A key component of iatrophysical anatomy was the study of particles. This was particularly influenced by 17th century developments in microbiology, the most prominent being the microscope. Antonie von Leeuwenhoeck was a Dutch scientist who is known for his use of the microscope for identifying single-celled organisms. He was also the first to observe muscle fibers, bacteria, spermatozoa and blood flow in capillaries.^[4] Another famous figure in microbiology at the time was Robert Hooke, an English scientist most famous for his use of the microscope for the discovery of cells.^[5] In his most famous work, Micrographia (1665), he attributed “occult properties” as elementary “contrivances of nature”. Like Galileo Galilei, he shared an iatrophysical viewpoint and saw living organisms as groups of small machines. The development of the microscope was largely influential in this view.^[6]

Machines were used as models by Iatrophysicists to quantitatively describe linear and rotational motion of various biological systems such as human limbs and animals. Some models came into existence before Isaac Newton's formulation of his three laws in classical mechanics, drawing on basic principles of statics and dynamics to represent how a biological system behaved. Giovanni Borelli was prolific in applying mechanics to a wide variety of humans and animals in different degrees of activity, drawing upon an array of simple machines and models for translational and rotational motion and equilibrium.^[7][8][9]

Iatrophysicists were also interested in studying how bodily liquids and gases were processed. They sought to understand how blood circulated throughout the body and what effects it made on the body. System consisted of arteries, veins, and vasculature verified through experiment and microscope by Marcello Malpighi's observations of capillaries in animal lung tissue. Albrecht von Haller, as did Borelli, postulated that friction from the blood on vessel walls lead to body heat and even fever. A hydraulic model for motion by René Descartes implied the body had a system that maintained flow between the brain and muscles in equilibrium state through nerves and blood vessels.^[8]

นักฟิสิกส์ฟิสิกส์ที่มีชื่อเสียงคนหนึ่งคือ Giovanni Borelli ซึ่งสร้างแบบจำลองร่างกายมนุษย์ สัตว์ต่างๆ และการเคลื่อนไหวของพวกมันโดยใช้หลักการทางกลศาสตร์^{[ 7 ] [ 10 ]} Borelli ซึ่งเป็นเพื่อนร่วมงานของ Marcello Malphigi เป็นนักคณิตศาสตร์ที่เชื่อมโยงสิ่งที่เขาพบเห็นในสิ่งมีชีวิตกับระบบที่ไม่มีชีวิตแต่ค่อนข้างเรียบง่าย เขาผ่าสัตว์และตรวจสอบว่ากล้ามเนื้อจะเพิ่มความได้เปรียบเชิงกลได้อย่างไร สังเกตว่าสิ่งมีชีวิตต่างๆ เคลื่อนไหวและทำกิจกรรมต่างๆ เช่น การวิ่ง การแบกของ การว่ายน้ำ และการบินได้อย่างไรตามธรรมชาติ แทนที่จะใช้การแทรกแซงของเขา และคิดค้นวิธีการง่ายๆ ในการคำนวณจุดศูนย์กลางมวล ของบุคคล เขายังคิดค้นการทดลองและอุปกรณ์ที่ค่อนข้างง่ายเพื่อทำการสังเกตของเขา เช่น แผ่นไม้และแท่งสำหรับจุดศูนย์กลางมวล และสไปโรมิเตอร์สำหรับปริมาตรอากาศ ในช่วงท้ายของชีวิต ผลงานของเขาได้สรุปออกมาเป็นDe Motu Animalium (1679) ซึ่งเป็นสิ่งพิมพ์ที่แสดงให้เห็นถึงการวิจัยของเขาเกี่ยวกับความคล้ายคลึงและความแตกต่างของกล้ามเนื้อในสิ่งมีชีวิต และความเข้าใจของเขาเกี่ยวกับกลไกพื้นฐานของการหดตัวและการขยายตัวของกล้ามเนื้อผ่านการไหลเข้าของของเหลวหรือก๊าซที่ปล่อยออกมาจากเส้นประสาท เขายังพยายามอธิบายกระบวนการที่ซับซ้อนมากขึ้น เช่น การส่งสัญญาณประสาทและการย่อยอาหาร^{[ 8 ] [ 11 ]}

