมถึงความเป็นพิษ ( ความเป็นพิษต่อแสง ) การกำหนดตำแหน่งเยื่อหุ้มพลาสมา ความสามารถในการปรับตัวของการถ่ายภาพเนื้อเยื่อส่วนลึก เป็นต้น[ 45 ]
การใช้งาน ข้อดี และข้อเสีย
GEVI ประเภทต่างๆ กำลังได้รับการพัฒนาในหลายสาขาการวิจัยทางชีววิทยาหรือสรีรวิทยา แตกต่างจากวิธีการตรวจจับแรงดันไฟฟ้าแบบเดิม เช่น การบันทึกทางสรีรวิทยาไฟฟ้า โดยใช้อิเล็กโทรดหรือสีย้อมที่ไวต่อแรงดันไฟฟ้า GEVI สามารถแสดงออกได้อย่างเสถียรและสามารถกำหนดเป้าหมายไปยังเซลล์ประเภทเฉพาะได้ GEVI มีความละเอียดเชิงพื้นที่ระดับเซลล์ย่อย[ 46 ] และความละเอียดเชิงเวลาต่ำถึง 0.2 มิลลิวินาที ซึ่งเร็วกว่า การถ่ายภาพแคลเซียมอย่างน้อยหนึ่งลำดับความแรงสิ่งนี้ทำให้ความแม่นยำในการตรวจจับสไปค์เทียบได้กับการบันทึกทางสรีรวิทยาไฟฟ้าโดยใช้อิเล็กโทรด แต่ไม่มีการรุกราน[ 33 ]นักวิจัยได้ใช้ GEVI เพื่อตรวจสอบการสื่อสารทางประสาทของสมองที่สมบูรณ์ (ของแมลงหวี่[ 47 ]หรือหนู[ 48 ] ) การเกิดสไปค์ไฟฟ้าของแบคทีเรีย ( E. coli [ 21 ] ) และเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจที่ ได้จากสเต็มเซลล์ของมนุษย์ [ 49 ] [ 50 ]
ในทางกลับกัน การบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าในรูปแบบใดๆ ก็ตามย่อมมีข้อจำกัดโดยธรรมชาติ[ 51 ] การถ่ายภาพต้องรวดเร็ว มิฉะนั้นจะพลาดการเปลี่ยนแปลงแรงดันไฟฟ้าในช่วงสั้นๆ ซึ่งหมายความว่าจะมีโฟตอนน้อยลงต่อการเปิดรับแสงภาพ นอกจากนี้ ความสว่างต่อเซลล์ยังต่ำกว่าตัวบ่งชี้แคลเซียมโดยธรรมชาติ เนื่องจากตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าสามารถอยู่ในเยื่อหุ้มเซลล์ได้น้อยกว่าตัวบ่งชี้แคลเซียมในไซโตพลาสซึมประมาณ 30 เท่า
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม
ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม (หรือ GEVI ) เป็น โปรตีน ที่สามารถรับรู้ ศักย์เยื่อ หุ้มเซลล์และเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงของ แรงดันไฟฟ้า กับรูปแบบของเอาต์พุต ซึ่งมักจะ...
ประวัติศาสตร์
แม้ว่าแนวคิดเรื่องการวัดกิจกรรมของเซลล์ประสาทด้วยแสงจะถูกเสนอขึ้นในช่วงปลายทศวรรษ 1960 [ 7 ] แต่ GEVI ตัวแรกที่ประสบความสำเร็จและสะดวกพอที่จะนำไปใช้งานจริงนั้นยังไม่ได้รับการพัฒนาจนกระทั่งเทคโนโลยีวิศวกรรมพันธุกรรมมีความสมบูรณ์ในช่วงปลายทศวรรษ 1990 GEVI...
โครงสร้าง
ตามหลักการแล้ว GEVI ควรตรวจจับความแตกต่างของแรงดันไฟฟ้าข้าม เยื่อหุ้มเซลล์ และรายงานโดยการเปลี่ยนแปลงของฟลูออเรสเซนซ์ โครงสร้างที่แตกต่างกันหลายแบบสามารถใช้สำหรับฟังก์ชันการตรวจจับแรงดันไฟฟ้าได้ [ 11 ]...
ลักษณะเฉพาะ
GEVI สามารถประเมินได้จากคุณลักษณะหลายประการ คุณลักษณะเหล่านี้สามารถจำแนกได้เป็นสองประเภท ได้แก่ ประสิทธิภาพและความเข้ากันได้ คุณสมบัติด้านประสิทธิภาพ ได้แก่ ความสว่าง ความเสถียรต่อ แสง ความไว จลนศาสตร์ (ความเร็ว) ความเป็นเส้นตรงของการตอบสนอง เป็นต้น...