กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 6 นาที

โครงการโปรตีโอมของมนุษย์

โครงการ Human Proteome Project [ 1 ] ( HPP ) เป็นความพยายามร่วมกันที่ประสานงานโดย Human Proteome Organization [ 2 ] เป้าหมายที่ระบุไว้คือการสังเกต โปรตีน...

โครงการโปรตีโอมของมนุษย์

โครงการโปรตีโอมของมนุษย์
เนื้อหา
คำอธิบายการวิเคราะห์ลักษณะเฉพาะของโปรตีนทั้งหมด
ประเภทข้อมูลที่บันทึกไว้ลำดับโปรตีน, ฟอสโฟรีเลชัน, อะเซทิเลชัน, ไกลโคซิเลชัน
สิ่งมีชีวิตโฮโมเซเปียนส์
ติดต่อ
ศูนย์วิจัยการจัดระเบียบโปรตีโอมของมนุษย์
ห้องปฏิบัติการหลากหลาย
การอ้างอิงหลักPMID  22398612
เข้าถึง
เว็บไซต์www.thehpp.org www.c-hpp.org
URL ของเว็บเซอร์วิสNextProt REST

โครงการHuman Proteome Project [ 1 ] ( HPP ) เป็นความพยายามร่วมกันที่ประสานงานโดยHuman Proteome Organization [ 2 ] เป้าหมายที่ระบุไว้คือการสังเกต โปรตีนทั้งหมดที่ผลิตโดยลำดับที่แปลจากจีโนมมนุษย์ด้วย วิธี การทดลอง

ประวัติศาสตร์

องค์กรโปรตีโอมของมนุษย์ ทำหน้าที่เป็นหน่วย งาน ประสานงานสำหรับโครงการวิจัย โปรตีโอมิกส์ระยะยาวหลายโครงการที่เกี่ยวข้องกับเนื้อเยื่อของมนุษย์ที่มีความสำคัญทางคลินิก เช่นพลาสมาในเลือด [ 3 ]ตับ [ 4 ]สมอง[ 5 ]และปัสสาวะ [ 6 ] นอกจาก นี้ ยังรับผิดชอบโครงการที่เกี่ยวข้องกับเทคโนโลยีเฉพาะ[ 7 ]และมาตรฐาน[ 8 ] ที่จำเป็นสำหรับการ ศึกษาโปรตีนในวงกว้าง

โครงสร้างและเป้าหมายของโครงการขนาดใหญ่ที่จะดำเนินควบคู่ไปกับโครงการจีโนมมนุษย์ได้รับการถกเถียงกันในเอกสารทางวิทยาศาสตร์[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]ผลจากการถกเถียงนี้และการประชุมหลายครั้งในการประชุมระดับโลกขององค์การโปรตีโอมมนุษย์ในปี 2009, 2010 และ 2011 ส่งผลให้มีการตัดสินใจที่จะกำหนดให้โครงการโปรตีโอมมนุษย์ประกอบด้วยโครงการย่อยสองโครงการ คือ C-HPP และ B/D-HPP [ 14 ] C-HPP จะถูกจัดกลุ่มเป็น 25 กลุ่ม กลุ่มละหนึ่งโครโมโซมของมนุษย์ ส่วน B/D-HPP จะถูกจัดกลุ่มตามความเกี่ยวข้องทางชีววิทยาและโรคของโปรตีน[ 15 ]

โครงการและกลุ่ม

รายชื่อคณะทำงานปัจจุบันเรียงตามลำดับโครโมโซมที่จะศึกษา แสดงไว้ด้านล่าง

โครโมโซม หัวหน้ากลุ่ม สังกัดระดับชาติ
1 ปิง ซู จีน
2 ลิดี้ เลน สวิตเซอร์แลนด์
3 ทาเคชิ คาวามูระ ญี่ปุ่น
4 หยู จู เฉินไต้หวัน
5 ปีเตอร์ ฮอร์วาโตวิช เนเธอร์แลนด์
6 คริสตอฟ บอร์เชอร์ส แคนาดา
7 เอ็ดเวิร์ด ไนซ์ ออสเตรเลีย นิวซีแลนด์
8 เผิงหยวน หยาง จีน
9 เจ-โยเอล โช โซล ประเทศเกาหลี
10 โจชัว ลาแบร์ สหรัฐอเมริกา
11 จงชินยู เกาหลี
12 ราวี สิรเดชมุขอินเดีย สิงคโปร์ ไต้หวัน ไทย
13 ยัง กี ไพค์ เกาหลี
14 ชาร์ลส์ ไพโน ฝรั่งเศส
15 กิลแบร์โต บี โดมอนต์ บราซิล
16 เฟอร์นันโด คอร์ราเลส สเปน
17 กิลเบิร์ต เอส. โอเมนน์สหรัฐอเมริกา
18 อเล็กซ์ อาร์ชาคอฟ รัสเซีย
19 จอร์จี มาร์โก-วาร์กา สวีเดน
20 ซีชิว หลิว จีน
21 อัลเบิร์ต ซิกแมนน์ เยอรมนี
22 อัคฮิเลช ปันเดย์สหรัฐอเมริกา
X ยาสุชิ อิชิฮามะ ญี่ปุ่น
วาย กาเซม ฮอสเซนี ซาเลกเดห์ อิหร่าน
เอ็มที อันเดรีย อูร์บานี อิตาลี

