กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 2 นาที

ล้อเกลียว

วงล้อเกลียวเป็นรูปแบบหนึ่งของแผนภาพ หรือการ แสดง ภาพที่ใช้เพื่อแสดงคุณสมบัติของเกลียวอัลฟาในโปรตีน

ล้อเกลียว

ตัวอย่างลำดับกรดอะมิโนที่แสดงบนแผนภาพวงล้อเกลียว หมู่กรดอะมิโนแบบอะลิฟาติกแสดงด้วยสี่เหลี่ยมสีฟ้า หมู่กรดอะมิโนแบบมีขั้วหรือมีประจุลบแสดงด้วยรูปเพชรสีแดง และหมู่กรดอะมิโนที่มีประจุบวกแสดงด้วยรูปแปดเหลี่ยมสีดำ

วงล้อเกลียวเป็นรูปแบบหนึ่งของแผนภาพ หรือการ แสดง ภาพที่ใช้เพื่อแสดงคุณสมบัติของเกลียวอัลฟาในโปรตีน

ลำดับของกรดอะมิโน ที่ประกอบขึ้นเป็นส่วนเกลียวของ โครงสร้างทุติยภูมิของโปรตีน จะถูกแสดงในลักษณะหมุน โดยมุมการหมุนระหว่างกรดอะมิโน ที่อยู่ติดกันคือ 100° เพื่อให้ภาพที่ได้สุดท้ายมองลงไปตามแกนเกลียว

ขั้วและลักษณะเฉพาะ

แผนภาพแสดงให้เห็นว่า กรดอะมิโน ที่ไม่ชอบน้ำจะกระจุกตัวอยู่ด้านใดด้านหนึ่งของเกลียว โดยปกติแล้วจะมี กรดอะมิโน ที่มีขั้วหรือชอบน้ำอยู่ด้านตรงข้าม การจัดเรียงแบบนี้พบได้ทั่วไปในเกลียวอัลฟาภายในโปรตีนทรงกลมโดยด้านหนึ่งของเกลียวจะหันไปทางแกนที่ไม่ชอบน้ำและอีกด้านหนึ่งจะหันไปทาง พื้นผิวที่สัมผัสกับ ตัวทำละลาย นอกจากนี้ยังเผยให้เห็น รูปแบบเฉพาะที่มีลักษณะเฉพาะของการพับโปรตีนและโมทีฟการเชื่อมต่อของโปรตีนเช่น การระบุบริเวณการเกิดไดเมอร์ของลิวซีนซิปเปอร์และคอยล์คอยล์แผนภาพการฉายภาพนี้มักเรียกว่า "วงล้อเอ็ดมันด์สัน" ตามชื่อผู้คิดค้น[ 1 ]

การวาดล้อเกลียว

ล้อเกลียวสามารถวาดได้ด้วยซอฟต์แวร์หลายประเภท รวมถึง helixvis [ 2 ]ในR , heliquest ในRหรือผ่านเซิร์ฟเวอร์ HELIQUEST [ 3 ]

อ่านเพิ่มเติม

  • Mount DM (2004). ชีวสารสนเทศ: การวิเคราะห์ลำดับและจีโนม (ฉบับที่ 2). โคลด์สปริงฮาร์เบอร์, นิวยอร์ก: สำนักพิมพ์ห้องปฏิบัติการโคลด์สปริงฮาร์เบอร์. ISBN 0-87969-712-1.
  • ล้อรถแบบไม่เหมือนใคร มีสีสันมากขึ้นเก็บถาวรเมื่อ 15 กรกฎาคม 2019 ที่Wayback Machine (ต้องใช้Macromedia Flash )
  • ดรอว์คอยล์ 1.0
  • การฉายภาพล้อเกลียว มหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนีย ริเวอร์ไซด์
  • NetWheels, การฉายภาพวงล้อเกลียวและตาข่ายคุณภาพสูงเก็บถาวรเมื่อ 2020-02-22 ที่Wayback Machine
  • ล้อเกลียวคุณภาพสูงใน R
  • เฮลิกซ์วิส
  • เฮลิเควสต์
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Helical_wheel&oldid=1252451869 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ล้อเกลียว

วงล้อเกลียวเป็นรูปแบบหนึ่งของแผนภาพ หรือการ แสดง ภาพที่ใช้เพื่อแสดงคุณสมบัติของเกลียวอัลฟาในโปรตีน

ขั้วและลักษณะเฉพาะ

แผนภาพแสดงให้เห็นว่า กรดอะมิโน ที่ไม่ชอบน้ำ จะกระจุกตัวอยู่ด้านใดด้านหนึ่งของเกลียว โดยปกติแล้วจะมี กรดอะมิโน ที่มีขั้ว หรือ ชอบน้ำ อยู่ด้านตรงข้าม การจัดเรียงแบบนี้พบได้ทั่วไปใน เกลียวอัลฟา ภายใน โปรตีนทรงกลม โดยด้านหนึ่งของเกลียวจะหันไปทาง แกนที่ไม่ชอบน้ำ...

การวาดล้อเกลียว

ล้อเกลียวสามารถวาดได้ด้วยซอฟต์แวร์หลายประเภท รวมถึง helixvis [ 2 ] ใน R , heliquest ใน R หรือผ่านเซิร์ฟเวอร์ HELIQUEST [ 3 ]

อ่านเพิ่มเติม

Mount DM (2004). ชีวสารสนเทศ: การวิเคราะห์ลำดับและจีโนม (ฉบับที่ 2). โคลด์สปริงฮาร์เบอร์, นิวยอร์ก: สำนักพิมพ์ห้องปฏิบัติการโคลด์สปริงฮาร์เบอร์. ISBN 0-87969-712-1 .