อิมพีไซโคลไฮโดรเลส
ในทางเอนไซม์วิทยา IMP ไซโคลไฮโดรเลส ( EC 3.5.4.10 ) คือเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาเคมี
- IMP + H O5-ฟอร์มามิโด-1-(5-ฟอสโฟ-ดี-ไรโบซิล)อิมิดาโซล-4-คาร์บอกซาไมด์
ดังนั้นสารตั้งต้น สอง ของเอนไซม์นี้คือIMPและH2Oในขณะที่ผลิตภัณฑ์ ของ เอนไซม์ นี้ คือ5-formamido-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4- carboxamide
เอนไซม์นี้อยู่ในกลุ่มของไฮโดรเลสซึ่งเป็นเอนไซม์ที่ทำหน้าที่กับพันธะคาร์บอน-ไนโตรเจนที่ไม่ใช่พันธะเปปไทด์ โดยเฉพาะในอะมิดีนแบบวงแหวนชื่อทางระบบของเอนไซม์กลุ่มนี้คือIMP 1,2-ไฮโดรเลส (ดีไซคลิซิง)ชื่ออื่นๆ ที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่อินโนซินิเคสและอินโนซิเนตไซโคลไฮโดรเลสเอนไซม์นี้ เร่งปฏิกิริยาการสร้างวงแหวนของ 5-ฟอร์มิลอะมิโดอิมิดาโซล-4-คาร์บอกซาไมด์ไรโบนิวคลีโอไทด์เป็น IMP ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสังเคราะห์พิวรีนแบบde novo ในอาร์เคีย[ 1 ]
การศึกษาโครงสร้าง
ในกรณีส่วนใหญ่ โปรตีน โดเมน เดี่ยวนี้ จะถูกจัดเรียงเพื่อสร้างโครงสร้าง โดยรวม ที่ประกอบด้วยโครงสร้าง แกน อัลฟา -เบตา- เบตา -อัลฟา แบบสี่ชั้น แผ่น เบตาแบบขนานสอง แผ่น จะวางชิดกันและถูกปกคลุมด้วยเกลียวอัลฟาบนด้านหนึ่งของโมเลกุลโปรตีนนี้มีโครงสร้างคล้ายกับสมาชิกใน กลุ่ม เอนไซม์ไฮโดรเลสที่ มี นิวคลีโอไฟล์ที่ปลาย N (NTN) ในความเป็นจริงแล้ว พบช่องลึกบนพื้นผิวของไซโคลไฮโดรเลส IMP ในตำแหน่งที่เทียบเท่ากับตำแหน่งของไซต์ที่ใช้งานของเอนไซม์ไฮโดรเลส NTN แต่ไม่พบนิวคลีโอไฟล์ที่ปลาย N ดังนั้นจึงคิดว่าเอนไซม์ นี้ มีโครงสร้างคล้ายกับสมาชิกในกลุ่มเอนไซม์ไฮโดรเลส NTN แต่ไม่มีหน้าที่การทำงานที่คล้ายคลึงกัน[ 2 ]
ณ ปลายปี 2550 มีการไขโครงสร้างของเอนไซม์กลุ่มนี้ได้แล้ว 14 โครงสร้าง โดยมีรหัสการเข้าถึงPDB ดังนี้PDB : 1G8M ,PDB : 1M9N ,PDB : 1OZ0 ,PDB : 1P4R ,PDB : 1PKX ,PDB : 1PL0 ,PDB : 1THZ ,PDB : 2B1G ,PDB : 2B1I ,PDB : 2IU0 ,PDB : 2IU3 ,PDB : 2NTK ,PDB : 2NTL และPDB : 2NTM