| เฮอร์ซี1 |
|---|
|
| โครงสร้างที่มีอยู่ |
|---|
| พีดีบี | ค้นหาข้อมูลมนุษย์ใน UniProt: PDBe RCSB |
|---|
| รายชื่อรหัส PDB |
|---|
4O2W , 4QT6 |
|
|
| ตัวระบุ |
|---|
| ชื่อเรียกอื่น | HERC1 , p532, p619, HECT และ RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, MDFPMR |
|---|
| รหัสภายนอก | โอมิม : 605109 ; เอ็มจีไอ : 2384589 ; โฮโมโลยีน : 31207 ; การ์ดยีน : HERC1 ; OMA : HERC1 - ออโธล็อก |
|---|
|
|
| รูปแบบการแสดงออกของ RNA |
|---|
| บีจี | | มนุษย์ | เมาส์ (ออร์โธล็อก) |
|---|
| สูงสุดที่แสดงใน | - ไจรัสขมับกลาง
- พื้นที่บรอดแมน 23
- ส่วนนูนของปมประสาท
- ซีกขวาของสมองน้อย
- เปลือกสมองส่วนรับภาพหลัก
- เปลือกสมองส่วนหน้า
- เอ็นร้อยหวาย
- เนื้อเยื่อกล้ามเนื้อโครงร่างของกล้ามเนื้อไบเซปส์ เบรคิไอ
- กล้ามเนื้อต้นขา
- กลีบหน้าผากด้านขวา
|
| | สูงสุดที่แสดงใน | - คอร์เทกซ์เพอริไรนัล
- ฟิลด์ CA3
- ไจรัสซิงกูเลต
- เอนโทไรนัลคอร์เทกซ์
- นิวเคลียสด้านหลังส่วนกลาง
- เปลือกสมองส่วนสั่งการหลัก
- เวอร์มิสของสม cerebellum
- ท่อรวมไขกระดูก
- กลีบของสมองน้อย
- ฮาเบนูลา
|
| | ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม |
|
|---|
| ไบโอจีพีเอส |  | | ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม |
|
|---|
|
| ออนโทโลยีของยีน |
|---|
| หน้าที่ระดับโมเลกุล | - กิจกรรมยูบิควิติน-โปรตีนทรานสเฟอเรส
- กิจกรรมของปัจจัยแลกเปลี่ยนกัวนิลนิวคลีโอไทด์
- กิจกรรมทรานสเฟอเรส
| | ส่วนประกอบของเซลล์ | - ไซโตพลาซึม
- ไซโตซอล
- เครื่องมือของกอลจิ
- เมมเบรน
| | กระบวนการทางชีวภาพ | - การแยกแยะเซลล์ Purkinje ในสม cerebellum
- การควบคุมเชิงลบของออโตฟาจี
- การพัฒนาการฉายภาพของเซลล์ประสาท
- การยูบิควิตินไนเซชันของโปรตีน
- กระบวนการทางประสาทและกล้ามเนื้อที่ควบคุมการทรงตัว
| | แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO |
|
|
| วิกิดาต้า |
|
เอนไซม์ยูบิควิติน-โปรตีนไลเกส E3 HERC1 ที่น่าจะเป็นไปได้คือเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนHERC1 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้จะกระตุ้น การแลกเปลี่ยนนิ วคลีโอไทด์กัวนีนบนโปรตีน ARF1 และ Rab โปรตีนนี้เชื่อว่ามีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการขนส่งผ่านเยื่อหุ้มเซลล์[ 7 ]
ความรู้เกี่ยวกับยีนได้รับการอำนวยความสะดวกโดยการค้นพบการกลายพันธุ์ของหนู การกลายพันธุ์ tambaleante (tbl) เกิดขึ้นเองตามธรรมชาติบนพื้นฐานทางพันธุกรรม DW/J-Pas [ 8 ]ซึ่งเป็นการกลายพันธุ์แบบด้อยของยีน Herc1 ที่อยู่บนโครโมโซม 9 ของหนูที่เพิ่มระดับโปรตีน Herc1 [ 9 ]โปรตีนนี้แสดงออกอย่างกว้างขวางในเนื้อเยื่อหลายชนิด (Sanchez-Tena et al., 2016; https://www.proteinatlas.org/ENSG00000103657-HERC1/tissue ) และบริเวณสมองหลายแห่งรวมถึงซีรีเบลลัม ( https://www.proteinatlas.org/ENSG00000103657-HERC1/brain )
