กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 11 นาที

ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม

ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม (หรือ GEVI ) เป็น โปรตีน ที่สามารถรับรู้ ศักย์เยื่อ หุ้มเซลล์และเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงของ แรงดันไฟฟ้า กับรูปแบบของเอาต์พุต ซึ่งมักจะ...

ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม

ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม (หรือGEVI ) เป็นโปรตีนที่สามารถรับรู้ศักย์เยื่อหุ้มเซลล์และเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงของแรงดันไฟฟ้ากับรูปแบบของเอาต์พุต ซึ่งมักจะเป็นระดับการเรืองแสง[ 1 ]เป็น เครื่องมือบันทึก ออปโตเจเนติกส์ที่มีศักยภาพซึ่งช่วยให้สามารถบันทึก สัญญาณ ทางสรีรวิทยาไฟฟ้าจากเซลล์เพาะเลี้ยงและสัตว์มีชีวิตได้ ตัวอย่างของตระกูล GEVI ได้แก่ Quasar/Archon [ 2 ] [ 3 ] Ace-mNeon [ 4 ]และ ASAP [ 5 ] [ 6 ]

ประวัติศาสตร์

แม้ว่าแนวคิดเรื่องการวัดกิจกรรมของเซลล์ประสาทด้วยแสงจะถูกเสนอขึ้นในช่วงปลายทศวรรษ 1960 [ 7 ]แต่ GEVI ตัวแรกที่ประสบความสำเร็จและสะดวกพอที่จะนำไปใช้งานจริงนั้นยังไม่ได้รับการพัฒนาจนกระทั่งเทคโนโลยีวิศวกรรมพันธุกรรมมีความสมบูรณ์ในช่วงปลายทศวรรษ 1990 GEVI ตัวแรกที่เรียกว่า FlaSh [ 8 ]ถูกสร้างขึ้นโดยการหลอมรวมโปรตีนเรืองแสงสีเขียว ที่ดัดแปลง เข้ากับช่อง K + ที่ไวต่อแรงดันไฟฟ้า ( Shaker ) แตกต่างจากโปรตีนเรืองแสง การค้นพบ GEVI ใหม่ๆ มักไม่ได้รับแรงบันดาลใจจากธรรมชาติ เนื่องจากเป็นการยากที่จะหาสิ่งมีชีวิตที่มีความสามารถในการเปลี่ยนการเรืองแสงตามแรงดันไฟฟ้าได้ตามธรรมชาติ ดังนั้น GEVI ใหม่ๆ ส่วนใหญ่จึงเป็นผลผลิตจากวิศวกรรมพันธุกรรมและ โปรตีน

สามารถใช้สองวิธีในการค้นหา GEVI ใหม่ ได้แก่การออกแบบอย่างมีเหตุผลและการวิวัฒนาการแบบกำหนดทิศทางวิธีแรกมีส่วนช่วยในการสร้าง GEVI รูปแบบใหม่ส่วนใหญ่ แต่การวิจัยล่าสุดที่ใช้การวิวัฒนาการแบบกำหนดทิศทางได้แสดงให้เห็นผลลัพธ์ที่น่าสนใจในการเพิ่มประสิทธิภาพ GEVI [ 9 ] [ 10 ]

โครงสร้าง

ตามหลักการแล้ว GEVI ควรตรวจจับความแตกต่างของแรงดันไฟฟ้าข้ามเยื่อหุ้มเซลล์และรายงานโดยการเปลี่ยนแปลงของฟลูออเรสเซนซ์ โครงสร้างที่แตกต่างกันหลายแบบสามารถใช้สำหรับฟังก์ชันการตรวจจับแรงดันไฟฟ้าได้[ 11 ]แต่คุณสมบัติที่สำคัญอย่างหนึ่งคือต้องฝังอยู่ในเยื่อหุ้มเซลล์ โดยปกติแล้ว โดเมนตรวจจับแรงดันไฟฟ้า (VSD) ของ GEVI จะทอดข้ามเยื่อหุ้มเซลล์และเชื่อมต่อกับโปรตีนเรืองแสง (FP) อย่างไรก็ตาม ไม่จำเป็นว่าการตรวจจับและการรายงานจะต้องเกิดขึ้นในโครงสร้างที่แตกต่างกัน - ดูตัวอย่างเช่น Archons

