หลังจากจบอาชีพนักกีฬาของโชเมกเกอร์ เขาได้เข้าร่วมทีมงานที่เวสเทิร์น วอชิงตันในตำแหน่งผู้ช่วยบัณฑิตฝ่ายรุกตั้งแต่ปี 1997 ถึง 1999 โดยเขาทำหน้าที่ฝึกสอนตำแหน่งไทต์เอนด์และรันนิ่งแบ็ก ในช่วงฤดูใบไม้ผลิ โชเมกเกอร์ยังเป็นผู้ช่วยโค้ชซอฟต์บอลของมหาวิทยาลัยอีกด้วย^{[ 2 ]}

ในปี 2000 ชูเมกเกอร์ใช้เวลาช่วงฤดูใบไม้ผลิในตำแหน่งผู้ประสานงานฝ่ายรุกที่เซนต์แมรีก่อนที่จะลาออกไปเป็นผู้ประสานงานเกมส่งบอล โค้ชควอเตอร์แบ็กและปีกที่มิโนต์สเตทเขาดำรงตำแหน่งนี้ตั้งแต่ปี 2000 ถึง 2002 ในช่วงเวลานี้ ชูเมกเกอร์ยังเป็นหัวหน้าโค้ชเบสบอลที่เซนต์แมรีในปี 2000 และหัวหน้าโค้ชเบสบอลที่มิโนต์สเตทในปี 2001 และ 2002 อีกด้วย^{[ 2 ]}

ระหว่างปี 2003 ถึง 2005 ชูเมกเกอร์ดำรงตำแหน่งผู้ช่วยหัวหน้าโค้ช ผู้ประสานงานฝ่ายรุก และโค้ชควอเตอร์แบ็กที่วิทยาลัยเคนยอนในเมืองแกมเบียร์ รัฐโอไฮโอขณะอยู่ที่เคนยอน ทีมรุกของชูเมกเกอร์ทำลายสถิติของโรงเรียนและสถิติส่วนบุคคลถึง 13 รายการ^{[ 2 ]}จากนั้นเขาย้ายไปที่บอลด์วิน-วอลเลซในตำแหน่งผู้ประสานงานฝ่ายรุกและโค้ชควอเตอร์แบ็กสำหรับฤดูกาล 2006 และ 2007 ^{[ 3 ]}

Shoemaker เป็นผู้ประสานงานเกมรุกร่วมและโค้ชควอเตอร์แบ็กที่St. Cloud Stateตั้งแต่ปี 2009 ถึง 2013 ภายใต้การนำของเขา เกมรุกของ Husky ได้สร้างสถิติของโรงเรียนหลายรายการ รวมถึงสถิติสูงสุดต่อฤดูกาลสำหรับคะแนนที่ทำได้ในฤดูกาลเดียว จำนวนทัชดาวน์ทั้งหมด ประสิทธิภาพการส่งบอล การส่งบอลสำเร็จ ระยะทางต่อการส่งบอล และเกมรุกโดยรวม^{[ 3 ]}

เมื่อวันที่ 26 ธันวาคม พ.ศ. 2556 ชูเมกเกอร์ได้รับการว่าจ้างให้เป็นหัวหน้าโค้ชฟุตบอลเป็นครั้งแรกที่เซ็นทรัลวอชิงตันซึ่งเป็น โปรแกรม NCAA Division IIในเมืองเอลเลนส์เบิร์ก รัฐวอชิงตัน [ ^{3 ] ตั้งแต่}ปี พ.ศ. 2557 ถึง พ.ศ. 2561 ชูเมกเกอร์นำทีมไปสู่สถิติโดยรวม 38–16 คว้า แชมป์ Great Northwest Athletic Conference สองสมัย (พ.ศ. 2560 และ พ.ศ. 2561) และเข้ารอบเพลย์ออฟ NCAA (พ.ศ. 2560) เขาได้รับรางวัล Don Hansen Super Region 3 Coach of the Year และโค้ชแห่งปีของ GNAC ในปี พ.ศ. 2560 รวมถึงร่วมกับทีมงานของเขาพัฒนาผู้เล่น All-American ถึง 8 คนตลอดระยะเวลาห้าปีที่เขาดำรงตำแหน่ง^{[ 4 ]}

ในปี 2019 Shoemaker ได้รับการว่าจ้างให้ดำรง ตำแหน่ง NCAA FCS เป็นครั้งแรก โดยเขาได้รับการว่าจ้างให้เป็นผู้ประสานงานฝ่ายรุกและโค้ชควอเตอร์แบ็กที่Eastern Washington ^{[ 5 ]}

ในฤดูกาลแรกของเขา ทีมบุกของ Shoemaker นำ NCAA FCS ในด้านเกมรุกโดยรวมด้วยค่าเฉลี่ย 524.8 หลาต่อเกม และควอเตอร์แบ็กEric Barriereเป็นผู้เข้ารอบสุดท้ายสำหรับรางวัล Walter Paytonซึ่งมอบให้กับผู้เล่น FCS ที่ดีที่สุดของประเทศ^{[ 6 ]}

ในปี 2020 เกมรุกของ Eastern Washington ยังคงทำคะแนนได้อย่างต่อเนื่อง โดยจบอันดับท็อป 5 ของประเทศในด้านการทำคะแนน (อันดับ 2) เกมรุกโดยรวม (อันดับ 3) และการส่งบอล (อันดับ 5) ^{[ 6 ]}

ในฤดูกาลที่ 3 และฤดูกาลสุดท้ายของเขาที่ EWU ชูเมกเกอร์นำทีมบุกให้เริ่มต้นได้อย่างรวดเร็วอีกครั้ง ในช่วง 7 เกมแรก อีเกิลส์ทำคะแนนเฉลี่ย 54 แต้มต่อเกม ทำระยะได้มากกว่า 628 หลาต่อเกม และทีมมีสถิติ 7–0 แต่หลังจากแพ้ติดต่อกัน 2 เกม ซึ่งทีมบุกทำได้เพียงครึ่งหนึ่งของค่าเฉลี่ยในฤดูกาล ชูเมกเกอร์จึงลาออก โดยระบุว่าเป็นการแยกทางกันโดยสมัครใจซึ่งเป็นประโยชน์สูงสุดต่อทีม^{[ 7 ]}

ก่อนฤดูกาล 2022 ชูเมกเกอร์ได้รับการว่าจ้างให้เป็นผู้ประสานงานฝ่ายรุกและโค้ชควอเตอร์แบ็กในทีมงานชุดแรกของทิมมี ชาง ที่ ฮาวายนับเป็นประสบการณ์ครั้งแรกของเขาในระดับDivision I FBS ^{[ 6 ]}