HLTF

Q: ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ HLTF

ปัจจัยการถอดรหัสคล้ายเฮลิเคส เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน HLTF [ 5 ] [ 6 ]

Q: ปฏิสัมพันธ์

HLTF ได้รับการแสดงให้เห็นว่า มี ปฏิสัมพันธ์ กับ UBE2N [ 8 ] RAD18 [ 8 ] และ UBE2V2 [ 8 ] (ดู เครือข่ายการเชื่อมโยงการทำงานและทางกายภาพ ของ STRING ด้วย : ภายใต้ตัวเลือก 'ค้นหาตามชื่อ' ให้ป้อน 'ชื่อโปรตีน' ที่สนใจ HLTF คลิก 'GO!

Q: อ่านเพิ่มเติม

บทความเกี่ยวกับ ยีน บน โครโมโซมคู่ที่ 3 ของมนุษย์นี้ ยังไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป

HLTF
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบี	การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
รายชื่อรหัส PDB
	2MZN , 4HRE , 4HRH , 4S0N , 4XZF , 4XZG , 5BNH , 5K5F
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	HLTF , HIP116, HIP116A, HLTF1, RNF80, SMARCA3, SNF2L3, ZBU1, ปัจจัยถอดรหัสคล้ายเฮลิเคส, ปัจจัยถอดรหัสคล้ายเฮลิเคส
รหัสภายนอก	OMIM : 603257 ; MGI : 1196437 ; HomoloGene : 30136 ; GeneCards : HLTF ; OMA : HLTF - orthologs
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 3 (มนุษย์)
จบ	149,086,554 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม 3 (เมาส์)
จบ	20,172,654 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	อัณฑะ; พอนส์; กลุ่มนิวเคลียสด้านข้างของทาลามัส; พาร์ส คอมแพ็กตา; เนื้อเยื่อบุผิวของคอรอยด์เพล็กซัส; ส่วนเรติคิวลาตา; นิวเคลียสซับทาลามิก; นิวเคลียสเวสติบูลาร์ส่วนบน; กลอบัส พัลลิดัสภายนอก; เวอร์มิสของสม cerebellum;
	สูงสุดที่แสดงใน
	ถุงน้ำ; แผ่นเนื้อเยื่อหู; ถุงน้ำในหู; ฮาเบนูลา; ลิ้นหัวใจเอทริโอเวนทริคูลาร์; เยื่อบุผิวเปลี่ยนผ่านของกระเพาะปัสสาวะ; ต่อมน้ำเหลืองในช่องท้อง; เยื่อบุผิวเม็ดสีเรตินา; เลือด; ร่องรอยดั้งเดิม;
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	การจับกับ DNA; การจับนิวคลีโอไทด์; กิจกรรมเฮลิเคส; การจับไอออนสังกะสี; กิจกรรมกระตุ้นการถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II; การจับไอออนโลหะ; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II; กิจกรรมไฮโดรเลส ซึ่งออกฤทธิ์ต่อกรดแอนไฮไดรด์ ในแอนไฮไดรด์ที่มีฟอสฟอรัสเป็นองค์ประกอบ; กิจกรรม ATPase; การจับโปรตีน; กิจกรรมเร่งปฏิกิริยา; การจับกรดนิวคลีอิก; กิจกรรมไฮโดรเลส; การจับกับ ATP; การจับกันของยูบิควิตินกับโปรตีนไลเกส; กิจกรรมทรานสเฟอเรส; การจับกับ RNA; กิจกรรมของยูบิควิตินโปรตีนไลเกส;
ส่วนประกอบของเซลล์	ไซโตพลาซึม; เมมเบรน; นิวคลีโอลัส; นิวเคลียส; นิวคลีโอพลาสม์;
กระบวนการทางชีวภาพ	การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมการถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การเผาผลาญ; การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II; การยูบิควิตินไนเซชันของโปรตีน; การจัดระเบียบโครมาติน;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	6596
	20585
	ENSG00000071794
	ENSMUSG00000002428
	Q14527
	Q6PCN7
	NM_003071 NM_139048 NM_001318934 NM_001318935
	NM_009210 NM_144959 NM_001355097
	NP_001305863 NP_001305864 NP_003062 NP_620636
	NP_033236 NP_001342026
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