โดยโครงสร้าง GEVI สามารถจำแนกได้เป็นสี่ประเภทตามการค้นพบในปัจจุบัน: (1) GEVI ที่มีโปรตีนเรืองแสงคู่ FRET เช่น VSFP1 (2) GEVI ออปซินเดี่ยว เช่น Arch (3) GEVI คู่ FRET ของออปซิน-FP เช่น MacQ-mCitrine (4) FP เดี่ยวที่มีโดเมนตรวจจับแรงดันไฟฟ้าชนิดพิเศษ เช่น ASAP1 GEVI ส่วนใหญ่มีพื้นฐานมาจากฟอสฟาเตสที่ไวต่อแรงดันไฟฟ้าของ Ciona intestinalis (Ci-VSP หรือ Ci-VSD (โดเมน)) ซึ่งถูกค้นพบในปี 2548 จาก การสำรวจ จีโนมของสิ่งมีชีวิต[ 12 ] GEVI บางตัวอาจมีส่วนประกอบที่คล้ายกัน แต่ในตำแหน่งที่แตกต่างกัน ตัวอย่างเช่น ทั้ง ASAP1 และ ArcLight ต่างก็ใช้ VSD และ FP หนึ่งตัว แต่ FP ของ ASAP1 อยู่ด้านนอกของเซลล์ ในขณะที่ FP ของ ArcLight อยู่ด้านใน และ FP สองตัวของ VSFP-Butterfly ถูกคั่นด้วย VSD ในขณะที่ FP สองตัวของ Mermaid อยู่ใกล้กันมากกว่า

