กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 8 นาที

ฮาโลรูบรัม

สกุลอาร์เคีย/Haloarchaea/แท็กซ่าอธิบายไว้ในปี 1996

Halorubrumเป็นสกุล หนึ่ง ในวงศ์ Halorubraceaeโดย ทั่วไปแล้วพืชใน สกุล Halorubrumมักชอบเกลือและพบได้ในแหล่งน้ำที่มีความเข้มข้นของเกลือสูง เช่นทะเลเดดซีหรือทะเลสาบซาบูเย

ฮาโลรูบรัม

ฮาโลรูบรัม
การจำแนกทางวิทยาศาสตร์แก้ไขการจัดหมวดหมู่นี้
โดเมน:อาร์เคีย
อาณาจักร:มีทาโนแบคทีเรีย
ไฟลัม:เมทาโนแบคทีเรีย
ระดับ:ฮาโลแบคทีเรีย
คำสั่ง:ฮาโลเฟอราเคิลส์
ตระกูล:ฮาโลรูบราซี
ประเภท:Halorubrum McGenity และ Grant 1996 [ 1 ]
ชนิดต้นแบบ
Halorubrum saccharovorum
(Tomlinson & Hochstein 1977) McGenity & Grant 1996
สายพันธุ์

ดูข้อความ

คำพ้องความหมาย
  • Halorubrobacterium Kamekura และ Dyall-Smith 1996 [ 1 ]

Halorubrumเป็นสกุล หนึ่ง ในวงศ์ Halorubraceaeโดย ทั่วไปแล้วพืชใน สกุล Halorubrumมักชอบเกลือและพบได้ในแหล่งน้ำที่มีความเข้มข้นของเกลือสูง เช่นทะเลเดดซีหรือทะเลสาบซาบูเย

การแลกเปลี่ยนทางพันธุกรรม

ประชากรของฮาโลอาร์ เคีย Halorubrumในสภาพแวดล้อมที่มีความเข้มข้นของเกลือสูงตามธรรมชาติมีการแลกเปลี่ยนข้อมูลทางพันธุกรรมบ่อยครั้งโดยการเกิดการรวมตัวใหม่[ 2 ] ประชากรนี้แสดงให้เห็นถึงระดับของสมดุลการเชื่อมโยงที่ใกล้เคียงกับประชากรที่มีการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศ

สายพันธุ์

Halorubrum ejinorenseถูกแยกได้เป็นครั้งแรกจากทะเลสาบ Ejinor ในมองโกเลียใน ประเทศจีน[ 3 ]

Halorubrum lacusprofundiถูกแยกได้ครั้งแรกในช่วงทศวรรษ 1980 จากทะเลสาบดีพเลแอนตาร์กติกา[ 4 ]จีโนมของมันซึ่งได้รับการจัดลำดับในปี 2008 ประกอบด้วยโครโมโซม สองอัน (อันหนึ่ง 2.74 Mbและอีกอัน 0.53 Mb) และพลาสมิดหนึ่งอัน (0.43 Mb) [ 5 ]เอนไซม์β-galactosidase ของมันได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางเพื่อทำความเข้าใจว่าโปรตีนทำงานอย่างไรในสภาพแวดล้อมที่มีอุณหภูมิต่ำและมีความเค็มสูง[ 6 ] [ 7 ] สายพันธุ์หนึ่งของH. lacusprofundiมีพลาสมิดสำหรับการถ่ายโอนยีนในแนวนอนซึ่งเกิดขึ้นผ่านกลไกที่ใช้อนุภาคคล้ายไวรัสที่ห่อหุ้มด้วยเวสิเคิล[ 8 ]