ปัจจัยการถอดรหัสคล้ายเฮลิเคสเป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน HLTF ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

การทำงาน

ยีนนี้เข้ารหัสสมาชิกของ ตระกูล SWI/SNFสมาชิกในตระกูลนี้มี กิจกรรม เฮลิเคสและATPaseและเชื่อกันว่าควบคุมการถอดรหัสของยีนบางชนิดโดยการเปลี่ยนแปลง โครงสร้าง โครมาตินรอบๆ ยีนเหล่านั้น โปรตีนที่เข้ารหัสประกอบด้วย โมทีฟการจับกับ DNA แบบ RING finger พบว่ามีรูปแบบการถอดรหัสสองแบบที่เข้ารหัสโปรตีนเดียวกันสำหรับยีนนี้ อย่างไรก็ตาม การใช้ไซต์เริ่มต้นการแปลทางเลือกทำให้เกิดไอโซฟอร์มที่ถูกตัดทอนที่ปลาย N เมื่อเทียบกับโปรตีนที่มีความยาวเต็ม^[⁶^]

HLTF เป็นทรานสโลเคส DNA สองสาย ซึ่งเป็นหนึ่งในสองโฮโมล็อกของมนุษย์ของSaccharomyces cerevisiae RAD5นอกเหนือจากSHPRH (SNF2 histone linker PHD RING helicase) ที่สามารถดำเนินการ ย้อนกลับ ของฟอร์กได้เช่นเดียวกับ Rad5 ^{[ 7 ]}

ปฏิสัมพันธ์

HLTF ได้รับการแสดงให้เห็นว่า^มีปฏิสัมพันธ์กับUBE2N [ ⁸^] RAD18 ^[⁸^]และUBE2V2 ^[⁸^] (ดู เครือข่ายการเชื่อมโยงการทำงานและทางกายภาพ ของ STRING ด้วย : ภายใต้ตัวเลือก'ค้นหาตามชื่อ'ให้ป้อน'ชื่อโปรตีน'ที่สนใจ HLTF คลิก'GO! ' เลือก'สิ่งมีชีวิต ' คลิก'ดำเนินการต่อ ->' )