ตาราง GEVI และโครงสร้างของ GEVI
เกวี[เอ]ปี การรับรู้ การรายงาน สารตั้งต้น
FlaSh [ 8 ]พ.ศ. 2540 เชคเกอร์ (ช่อง K + ) จีเอฟพี -
VSFP1 [ 13 ]2001 หนู Kv2.1 (ช่อง K + ) คู่ FRET : CFP และ YFP -
SPARC [ 14 ]2002 ช่องทาง Rat Na +จีเอฟพี -
VSFP2 [ 15 ]2007 ซี-วีเอสดี คู่ FRET : CFP (สีฟ้าคราม) และ YFP (สีเหลืองมะนาว) วีเอสเอฟพี1
แฟลร์[ 16 ]2007 Kv1.4 (ช่อง K + ) วายเอฟพี แฟลช
VSFP3.1 [ 17 ]2008 ซี-วีเอสดี ซีเอฟพี VSFP2
นางเงือก[ 18 ]2008 ซี-วีเอสดี คู่ FRET : Marine GFP (mUKG) และ OFP (mKOκ) VSFP2
hVOS [ 19 ]2008 ไดพิคริลามีนจีเอฟพี -
VSFP ที่มีการเลื่อนสีแดง[ 20 ]2009 ซี-วีเอสดี RFP/YFP (Citrine, mOrange2, TagRFP หรือ mKate2) VSFP3.1
อุปกรณ์ประกอบฉาก[ 21 ]2011 โปรตีโอโรดอปซิน (GPR) ที่ดูดซับสีเขียวที่ได้รับการดัดแปลง เหมือนกับด้านซ้าย -
ซาห์รา, ซาห์รา 2 [ 22 ]2012 Nv-VSD, Dr-VSD คู่ FRET : CFP (สีฟ้าคราม) และ YFP (สีเหลืองมะนาว) VSFP2
ArcLight [ 23 ]2012 ซี-วีเอสดี ซูเปอร์อีคลิปติก pHluorin ที่ได้รับการดัดแปลง -
อาร์ช[ 24 ]2012 อาร์เคอร์โรดอปซิน 3เหมือนกับด้านซ้าย -
ElectricPk [ 25 ]2012 ซี-วีเอสดี EGFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม VSFP3.1
VSFP-ผีเสื้อ[ 26 ]2012 ซี-วีเอสดี คู่ FRET : YFP (mCitrine) และ RFP (mKate2) VSFP2
VSFP-CR [ 27 ]2013 ซี-วีเอสดี คู่ FRET : GFP (Clover) และ RFP (mRuby2) VSFP2.3
นางเงือก2 [ 28 ]2013 ซี-วีเอสดี คู่ FRET : CFP (seCFP2) และ YFP เงือก
Mac GEVIs [ 29 ]2014 แมคโรดอปซิน (ตัวรับ FRET) ผู้บริจาค FRET: mCitrine หรือ mOrange2 -
QuasAr1, QuasAr2 [ 30 ]2014 อาร์เคอร์โรดอปซิน 3 ที่ได้รับการดัดแปลง เหมือนกับด้านซ้าย โค้ง
อาร์เชอร์[ 31 ]2014 อาร์เคอร์โรดอปซิน 3 ที่ได้รับการดัดแปลง เหมือนกับด้านซ้าย โค้ง
ASAP1 [ 32 ]2014 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม -
เอซ GEVI [ 33 ]2015 โรดอปซินเอซที่ดัดแปลงแล้ว ผู้บริจาค FRET: mNeonGreen แม็ค จีอีวี
ArcLightning [ 34 ]2015 ซี-วีเอสดี ซูเปอร์อีคลิปติก pHluorin ที่ได้รับการดัดแปลง อาร์คไลท์
ปาโด[ 35 ]2016 ช่องโปรตอนที่ควบคุมด้วยแรงดันไฟฟ้า ซูเปอร์อีคลิปติก พีเอชลูริน -
ASAP2f [ 36 ]2016 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม เร็วที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้1
FlicR1 [ 37 ]2016 ซี-วีเอสดี RFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม (mApple) VSFP3.1
บงวูรี[ 38 ]2017 ซี-วีเอสดี ซูเปอร์อีคลิปติก pHluorin ที่ได้รับการดัดแปลง อาร์คไลท์
ASAP2s [ 39 ]2017 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม เร็วที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้1
ASAP-Y [ 40 ]2017 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม เร็วที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้1
(pa)QuasAr3(-s) [ 41 ]2019 อาร์เคอร์โรดอปซิน 3 ที่ได้รับการดัดแปลง เหมือนกับด้านซ้าย ควาสอาร์2
โวลตรอน(-ST) [ 42 ]2019 โรดอปซิน Ace ที่ได้รับการดัดแปลง (Ace2) สารให้ FRET: Janelia Fluor (สารเคมี) -
ASAP3 [ 43 ]2019 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม เอเอสเอพี2
JEDI-2P [ 44 ]2022 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม เอเอสเอพี2
ASAP4 2023 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม เอเอสเอพี2
ASAP5 2024 Gg-VSD ที่ได้รับการดัดแปลง GFP ที่เรียงลำดับแบบวงกลม ASAP3
  1. ชื่อที่พิมพ์เป็นตัวเอียง หมายถึง GEVI ที่ยังไม่ได้ตั้งชื่อ

ลักษณะเฉพาะ

GEVI สามารถประเมินได้จากคุณลักษณะหลายประการ คุณลักษณะเหล่านี้สามารถจำแนกได้เป็นสองประเภท ได้แก่ ประสิทธิภาพและความเข้ากันได้ คุณสมบัติด้านประสิทธิภาพ ได้แก่ ความสว่างความเสถียรต่อแสง ความไว จลนศาสตร์ (ความเร็ว) ความเป็นเส้นตรงของการตอบสนอง เป็นต้น ในขณะที่คุณสมบัติด้านความเข้ากันได้ ครอบคลุมถึงความเป็นพิษ ( ความเป็นพิษต่อแสง ) การกำหนดตำแหน่งเยื่อหุ้มพลาสมา ความสามารถในการปรับตัวของการถ่ายภาพเนื้อเยื่อส่วนลึก เป็นต้น[ 45 ]