ทรัพยากรการคำนวณ

การลดขนาดข้อมูล การวิเคราะห์ และการตรวจสอบความถูกต้องของผลลัพธ์โปรตีโอมิกส์แบบ MS/MS นั้น ดำเนินการโดย Eric Deutsch ที่ Institute for Systems Biology, Seattle, USA ( PeptideAtlas ) การจัดการข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับวิธีการใช้แอนติบอดีนั้น ประสานงานโดย Kalle von Feilitzen, Stockholm, Sweden ( Human Protein Atlas ) การบูรณาการโดยรวมและการรายงานข้อมูลทางสารสนเทศเป็นความรับผิดชอบของ Lydie Lane ที่ SIB, Geneva, Switzerland ( NeXtProt ) ข้อมูลทั้งหมดที่สร้างขึ้นจากส่วนร่วมของ HPP จะถูกฝากไว้ในคลังข้อมูล ProteomeXchange แห่งใดแห่งหนึ่ง

สถานะปัจจุบัน

มีการเผยแพร่ข้อมูลอัปเดตเกี่ยวกับโครงการ Human Proteome Project เป็นประจำ เช่น ใน Journal of Proteome Research (2014) [ 16 ]มีการเผยแพร่เมตริกสำหรับระดับความเชื่อมั่นที่เกี่ยวข้องกับการสังเกตโปรตีน[ 17 ]เช่นเดียวกับ "MissingProteinPedia" [ 18 ] [ 19 ]

การตรวจสอบพอร์ทัลคำอธิบายหลักเก้าแห่งให้การกระจายของจำนวนโปรตีนของมนุษย์ตั้งแต่ 18,891 ถึง 21,819 (ณ ปี 2017) [ 20 ]เมตริกของ HPP ในปี 2021 แสดงให้เห็นว่าขณะนี้สามารถตรวจพบการแสดงออกของโปรตีนได้อย่างน่าเชื่อถือถึง 92.8% ของโปรตีนที่คาดการณ์ไว้ซึ่งเข้ารหัสในจีโนมของมนุษย์[ 21 ]

ดูเพิ่มเติม

  1. หน้าโครงการ HPP (www.hupo.org)
  2. เว็บไซต์ของ HPP (www.thehpp.org)
  3. เว็บไซต์ HPP ที่เน้นเรื่องโครโมโซม (www.c-hpp.org)
  4. เว็บไซต์ BD HPP (www.hupo.org/B/D-HPP)
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Human_Proteome_Project&oldid=1314657022 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ โครงการโปรตีโอมของมนุษย์

โครงการ Human Proteome Project [ 1 ] ( HPP ) เป็นความพยายามร่วมกันที่ประสานงานโดย Human Proteome Organization [ 2 ] เป้าหมายที่ระบุไว้คือการสังเกต โปรตีน...

ประวัติศาสตร์

องค์กร โปรตีโอมของมนุษย์ ทำหน้าที่เป็นหน่วย งาน ประสานงานสำหรับโครงการวิจัย โปรตีโอมิกส์ ระยะยาวหลายโครงการที่เกี่ยวข้องกับเนื้อเยื่อของมนุษย์ที่มีความสำคัญทางคลินิก เช่น พลาสมาในเลือด [ 3 ] ตับ [ 4 ] สมอง [ 5 ] และ ปัสสาวะ [ 6 ] นอกจาก นี้...

โครงการและกลุ่ม

รายชื่อคณะทำงานปัจจุบันเรียงตามลำดับโครโมโซมที่จะศึกษา แสดงไว้ด้านล่าง

ทรัพยากรการคำนวณ

การลดขนาดข้อมูล การวิเคราะห์ และการตรวจสอบความถูกต้องของผลลัพธ์โปรตีโอมิกส์แบบ MS/MS นั้น ดำเนินการโดย Eric Deutsch ที่ Institute for Systems Biology, Seattle, USA ( PeptideAtlas ) การจัดการข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับวิธีการใช้แอนติบอดีนั้น ประสานงานโดย Kalle von...