อ่าน 2 นาที
ขอให้สนุกกับการทำแผนที่
ใน ทางพันธุศาสตร์ HAPPY Mapping ซึ่งเสนอครั้งแรกโดย Paul H. Dear และ Peter R.
ขอให้สนุกกับการทำแผนที่
ในทางพันธุศาสตร์ HAPPY Mappingซึ่งเสนอครั้งแรกโดย Paul H. Dear และ Peter R. Cook ในปี 1989 เป็นวิธีการที่ใช้ในการศึกษาการเชื่อมโยง ระหว่าง ลำดับ DNAสองลำดับขึ้นไป[ 1 ] ตามที่Single Molecule Genomics Group ระบุไว้ มันคือ"การทำแผนที่โดยอาศัยการวิเคราะห์ตัวอย่าง DNA ที่มี HAPloid โดยประมาณโดยใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส"ในทางจีโนมิกส์ HAPPY mapping สามารถนำมาใช้เพื่อประเมินความสัมพันธ์และการวางแนวของลำดับ DNA ต่างๆ ทั่วทั้งจีโนมเฉพาะ ซึ่งเป็นการสร้างแผนที่ "จีโนม"
เช่นเดียวกับการทำแผนที่แบบเชื่อมโยง (linkage mapping ) การทำแผนที่แบบ HAPPY อาศัยความน่าจะเป็นที่แตกต่างกันของการแยกตัวของลำดับดีเอ็นเอสองลำดับขึ้นไป ในการทำแผนที่ทางพันธุกรรม ความน่าจะเป็นของ การเกิด การรวมตัวใหม่ (recombination ) ระหว่างตำแหน่งทางพันธุกรรมสองตำแหน่ง บน โครโมโซมเดียวกันนั้นแปรผันตรงกับระยะห่างระหว่างตำแหน่งเหล่านั้น การทำแผนที่แบบ HAPPY แทนที่การรวมตัวใหม่ด้วยการแตกตัว (fragmentation) แทนที่จะอาศัยการรวมตัวใหม่เพื่อแยกตำแหน่งทางพันธุกรรม จีโนมทั้งหมดจะถูกแตกตัว เช่น โดยรังสีหรือการตัดด้วยกลไก หากดีเอ็นเอแตกตัวแบบสุ่ม ยิ่งระยะห่างระหว่างลำดับดีเอ็นเอสองลำดับยาวเท่าใด โอกาสที่จะแตกตัวระหว่างสองลำดับนั้นก็จะยิ่งสูงขึ้นเท่านั้น และในทางกลับกัน
การทำแผนที่แบบ HAPPY ช่วยรักษาประโยชน์ของการทำแผนที่ทางพันธุกรรมไว้ ในขณะเดียวกันก็ขจัดปัญหาบางประการที่เกี่ยวข้องกับการเกิดการรวมตัวใหม่ เช่น ความจำเป็นของความหลากหลายทางพันธุกรรมและการผสมพันธุ์ นอกจากนี้ การรวมตัวใหม่ยังสามารถเกิดขึ้นเฉพาะที่ ในขณะที่การแตกหักของดีเอ็นเอจีโนมโดยรังสีหรือการตัดด้วยกลไกดูเหมือนจะเป็นแบบสุ่มมากกว่า มีการใช้เพื่อทำแผนที่ทางพันธุกรรมของสิ่งมีชีวิตหลายชนิด[ 2 ] [ 3 ]
การทำแผนที่ HAPPY ยังได้รับการปรับปรุงเพื่อให้สามารถวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนา ได้อย่างแม่นยำ และโดยเฉพาะอย่างยิ่งการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงจำนวนสำเนาในมะเร็ง[ 4 ]
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ขอให้สนุกกับการทำแผนที่
ใน ทางพันธุศาสตร์ HAPPY Mapping ซึ่งเสนอครั้งแรกโดย Paul H. Dear และ Peter R.