Halorubrum sodomenseถูกค้นพบครั้งแรกในทะเลเดดซีในปี 1980 มันต้องการความเข้มข้นของไอออนMg 2+ ที่สูงกว่า ฮาโลฟิลล์ ที่เกี่ยวข้องสำหรับการเจริญ เติบโต[ 9 ]เยื่อหุ้มเซลล์ของมันมีArchaerhodopsin-3 (AR3) ซึ่งเป็นโปรตีนรับแสงที่เก็บเกี่ยวพลังงานจากแสงแดดเพื่อสร้างแรงขับเคลื่อนโปรตอนที่ใช้ในการสังเคราะห์ATP [ 10 ] [ 11 ]มิวแทนต์ของ AR3 ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายเป็นเครื่องมือในออปโตเจเนติกส์สำหรับการวิจัยทางประสาทวิทยา[ 12 ]

Halorubrum tibetenseถูกแยกได้เป็นครั้งแรกจากทะเลสาบ Zabuyeในทิเบต ประเทศจีน[ 13 ]

Halorubrum xinjiangenseถูกแยกได้เป็นครั้งแรกจากทะเลสาบ Xiao-Er-Kuleในซินเจียง ประเทศจีน[ 14 ]

ชนิดพันธุ์ที่เสนอ

มีการเสนอชื่อวิทยาศาสตร์และชื่อวิทยาศาสตร์ใหม่หลายชนิด แต่ยังไม่ได้รับการตีพิมพ์อย่างถูกต้อง

  • " Halorubrum africanae " Kharroub และคณะ 2007bและ " Halorubrum Constantinense " Kharroub และคณะ 2550bถูกแยกออกในประเทศแอลจีเรียและเสนอให้เป็นสายพันธุ์ใหม่ในปี 2550 [ 15 ]และ 2548 [ 16 ]
  • " Halorubrum alimentarium " Nam et al. 2008 nom. nud.และ " Halorubrum koreense " Nam et al. 2008 nom. nud.เป็นชื่อที่เสนอสำหรับสายพันธุ์B43และB6 ที่ยังไม่ได้รับการอธิบาย ซึ่งปรากฏในสิ่งพิมพ์เมื่อปี 2008 [ 17 ]
  • " Halorubrum halotolerans " Sabet et al. 2009เป็นชื่อที่เสนอสำหรับสายพันธุ์ที่ไม่ได้รับการอธิบายซึ่งแยกได้จากบ่อเกลือพลังงานแสงอาทิตย์ในบาฮาแคลิฟอร์เนียในปี 2009 [ 18 ]
  • Halorubrum hochsteniumเป็นชื่อที่เสนอสำหรับจีโนมทั้งหมดของสายพันธุ์ที่ยังไม่ได้รับการอธิบายATCC 700873ซึ่งส่งไปยังฐานข้อมูลในปี 2014 [ 19 ] [ 20 ]
  • " Halorubrum jeotgali " Roh et al. 2007bถูกแยกได้จากตัวอย่างอาหารทะเลแบบดั้งเดิมของเกาหลีและเสนอให้เป็นสายพันธุ์ใหม่ในปี 2007 [ 21 ] Halorubrum cibariumได้รับการเสนอในสิ่งพิมพ์เดียวกัน ได้รับการเสนออีกครั้งภายใต้ชื่อH. cibiและได้รับการยอมรับในปี 2009
  • " Halorubrum kribbense " Nkamga, Henrissat & Drancourt 2017และ " Halorubrum norisence " Nkamga, Henrissat & Drancourt 2017เป็นชื่อที่เสนอของสายพันธุ์ที่ไม่ได้รับการแยกจากไมโครไบโอมในลำไส้ของมนุษย์ ซึ่งอ้างอิงในสิ่งพิมพ์ในปี 2017 [ 22 ]
  • H. miltondacostae อัลบูเคอร์คี และคณะ 2025
  • " Halorubrum salipaludis " Gong et al. 2021ได้รับการตีพิมพ์ครั้งแรกในปี 2021 [ 23 ]
  • " ฮาโลรูบรัม ซัลโซลิส "
  • Halorubrum salsamentiแยกได้จากน้ำเกลือและเสนอให้เป็นสายพันธุ์ใหม่ในปี 2017 [ 24 ]
  • " Halorubrum sfaxense " Trigui และคณะ พ.ศ. 2554ถูกแยกออกในตูนิเซียและเสนอให้เป็นสายพันธุ์ใหม่ในปี พ.ศ. 2560 [ 25 ]
  • " ฮาโลรูบรัม ทรอปิคอล "ถูกแยกในเปอร์โตริโกและเสนอให้เป็นสายพันธุ์ใหม่ในปี 2559 [ 26 ]