หนูที่กลายพันธุ์ Herc1-tbl (tambaleante) มีลักษณะเฉพาะคือการสูญเสียเซลล์ Purkinje [ 8 ]นอกจากสมองน้อยแล้ว หนูที่กลายพันธุ์ Herc1tbl ยังมีความกว้างของหนามเดนไดรต์ที่ต่ำกว่าในเซลล์ประสาทพีระมิด CA1 [ 10 ]หนูที่กลายพันธุ์ Herc1-tbl ยังมีลักษณะเฉพาะคือภาวะเสียการทรงตัวของสมองน้อย การเดินที่ไม่มั่นคง และปฏิกิริยาการงอแขนขาที่ถูกกระตุ้นโดยการยกหาง[ 9 ]ซึ่งพบในหนูที่กลายพันธุ์ของสมองน้อยชนิดอื่น ๆ ซึ่งเป็นปฏิกิริยาตรงกันข้ามกับปฏิกิริยาการเหยียดแขนขาตามปกติ[ 11 ]
เมื่อเทียบกับหนูสายพันธุ์ปกติ หนูที่กลายพันธุ์ Herc1-tbl จะตกลงมาจากโรตาร็อดได้เร็วกว่าและบ่อยกว่า[ 12 ] [ 13 ]ตกลงมาจากเสาแนวตั้งได้เร็วกว่า[ 14 ] [ 9 ]ลื่นบ่อยกว่าและใช้เวลานานกว่าในการไปถึงปลายคานนิ่ง[ 13 ]และมีแรงยึดเกาะของแขนขาหน้าอ่อนกว่าเมื่อวัดด้วยเครื่องวัดแรงยึดเกาะ[ 12 ]ความบกพร่องของโรตาร็อดได้รับการแก้ไขเมื่อผสมพันธุ์หนูที่กลายพันธุ์ Herc1tbl กับหนูทรานส์เจนิกที่แสดงออกถึง HERC1 ของมนุษย์ปกติ[ 9 ]หนูที่กลายพันธุ์ Herc1tbl ยังมีความสามารถในการลงจอดบนขาทั้งสี่อย่างถูกต้องน้อยลงเมื่อปล่อยในอากาศ[ 14 ]
มีการรายงานการกลายพันธุ์ของ HERC1 แบบไบอัลลีลิกในพี่น้องสองคนที่มีลักษณะใบหน้าผิดรูป ศีรษะโต พัฒนาการด้านการเคลื่อนไหวล่าช้า เดินเซ กล้ามเนื้ออ่อนแรง และความบกพร่องทางสติปัญญา[ 15 ]ในทำนองเดียวกัน มีการรายงานการกลายพันธุ์แบบไร้ความหมาย (nonsense) ของ HERC1 ในผู้ป่วยรายหนึ่งที่มีภาวะถ่ายทอดทางพันธุกรรมแบบออโตโซมัลรีเซสซีฟ ซึ่งประกอบด้วยลักษณะใบหน้าผิดรูป ศีรษะโต โรคลมชัก พัฒนาการด้านการเคลื่อนไหวล่าช้า สมองน้อยฝ่อ และความบกพร่องทางสติปัญญา[ 16 ]นอกจากนี้ยังมีการรายงานลักษณะใบหน้าผิดรูป ศีรษะโต และความบกพร่องทางสติปัญญา แต่ไม่มีภาวะสมองน้อยผิดปกติ ในพี่น้องสองคนที่มีการกลายพันธุ์ของ HERC1 แบบสไปลซ์[ 17 ]การที่ไม่มีความเกี่ยวข้องกับสมองน้อยนั้นเกิดจากลักษณะของการกลายพันธุ์หรืออิทธิพลของยีนดัดแปลง ผู้ป่วยอีกรายที่มีการกลายพันธุ์แบบเฟรมชิฟต์ของ HERC1 ซึ่งคาดว่าจะทำให้โปรตีนสั้นลง แสดงอาการใบหน้าผิดรูป ศีรษะโต การปล่อยกระแสไฟฟ้าแบบโรคลมชัก กล้ามเนื้ออ่อนแรง ความบกพร่องทางสติปัญญา และลักษณะออทิสติก[ 18 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Ewing RM, Chu P, Elisma F และ คณะ (2007). "การทำแผนที่ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์ในระดับใหญ่ด้วยแมสสเปกโทรเมตรี" Mol . Syst. Biol . 