นักฟิสิกส์ฟิสิกส์ที่มีชื่อเสียงอีกคนหนึ่งคือ เรเน่ เดส์การ์ต นักปรัชญาและนักคณิตศาสตร์ชาวฝรั่งเศส ซึ่งจากปรัชญาของเขาที่ยืนยันว่าร่างกายมนุษย์และจิตวิญญาณเป็นสองสิ่งที่เป็นคู่กัน เขาจึงมองร่างกายมนุษย์เป็นเครื่องจักรที่สามารถวัดปริมาณ แยกส่วน และศึกษาได้ เขาพยายามสร้างแบบจำลองปรากฏการณ์ต่างๆ เช่น สมอง การเคลื่อนไหว การนอนหลับ การไหลเวียนโลหิต และประสาทสัมผัส โดยใช้การเปรียบเทียบกับวัตถุที่ไม่มีชีวิต เช่น อ่างเก็บน้ำ ท่อ เลนส์ และเครื่องจักรไอน้ำ ซึ่งมักจะพยายามรักษาสมดุลในบางสถานะ ข้ออ้างบางประการของเขามักจะเป็นอิสระจากการสังเกตทางกายภาพของอวัยวะหรือร่างกายที่เกี่ยวข้อง และเน้นสิ่งที่เขาคิดว่า "เรียบง่าย" หรือ "มีเหตุผล" มากกว่าความเป็นจริง ตัวอย่างเช่น เขายืนยันว่าเลือดไหลเวียนไปทั่วร่างกายโดยการขยายตัวเป็นไอน้ำด้วยความร้อนจากหัวใจมากกว่าการหดตัว^{[ 7 ] [ 8 ]}

วิลเลียม ฮาร์วีย์ตั้งสมมติฐานว่าการไหลเวียนของเลือดเป็นวงจรปิดต่อเนื่องที่วิ่งไปทั่วร่างกายซึ่งมีปริมาณเลือดที่แน่นอน เพื่อทดสอบข้ออ้างของเขา ฮาร์วีย์ได้ผ่าศพมนุษย์และสัตว์ และจากการค้นพบทางกายวิภาค เขาได้คิดค้นการสาธิตอย่างง่ายๆ เกี่ยวกับวิธีการที่หลอดเลือดแดงและหลอดเลือดดำนำเลือดไปทั่วร่างกายอย่างต่อเนื่อง โดยใช้ประโยชน์จากข้อเท็จจริงที่ว่าหลอดเลือดแดงและหลอดเลือดดำอยู่ที่ระดับความลึกที่แตกต่างกันใต้ผิวหนัง เขาผูกแขนของคนคนหนึ่งไว้และให้พวกเขากดแท่งเพื่อเบี่ยงเบนเลือดจากหลอดเลือดแดงไปยังหลอดเลือดดำ ซึ่งแสดงให้เห็นว่าเลือดเดินทางไปตามหลอดเลือดแดงและเข้าสู่หลอดเลือดดำ ข้ออ้างของเขาได้รับการอธิบายเพิ่มเติมโดยการค้นพบของมัลฟิกีเกี่ยวกับเส้นเลือดฝอยและวิธีที่พวกมันเชื่อมต่อกับหลอดเลือดแดงและหลอดเลือดดำ^{[ 7 ] [ 8 ]}

หนึ่งในนักสรีรวิทยาที่มีอิทธิพลมากที่สุดคือเฮอร์มันน์ โบเออร์ฮาฟแพทย์และนักเคมีชาวดัตช์จากมหาวิทยาลัยไลเดนเช่นเดียวกับนักสรีรวิทยาคนอื่นๆ เขาถือว่าสรีรวิทยาเป็นกลไก แม้ว่าเขาจะไม่เห็นด้วยกับความคิดที่ว่าร่างกายและจิตใจเชื่อมโยงกัน แต่เขาก็ให้เหตุผลว่าทุกสิ่งที่เกี่ยวข้องกับร่างกายนั้นเกิดจากการขยายตัว การไม่สามารถทะลุผ่านได้ หรือการเคลื่อนไหว^{[ 6 ]}

ฟรานซิส กลิสสันเป็นที่รู้จักจากผลงานเกี่ยวกับการไหลเวียนของเลือด กลไกของระบบประสาท และโรคทางพันธุกรรม เขาได้รับอิทธิพลอย่างมากจากผลงานของฮาร์วีย์เกี่ยวกับธรรมชาติของเลือดที่มีความรู้สึก และผลงานของเขาแสดงให้เห็นถึงอุดมการณ์ทางสรีรวิทยาโดยเฉพาะผ่านมุมมองของเขาเกี่ยวกับแรงดึงดูดและความไวต่อสิ่งเร้า หรือแนวคิดที่ว่าเส้นใยของร่างกายตอบสนองต่อสิ่งเร้าอย่างไร ในผลงานของเขาAnatomia hepatisเขาโต้แย้งว่ากิ่งก้านสาขาจะไขว้กัน และเลือดที่ไหลเวียนจะถูกแยกออกในตับ จากนั้นเลือดนี้จะถูกดูดซึมโดยหลอดเลือดน้ำดีผ่านแรงดึงดูดที่กลิสสันอธิบายว่าเป็นแรงดึงดูดที่คล้ายคลึงกัน แรงแม่เหล็ก หรือแรงธรรมชาติ^{[ 12 ]}