วิวัฒนาการ

อนุกรมวิธานที่ยอมรับในปัจจุบันนั้นอิงตามรายชื่อชื่อโปรคาริโอตที่มีสถานะในระบบการตั้งชื่อ (LPSN) [ 1 ]และศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI) [ 27 ]

LTPที่ใช้ 16S rRNA _10_2024 [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ]โปรตีนเครื่องหมาย 53 ตัวตามGTDB 10-RS226 [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ]
ฮาโลรูบรัม

H. vacuolatum (Mwatha & Grant 1993) Kamekura และคณะ 1997

H. gandharaense Kondô และคณะ 2558

H. luteum Hu et al. 2008

H. alkaliphilumเฟงและคณะ 2005

H. tibetense Fan et al. 2004

H. glutamatedens Xu et al. 2019

H. Aquatum Gutierrez และคณะ 2554

H. aethiopicum Gibtan และคณะ 2018

H. rubrum Qiu และคณะ 2014

H. cibi Roh & Bae 2009

H. halodurans Corral et al. 2016

H. distributum (Zvyagintseva & Tarasov 1989) Oren & Ventosa 1996

H. ejinorense Castillo และคณะ 2550

H. tebenquichense Lizama และคณะ 2545

H. hochsteinianum Vreeland และคณะ 2024

H. salinarum Han et al. 2022

H. xinjiangense Feng และคณะ. 2547

H. coriense (คาเมคุระ & ไดออล-สมิธ 1996) โอเรน & เวนโตซา 1996

H. ezzemoulense Kharroub และคณะ 2549

H. sodomense (Oren 1983) McGenity & Grant 1996

H. californiense Pesenti และคณะ 2551

H. trapanicum (Petter 1931) McGenity & Grant 1996

H. amylolyticum Sun และคณะ 2019

H. persicum Corral และคณะ 2558

H. saccharovorum (Tomlinson & Hochstein 1977) McGenity & Grant 1996

H. pallidum Chen et al. 2016

H. laminariae Han & Cui 2015

H. salinum Zhang & Cui 2014

H. lipolyticum Cui และคณะ 2549

H. kocurii Gutierrez และคณะ 2551

H. lacusprofundi (Franzmann et al. 1989) McGenity & Grant 1996

เอช. ซัลซาเมนติเฉิน และคณะ 2019

H. halophilum Yim et al. 2014

H. orientale Castillo และคณะ 2549

H. trueperi Chen et al. 2017

H. aidingense Cui et al. 2006

H. yunnanense Chen และคณะ 2558

H. depositum Chen et al. 2019

H. rutilum Yin et al. 2016

ฮาโลรูบรัม

เอช. แวคิวโอลาตัม

เอช. อัลคาลิฟิลัม

เอช. อควาติคัม

เอช. ซิบิ

เอช. รูบรัม

เอช. เอธิโอปิคัม

เอช. ฮาโลดูรันส์

เอช. ลามินาเรีย

เอช. ซาลินัม

เอช. เอดิงเกนส์

เอช. ดีโพซิตัม

ฮ. หยุนหนานเซ็ง

เอช. ลาคัสโปรฟันดี

เอช. เพอร์ซิคัม

เอช. แซคคาโรโวรัม

เอช. ฮาโลฟิลัม

" H. salipaludis " Gong และคณะ 2021

เอช. อะไมโลไลติคัม

เอช. ซัลซาเมนติ

อ่านเพิ่มเติม

วารสารทางวิทยาศาสตร์

  • Oren A, Ventosa A (2000). "คณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยแบคทีเรียวิทยาเชิงระบบ คณะอนุกรรมการว่าด้วยอนุกรมวิธานของ Halobacteriaceae รายงานการประชุม 16 สิงหาคม 2542 ซิดนีย์ ออสเตรเลีย" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405– 1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 . 