การใช้งาน ข้อดี และข้อเสีย

GEVI ประเภทต่างๆ กำลังได้รับการพัฒนาในหลายสาขาการวิจัยทางชีววิทยาหรือสรีรวิทยา แตกต่างจากวิธีการตรวจจับแรงดันไฟฟ้าแบบเดิม เช่น การบันทึกทางสรีรวิทยาไฟฟ้า โดยใช้อิเล็กโทรดหรือสีย้อมที่ไวต่อแรงดันไฟฟ้า GEVI สามารถแสดงออกได้อย่างเสถียรและสามารถกำหนดเป้าหมายไปยังเซลล์ประเภทเฉพาะได้ GEVI มีความละเอียดเชิงพื้นที่ระดับเซลล์ย่อย[ 46 ] และความละเอียดเชิงเวลาต่ำถึง 0.2 มิลลิวินาที ซึ่งเร็วกว่า การถ่ายภาพแคลเซียมอย่างน้อยหนึ่งลำดับความแรงสิ่งนี้ทำให้ความแม่นยำในการตรวจจับสไปค์เทียบได้กับการบันทึกทางสรีรวิทยาไฟฟ้าโดยใช้อิเล็กโทรด แต่ไม่มีการรุกราน[ 33 ]นักวิจัยได้ใช้ GEVI เพื่อตรวจสอบการสื่อสารทางประสาทของสมองที่สมบูรณ์ (ของแมลงหวี่[ 47 ]หรือหนู[ 48 ] ) การเกิดสไปค์ไฟฟ้าของแบคทีเรีย ( E. coli [ 21 ] ) และเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจที่ ได้จากสเต็มเซลล์ของมนุษย์ [ 49 ] [ 50 ]

ในทางกลับกัน การบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าในรูปแบบใดๆ ก็ตามย่อมมีข้อจำกัดโดยธรรมชาติ[ 51 ] การถ่ายภาพต้องรวดเร็ว มิฉะนั้นจะพลาดการเปลี่ยนแปลงแรงดันไฟฟ้าในช่วงสั้นๆ ซึ่งหมายความว่าจะมีโฟตอนน้อยลงต่อการเปิดรับแสงภาพ นอกจากนี้ ความสว่างต่อเซลล์ยังต่ำกว่าตัวบ่งชี้แคลเซียมโดยธรรมชาติ เนื่องจากตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าสามารถอยู่ในเยื่อหุ้มเซลล์ได้น้อยกว่าตัวบ่งชี้แคลเซียมในไซโตพลาสซึมประมาณ 30 เท่า

ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Genetically_encoded_voltage_indicator&oldid=1355240934 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม

ตัวบ่งชี้แรงดันไฟฟ้าที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม (หรือ GEVI ) เป็น โปรตีน ที่สามารถรับรู้ ศักย์เยื่อ หุ้มเซลล์และเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงของ แรงดันไฟฟ้า กับรูปแบบของเอาต์พุต ซึ่งมักจะ...

ประวัติศาสตร์

แม้ว่าแนวคิดเรื่องการวัดกิจกรรมของเซลล์ประสาทด้วยแสงจะถูกเสนอขึ้นในช่วงปลายทศวรรษ 1960 [ 7 ] แต่ GEVI ตัวแรกที่ประสบความสำเร็จและสะดวกพอที่จะนำไปใช้งานจริงนั้นยังไม่ได้รับการพัฒนาจนกระทั่งเทคโนโลยีวิศวกรรมพันธุกรรมมีความสมบูรณ์ในช่วงปลายทศวรรษ 1990 GEVI...

โครงสร้าง

ตามหลักการแล้ว GEVI ควรตรวจจับความแตกต่างของแรงดันไฟฟ้าข้าม เยื่อหุ้มเซลล์ และรายงานโดยการเปลี่ยนแปลงของฟลูออเรสเซนซ์ โครงสร้างที่แตกต่างกันหลายแบบสามารถใช้สำหรับฟังก์ชันการตรวจจับแรงดันไฟฟ้าได้ [ 11 ]...

ลักษณะเฉพาะ

GEVI สามารถประเมินได้จากคุณลักษณะหลายประการ คุณลักษณะเหล่านี้สามารถจำแนกได้เป็นสองประเภท ได้แก่ ประสิทธิภาพและความเข้ากันได้ คุณสมบัติด้านประสิทธิภาพ ได้แก่ ความสว่าง ความเสถียรต่อ แสง ความไว จลนศาสตร์ (ความเร็ว) ความเป็นเส้นตรงของการตอบสนอง เป็นต้น...