อ่าน 2 นาที
ล้อเกลียว
วงล้อเกลียวเป็นรูปแบบหนึ่งของแผนภาพ หรือการ แสดง ภาพที่ใช้เพื่อแสดงคุณสมบัติของเกลียวอัลฟาในโปรตีน
ล้อเกลียว

วงล้อเกลียวเป็นรูปแบบหนึ่งของแผนภาพ หรือการ แสดง ภาพที่ใช้เพื่อแสดงคุณสมบัติของเกลียวอัลฟาในโปรตีน
ลำดับของกรดอะมิโน ที่ประกอบขึ้นเป็นส่วนเกลียวของ โครงสร้างทุติยภูมิของโปรตีน จะถูกแสดงในลักษณะหมุน โดยมุมการหมุนระหว่างกรดอะมิโน ที่อยู่ติดกันคือ 100° เพื่อให้ภาพที่ได้สุดท้ายมองลงไปตามแกนเกลียว
ขั้วและลักษณะเฉพาะ
แผนภาพแสดงให้เห็นว่า กรดอะมิโน ที่ไม่ชอบน้ำจะกระจุกตัวอยู่ด้านใดด้านหนึ่งของเกลียว โดยปกติแล้วจะมี กรดอะมิโน ที่มีขั้วหรือชอบน้ำอยู่ด้านตรงข้าม การจัดเรียงแบบนี้พบได้ทั่วไปในเกลียวอัลฟาภายในโปรตีนทรงกลมโดยด้านหนึ่งของเกลียวจะหันไปทางแกนที่ไม่ชอบน้ำและอีกด้านหนึ่งจะหันไปทาง พื้นผิวที่สัมผัสกับ ตัวทำละลาย นอกจากนี้ยังเผยให้เห็น รูปแบบเฉพาะที่มีลักษณะเฉพาะของการพับโปรตีนและโมทีฟการเชื่อมต่อของโปรตีนเช่น การระบุบริเวณการเกิดไดเมอร์ของลิวซีนซิปเปอร์และคอยล์คอยล์แผนภาพการฉายภาพนี้มักเรียกว่า "วงล้อเอ็ดมันด์สัน" ตามชื่อผู้คิดค้น[ 1 ]
การวาดล้อเกลียว
ล้อเกลียวสามารถวาดได้ด้วยซอฟต์แวร์หลายประเภท รวมถึง helixvis [ 2 ]ในR , heliquest ในRหรือผ่านเซิร์ฟเวอร์ HELIQUEST [ 3 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Mount DM (2004). ชีวสารสนเทศ: การวิเคราะห์ลำดับและจีโนม (ฉบับที่ 2). โคลด์สปริงฮาร์เบอร์, นิวยอร์ก: สำนักพิมพ์ห้องปฏิบัติการโคลด์สปริงฮาร์เบอร์. ISBN 0-87969-712-1.
ลิงก์ภายนอก
- ล้อรถแบบไม่เหมือนใคร มีสีสันมากขึ้นเก็บถาวรเมื่อ 15 กรกฎาคม 2019 ที่Wayback Machine (ต้องใช้Macromedia Flash )
- ดรอว์คอยล์ 1.0
- การฉายภาพล้อเกลียว มหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนีย ริเวอร์ไซด์
- NetWheels, การฉายภาพวงล้อเกลียวและตาข่ายคุณภาพสูงเก็บถาวรเมื่อ 2020-02-22 ที่Wayback Machine
- ล้อเกลียวคุณภาพสูงใน R
- เฮลิกซ์วิส
- เฮลิเควสต์
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ล้อเกลียว
วงล้อเกลียวเป็นรูปแบบหนึ่งของแผนภาพ หรือการ แสดง ภาพที่ใช้เพื่อแสดงคุณสมบัติของเกลียวอัลฟาในโปรตีน
ขั้วและลักษณะเฉพาะ
แผนภาพแสดงให้เห็นว่า กรดอะมิโน ที่ไม่ชอบน้ำ จะกระจุกตัวอยู่ด้านใดด้านหนึ่งของเกลียว โดยปกติแล้วจะมี กรดอะมิโน ที่มีขั้ว หรือ ชอบน้ำ อยู่ด้านตรงข้าม การจัดเรียงแบบนี้พบได้ทั่วไปใน เกลียวอัลฟา ภายใน โปรตีนทรงกลม โดยด้านหนึ่งของเกลียวจะหันไปทาง แกนที่ไม่ชอบน้ำ...
การวาดล้อเกลียว
ล้อเกลียวสามารถวาดได้ด้วยซอฟต์แวร์หลายประเภท รวมถึง helixvis [ 2 ] ใน R , heliquest ใน R หรือผ่านเซิร์ฟเวอร์ HELIQUEST [ 3 ]
อ่านเพิ่มเติม
Mount DM (2004). ชีวสารสนเทศ: การวิเคราะห์ลำดับและจีโนม (ฉบับที่ 2). โคลด์สปริงฮาร์เบอร์, นิวยอร์ก: สำนักพิมพ์ห้องปฏิบัติการโคลด์สปริงฮาร์เบอร์. ISBN 0-87969-712-1 .