  • โอเรน เอ, เวนโตซา เอ (1996) "ข้อเสนอสำหรับการโอน Halorubrobacterium distributum และ Halorubrobacterium coriense ไปยังสกุล Halorubrum เป็น Halorubrum distributum comb.nov. และ Halorubrum coriense comb.nov. ตามลำดับ " นานาชาติ เจ. ซิสเต็ม. แบคทีเรีย . 46 (4): 1180. ดอย : 10.1099 / 00207713-46-4-1180
  • แมคเจนนิตี้ ทีเจ, แกรนท์ WD (1995) "การถ่ายโอน Halobacterium saccharovorum, Halobacterium sodomense, Halobacterium trapanicum NRC 34021 และ Halobacterium lacusprofundi ไปยังสกุล Halorubrum gen. พ.ย., เป็น Halorubrum saccharovorum comb. พ.ย., Halorubrumsodomense หวี พ.ย., Halorubrum trapanicum หวี พ.ย. และ Halorubrum lacusprofundi หวี.nov" ระบบ ใบสมัคร ไมโครไบโอล . 18 (2): 237– 243. ดอย : 10.1016/s0723-2020(11)80394-2 .
  • Kamekura M, Dyall-Smith ML (1995). "อนุกรมวิธานของวงศ์ Halobacteriaceae และคำอธิบายของสกุลใหม่สองสกุล Halorubrobacterium และ Natrialba" . J. Gen. Appl. Microbiol . 41 (4): 333– 350. doi : 10.2323/jgam.41.333 .
  • Papke T, Fullmer M, Soucy S, Swithers K, Makkay A, Wheeler R, Ventosa A, Gogarten P (11 เมษายน 2557). "การวิเคราะห์ประชากรและจีโนมของสกุล Halorubrum" . Frontiers in Microbiology . 5 (บทความหมายเลข: 140): 140. doi : 10.3389/fmicb.2014.00140 . PMC 3990103 . PMID 24782836 .  

หนังสือวิทยาศาสตร์

  • Gibbons, NE (1974). "Family V. Halobacteriaceae fam. nov.". ใน RE Buchanan; NE Gibbons (บรรณาธิการ). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (  ฉบับที่ 8). บัลติมอร์: The Williams & Wilkins Co. ISBN 0-683-01117-0.
  • Halorubrumที่ Bac Dive - ฐานข้อมูลเมตาของความหลากหลายทางแบคทีเรีย
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Halorubrum&oldid=1344918418 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ฮาโลรูบรัม

Halorubrumเป็นสกุล หนึ่ง ในวงศ์ Halorubraceaeโดย ทั่วไปแล้วพืชใน สกุล Halorubrumมักชอบเกลือและพบได้ในแหล่งน้ำที่มีความเข้มข้นของเกลือสูง เช่นทะเลเดดซีหรือทะเลสาบซาบูเย

การแลกเปลี่ยนทางพันธุกรรม

ประชากรของฮาโลอาร์ เคีย Halorubrum ในสภาพแวดล้อมที่มีความเข้มข้นของเกลือสูงตามธรรมชาติมีการแลกเปลี่ยนข้อมูลทางพันธุกรรมบ่อยครั้งโดยการเกิดการรวมตัวใหม่ [ 2 ] ประชากรนี้แสดงให้เห็นถึงระดับของสมดุลการเชื่อมโยงที่ใกล้เคียงกับประชากรที่มีการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศ

สายพันธุ์

Halorubrum ejinorense ถูกแยกได้เป็นครั้งแรกจากทะเลสาบ Ejinor ใน มองโกเลีย ใน ประเทศจีน [ 3 ]

วิวัฒนาการ

อนุกรมวิธานที่ยอมรับในปัจจุบันนั้นอิงตาม รายชื่อชื่อโปรคาริโอตที่มีสถานะในระบบการตั้งชื่อ (LPSN) [ 1 ] และ ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI) [ 27 ]