3 (1) 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y และ คณะ (2006). "การกระจายตัวของการปรับเปลี่ยนการถอดรหัส: การระบุและลักษณะเฉพาะของโปรโมเตอร์ทางเลือกที่อาจเป็นไปได้ของยีนมนุษย์ในวงกว้าง" . Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- Garcia-Gonzalo FR, Bartrons R, Ventura F, Rosa JL (2005). "ความต้องการฟอสฟาติดิลอิโนซิทอล-4,5-บิสฟอสเฟตสำหรับการปลดปล่อยกัวนีนนิวคลีโอไทด์จากโปรตีน ARF ที่เกิดจาก HERC1" FEBS Lett . 579 (2): 343– 8. Bibcode : 2005FEBSL.579..343G . doi : 10.1016/j.febslet.2004.11.095 . PMID 15642342 .
- Garcia-Gonzalo FR, Muñoz P, González E และ คณะ (2004). "โปรตีนยักษ์ HERC1 ถูกดึงดูดไปยังส่วนยื่นของพื้นผิวที่อุดมไปด้วยแอคตินซึ่งเกิดจากการเหนี่ยวนำด้วยอะลูมิเนียมฟลูออไรด์ในเซลล์ HeLa" FEBS Lett . 559 ( 1–3 ): 77–83 . Bibcode : 2004FEBSL.559...77G . doi : 10.1016/S0014-5793(04)00030-4 . PMID 14960311 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T และ คณะ (2004). "การจัดลำดับและลักษณะเฉพาะของ cDNA มนุษย์ความยาวเต็ม 21,243 รายการ" Nat . Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Garcia-Gonzalo FR, Cruz C, Muñoz P และ คณะ (2003). "ปฏิสัมพันธ์ระหว่าง HERC1 และไพรูเวทไคเนสชนิด M2" FEBS Lett . 539 ( 1–3 ): 78–84 . Bibcode : 2003FEBSL.539...78G . doi : 10.1016/S0014-5793(03)00205-9 . PMID 12650930. S2CID 32809019 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และ คณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Cruz C, Paladugu A, Ventura F และ คณะ (1999). "การกำหนดตำแหน่งของยีน P532 ของมนุษย์ (HERC1) บนโครโมโซม 15q22 โดยการผสมแบบฟลูออเรสเซนต์ในแหล่งกำเนิด" Cytogenet . Cell Genet . 86 (1): 68– 9. doi : 10.1159/000015414 . PMID 10516438. S2CID 46241923 .
- Ji Y, Walkowicz MJ, Buiting K และ คณะ (1999). "ยีนบรรพบุรุษสำหรับการถอดรหัสซ้ำที่มีจำนวนสำเนาต่ำในบริเวณ Prader-Willi/Angelman เข้ารหัสโปรตีนขนาดใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับการขนส่งโปรตีน ซึ่งขาดหายไปในหนูที่มีความผิดปกติของระบบประสาทและกล้ามเนื้อและการสร้างอสุจิ" Hum . Mol. Genet . 8 (3): 533– 42. doi : 10.1093/hmg/8.3.533 . PMID 9949213 .
- Yu W, Andersson B, Worley KC และ คณะ (1997). "การจัดลำดับ cDNA แบบต่อกันขนาดใหญ่" . Genome Res . 7 (4): 353– 8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "การทำให้เป็นมาตรฐานและการลบ: สองแนวทางเพื่ออำนวยความสะดวกในการค้นพบยีน" . Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY และ คณะ (1996). "วิธีการ 'อะแดปเตอร์คู่' สำหรับการสร้างไลบรารีช็อตกันที่ดีขึ้น" Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