อัลเบรชต์ ฟอน ฮัลเลอร์ เป็นนักสรีรวิทยาคนสำคัญอีกคนหนึ่ง ซึ่งเช่นเดียวกับกลิสซง เขาให้ความสำคัญกับสรีรวิทยาในฐานะกลไกของเส้นใยในร่างกาย เขามีมุมมองเดียวกับกลิสซงเกี่ยวกับความไวต่อสิ่งเร้า แต่ต่างจากกลิสซงตรงที่เขาเชื่อว่าปฏิกิริยาต่อสิ่งเร้าภายนอกเกิดจากเส้นใยในร่างกายเท่านั้น ไม่ใช่พลังที่แท้จริงของสสารอย่างที่กลิสซงเสนอ ในงานเขียนPhysiologiae Corporis Humani (1757–1766) เขาอธิบายอวัยวะและกล้ามเนื้อของร่างกายว่าเป็นเส้นใยที่ถักทอเข้าด้วยกัน มุมมองของเขาเกี่ยวกับกล้ามเนื้อคือ กล้ามเนื้อมีแนวโน้มที่จะหดตัว ซึ่งเขาเรียกว่าvis mortuaหรือพลังที่ตายแล้ว เขาเชื่อว่าการหดตัวของกล้ามเนื้อนี้เกิดจากความไวต่อสิ่งเร้า ซึ่งเขาอธิบายว่าเป็นพลังที่แท้จริง เขาได้แยกความแตกต่างระหว่างความไวต่อสิ่งเร้าและความรู้สึก โดยความไวต่อสิ่งเร้าคือพลังของการหดตัวของกล้ามเนื้อ และความรู้สึกคือแรงกระตุ้นของเส้นประสาท ดังนั้น ส่วนหนึ่งจะเกิดอาการระคายเคืองหากเกิดการหดตัวเมื่อสัมผัส และจะเกิดความรู้สึกไวหากการสัมผัสส่งผลกระทบต่อจิตใจ^{[ 6 ]}

ซานโตริโอ ซานโตริโอเป็นแพทย์ชาวเวนิสที่พยายามวัดปริมาณการย่อยอาหารของมนุษย์ โดยวัดปริมาณอาหาร/น้ำที่รับประทานและน้ำหนักของของเสียที่ขับถ่ายออกมาอย่างละเอียดเป็นเวลาหลายปี เพื่อสร้างความสัมพันธ์ทางคณิตศาสตร์ระหว่างการรับประทานอาหาร/น้ำและการขับถ่าย ซานโตริโอได้ออกแบบเก้าอี้พิเศษที่มีเครื่องชั่งที่ชั่งน้ำหนักอาหารและของเสียที่ขับถ่ายออกมาของผู้ป่วย จากนั้นเขาจึงคำนวณการเปลี่ยนแปลงสุทธิของน้ำหนักในแต่ละวันโดยอิงจากการวัดเหล่านี้ นอกจากจะรู้ว่าตนเองรับประทานอะไรเข้าไปแล้ว เขายังวิเคราะห์เนื้อหาของของเสียและสารคัดหลั่ง โดยจำแนกตามประเภทและแหล่งที่มา เขายังสร้างเครื่องมือทางคลินิกอื่นๆ เพื่อวัดปริมาณทางการแพทย์อื่นๆ เช่น อุณหภูมิและชีพจร^{[ 7 ] [ 8 ]}

นิโคลัส สเตโนเป็นนักวิทยาศาสตร์ชาวเดนมาร์กที่พัฒนาแบบจำลองกล้ามเนื้อเชิงกลและเรขาคณิตล้วนๆ ในแบบจำลองนี้ เขาถือว่ากล้ามเนื้อเป็นเครือข่ายเส้นใยยาวที่สานกันอย่างเรียบง่าย ก่อให้เกิดรูปทรงเรขาคณิตที่สม่ำเสมอและแข็งแรง การหดตัวจึงถูกอธิบายว่าเป็นการปรับรูปร่างของเครือข่ายนี้ให้สั้นลงหรือยาวขึ้นตามทิศทางเดียว ดังนั้นกล้ามเนื้อจึงเปลี่ยนรูปร่างที่ปริมาตรคงที่โดยการเปลี่ยนมุมระหว่างเส้นใยแต่ละเส้นเท่านั้น คำอธิบายเกี่ยวกับการหดตัวนี้ และทฤษฎีที่ตามมาของเขาที่ว่าหัวใจหดตัวโดยเส้นใยจำนวนมากสั้นลงและยาวขึ้น ถือว่าเป็นแนวคิดที่แปลกใหม่ คำอธิบายที่เป็นที่นิยมมากที่สุด ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากนักสรีรวิทยาที่มีชื่อเสียง เช่น เดส์การ์ตและโบเรลลี ยืนยันว่าหัวใจหดตัวจากการที่เส้นใยพองตัวผ่านปฏิกิริยาเคมี^{[ 8 ] [ 13 ]}