อ่านเพิ่มเติม

Sheridan PL, Schorpp M, Voz ML, Jones KA (1995). "การโคลนโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับ SNF2/SWI2 ที่จับกับโมทีฟ SPH ของตัวเร่งปฏิกิริยา SV40 และโปรโมเตอร์ HIV-1 โดยเฉพาะ" . J. Biol. Chem . 270 (9): 4575– 87. doi : 10.1074/jbc.270.9.4575 . PMID 7876228 .
Descheemaeker K (1993). "เกี่ยวกับการควบคุมการแสดงออกของยีน plasminogen activator inhibitor-1" Verh. K. Acad. Geneeskd. Belg . 55 (3): 225– 64. PMID 8342330 .
Ding H, Descheemaeker K, Marynen P และคณะ (1996). "การจำแนกลักษณะของปัจจัยการถอดรหัสคล้ายเฮลิเคสที่เกี่ยวข้องกับการแสดงออกของยีนยับยั้งการทำงานของพลาสมิโนเจน-1 ในมนุษย์" DNA Cell Biol . 15 (6): 429– 42. doi : 10.1089/dna.1996.15.429 . PMID 8672239 .
Gong X, Kaushal S, Ceccarelli E และคณะ (1997). "การควบคุมการพัฒนาของ Zbu1 ซึ่งเป็นสมาชิกที่จับกับ DNA ของตระกูล SWI2/SNF2" Dev. Biol . 183 ( 2): 166– 82. doi : 10.1006/dbio.1996.8486 . PMID 9126292 .
Ding H, Benotmane AM, Suske G และคณะ (1999). "ปฏิสัมพันธ์เชิงหน้าที่ระหว่าง Sp1 หรือ Sp3 และปัจจัยการถอดรหัสคล้ายเฮลิเคสเป็นตัวกลางในการแสดงออกพื้นฐานของยีนยับยั้งการทำงานของพลาสมิโนเจน-1 ของมนุษย์" J. Biol. Chem . 274 (28): 19573– 80. doi : 10.1074/jbc.274.28.19573 . PMID 10391891 .
Mansharamani M, Hewetson A, Chilton BS (2001). "การโคลนและลักษณะเฉพาะของ ATPase ชนิด P-type IV ที่ผิดปกติซึ่งจับกับโมทีฟ RING ของปัจจัยการถอดรหัส RUSH" . J. Biol. Chem . 276 (5): 3641– 9. doi : 10.1074/jbc.M004231200 . PMID 11058586 .
Shaheduzzaman S, Krishnan V, Petrovic A และคณะ (2002). "ผลกระทบของ HIV-1 Nef ต่อโปรไฟล์การแสดงออกของยีนในเซลล์". J. Biomed. Sci . 9 (1): 82– 96. doi : 10.1007/BF02256581 . PMID 11810028 .
Moinova HR, Chen WD, Shen L และคณะ (2002). "การปิดการทำงานของยีน HLTF ในมะเร็งลำไส้ใหญ่ของมนุษย์" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (7): 4562– 7. Bibcode : 2002PNAS...99.4562M . doi : 10.1073/pnas.062459899 . PMC 123687 . PMID 11904375 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และคณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Leung WK, Yu J, Bai AH และคณะ (2003). "การปิดใช้งานปัจจัยการถอดรหัสคล้ายเฮลิเคสโดยการเพิ่มเมทิลเลชั่นของโปรโมเตอร์ในมะเร็งกระเพาะอาหารของมนุษย์" Mol . Carcinog . 37 (2): 91– 7. doi : 10.1002/mc.10124 . PMID 12766908. S2CID 46627646 .
Hamai Y, Oue N, Mitani Y และคณะ (2004). "การเพิ่มเมทิลเลชั่นของ DNA และการลดอะเซทิลเลชั่นของฮิ สโตนของยีน HLTF เกี่ยวข้องกับการแสดงออกที่ลดลงในมะเร็งกระเพาะอาหาร" Cancer Sci . 94 ( 8): 692– 8. doi : 10.1111/j.1349-7006.2003.tb01504.x . PMC 11160177. PMID 12901794. S2CID 27311901 .
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U และคณะ (2004). "เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนเชื่อมโยง GIT1 ซึ่งเป็นตัวเร่งการรวมตัวของฮันติงตินกับโรคฮันติงตัน" . Mol. Cell . 15 (6): 853– 65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . PMID 15383276 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA และคณะ (2004). "สถานะ คุณภาพ และการขยายตัวของโครงการ cDNA ความยาวเต็มของ NIH: ชุดสะสมยีนสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK และคณะ (2005). "พลวัตของโปรตีนในนิวเคลียส" Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F และคณะ (2006). "พลวัตการฟอสโฟรีเลชันทั่วโลก ในร่างกาย และเฉพาะตำแหน่งในเครือข่ายการส่งสัญญาณ" . Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Fukuoka T, Hibi K, Nakao A (2006). "พบเมทิลเลชั่นที่ผิดปกติบ่อยครั้งในมะเร็งเซลล์สความัสของหลอดอาหารระยะลุกลาม" Anticancer Res . 26 (5A): 3333– 5. PMID 17094449 .

บทความเกี่ยวกับยีนบนโครโมโซมคู่ที่ 3 ของมนุษย์นี้ ยังไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

มี

HLTF

การทำงาน

ปฏิสัมพันธ์

อ่านเพิ่มเติม

ข้อมูลสำคัญจากบทความ